SLX4IP
SLX4IP| SLX4IP | |||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 식별자 | |||||||||||||||||||||||||
| 에일리어스 | SLX4IP, C20orf94, bA204H22.1, bA254M13.1, dJ1099D15.3, SLX4상호작용단백질 | ||||||||||||||||||||||||
| 외부 ID | OMIM: 615958 MGI: 1921493 HomoloGene: 49913 GeneCard: SLX4IP | ||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| 맞춤법 | |||||||||||||||||||||||||
| 종. | 인간 | 마우스 | |||||||||||||||||||||||
| 엔트레즈 | |||||||||||||||||||||||||
| 앙상블 | |||||||||||||||||||||||||
| 유니프로트 | |||||||||||||||||||||||||
| RefSeq(mRNA) |
| ||||||||||||||||||||||||
| RefSeq(단백질) |
| ||||||||||||||||||||||||
| 장소(UCSC) | Chr 20: 10.44 ~10.64 Mb | Chr 2: 136.73 ~136.91 Mb | |||||||||||||||||||||||
| PubMed 검색 | [3] | [4] | |||||||||||||||||||||||
| 위키데이터 | |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
SLX4 상호 작용 단백질은 SLX4에 의해 인간에게 암호화되는 단백질이다.IP [5]유전자
기능.
SLX4 인터랙티브 단백질(SLX4IP)은 단량체 형태로 존재하며, SLX4-XPF-ERCC1 다단백질 복합체와 상호작용하며, 이는 DNA 수복 [6]및 유지의 역할에서 홀리데이 접합 분해효소의 조립을 담당한다.
SLX4IP는 여러 다른 DNA 구조 특이적 엔도핵산 [7]분해효소의 배위에 역할을 하는 SLX4 단백질의 N 말단과 직접 상호작용하는 것으로 나타났다.
SLX4IP는 또한 SLX4, BLM 및 XPF [8]단백질과의 상호작용과 축적을 통해 텔로미어의 대체 신장 조절에 관여하는 것으로 나타났다.
장소와 식
SLX4IP 유전자는 염색체 20의 짧은 팔(p)의 위치 12.2(20p12.2)[9]에 위치한다.인간 SLX4IP 유전자는 14개의 엑손(exon)을 포함하며, cDNA는 플러스 [9]가닥에 배치된 204,000개의 염기쌍입니다.이것은 분자량이 45,[10]552 달톤인 408개의 아미노산 단백질을 코드화한다.
SLX4의 호몰로그IP 유전자는 쥐, 개구리, 닭, 개, 붉은털원숭이,[11] 침팬지 등 인간이 아닌 여러 종에서 보존된 것으로 밝혀졌다.인간 SLX4용 맞춤법IP 유전자는 283개의 다른 [11]유기체에서도 확인되었다.
SLX4IP 단백질은 피부와 고환에서 가장 높은 수준으로 발현되며, 26개의 다른 [12]조직에서도 발현된다.
임상적 의의
암
급성림프아구성백혈병
SLX4의 5' 영역의 체세포 및 모노알렐 결실IP는 소아 급성 림프아구성 백혈병(ALL) 환자의 30%에서 발생하는 것으로 나타났으며, ETV6/RUNX1 재배열 급성 림프아구성 백혈병의 경우 60% [13]이상의 사례에서 결실이 발견되었다.SLX4IP의 브레이크포인트를 분석함으로써 특징적인 부정한 V(D)J 매개 재조합이 밝혀졌다.[13]이러한 결실은 [13]남성에게 상당히 치우친 것으로 밝혀졌다.
텔로미어의 대체 연장
암세포가 제한 없이 증식하는 능력을 유지하기 위해, 그들은 대체 텔로미어 연장(ALT)[14]으로 알려진 과정을 통해 재조합함으로써 염색체의 텔로미어를 조절할 수 있다.이 재조합은 SLX4의 축적을 필요로 하는 것으로 나타났다.무차별 BLM [8]액티비티의 길항화로 인해 ALT 텔로미어의 IP.BLM은 상동 재조합과 DNA [15]복제에 필수적인 RecQ 헬리케이스이기 때문에 텔로미어의 확장에 책임이 있다.
스트랜드간 크로스링크 복구
DNA에서 ICL(Interstrand Crosslinks)은 높은 독성으로 인해 종종 판코니 [16]빈혈과 같은 질병으로 이어지기 때문에 수리가 필요하다.SLX4IP는 SLX4와 XPF-ERCC1의 동시 바인딩을 통해 SLX4와 XPF-ERCC1의 안정성을 유지하고 SLX4와 XPF-1의 상호 작용을 [6][17]촉진하기 때문에 SLX4-ERCC1의 ICL 복구 기능에 관여합니다.SLX4의 경우처리된 세포에서 IP가 고갈되었으며, ICL 복구 시 홀리데이 접합부 분해능이 정기적으로 [17][18]발생하는 세포 주기의 G2/M 단계에서 축적되는 것으로 확인되었다.
HIV-1
HIV-1 보조단백질 Vpr은 G2/M 전환단계에서 [19]자연주기를 통해 숙주세포의 진행을 강력하게 막는다.이 중단은 SLX4 구조 특이적 핵산가수분해효소 복합체의 조기 활성화로 인해 발생한 것으로 밝혀졌다.IP는 [20]와 직접 대화합니다.이 연구를 통해 SLX4 복합체는 또한 자연유도 및 HIV-1 [20]매개체 모두에서 타입 1 간섭자 생성에 대한 음성 조절 때문에 선천성 면역 조절에 관여하는 것으로 밝혀졌다.
레퍼런스
- ^ a b c GRCh38: 앙상블 릴리즈 89: ENSG00000149346 - 앙상블, 2017년 5월
- ^ a b c GRCm38: 앙상블 릴리즈 89: ENSMUSG000027281 - 앙상블, 2017년 5월
- ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
- ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
- ^ "Entrez Gene: SLX4 interacting protein".
- ^ a b Svendsen JM, Smogorzewska A, Sowa ME, O'Connell BC, Gygi SP, Elledge SJ, Harper JW (July 2009). "Mammalian BTBD12/SLX4 assembles a Holliday junction resolvase and is required for DNA repair". Cell. 138 (1): 63–77. doi:10.1016/j.cell.2009.06.030. PMC 2720686. PMID 19596235.
- ^ Fekairi S, Scaglione S, Chahwan C, Taylor ER, Tissier A, Coulon S, et al. (July 2009). "Human SLX4 is a Holliday junction resolvase subunit that binds multiple DNA repair/recombination endonucleases". Cell. 138 (1): 78–89. doi:10.1016/j.cell.2009.06.029. PMC 2861413. PMID 19596236.
- ^ a b Panier S, Maric M, Hewitt G, Mason-Osann E, Gali H, Dai A, et al. (October 2019). "SLX4IP Antagonizes Promiscuous BLM Activity during ALT Maintenance". Molecular Cell. 76 (1): 27–43.e11. doi:10.1016/j.molcel.2019.07.010. PMC 6863466. PMID 31447390.
- ^ a b "SLX4IP SLX4 interacting protein [Homo sapiens (human)] - Gene - NCBI". www.ncbi.nlm.nih.gov. Retrieved 2019-10-31.
- ^ "SLX4IP - Protein SLX4IP - Homo sapiens (Human) - SLX4IP gene & protein". www.uniprot.org. Retrieved 2019-10-31.
- ^ a b "Gene: SLX4IP (ENSG00000149346) - Summary - Homo sapiens - Ensembl genome browser 98". asia.ensembl.org. Retrieved 2019-10-31.
- ^ Fagerberg L, Hallström BM, Oksvold P, Kampf C, Djureinovic D, Odeberg J, et al. (February 2014). "Analysis of the human tissue-specific expression by genome-wide integration of transcriptomics and antibody-based proteomics". Molecular & Cellular Proteomics. 13 (2): 397–406. doi:10.1074/mcp.M113.035600. PMC 3916642. PMID 24309898.
- ^ a b c Meissner B, Bartram T, Eckert C, Trka J, Panzer-Grümayer R, Hermanova I, et al. (February 2014). "Frequent and sex-biased deletion of SLX4IP by illegitimate V(D)J-mediated recombination in childhood acute lymphoblastic leukemia". Human Molecular Genetics. 23 (3): 590–601. doi:10.1093/hmg/ddt447. PMID 24045615.
- ^ Bryan TM, Englezou A, Dalla-Pozza L, Dunham MA, Reddel RR (November 1997). "Evidence for an alternative mechanism for maintaining telomere length in human tumors and tumor-derived cell lines". Nature Medicine. 3 (11): 1271–4. doi:10.1038/nm1197-1271. PMID 9359704. S2CID 10220776.
- ^ Bhattacharyya S, Keirsey J, Russell B, Kavecansky J, Lillard-Wetherell K, Tahmaseb K, et al. (May 2009). "Telomerase-associated protein 1, HSP90, and topoisomerase IIalpha associate directly with the BLM helicase in immortalized cells using ALT and modulate its helicase activity using telomeric DNA substrates". The Journal of Biological Chemistry. 284 (22): 14966–77. doi:10.1074/jbc.m900195200. PMC 2685679. PMID 19329795.
- ^ Hashimoto S, Anai H, Hanada K (2016-05-01). "Mechanisms of interstrand DNA crosslink repair and human disorders". Genes and Environment. 38 (1): 9. doi:10.1186/s41021-016-0037-9. PMC 4918140. PMID 27350828.
- ^ a b Zhang H, Chen Z, Ye Y, Ye Z, Cao D, Xiong Y, et al. (November 2019). "SLX4IP acts with SLX4 and XPF-ERCC1 to promote interstrand crosslink repair". Nucleic Acids Research. 47 (19): 10181–10201. doi:10.1093/nar/gkz769. PMC 6821277. PMID 31495888.
- ^ McHugh PJ, Sarkar S (May 2006). "DNA interstrand cross-link repair in the cell cycle: a critical role for polymerase zeta in G1 phase". Cell Cycle. 5 (10): 1044–7. doi:10.4161/cc.5.10.2763. PMID 16687932.
- ^ Connor RI, Chen BK, Choe S, Landau NR (February 1995). "Vpr is required for efficient replication of human immunodeficiency virus type-1 in mononuclear phagocytes". Virology. 206 (2): 935–44. doi:10.1006/viro.1995.1016. PMID 7531918.
- ^ a b Laguette N, Brégnard C, Hue P, Basbous J, Yatim A, Larroque M, et al. (January 2014). "Premature activation of the SLX4 complex by Vpr promotes G2/M arrest and escape from innate immune sensing". Cell. 156 (1–2): 134–45. doi:10.1016/j.cell.2013.12.011. PMID 24412650.
추가 정보
- Svendsen JM, Smogorzewska A, Sowa ME, O'Connell BC, Gygi SP, Elledge SJ, Harper JW (July 2009). "Mammalian BTBD12/SLX4 assembles a Holliday junction resolvase and is required for DNA repair". Cell. 138 (1): 63–77. doi:10.1016/j.cell.2009.06.030. PMC 2720686. PMID 19596235.
- Ghosal G, Leung JW, Nair BC, Fong KW, Chen J (October 2012). "Proliferating cell nuclear antigen (PCNA)-binding protein C1orf124 is a regulator of translesion synthesis". The Journal of Biological Chemistry. 287 (41): 34225–33. doi:10.1074/jbc.M112.400135. PMC 3464530. PMID 22902628.
- Warnatz HJ, Schmidt D, Manke T, Piccini I, Sultan M, Borodina T, et al. (July 2011). "The BTB and CNC homology 1 (BACH1) target genes are involved in the oxidative stress response and in control of the cell cycle". The Journal of Biological Chemistry. 286 (26): 23521–32. doi:10.1074/jbc.M111.220178. PMC 3123115. PMID 21555518.
