베타코로나바이러스

Betacoronavirus
이 기사는 코로나바이러스 속성에 관한 것이다.COVID-19를 유발하는 사스-CoV-2 바이러스의 베타 변종과 혼동해서는 안 된다.
베타코로나바이러스
Murine coronavirus virion electron micrograph, schematic structure, and genome
뮤린 코로나바이러스(MHV) 처녀자리 전자 마이크로그래프, 도식 구조, 게놈
바이러스 분류 e
(랭킹되지 않음): 바이러스
영역: 리보비리아
왕국: 오르토나비라과
망울: 피수비리코타
클래스: 피소니비리케테스
주문: 니도비라목
가족: 코로나비루스과
하위 패밀리: 오트코로나비리나과
지누스: 베타코로나바이러스
하위게놈과 종

텍스트 보기

베타코로나바이러스(β-CoVs 또는 베타-CoVs)는 코로나비루스의 4개 제네라(Alpha-, 베타-, 감마-, 델타-) 중 하나이다.회원 바이러스는 포유류를 감염시키는 양스트랜드 RNA 바이러스를 포함하고 있다.베타코로나비루스의 자연 저수지는 박쥐와 설치류다.설치류는 소제너스의 엠베코바이러스를 위한 저장고인 반면 박쥐는 다른 하위제너럴을 위한 저장고인 것이다.[1]

코로나바이러스 성형은 각각 A, B, C, D의 4가지 선들을 포함하는 베타코로나바이러스 속과의 다양한 바이러스 선으로 구성되어 있다.구 문헌에서 이 속은 "그룹 2 코로나비루스"로도 알려져 있다.이 속은 니도비랄레스(Nidovirales)의 코로나비르과(Coronavirae)과에 속하는 아과에 속한다.

The betacoronaviruses of the greatest clinical importance concerning humans are OC43 and HKU1 (which can cause the common cold) of lineage A, SARS-CoV and SARS-CoV-2 (which causes the disease COVID-19) of lineage B,[2] and MERS-CoV of lineage C. MERS-CoV is the first betacoronavirus belonging to lineage C that is known to infect humans.[3][4]

어원

'베타코로나바이러스'라는 명칭은 고대 그리스어 βαα(btata, "그리스 알파벳의 두 번째 글자")와 κρώηηη(korēn,, "갈랜드, 화환")에서 따온 것으로, 태양 코로나를 닮은 전자 현미경 아래에서 보이는 표면 투영의 외관을 묘사하고 있다.이 형태학은 바이러스 스파이크(S) 외교관에 의해 만들어지는데, 이것은 바이러스의 표면을 채우고 숙주 열도를 결정하는 단백질이다.니도비랄레스 순서는 '둥지'를 뜻하는 라틴 니두스의 이름을 따서 명명되었다.이 주문서는 감염 시 3′의 코테르미날 중첩된 유전자 이하의 mRNA 세트를 생산하는 것을 말한다.[5]

구조

메르스-CoV: 구조, 부착, 입구, 게놈 구성

스파이크 단백질의 몇 가지 구조가 해결되었다.알파와 베타코나바이러스 스파이크 단백질의 수용체 결합 영역은 InterPro: IPR018548로 분류된다.[6]제1종 핵융합 기계인 스파이크 단백질은 트리머(PDB: 3jcl, 6acg)로 조립되는데, 핵심 구조는 파라믹소바이러스 F(융접) 단백질을 닮았다.[7]수용체 사용은 그다지 보존되지 않는다. 예를 들어 사르베코 바이러스 중에는 사스를 포함하는 하위 라인만이 ACE2 수용체를 공유한다.

소제네라 엠베코바이러스의 바이러스는 헤마글루틴에스테라아제(HE)(P15776)라고 하는 더 짧은(8nm) 스파이크 형태의 단백질을 추가로 가지고 있다는 점에서 속내의 다른 모든 바이러스와 다르다.인플루엔자 C형 바이러스에서 인수한 것으로 추정된다.[5][8]

게놈

알파코로나비루스와 베타코로나비루스의 게놈

코로나비루스의 게놈 크기는 26~32킬로바이트에 이른다.β-CoV 게놈의 전체적인 구조는 다른 원소보다 ORF1ab 복제효소 다단백질(rep, pp1ab)이 앞선 다른 CoVs와 유사하다.이 다단백질은 16개의 비구조적 단백질로 분해된다(SARS 담당자의 유니프로트 주석, P0C6X7 참조).

GenBank는 2013년 5월 현재 46개의 α-(1그룹), β-(2그룹), β-(3그룹), Δ-(4그룹) CoVs의 완전한 게놈을 발행하고 있다.[9]

재조합

유전적 재조합은 둘 이상의 바이러스 게놈들이 동일한 숙주세포에 존재할 때 발생할 수 있다.낙타 베타-CoV HKU23은 아프리카 낙타 개체군에서 유전적 다양성을 보여준다.[10]이러한 다양성에 기여하는 것은 과거에는 하위 유전자 엠베코바이러스의 밀접하게 연관된 베타코로나비루스 사이에서 일어났던 여러 재결합 사건들이다.[10]또한 베타코로나바이러스인 휴먼 사스-코브 바이러스는 여러 다른 동물군에서 진행되었던 조상들의 코로나비루스 사이의 복잡한 재조합의 역사를 가지고 있는 것으로 보인다.[11][12]

병생성

베타코로나바이러스속 바이러스의 복제주기

알파와 베타코로나비루스는 주로 박쥐를 감염시키지만 인간, 낙타, 설치류 같은 다른 종도 감염시킨다.[13][14][15][16]인간에게 전염병을 일으킨 베타코로나비루스는 일반적으로 발열과 호흡기 증상을 유발한다.여기에는 다음이 포함된다.

분류

사스-CoV와 메르스-CoV에 대한 세부 정보가 포함된 베타코로나바이러스 계열의 계통식 나무

베타코로나바이러스(2그룹 CoV) 내에서는 전통적으로 4개의 하위 유전자나 라인(A, B, C, D)이 인정되어 왔다.[5]네 줄의 이름도 그리스 문자나 숫자로 지어졌다.[9]다섯 번째 하위 유전자인 히베코바이러스가 더 최근에 추가되었다.[17]회원 하위 유전자와 종은 다음을 포함한다.[18]

엠베코바이러스(A라인)

주요 기사: Embeco

베타코로나바이러스 1호

중국 래투스 코로나바이러스 HKU24
인간 코로나바이러스 HKU1
무린 코로나바이러스

미오데스 코로나바이러스 2JL14

사르베코바이러스(연령 B)

주요기사 : 사르베코바이러스

중증급성호흡기증후군 관련 코로나바이러스(SARSR-CoV 또는 SARS-CoV)

코로나비루스
HCoV-229E virus
종류들
질병.
백신
전염병 및 유행병
참고 항목

메르베코바이러스(연계 C)

주요 기사:메르베코바이러스

고슴도치 코로나바이러스 1
중동호흡기증후군 관련 코로나바이러스(MERS-CoV)
피피스트렐루스 배트 코로나바이러스 HKU5
실로닉테리스박쥐코로나바이러스HKU4

노베코바이러스(연계 D)

주요 기사:노베코바이러스

에이돌론박쥐코로나바이러스 C704
루세투스 박쥐 코로나바이러스 GCCDC1
호세투스 박쥐 코로나바이러스 HKU9

히베코바이러스

주요 기사:히베코바이러스

박쥐 HP-베타코나바이러스 저장2013

참고 항목

참조

  1. ^ Wartecki, Adrian; Rzymski, Piotr (June 2020). "On the Coronaviruses and Their Associations with the Aquatic Environment and Wastewater". Water. 12 (6): 1598. doi:10.3390/w12061598.
  2. ^ "Phylogeny of SARS-like betacoronaviruses". nextstrain. Retrieved 18 January 2020.
  3. ^ 프로메디 메르스-코브-동부 지중해(06) (http://www.promedmail.org/)
  4. ^ Memish, Z. A.; Zumla, A. I.; Al-Hakeem, R. F.; Al-Rabeeah, A. A.; Stephens, G. M. (2013). "Family Cluster of Middle East Respiratory Syndrome Coronavirus Infections". New England Journal of Medicine. 368 (26): 2487–94. doi:10.1056/NEJMoa1303729. PMID 23718156.
  5. ^ a b c Woo, Patrick C. Y.; Huang, Yi; Lau, Susanna K. P.; Yuen, Kwok-Yung (2010-08-24). "Coronavirus Genomics and Bioinformatics Analysis". Viruses. 2 (8): 1804–20. doi:10.3390/v2081803. PMC 3185738. PMID 21994708.
  6. ^ Huang, C; Qi, J; Lu, G; Wang, Q; Yuan, Y; Wu, Y; Zhang, Y; Yan, J; Gao, GF (1 November 2016). "Putative Receptor Binding Domain of Bat-Derived Coronavirus HKU9 Spike Protein: Evolution of Betacoronavirus Receptor Binding Motifs". Biochemistry. 55 (43): 5977–88. doi:10.1021/acs.biochem.6b00790. PMC 7075523. PMID 27696819.
  7. ^ Walls, Alexandra C.; Tortorici, M. Alejandra; Bosch, Berend-Jan; Frenz, Brandon; Rottier, Peter J. M.; DiMaio, Frank; Rey, Félix A.; Veesler, David (8 February 2016). "Cryo-electron microscopy structure of a coronavirus spike glycoprotein trimer". Nature. 531 (7592): 114–117. Bibcode:2016Natur.531..114W. doi:10.1038/nature16988. PMC 5018210. PMID 26855426.
  8. ^ Bakkers, Mark J. G.; Lang, Yifei; Feitsma, Louris J.; Hulswit, Ruben J. G.; Poot, Stefanie A. H. de; Vliet, Arno L. W. van; Margine, Irina; Groot-Mijnes, Jolanda D. F. de; Kuppeveld, Frank J. M. van; Langereis, Martijn A.; Huizinga, Eric G. (2017-03-08). "Betacoronavirus Adaptation to Humans Involved Progressive Loss of Hemagglutinin-Esterase Lectin Activity". Cell Host & Microbe. 21 (3): 356–366. doi:10.1016/j.chom.2017.02.008. ISSN 1931-3128. PMC 7104930. PMID 28279346.
  9. ^ a b Cotten, Matthew; Lam, Tommy T.; Watson, Simon J.; Palser, Anne L.; Petrova, Velislava; Grant, Paul; Pybus, Oliver G.; Rambaut, Andrew; Guan, Yi; Pillay, Deenan; Kellam, Paul; Nastouli, Eleni (2013-05-19). "Full-Genome Deep Sequencing and Phylogenetic Analysis of Novel Human Betacoronavirus". Emerging Infectious Diseases. 19 (5): 736–42B. doi:10.3201/eid1905.130057. PMC 3647518. PMID 23693015.
  10. ^ a b 아프리카 낙타에 있는 드로메다리 낙타 코로나바이러스 HKU23의 다양성으로 인해 서브게너스 엠베코바이러스의 밀접하게 연관된 베타코로나비루스 사이의 복수 재결합 사건이 밝혀졌다.그래서 RTY 등.J Virol. 2019.PMID 31534035
  11. ^ 스탠호프 MJ, 브라운 JR, 아므린-마드센 H. 사스-CoV 재조합 역사에 대한 뉴클레오티드 시퀀스의 진화적 분석에서 나온 증거.Genete Evol을 감염하십시오.2004년 3월 4일(1):15-9.PMID 1501985
  12. ^ 장XW, 야프 YL, 단친 A.사스 관련 코로나바이러스 재조합원 가설 검정.아치 비롤. 2005년 1월150(1:20) 1월1일-20일. 에푸브 2004년 10월11일. PMID 15480857
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  17. ^ Wong, Antonio C.P.; Li, Xin; Lau, Susanna K.P.; Woo, Patrick C.Y. (2019). "Global Epidemiology of Bat Coronaviruses". Viruses. 11 (2): 174. doi:10.3390/v11020174. PMC 6409556. PMID 30791586.
  18. ^ "Virus Taxonomy: 2019 Release". talk.ictvonline.org. International Committee on Taxonomy of Viruses. Retrieved 20 June 2020.

외부 링크