SLBP

SLBP
SLBP
Crystal structure of the histone mRNA stem-loop, human stem-loop binding protein and 3′hExo ternary complex.png
사용 가능한 구조물
PDB직교 검색: PDBe RCSB
식별자
별칭SLBP, HBP, 줄기-루프 결합 단백질
외부 IDOMIM: 602422 MGI: 108402 HomoloGene: 31389 GeneCard: SLBP
직교체
인간마우스
엔트레스
앙상블
유니프로트
RefSeq(mRNA)

NM_001306074
NM_001306075
NM_006527

NM_001289724
NM_001289725
NM_009193

RefSeq(단백질)

NP_001293003
NP_001293004
NP_006518
NP_006518.1

NP_001276653
NP_001276654
NP_033219

위치(UCSC)Chr 4: 1.69 – 1.71MbCr 5: 33.79 – 33.81Mb
PubMed 검색[3][4]
위키다타
인간 보기/편집마우스 보기/편집

히스톤 RNA 헤어핀 결합 단백질 또는 스템 루프 결합 단백질(SLBP)은 인간에서 SLBP 유전자에 의해 인코딩되는 단백질이다.[5][6][7]

종 분포

SLBP는 인간, C. 엘레간, D. 멜라노가스터, X. 레비스, 성게에서 복제되었다.인간 전장단백질에는 270개의 아미노산(31kDa)이 있으며 RBD(RNA Binding Domain)가 중앙에 위치한다.75개의 아미노산 RBD는 종에 걸쳐 잘 보존되어 있지만, 나머지 SLBP는 대부분의 유기체에서 매우 다양하며 진핵 게놈의 다른 단백질과 균질하지 않다.

함수

이 유전자는 복제에 의존하는 히스톤 mRNA에서 히스톤 3의 UTR 줄기-루프 구조에 결합하는 단백질을 암호화한다.히스톤 mRNA는 인트론이나 폴리아데닐화 신호를 포함하지 않으며, 줄기-루프 다운스트림 하류에서 단일 내핵 분열성 이벤트에 의해 처리된다.스템 루프 구조는 히스톤 프리 mRNA의 효율적인 처리를 위해 필수적이지만 이 구조는 히스톤 mRNA의 전송, 번역 및 안정성을 제어한다.SLBP 표현은 셀 사이클의 S상 동안 조절되며 G1의 후반부에 10배 이상 증가한다.

모든 SLBP 단백질은 히스톤 줄기-루프 RNA로 매우 안정적인 콤플렉스를 형성할 수 있다. 히스톤 mRNA 줄기-루프를 가진 복합형성은 신기한 3헥스 묶음 접힘으로 이루어진다.또한 SLBP 단백질은 히스톤 헤어핀의 4각형 구조, 줄기의 밑부분, 그리고 5' 옆구리 부분을 인식한다.인간 SLBP의 결정 구조는 줄기-루프 RNA뿐만 아니라 엑소누클리스 Eri1과 복잡하게 얽혀있으며, SLBP의 Arg181 잔여물은 RNA 줄기의 두 번째 구아닌 베이스와 특별히 상호작용을 한다는 것을 보여준다.[8]나머지 단백질은 본질적으로 사람뿐만 아니라 과일파리에서도 분열을 일으킨다.SLBP RBD의 독특한 특징은 그것이 그것의 RNA 결합 영역에서 Thr171 잔여물에서 인산염화된다는 것이다.또한 SLBP RBD는 이 염기서열에 대해 직선 이등분화를 거치며 프롤릴 이등분효소 핀1의 기질이다.인간 SLBP의 N단자 영역은 SLIP1과의 상호작용을 통한 히스톤 mRNA의 번역 활성화를 위해 필요하다.또한 SLBP는 히스톤 mRNA의 빠른 저하를 촉진하기 위해 CBP80 관련 단백질 CTIF와 상호작용한다.SLBP는 인산단백질이며, T171 이외에도 포유류 세포에서 Ser7, Ser20, Ser23, Thr60, Thr61에서 인산염화된다.Thr60에서 인산염은 CK2에 의해 매개되고 Thr61은 Cyclin A/Cdk1에 의해 매개된다.[7]

참조

  1. ^ a b c GRCh38: 앙상블 릴리스 89: ENSG00000163950 - 앙상블, 2017년 5월
  2. ^ a b c GRCm38: 앙상블 릴리스 89: ENSMUSG00000004642 - 앙상블, 2017년 5월
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ Martin F, Schaller A, Eglite S, Schumperli D, Muller B (Mar 1997). "The gene for histone RNA hairpin binding protein is located on human chromosome 4 and encodes a novel type of RNA binding protein". EMBO J. 16 (4): 769–78. doi:10.1093/emboj/16.4.769. PMC 1169678. PMID 9049306.
  6. ^ McCombie WR, Martin-Gallardo A, Gocayne JD, FitzGerald M, Dubnick M, Kelley JM, Castilla L, Liu LI, Wallace S, Trapp S (August 1992). "Expressed genes, Alu repeats and polymorphisms in cosmids sequenced from chromosome 4p16.3". Nature Genetics. 1 (5): 348–53. doi:10.1038/ng0892-348. PMID 1338771. S2CID 6716635.
  7. ^ a b "Entrez Gene: SLBP stem-loop (histone) binding protein".
  8. ^ Dazhi Tan; William F. Marzluff; Zbigniew Dominski; Liang Tong (Jan 2013). "Structure of Histone mRNA Stem-Loop, Human Stem-Loop Binding Protein, and 3′hExo Ternary Complex". Science. 339 (6117): 318–321. doi:10.1126/science.1228705. PMC 3552377. PMID 23329046.

추가 읽기