파디4

파디4
사용 가능한 구조물
PDB	직교 검색: PDBe RCSB
PDB ID 코드 목록
	1WD8, 1WD9, 1WDA, 2DEW, 2DEX, 2DEY, 2DW5, 3APM, 3APN, 3B1T, 3B1U, 4X8C, 4X8G
식별자
별칭	PADI4, PAD4, PADI5, PDI4, PDI5, 펩티딜 아르기닌 디미노아제 4
외부 ID	OMIM: 605347 MGI: 1338898 호몰로진: 7883 GeneCard: PADI4
EC 번호	3.5.3.15
유전자 위치(인간)
쳇.	염색체 1 (인간)
끝	17,364,004 bp
유전자 위치(마우스)
쳇.	4번 염색체(쥐)
끝	140,501,547 bp
RNA 표현 패턴
	표현된 상단
	핏덩어리; ; 골수; ; 골수 세포; ; 단모세포; ; 비장의; ; 좌측 폐 상부엽; ; 오른쪽 폐; ; 간 우엽; ; 담낭; ; 매끄러운 근육 조직;
	추가 참조 표현식 데이터
	; ; ; ;
	추가 참조 표현식 데이터
유전자 온톨로지
분자함수	금속 이온 결합; 아르기닌 탈소 활동; GO:0001948 단백질 결합; 수산화효소 활동; 단백질-아르기닌 디미노아제 활동; 칼슘 이온 결합; 아르기닌 제본; 단백질 호모디메르화 활동;
셀룰러 컴포넌트	핵종의; 핵의; 시토솔; 세포질; 단백질 함유 복합체;
생물학적 과정	염색질 리모델링; 뉴클레오솜 조립체; 전사 규정, DNA-템플링; 면역 체계 과정; 히스톤 H3-R26 시추; 전사, DNA-템플릿; 줄기세포 인구 유지; 히스톤 시추; 세포 단백질 수정 과정; 선천적인 면역 반응; 염색질 조직; 단백질 도태; 아르기닌데미나제길;
	출처:아미고 / 퀵고
직교체
	23569
	18602
	ENSG00000280908; ENSG00000159339
	ENSMUSG00000025330
	Q9UM07
	Q9Z183
	NM_012387
	NM_011061
	NP_036519
	NP_035191
	위키다타
인간 보기/편집	마우스 보기/편집

단백질-arginine deminase 타입-4는 인간에게 PADI4 유전자에 의해 암호화된 인간 단백질이다.^[5]^[6]효소로서의 단백질, 특히 하이드롤라제의 일종인 단백질-아르기닌 디미노아제.

분자생물학

인간의 유전자는 텔로미어(1p36.13) 근처의 염색체 1의 짧은 팔에서 발견된다.왓슨(플러스) 가닥에 위치하며, 길이는 55,806베이스다.단백질은 663개의 아미노산이고 분자량은 74,095 Da이다.^[5]

함수

이 유전자는 아르기닌의 시트라울린 잔류물(시끌린)으로의 변환을 담당하는 효소를 인코딩하는 유전자 계열의 일원이다.이 유전자는 염증과 면역 반응을 유발하는 과립세포와 대식세포 발달에 역할을 할 수 있다.^[6]PADI4는 후생유전학에서 역할을 하는데 히스톤 H3와 H4에서 아르기닌의 디이미징은 아르기닌 메틸화에 대항하여 작용할 수 있다.^[7]

이 단백질은 과점체에서 발견될 수 있으며 서브 유닛당 5개의 칼슘 이온을 결합한다.그것은 다음과 같은 반응을 촉진한다.

단백질 L-arginine + HO₂ = 단백질 L-시끌린 + NH₃

아세포 및 조직 분포

그것은 보통 세포질, 핵 그리고 어시노필과 중성미자의 세포질 과립에서 발견된다.말초 단세포나 림프구에서는 표현되지 않는다.류머티즘성 관절염 시뉴브랄 조직에서도 발현된다.

참조

^ ^a ^b ^c ENSG00000159339 GRCh38: 앙상블 릴리스 89: ENSG00000280908, ENSG00000159339 - 앙상블, 2017년 5월
^ ^a ^b ^c GRCm38: 앙상블 릴리스 89: ENSMUSG000025330 - 앙상블, 2017년 5월
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^ ^a ^b "Entrez Gene: PADI4 peptidyl arginine deiminase, type IV".
^ Kouzarides (2007). "Chromatin modifications and their function". Cell. doi:10.1016/j.cell.2007.02.005.

추가 읽기

Nakashima K, Hagiwara T, Ishigami A, et al. (1999). "Molecular characterization of peptidylarginine deiminase in HL-60 cells induced by retinoic acid and 1alpha,25-dihydroxyvitamin D(3)". J. Biol. Chem. 274 (39): 27786–92. doi:10.1074/jbc.274.39.27786. PMID 10488123.
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[refGRCh38Ensembl-1] ENSG00000159339 GRCh38: 앙상블 릴리스 89: ENSG00000280908, ENSG00000159339 - 앙상블, 2017년 5월

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: 앙상블 릴리스 89: ENSMUSG000025330 - 앙상블, 2017년 5월

[3] "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.

[4] "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.

[pmid10488123-5] Nakashima K, Hagiwara T, Ishigami A, Nagata S, Asaga H, Kuramoto M, Senshu T, Yamada M (September 1999). "Molecular characterization of peptidylarginine deiminase in HL-60 cells induced by retinoic acid and 1alpha,25-dihydroxyvitamin D(3)". J. Biol. Chem. 274 (39): 27786–92. doi:10.1074/jbc.274.39.27786. PMID 10488123.

[entrez-6] "Entrez Gene: PADI4 peptidyl arginine deiminase, type IV".

[7] Kouzarides (2007). "Chromatin modifications and their function". Cell. doi:10.1016/j.cell.2007.02.005.

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