DDX3X

DDX3X
DDX3X
Protein DDX3X PDB 2i4i.png
사용 가능한 구조물
PDB직교 검색: PDBe RCSB
식별자
별칭DDX3X, DBX, DDX14, DDX3, HLP2, CAP-Rf, MRX102, DEAD-box 헬리코아제 3, X-연결, DEAD-box 헬리코아제 3X 연결, MRXSSB
외부 IDOMIM: 300160 MGI: 103064 HomoloGene: 3425 GeneCard: DDX3X
직교체
종인간마우스
엔트레스

1654

13205

앙상블

ENSG00000215301

ENSMUSG000000787

유니프로트

O00571

Q62167

RefSeq(mRNA)

NM_001193416
NM_001193417
NM_001356
NM_024005
NM_001363819

NM_010028

RefSeq(단백질)

NP_001180345
NP_001180346
NP_001347
NP_001350748

NP_034158

위치(UCSC)Cr X: 41.33 – 41.36MbCr X: 13.28 – 13.29Mb
PubMed 검색[3][4]
위키다타
인간 보기/편집마우스 보기/편집

ATP 의존 RNA 헬리코아제 DDX3X는 인간에서 DDX3X 유전자에 의해 인코딩되는 효소다.[5][6][7]

함수

보존 모티브인 Asp-Glu-Ala-Asp(DEAD)가 특징인 DEAD 박스 단백질은 Putative RNA 나선형이다. 그것들은 변환 개시, 핵 및 미토콘드리아 스플라이싱, 리보솜 및 스플라이소솜 조립과 같은 RNA 2차 구조의 변경을 포함하는 많은 세포 과정에 관여한다. 이들의 분포 패턴으로 볼 때, 이 가족의 일부 구성원은 발생, 정자생식, 세포 성장 및 분열에 관여하는 것으로 여겨진다. 이 유전자는 특히 C형 간염 바이러스 코어 단백질과 상호작용하는 DEAD 박스 단백질을 암호화하여 세포내 위치의 변화를 일으킨다. 이 유전자는 Y염색체의 비복제 영역에 위치한 호몰로그램을 가지고 있다. 단백질 염기서열은 이 유전자와 Y-연계 호몰로그램 사이에서 91% 동일하다.[7]

아세포 밀매

DDX3X는 세포핵과 세포질에서 기능을 수행하며, exportin-1/CRM1 핵 수출 경로를 통해 핵에서 나온다. 이러한 상호작용을 위해 DDX3X 헬리캐아제 영역이 필요한 것으로 최초 보고되었으며, 인신매매 경로의 규범적 특징, 즉 DDX3X에 대한 핵수출 신호(NES)와 내보내기-1에 대한 Ran-GTP 바인딩이 존재한다는 것은 불필요한 것이었다.[8] 이후 DDX3X와 엑스포트인-1의 결합 및 인신매매는 DDX3X 헬리캐아제 도메인을 요구하지 않으며 NES-와 Ran-GTP에 의존하는 것으로 밝혀졌다.[9]

암에서의 역할

DDX3X는 많은 다른 종류의 암에 관련되어 있다. 예를 들어 저산소증 때 HIF1A에 의해 발현이 활성화되는 유방상피암세포에서 비정상적으로 발현된다.[10] 저산소증에서 HIF1A에 의한 DDX3X의 증가된 표현은 HIF1A 반응 요소에 대한 HIF1A의 직접 결합에 의해 시작되며,[10] 이는 염색질 면역소모소화와 루시퍼아제 리포터 분석으로 검증되었다. DDX3X의 발현이 HIF1A의 활성도에 영향을 받기 때문에 이러한 단백질의 공동 국지화는 MDA-MB-231 이종기래프트 종양 샘플에서도 입증되었다.[10]

Hela 세포에서는 DDX3X가 사이클린 E1을 통한 세포 주기 진행을 제어하는 것으로 보고되었다.[11] 좀 더 구체적으로, DDX3X는 사이클린 E1의 5' UTR에 직접 결합되어 단백질의 번역을 촉진하는 것으로 나타났다. S상 엔트리의 전환을 중재하기 위해 Cyclin E1의 단백질 수준 증가가 입증되었다.[11]

흑색종 생존, 이주, 확산은 DDX3X 활동의 영향을 받는다.[12] DDX3X 발현이 낮은 흑색종 세포는 이동능력이 높고 확산률이 낮으며 베무라페니브 민감도가 감소하는 것으로 나타났다. 높은 DDX3X는 약물에 민감하지만, 더 많이 증식하고 덜 이동한다. 이러한 표현형은 흑색종 전사 인자 MITF에 대한 번역 효과로 설명할 수 있다.[12] MITF mRNA의 5' UTR는 DDX3X에 의해 결합되고 활성화된 복합 RNA 레귤론(IRES)을 포함하고 있다. IRES의 활성화는 MITF mRNA의 번역으로 이어진다. IRES가 삭제된 흑색종 세포를 주입한 생쥐는 폐 전이 증가 등 종양 진행에 보다 적극적인 모습을 보인다.[12] 흥미롭게도, 흑색종의 DDX3X는 발견되지 않은 메커니즘을 통해 베무라페니브의 영향을 받는다. DDX3X가 베무라페니브의 존재에 의해 어떻게 하향 조정되는지는 알 수 없다. 그러나 약물 치료 중 DDX3X의 감소된 수치는 낮은 MITF 발현으로 자주 검출되는 약물 내성 세포의 발달을 설명한다.[12][13][14]

임상적 유의성

DDX3X 유전자의 돌연변이는 중수성형종과 관련이 있다.[15][16][17] 흑색종에서 그 유전자의 낮은 발현이 가난한 먼 전이의 자유로운 생존과 연관되어 있다.[12] 또한 DDX3X의 mRNA 수준은 베무라페니브와 진행성 종양에서 일치하는 재발 후 흑색종 생체검사에서 더 낮다.

참고 항목

참조

  1. ^ a b c GRCh38: 앙상블 릴리스 89: ENSG00000215301 - 앙상블, 2017년 5월
  2. ^ a b c GRCm38: 앙상블 릴리스 89: ENSMUSG000000787 - 앙상블, 2017년 5월
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ Lahn BT, Page DC (October 1997). "Functional coherence of the human Y chromosome". Science. 278 (5338): 675–80. doi:10.1126/science.278.5338.675. PMID 9381176.
  6. ^ Park SH, Lee SG, Kim Y, Song K (Oct 1998). "Assignment of a human putative RNA helicase gene, DDX3, to human X chromosome bands p11.3→p11.23". Cytogenetics and Cell Genetics. 81 (3–4): 178–9. doi:10.1159/000015022. PMID 9730595. S2CID 46774908.
  7. ^ a b "Entrez Gene: DDX3X DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 3, X-linked".
  8. ^ Yedavalli VS, Neuveut C, Chi YH, Kleiman L, Jeang KT (October 2004). "Requirement of DDX3 DEAD box RNA helicase for HIV-1 Rev-RRE export function". Cell. 119 (3): 381–92. doi:10.1016/j.cell.2004.09.029. PMID 15507209.
  9. ^ Heaton SM, Atkinson SC, Sweeney MN, Yang SN, Jans DA, Borg NA (September 2019). "Exportin-1-Dependent Nuclear Export of DEAD-box Helicase DDX3X is Central to its Role in Antiviral Immunity". Cells. 8 (10): 1181. doi:10.3390/cells8101181. PMC 6848931. PMID 31575075.
  10. ^ a b c Botlagunta M, Krishnamachary B, Vesuna F, Winnard PT, Bol GM, Patel AH, Raman V (March 2011). "Expression of DDX3 is directly modulated by hypoxia inducible factor-1 alpha in breast epithelial cells". PLOS ONE. 6 (3): e17563. doi:10.1371/journal.pone.0017563. PMC 3063174. PMID 21448281.
  11. ^ a b Lai MC, Chang WC, Shieh SY, Tarn WY (November 2010). "DDX3 regulates cell growth through translational control of cyclin E1". Molecular and Cellular Biology. 30 (22): 5444–53. doi:10.1128/MCB.00560-10. PMC 2976371. PMID 20837705.
  12. ^ a b c d e Phung B, Cieśla M, Sanna A, Guzzi N, Beneventi G, Cao Thi Ngoc P, et al. (June 2019). "The X-Linked DDX3X RNA Helicase Dictates Translation Reprogramming and Metastasis in Melanoma". Cell Reports. 27 (12): 3573–3586.e7. doi:10.1016/j.celrep.2019.05.069. PMID 31216476.
  13. ^ Müller J, Krijgsman O, Tsoi J, Robert L, Hugo W, Song C, et al. (December 2014). "Low MITF/AXL ratio predicts early resistance to multiple targeted drugs in melanoma". Nature Communications. 5 (1): 5712. doi:10.1038/ncomms6712. PMC 4428333. PMID 25502142.
  14. ^ Konieczkowski DJ, Johannessen CM, Abudayyeh O, Kim JW, Cooper ZA, Piris A, et al. (July 2014). "A melanoma cell state distinction influences sensitivity to MAPK pathway inhibitors". Cancer Discovery. 4 (7): 816–27. doi:10.1158/2159-8290.CD-13-0424. PMC 4154497. PMID 24771846.
  15. ^ Robinson G, Parker M, Kranenburg TA, Lu C, Chen X, Ding L, et al. (August 2012). "Novel mutations target distinct subgroups of medulloblastoma". Nature. 488 (7409): 43–8. doi:10.1038/nature11213. PMC 3412905. PMID 22722829.
  16. ^ Jones DT, Jäger N, Kool M, Zichner T, Hutter B, Sultan M, et al. (August 2012). "Dissecting the genomic complexity underlying medulloblastoma". Nature. 488 (7409): 100–5. doi:10.1038/nature11284. PMC 3662966. PMID 22832583.
  17. ^ Pugh TJ, Weeraratne SD, Archer TC, Pomeranz Krummel DA, Auclair D, Bochicchio J, et al. (August 2012). "Medulloblastoma exome sequencing uncovers subtype-specific somatic mutations". Nature. 488 (7409): 106–10. doi:10.1038/nature11329. PMC 3413789. PMID 22820256.

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