크산토모나스목

Xanthomonadales
크산토모나스목
Xanthomonas leaf spot.png
크산토모나스 호토룸에 의한 영국 담쟁이덩굴 식물의 잎 자국
과학적 분류 e
도메인: 박테리아
망울: 프로테오박테리아
클래스: 감마프로테오박테리아
순서: 크산토모나스목
가족들
동의어
  • 리소박테랄레스 크리스텐슨과 쿡 1978년

크산토모나달레스는 감마프로테오박테리아 내의 박테리아 주문이다.그들은 크산토모나스 씨트리, 크산토모나스 에우베시케토리아, 크산토모나스 오리지아, 자일라 파스티도오사와 같은 항구의 가장 큰 박테리아 식물성 동물군 중 하나이다.[1][2][3][4][5]이 박테리아는 토마토, 바나나, 감귤류, 쌀, 커피를 포함한 농업적으로 중요한 식물들에 영향을 미친다.그 질서 안에 있는 많은 종들도 인간의 병원균이다.스테노트로포모나스속 내 종은 면역 결핍증 환자의 항원성 감염을 담당하는 다의류 내성 기회주의 병원균이다.[6][7]

특성.

크산토모나달레스는 그램 음성, 카탈라아제 양성, 비스포어성 에어로브를 형성한다.[8]순서에 속하는 멤버는 전립선이 부족한 직선봉이다.어떤 회원들은 운동성이 없는 반면, 그 안에 있는 다른 종들은 플라겔라를 이용하여 운동성이 있다.스테노트로포모나스속은 크산토모나달레스 내에서 질산염을 줄일 수 있는 유일한 속이다.

분류학

크산토모나달레스는 크산토모나스과와 로다노박테라과 등 두 가족 중에서 28개의 유효한 이름이 있는 [9][10][11]제네라로다노박테리아과크산토모나스과는 13세대로, 로다노박테리아과는 14세대로 구성되어 있다.각각의 가족에 특정한 다양한 단백질들 사이에서 발견된 보존된 서명 인델에 기초하여 그 가족은 서로 구별될 수 있다.[10]이들 인델은 진화론적으로 분화된 것으로 보이는 두 개의 뚜렷한 집단을 드러내는 친족학적 분석과 병행된다.리소박테랄레스과와 리소박테르과는 각각 크산토모나달레스과와 크산토모나르과의 초기 동의어다.[10][12]

계통학적 위치

크산토모나달레스는 감마프로테오박테리아 내 박테리아의 초기 분화물로, 클래스를 위해 만들어진 계통생성 나무를 뿌리 뽑는데 종종 사용된다.[13]최근까지 크산토모노다일스주문에는 크산토모나스과, 알지필라과, 솔리모나드과, 네브스키아과, 시노박테라과 등이 포함되어 있었다.그러나 모든 가문을 포함하는 분자서명은 발견되지 않았다.[10]이 유기체는 크산토모나달레스가 크산토모나달레스를 포함할 정도로 분류학적으로 재배열되었고, 이후 두 패밀리로 나뉘었다.이 중분류는 크산토모나달레스 주문의 모든 멤버를 위해 특별히 발견된 CSI에 따른 것으로, 현재 승인된 분류법에 대한 지원을 제공했다.다른 모든 종들은 크산토모나달레스와 CSI를 공유하지 않고 감마프로테오박테리아 내 가까운 친척으로 남아 있는 네브시알레스로 옮겨졌다.[10]심장박테리알레스, 크로마티알레스, 메틸로코칼레스, 레지오넬랄레스, 티오트리히알레스도 크산토마날레스와 네브시알레스 구성원의 혈전 인접인 깊은 분기 주문이다.[10][13]네브시알레스코페르과(Salinisphaerae)의 순서는 단족(Salinisphaerae)과 6개의 제네라: 알카니박터, 폰티모나스, 탄화수소iphaga, 네브스키아, 솔리모나스, 스테로이도박터.[10]볼파흐르티아모나스 치티니클라스타와 이그나츠치니아 유충은 역사적으로 크산토모나스과의 일원으로 받아들여진 두 종이다.그러나 그들은 보존된 서명을 가족과 공유하거나 크산토모노달레스 명령과 공유하지 않는다.[10]이 종들은 인접한 감마프로테오박테리아 내에서 깊은 분지를 형성하며, Cardyobacteriales 구성원과 함께 단구성을 가지고 있다.그래서 이 종들은 현재 인서태 세디스로 불린다.

필로제니

현재 승인된 분류법은 국립생명공학정보센터(NCBI)에 근거한다.[9]

참조

  1. ^ da Silva AC, Ferro JA, Reinach FC, et al. (2002). "Comparison of the genomes of two Xanthomonas pathogens with differing host specificities". Nature. 417 (6887): 459–463. doi:10.1038/417459a. PMID 12024217.
  2. ^ Van Sluys MA, de Oliveira MC, Monteiro-Vitorello CB, et al. (2003). "Comparative analyses of the complete genome sequences of Pierce's disease and citrus variegated chlorosis strains of Xylella fastidiosa". J Bacteriol. 185 (3): 1018–26. doi:10.1128/JB.185.3.1018-1026.2003. PMC 142809. PMID 12533478.
  3. ^ Lee BM, Park YJ, Park DS, et al. (2005). "The genome sequence of Xanthomonas oryzae pathovar oryzae KACC10331, the bacterial blight pathogen of rice". Nucleic Acids Res. 33 (2): 577–586. doi:10.1093/nar/gki206. PMC 548351. PMID 15673718.
  4. ^ Ryan RP, Vorholter F, Potnis N, et al. (2005). "Pathogenomics of Xanthomonas: understanding bacterium–plant interactions". Nat Rev Microbiol. 9 (5): 344–355. doi:10.1038/nrmicro2558. PMID 21478901.
  5. ^ Chen J, Xie G, Han S, Chertkov O, Sims D, Civerolo EL (2010). "Whole genome sequences of two Xylella fastidiosa strains (M12 and M23) causing almond leaf scorch disease in California". J Bacteriol. 192 (17): 4534. doi:10.1128/JB.00651-10. PMC 2937377. PMID 20601474.
  6. ^ Crossman LC, Gould VC, Dow JM, et al. (2008). "The complete genome, comparative and functional analysis of Stenotrophomonas maltophilia reveals an organism heavily shielded by drug resistance determinants". Genome Biol. 9 (4): R74. doi:10.1186/gb-2008-9-4-r74. PMC 2643945. PMID 18419807.
  7. ^ Looney WJ, Narita M, Mühlemann K (2009). "Stenotrophomonas maltophilia: an emerging opportunist human pathogen". Lancet Infect Dis. 9 (5): 312–323. doi:10.1016/S1473-3099(09)70083-0. PMID 19393961.
  8. ^ 새들러 GS, 브래드베리 JF(2005) 주문 III. 크산토모나달레스 서드 11월본문: Bergey의 체계적 세균학 설명서 63-122페이지.Eds Brendner DJ, Krieg NR, Steiny JT, Garrity GM, Boone, Vos P, Goodfellow M, Rainey FA, Schleifer K-H Springer-: 오스틴.
  9. ^ a b Sayers; et al. "Xanthomonadales". National Center for Biotechnology Information (NCBI) taxonomy database. Retrieved 2016-10-24.
  10. ^ a b c d e f g h Naushad S, Adeolu M, Wong S, Sohail M, Schellhorn HE, Gupta RS (2015). "A phylogenomic and molecular marker based taxonomic framework for the order Xanthomonadales: proposal to transfer the families Algiphilaceae and Solimonadaceae to the order Nevskiales ord. nov. and to create a new family within the order Xanthomonadales, the family Rhodanobacteraceae fam. nov., containing the genus Rhodanobacter and its closest relatives". Antonie van Leeuwenhoek. 107 (2): 467–485. doi:10.1007/s10482-014-0344-8. PMID 25481407.
  11. ^ Oren A, Garrity GM (2015). "List of new names and new combinations previously effectively, but not validly, published". Int J Syst Evol Microbiol. 65 (7): 2017–2025. doi:10.1099/ijs.0.000317.
  12. ^ Christensen P, Cook F (1978). "Lysobacter, a New Genus of Nonfruiting, Gliding Bacteria with a High Base Ratio". Int J Syst Evol Microbiol. 28 (3): 367–393. doi:10.1099/00207713-28-3-367.
  13. ^ a b Cutiño-Jiménez AM, Martins-Pinheiro M, Lima WC, Martín-Tornet A, Morales OG, Menck CF (2010). "Evolutionary placement of Xanthomonadales based on conserved protein signature sequences". Mol Phylogenet Evol. 54 (2): 524–34. doi:10.1016/j.ympev.2009.09.026. PMID 19786109.