C1orf131

C1orf131
C1orf131
식별자
에일리어스C1orf131, 1번 염색체 개방 판독범위 131
외부 IDMGI: 1913773 HomoloGene: 11982 GenCard: C1orf131
맞춤법
종.인간마우스
엔트레즈

128061

66523

앙상블

ENSG00000143633

ENSMUSG000031984

유니프로트

Q8NDD1

Q8CIL4

RefSeq(mRNA)

NM_152379
NM_001300830

NM_025615

RefSeq(단백질)

NP_001287759
NP_689592

NP_079891

장소(UCSC)Chr 1: 231.22 ~231.24 MbChr 8: 125.56 ~125.59 Mb
PubMed 검색[3][4]
위키데이터
인간 보기/편집마우스 표시/편집

불특정 단백질 C1orf131은 유전자 C1orf131에 의해 인간 내에서 암호화되는 단백질이다.이 단백질의 첫 번째 맞춤법은 [5][6]사람에게서 발견되었다.그 후 알고리즘과 생체정보학을 이용하여 C1orf131의 상동체가 수많은 종에서 발견되었으며, 그 결과 이 단백질 패밀리의 대다수 단백질의 이름은 Uncharaciated protein C1orf131 상동체이다.


진

사람에게 C1orf131은 193개의 다른 유전자와 [7]함께 염색체 1의 마이너스 가닥과 세포유전학적 밴드 1q42.2에 위치한다.특히 C1orf131의 상류 유전자는 GNPAT이고, C1orf131의 하류 유전자는 TRIM67이다.이 유전자가 인간에게 전사될 때, C1orf131은 7개의 엑손으로 구성된 1458개의 염기쌍의 mRNA를 형성한다.인간에게는 단백질을 생산하는 적어도 9개의 다른 대체 접합 형태가 있다.크기는 129개의 염기쌍(2엑손)에서 1458개의 염기쌍(7엑손)[8]까지입니다.

단백질

C1orf131 단백질 패밀리에서 단백질은 93에서 450개의 아미노산 사이지만 대부분은 160에서 295개의 아미노산 사이인 경향이 있다.분자량은 10.6~49.0kDa이며, 대부분은 18.6~32.7kDa이다.9.6과 11.[9]2 사이에 등전점이 있습니다.포유류, 조류, 도마뱀에서 나온 30개 이상의 정형어는 폴리(A) RNA 결합 [10]부위가 있는 것으로 확인되었다.이 단백질 계열의 모든 정형외과에는 알려지지 않은 기능 DUF4602 [10][11]도메인이 있습니다.인간 단백질은 인산화와 아세틸화 [12][13][14][15][16][17]둘 다로 나타났다.이 단백질들은 리신이 풍부하고, 하전아미노산(DEHKR)과 염기성 하전아미노산(HKR)[18]이다.이러한 단백질의 2차 구조는 주로 베타 가닥의 비율이 [19]적은 알파 나선과 코일로 구성됩니다.C1orf131은 어피니티 캡처를 통해 유비퀴틴과[20] 상호작용하는 것으로 나타났으며, 이어서 질량분석과 재구성 복합체를 통해 APP(아밀로이드 베타(A4) 전구 단백질)[21]가 이루어졌다.

녹색으로 표시된 DUF4602를 가진 인간 단백질 C1orf131의 그래픽 개요, 빨간색 점으로 표시된 인산화, 회색 점으로 표시된 아세틸화.

DUF4602

DUF4602(PF15375)는 일반적으로 120개 이상의 아미노산 [22]길이입니다.이 DUF 도메인을 포함하는 유전자는 전형적으로 한 가지뿐이지만, DUF 도메인은 여러 종에서 두 개의 다른 단백질에서 확인되었습니다.Trichuris suis DUF4602는 가설단백질 M5114_09117과 tRNA pseudouridine synthase D에, Echinoccus granulosus DUF4602는 가설단백질 EGR 05135에서 발견되어 발현 보존단백질이다.DUF4602는 주로 진핵생물에서 발견되었지만 DUF4602는 바이러스 DRHN1, 바실러스 sp에서 확인되었다. UNC41MFS5, Enteroccus faecalis 및 Enteroccus faecalis 13-SD-W-01.C1orf131 정형외과에서 DUF 도메인은 일반적으로 큰 단백질(250+잔기)에서 C 말단 쪽으로 향하는 유전자의 중앙에 위치하고 작은 정형외과(160~250잔기)에서 DUF 도메인은 N 말단 근처에 위치한다.또한 더 큰 정형어에는 이러한 단백질이 본질적으로 무질서한 단백질임을 나타낼 수 있는 낮은 복잡도의 영역이 있다.

진화사

이 유전자군은 진핵생물에만 존재한다.이 유전자의 병변은 없지만, C1orf131의 의사유전자가 몇 개 있다.지금까지 그들은 오랑우탄, 쥐여우원숭이, [11]나무늘보에서만 발견되었다.이 유전자 패밀리를 느린 진화의 [23]유전자인 시토크롬C와 빠르게 진화하는[24] 유전자인 피브리노겐 감마사슬과 비교하면 피브리노겐보다 빠른 속도로 진화하는 것으로 나타났다.

피브리노겐과 시토크롬C와 비교한 이 유전자의 발산 그래프.

레퍼런스

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