YadA세균접착단백질도메인
YadA bacterial adhesin protein domain| YadA세균접착단백질도메인 | |||||||||
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 박테리아 접착 단백질 도메인인 YadA의 C 말단에서 발견된 베타 배럴 구조 [1] | |||||||||
| 식별자 | |||||||||
| 기호. | 야다 | ||||||||
| 팜 | PF03895 | ||||||||
| 빠맘 클랜 | CL0327 | ||||||||
| 인터프로 | IPR005594 | ||||||||
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분자생물학에서 YadA는 예르시니아 접착제 A의 줄임말인 단백질 도메인이다.이러한 단백질은 특히 C 말단 말단에서 강한 배열과 구조적 호몰로지를 가지고 있다.그 기능은 세포 접착을 통해 숙주 세포에서 그들의 병원성과 독성을 촉진하는 것이다.YadA는 Yersinia, Y. pestis, Y. pseudotuberculosis, Y. enterocolitica의 세 가지 병원성 종에서 발견됩니다.YadA 도메인은 Yersinia의 독성 플라스미드에 의해 부호화되어 Ysc 주입체 [1]및 Yop 이펙터로 이루어진 Type-III 분비물(T3S) 시스템을 부호화한다.
기능.
본질적으로, YadA 도메인의 주요 기능은 세포 유착을 돕고 독성을 증가시키는 것이다.YadA는 콜라겐 결합 외막 단백질이다.그것은 세균 세포 표면에 섬유질 기질을 형성한다.이것은 세포 부착을 돕고 박테리아가 진핵 세포에 침입하는 것을 돕는다.또한 YadA 도메인은 섬유질 매트릭스를 형성함으로써 응집 저항성, 혈청 저항성, 보체 불활성화 및 식세포 내성을 촉진함으로써 세균을 보호한다.
Yada 기능과 Yersinia 생존에 있어 접착제의 중요성은 매우 큽니다.부착은 더 많은 상호작용을 가능하게 하고 세균의 군집화를 돕기 위해 바이오필름 형성을 증가시킨다.예르시니아에서, 그것은 숙주 세포에서 감염 과정을 시작하는 것을 돕고 중요한 독성 인자입니다.또한 박테리아는 접착 발현을 조절하는 능력이 있어 예르시니아가 YadA를 더 이상 필요로 하지 않게 되면 [2]YadA를 끌 수 있다.또한 YadA 표현은 주로 섭씨 37도에서 온도 조절된다.그것은 또한 두 개의 분자 조절제를 가지고 있다: 활성제인 VirF와 억제제인 YmoA.[3]
기판 접착
YadA 단백질 도메인은 다음 [1]기질에 부착됩니다.
YadA 단백질 도메인
C 터미널 도메인
C 말단 도메인은 표면 노출 세균 단백질군에 속하는 120개의 아미노산으로 구성됩니다.YadA C 단자 도메인은 삼량체 N 단자 승객 도메인을 멤브레인 외부로 이동시키는 특별한 기능을 가지고 있으며 삼량체화를 [4]담당하기도 합니다.
구조.
C 말단 도메인 구조
C 말단 영역은 외부 [5]막에서 삼량체를 형성하는 4개의 베타 가닥으로 구성된 막 통과 영역입니다.C 말단에는 F(페닐알라닌) 또는 W(트립토판)로 끝나는 소수성 아미노산이 번갈아 함유되어 있으며, 이는 그램 음성 세포막의 외막에 대한 표적 모티브를 구성한다.이 지역은 올리고머화에 [6]중요하다.C 말단 도메인은 외부 막에 베타 배럴 모공을 형성하는 데 도움이 됩니다.
YadA단백질구조
YadA는 섬유질 매트릭스의 일부를 구성하는 동질성 외막 단백질이다.간단히 말해서, 이것은 단백질이 막의 바깥 표면에 있는 세 개의 동일한 소단위 중 하나로 이루어져 있다는 것을 의미합니다.표면은 YadA 롤리팝 구조로 완전히 덮여 있습니다. 짧은 C 말단 막 앵커, 18 nm 길이의 코일 코일 스템 및 왼손 평행 베타 롤로 구성된 5 nm 길이의 N 말단 구상 헤드 구조입니다.YadA는 올리고머 코일 접착(Oca)의 한 예이다.Oca 단백질군은 Vc형 또는 삼량체 [1]자동 전달체로도 알려진 자동 전달체의 하위 집합이다.
삼량화에는 코일 코일 스템과 C 말단 막 앵커가 관여하는 것으로 생각되며, C 말단 막 앵커는 3개의 단량체 중 4개의 막 통과 베타 스트랜드인 12 스트랜드 베타 바렐프롬은 3개의 단량체 중 4개의 막간 베타 스트랜드를 형성한다.이 베타배럴은 세 개의 단량체 사슬의 N-말단 헤드와 코일 나선형 도메인이 세포 표면으로 빠져나가는 모공 같은 구조를 형성할 것이다.YadA 단백질 도메인은 삼량체 자동수송체 접착제(TAA)의 한 형태입니다.각 TAA는 머리, 줄기 및 베타 배럴 막 [7]앵커로 구성되어야 합니다.
역사
Yersinia의 접착제인 YadA는 이 제품군의 첫 번째 성분입니다.Moraxella의 UspA2가 2위를 차지했다.대장균의 Eib 면역글로불린 결합 단백질이 3위였고, Hemophilus ducrayi의 DsrA 단백질이 그 뒤를 이었다.
「 」를 참조해 주세요.
레퍼런스
- ^ a b c Casutt-Meyer S, Renzi F, Schmaler M, Jann NJ, Amstutz M, Cornelis GR (2010). "Oligomeric coiled-coil adhesin YadA is a double-edged sword". PLOS ONE. 5 (12): e15159. Bibcode:2010PLoSO...515159C. doi:10.1371/journal.pone.0015159. PMC 2999546. PMID 21170337.
- ^ Thanassi DG (2011). "The long and the short of bacterial adhesion regulation". J Bacteriol. 193 (2): 327–8. doi:10.1128/JB.01345-10. PMC 3019830. PMID 21097622.
- ^ Białas N, Kasperkiewicz K, Radziejewska-Lebrecht J, Skurnik M (2012). "Bacterial cell surface structures in Yersinia enterocolitica". Arch Immunol Ther Exp (Warsz). 60 (3): 199–209. doi:10.1007/s00005-012-0168-z. PMID 22484801. S2CID 10237335.
- ^ Ackermann N, Tiller M, Anding G, Roggenkamp A, Heesemann J (2008). "Contribution of trimeric autotransporter C-terminal domains of oligomeric coiled-coil adhesin (Oca) family members YadA, UspA1, EibA, and Hia to translocation of the YadA passenger domain and virulence of Yersinia enterocolitica". J Bacteriol. 190 (14): 5031–43. doi:10.1128/JB.00161-08. PMC 2447023. PMID 18487327.
- ^ Roggenkamp A, Ackermann N, Jacobi CA, Truelzsch K, Hoffmann H, Heesemann J (2003). "Molecular analysis of transport and oligomerization of the Yersinia enterocolitica adhesin YadA". J Bacteriol. 185 (13): 3735–44. doi:10.1128/jb.185.13.3735-3744.2003. PMC 161578. PMID 12813066.
- ^ Sandt CH, Hill CW (December 2001). "Nonimmune binding of human immunoglobulin A (IgA) and IgG Fc by distinct sequence segments of the EibF cell surface protein of Escherichia coli". Infect. Immun. 69 (12): 7293–303. doi:10.1128/IAI.69.12.7293-7203.2001. PMC 98814. PMID 11705900.
- ^ Lehr U, Schütz M, Oberhettinger P, Ruiz-Perez F, Donald JW, Palmer T, et al. (2010). "C-terminal amino acid residues of the trimeric autotransporter adhesin YadA of Yersinia enterocolitica are decisive for its recognition and assembly by BamA". Mol Microbiol. 78 (4): 932–46. doi:10.1111/j.1365-2958.2010.07377.x. PMID 20815824. S2CID 5647943.
