C14orf80

C14orf80
TEDC1
식별자
에일리어스TEDC1, C14orf80, 14번 염색체 오픈 판독 프레임 80, 튜불린 엡실론 및 델타 복합체 1
외부 IDMGI: 2144738 HomoloGene: 77129 GenCard: TEDC1
맞춤법
종.인간마우스
엔트레즈

283643

104732

앙상블

ENSG00000185347

ENSMUSG000037466

유니프로트

Q86SX3

Q3UK37

RefSeq(mRNA)

NM_134041

RefSeq(단백질)

NP_001128347
NP_001128348
NP_001128349
NP_001185912
NP_001354107

NP_598802

장소(UCSC)Chr 14: 105.49 ~105.5 MbChr 12: 113.12 ~113.13 Mb
PubMed 검색[3][4]
위키데이터
인간 보기/편집마우스 표시/편집

비특징단백질 C14orf80은 염색체 14의 오픈 판독범위 80, C14orf80, 유전자에 의해 인체 내에서 부호화되는 단백질이다.

진

위치

C14orf80은 105,489,855bp에서 시작하여 105,499,248bp로 끝나는 염색체 14(14q32.33)에 위치한다. C14orf80은 9,393개의 염기쌍으로 다른 mRNA [5]변형을 형성하기 위해 교대로 결합할 수 있는 11개의 엑손이 포함되어 있다.


변종

C14orf80의 전사에서는 19개의 mRNA 스플라이스 변형을 생성할 수 있습니다.이 19개의 변종 중 [6]6개만이 단백질을 암호화하지 않을 것으로 예측된다.실험적으로 발견된 mRNA 변종 중 가장 긴 것은 1,719개의 염기쌍이며 426개의 아미노산을 [7]가진 단백질을 생성한다.

표현

C14orf80은 77가지 유형의 조직과 100가지 발달 [8]단계에서 발현되는 것으로 확인되었다.또한 췌장암과 전립선암세포의 일부 사례에서 정상 [9]조직에 비해 발현 수준이 높은 것으로 확인되었다.

다양한 조직에서의 C14orf80 발현

호몰로지

패럴로그

C14orf80의 [10]병변은 없다.

맞춤법

NCBI의 BLAST 프로그램을 사용하여, C14orf80의 맞춤법은 영장류에서 무척추동물까지 다양함을 발견했다.아래 표는 이러한 다양한 [11]맞춤법을 포함하고 있습니다.

종. 통칭 등록번호 분기일 시퀀스 길이(AA) 시퀀스 유사성
호모 사피엔스 인간 NP_001128347 0 mya 426 100%
클로로케부스사바에우스 녹색원숭이 XP_007986247 29 mya 424 94%
흰털쥐 13줄다람쥐 XP_005334680 92.3 mya 426 80%
보스 황소자리 소. XP_003585026 94.2 mya 419 78%
노베기쿠스 갈색쥐 XP_002726827 92.3 mya 420 76%
조노트리히아 알비콜리스 흰목참새 XP_005493655 296 mya 454 53%
시넨시스메로디스카스 중국 연갑거북 XP_006137260 296 mya 404 51%
크세노푸스 트로피컬리스 열대발톱개구리 XP_002935771 371.2 mya 437 50%
다니오 레리오 제브라피시 XP_706561 400.1 mya 452 41%
캄포노투스플로리다누스 플로리다목수개미 XP_011255960 782.7 mya 374 38%

진화율

느리게 진화하는 시토크롬C 유전자와 빠르게 진화하는 피브리노겐 유전자와 비교해도 C14orf80 유전자는 빠르게 [11]진화하고 있다.

세 개의 다른 유전자가 수백만 년 동안 얼마나 빨리 진화했는지 보여줍니다.

단백질

일반 속성

불특정 단백질 C14orf80은 426개의 아미노산 길이에 47kDa의 [12]분자량을 가진다.등전점은 8.[13]9입니다.

C14orf80 아미노산 배열

구성.

특성화되지 않은 단백질 C14orf80의 아미노산 조성.

이차 구조

비특징단백질 C14orf80은 전체적으로 알파나선으로 [14]구성될 것으로 예측된다.SUSI-signal 프로그램을 이용하여 비특징 단백질 C14orf80은 신호펩타이드를 포함하지 않고 수용성 [15]단백질로 예측되었다.

기능.

도메인

특성화되지 않은 단백질 C14orf80은 두 가지 기능 도메인을 가지고 있다.첫 번째 도메인은 미지 함수 4509의 도메인이고, 두 번째 도메인은 미지 함수 4510의 도메인이다.이러한 도메인은 이름이 명시되어 있기 때문에 기능을 아직 알 [10]수 없습니다.

DUF4509는 아미노산 45~아미노산 228에 위치한다.이 미지의 기능 영역에는 보존된 WLL 시퀀스 [16]모티브가 있습니다.

DUF4510은 아미노산 263~아미노산 425에 위치한다.이 미지의 함수 영역에는 보존된 두 가지 시퀀스 [17]모티브, 즉 LEA와 WMD가 있습니다.

번역 후 수정

비특징 단백질 C14orf80은 번역 후 수식을 위한 당화 및 인산화 부위를 가질 것으로 예측된다.이들 부위 중 3개는 당화, 8개는 세린인산화, 1개는 트레오닌인산화이다.[18][19]

세포 외 위치

비특징단백질 C14orf80은 트랜스막단백질일 것으로 예측되지 않는다.그것은 주로 골지 기구에 국한되어 있지만 핵과 세포질에서도 [20]발견되었다.

상호 작용

현재, 특징 없는 단백질 C14orf80과 상호작용할 것으로 예측되는 21개의 단백질이 있다.이 21개의 단백질은 데이터베이스 Mentha,[21] BioGRID,[22] STRING,[23] GeneCards[24] 및 IntAct를 [25]사용하여 발견되었다.아래 표는 이러한 21가지 단백질의 다양한 종류입니다.

상호작용단백질 전체 단백질 이름 기능. 인용문
DDIT3 DNA손상유발성전사3 ER 스트레스 시 세포 주기 정지 및 아포토시스를 유도 [26]
CEBPZ CCAAT증강제결합단백질 HSP70 프로모터의 전사를 촉진합니다. [26]
UBC 유비퀴틴 C Udeshi ND, Mani DR, Eisenhaure T, Mertins P, Jaffe JD, Clauser KR, Hacohen N, Carr SA (May 2012). "Methods for quantification of in vivo changes in protein ubiquitination following proteasome and deubiquitinase inhibition". Molecular & Cellular Proteomics : MCP. 11 (5): 148–59. doi:10.1074/mcp.M111.016857. PMC 3418844. PMID 22505724.
FKBP5 FK506결합단백질 PPIase를 가진 면역필린단백질 Taipale M, Tucker G, Peng J, Krykbaeva I, Lin ZY, Larsen B, Choi H, Berger B, Gingras AC, Lindquist S (July 2014). "A quantitative chaperone interaction network reveals the architecture of cellular protein homeostasis pathways". Cell. 158 (2): 434–448. doi:10.1016/j.cell.2014.05.039. PMC 4104544. PMID 25036637.
DEF107A 베타-디펜신 107 항균 활동 [27]
XAGE1D 암/고환 항원 패밀리 12명 1D [28]
트랙2 인신매매 단백질 키네신 결합 2 막화물의 리소좀 밀매에 대한 엔도솜을 조절할 수 있음 [29]
NRF1 핵호흡인자 1 호흡 서브유닛을 코드하는 핵유전자 전사인자 및 미토콘드리아 전사인자 및 복제기계 성분 [30]

임상적 의의

특징 없는 단백질 C14orf80은 유방, CNS, 자궁내막, 대장, 폐, 피부 및 위 종양과 [31]관련이 있습니다.

레퍼런스

  1. ^ a b c GRCh38: 앙상블 릴리즈 89: ENSG00000185347 - 앙상블, 2017년 5월
  2. ^ a b c GRCm38: 앙상블 릴리즈 89: ENSMUSG000037466 - 앙상블, 2017년 5월
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