난모세포 가설

Eocyte hypothesis
카료타
Urzwerg.jpg
이그니코쿠스 병원( 그 공생동물인 나노카르카에움 등각류)
과학적 분류
도메인:
(랭킹되지 않음):
카료타

1988년[1] 호수 등
도메인 & 레지넘
동의어
  • 원핵군
  • 카리오테스

난모세포 가설진핵생물원핵생물크레나카게오타(옛날에는 난모세포로 알려져 있다) 내에서 출현했음을 나타내는 생물학적 분류다. 이 가설은 원래 제임스 A에 의해 제안되었다. 1984년 크레나카게오타와 진핵생물에서 리보솜모양이 박테리아나 제2의 주요 골문인 에우리카게오타보다 서로 더 유사하다는 발견을 바탕으로 호수와 동료들이 함께한 것이다.[2][3]

도식 표현

소개

난세포 가설은 진핵세포의 기원을 판별하는 관심 때문에 도입 후 상당한 주목을 받았다. 이 가설은 주로 1977년워즈가 도입한 3도메인 제도와 대조적이었다. 난소세포 가설을 뒷받침하는 추가 증거가 1980년대에 발표되었지만, 상당히 명백한 증거에도 불구하고, 3개 영역 시스템에 대한 지지도가 떨어졌다.[1][2]

게놈의 진보

유전체학의 발달과 함께, 난세포 가설은 2000년대 중반부터 부활을 경험했다. 더 많은 고고학적 게놈의 서열을 정립함에 따라, 진핵 형질을 위한 수많은 유전자 코딩이 다양한 고고학적 필라에서 발견되어, 외견상으로는 난세포 가설을 뒷받침해 주고 있다. 프로테오믹스에 기반한 연구는 또한 진핵과 고고학적 선 사이의 구조적 동질감을 비교하기 위해 일반적인 하우스키핑 단백질인 신장 계수 1-α(eEF-1)를 사용한 지원 데이터를 발견했다.[4] 게다가, 다른 단백질들은 진핵생물과 고고학 모두에서 발견되는 열충격 단백질에 있는 동음이의 구조를 가진 단백질학으로 배열되었다. 이러한 열충격 단백질의 구조는 X선 결정학을 통해 확인되어 단백질의 3차원 구조를 찾아냈다.[5] 그러나 eukaryote 열충격 단백질은 T-complex의 일부인 반면, 고고학적 열충격 단백질은 분자 샤페론이기 때문에 이 단백질들은 다른 목적을 가지고 있다.[5] 이는 진핵생물에서 70 킬로달톤 열충격 단백질과 그램 음성 박테리아 사이에서 관찰된 일련의 동질학에 문제를 일으킨다.[6]

연구

진핵생물의 크레나카게알 기원에 더해 진핵생물이 타우마카게오타에서도 기원했을 수 있다는 일부 연구결과가 나왔다.[2][7][8][9][10]

Taumarchaeota, Crenarchaeota 및 기타 고고학 그룹을 포함하는 수퍼필럼(TACK)이 제안되어 이 슈퍼필럼이 진핵생물의 출처와 관련이 있을 수 있다.[11] 진핵생물은 TACK 슈퍼필름의 구성원과 많은 양의 단백질을 공유하고 있으며, 이러한 복잡한 고고학은 박테리아를 집어삼킬 수 있는 초보적인 혈소판감소증 능력을 가지고 있었을 것으로 보인다.[12]

열수 분출구 근처에서 발견된 물질에 대한 메타게놈 분석 결과, 또 다른 슈퍼필룸인 아스가르드가 더 최근에 원래의 진핵생물 및 TACK에 자매그룹과 더 밀접하게 연관되어 있다고 명명되고 제안되었다. 아스가르드는 필라 로키아카게오타(먼저 발견), 헤임달라카게오타(eukaryotes와 가장 가까운 관계일 가능성이 있음) 등으로 구성되어 있다.[13][14]

난모세포 나무 뿌리

난세포 나무 뿌리는 RNA 세계에 위치할지도 모른다; 즉, 그 뿌리 유기체는 리보세포(리보세포라고도 한다)였을지도 모른다. 세포 DNA와 DNA 취급의 경우, DNA에 유전 정보를 저장하는 것이 바이러스에 의해 수행된 혁신일 수 있고 나중에 리브모세포에 두 번 넘겨준 후 박테리아로 변형하고 한 번은 고대로 변형시키는 "바이러스 퇴치" 시나리오가 제안되었다.[15][16]

고고 바이러스는 박테리아 페이징만큼 잘 연구되지는 않지만, dsDNA 바이러스가 바이러스 게놈을 고고 게놈에 접목시킨 것으로 생각된다.[17] 바이러스 벡터를 통한 유전 물질의 전도는 진핵 전세포의 복잡성을 증가시켰다.[18] 이 모든 발견은 원칙적으로 여기 주어진 것과 같은 난모세포 나무를 변화시키지 않고, 보다 높은 분해능을 검사한다.

에 대한 주장

진핵생물들과 고고학과 박테리아 둘 다에서 발견되는 유사성 때문에, 유전적 변동의 주요 원인은 수평적 유전자 전이를 통해서라고 생각된다.[19] 수평 유전자 전달은 왜 고고학적 서열이 박테리아에서 발견되고 박테리아 서열이 고고학에서 발견되는지를 설명한다.[19] 이것은 왜 고고학과 진핵생물에서 발견되는 신장 인자가 그렇게 유사한지 설명할 수 있고, 현재 나온 데이터는 수평 유전자 전이, 수직 유전자 전이 또는 내시경 검사로 가려지고 유전자 배열 유사성의 배후에 있을 수 있다.[6] 난소세포 가설은 또한 내분비생물학 이론으로 인해 문제를 일으키는데, 고고자는 막에 묶인 오르간세포 형성을 위해 박테리아를 포고시화시킬 수 있다.[20] 이러한 조상 원핵생물들이 다른 원핵생물들과 친생관계를 가지기 시작했고 세포막 돌기를 통해 점차적으로 이들 공생물을 삼켜버렸다고 생각된다.[21]

보다 최근의 데이터는 신장 인자 분석을 통해 진핵생물과 크레나카에오타 사이의 관계에 유리한 증거를 제공하지만, 초기에는 신장 인자를 사용한 실험이 그러한 관계에 대한 증거를 제공했다.[22] 하세가와 외 진핵생물과 고고학박테리아가 이 두 나무 체계에서 설명되는 것보다 고고학박테리아와 진박테리아보다 더 밀접하게 연관되어 있다는 것을 보여주기 위해 이러한 신장 요인을 사용한다.[22]

경쟁 가설

경쟁 가설은 원핵생물이 열유도 가설을 통해 바이러스를 피하기 위해 고온에서 번성하는 방향으로 진화했다는 것이지만, 이는 진핵생물의 발생을 설명하지 않고 원핵생물의 기원만을 고려하는 것이다.[23] 그러나 더 복잡한 기원에서의 복잡성의 감소는 평등한 관계가 일어나는 환원적 진화의 기초가 되는 반면, 열전도 가설에서 설명하는 이러한 감소는 바이러스와의 기생적 관계를 사용하여 복잡한 진핵 전 원소의 이동을 더 가혹한 환경으로 설명하며, 그것이 해저 수산화물이라는 것이다.암막 [24]환풍구

참조

  1. ^ a b Lake, James A. (1988). "Origin of the eukaryotic nucleus determined by rate-invariant analysis of rRNA sequences". Nature. 331 (6152): 184–186. Bibcode:1988Natur.331..184L. doi:10.1038/331184a0. PMID 3340165. S2CID 4368082.
  2. ^ a b c Archibald, John M. (23 December 2008). "The eocyte hypothesis and the origin of eukaryotic cells". PNAS. 105 (51): 20049–20050. Bibcode:2008PNAS..10520049A. doi:10.1073/pnas.0811118106. PMC 2629348. PMID 19091952.
  3. ^ Lake, James A.; Henderson, Eric; Oakes, Melanie; Clark, Michael W. (June 1984). "Eocytes: A new ribosome structure indicates a kingdom with a close relationship to eukaryotes". PNAS. 81 (12): 3786–3790. Bibcode:1984PNAS...81.3786L. doi:10.1073/pnas.81.12.3786. PMC 345305. PMID 6587394.
  4. ^ Roger, A; Sandblom, O; Doolittle, W.F.; Philippe, H (1999). "An evaluation of elongation factor 1 alpha as a phylogenetic marker for eukaryotes". Molecular Biology and Evolution. 16 (2): 218–233. doi:10.1093/oxfordjournals.molbev.a026104. PMID 10028289.
  5. ^ a b Rivera, Maria; Lake, James (July 3, 1992). "Evidence That Eukaryotes and Eocyte Prokaryotes are Immediate Relatives". Science. 257 (5066): 74–76. Bibcode:1992Sci...257...74R. doi:10.1126/science.1621096. PMID 1621096.
  6. ^ a b Gupta, R.S.; Singh, B. (1994). "Phylogenetic analysis of 70 kD heat shock protein sequences suggests a chimeric origin for the eukaryotic nucleus". Current Biology. 4 (12): 1104–1114. doi:10.1016/s0960-9822(00)00249-9. PMID 7704574. S2CID 2568264.
  7. ^ Kelly, S.; Wickstead, B.; Gull, K. (2011). "Archaeal phylogenomics provides evidence in support of a methanogenic origin of the Archaea and a thaumarchaeal origin for the eukaryotes" (PDF). Proceedings of the Royal Society B. 278 (1708): 1009–1018. doi:10.1098/rspb.2010.1427. PMC 3049024. PMID 20880885. Archived from the original (PDF) on 3 March 2016. Retrieved 5 October 2012.
  8. ^ Poole, Anthony M.; Neumann, Nadja (2011). "Reconciling an archaeal origin of eukaryotes with engulfment: a biologically plausible update of the Eocyte hypothesis" (PDF). Research in Microbiology. 162 (1): 71–76. doi:10.1016/j.resmic.2010.10.002. PMID 21034814. Retrieved 5 October 2012.
  9. ^ Guy, Lionel; Ettema, Thijs J. G. (December 2011). "The archaeal 'TACK' superphylum and the origin of eukaryotes". Trends in Microbiology. 19 (12): 580–587. doi:10.1016/j.tim.2011.09.002. PMID 22018741.
  10. ^ Cox, Cymon J.; Foster, Peter G.; Hirt, Robert P.; Harris, Simon R.; Embley, T. Martin (23 December 2008). "The archaebacterial origin of eukaryotes". PNAS. 105 (51): 20356–20361. Bibcode:2008PNAS..10520356C. doi:10.1073/pnas.0810647105. PMC 2629343. PMID 19073919.
  11. ^ Guy, L.; Ettema, T.J. (19 December 2011). "The archaeal 'TACK' superphylum and the origin of eukaryotes". Trends Microbiol. 19 (12): 580–587. doi:10.1016/j.tim.2011.09.002. PMID 22018741.
  12. ^ Koonin, Eugene (26 September 2015). "Origin of eukaryotes from within archaea, archaeal eukaryome and bursts of gene gain: eukaryogenesis just made easier?". Philosophical Transactions of the Royal Society B: Biological Sciences. 370 (1678): 20140333. doi:10.1098/rstb.2014.0333. PMC 4571572. PMID 26323764.
  13. ^ Eme, Laura; Spang, Anja; Lombard, Jonathan; Stairs, Courtney W.; Ettema, Thijs J. G. (10 November 2017). "Archaea and the origin of eukaryotes". Nature Reviews Microbiology. 15 (12): 711–723. doi:10.1038/nrmicro.2017.133. ISSN 1740-1534. PMID 29123225. S2CID 8666687.
  14. ^ Zaremba-Niedzwiedzka, K; et al. (2017). "Asgard archaea illuminate the origin of eukaryotic cellular complexity". Nature. 541 (7637): 353–358. Bibcode:2017Natur.541..353Z. doi:10.1038/nature21031. OSTI 1580084. PMID 28077874. S2CID 4458094.
  15. ^ Forterre, Patrick; Krupovic, Mart (2012). "The Origin of Virions and Virocells: The Escape Hypothesis Revisited". Viruses: Essential Agents of Life. pp. 43–60. doi:10.1007/978-94-007-4899-6_3. ISBN 978-94-007-4898-9.
  16. ^ 패트릭 포테르: 진화 - 디와르 나투르 데르 비렌, in: Specktrum 2017년 8월, S. 37(온라인-아티켈은 19를 토한다. 2017년 줄리) (독일어)
  17. ^ Zilig, W (1996). "Viruses, plasmids, and other genetic elements of thermophilic and hyperthermophilic Archaea". FEMS Microbiology Reviews. 18 (2–3): 225–236. doi:10.1016/0168-6445(96)00014-9. PMID 8639330.
  18. ^ P, Forterre (2013). "The Common Ancestor of Archaea and Eukarya Was Not as Archaeon". Archaea. 2013: 372396. doi:10.1155/2013/372396. PMC 3855935. PMID 24348094.
  19. ^ a b Leonard, C.J.; Aravind, L; Koonin, E.V. (1998). "Novel Families of Putative Protein Kinases in Bacteria and Archaea: Evolution of the "Eukaryotic" Protein Kinase Superfamily". Genome Research. 8 (10): 1038–1047. doi:10.1101/gr.8.10.1038. PMID 9799791.
  20. ^ Davidov, Y; Jurkevitch, E (2009). "Predation between prokaryotes and the origin of eukaryotes". BioEssays. 31 (7): 748–757. doi:10.1002/bies.200900018. PMID 19492355. S2CID 8796311.
  21. ^ Baum, David (28 October 2014). "An inside-out origin for the eukaryotic cell". BMC Biology. 12: 776. doi:10.1186/s12915-014-0076-2. PMC 4210606. PMID 25350791.
  22. ^ a b Hasegawa, Masami; Iwabe, Naoyuko; Mukohata, Yasuo; Miyata, Takashi (11 April 1990). "Close evolutionary relatedness of archaebacteria, Methanococcus and Halobacterium, to eukaryotes demonstrated by composite phylogenetic trees of elongation factors EF-Tu and EF-G: Eocyte tree is unlikely". The Japanese Journal of Genetics. 65 (3): 109–114. doi:10.1266/jjg.65.109.
  23. ^ Forterre, P (April 1995). "Thermoreduction, a hypothesis for the origin of prokaryotes". Comptes Rendus de l'Académie des Sciences, Série III. 318 (4): 415–22. PMID 7648354.
  24. ^ Martin, William F.; Garg, Sriram; Zimorski, Verena (2015). "Endosymbiotic theories for eukaryote origin". Philosophical Transactions of the Royal Society B: Biological Sciences. 370 (1678): 20140330. doi:10.1098/rstb.2014.0330. PMC 4571569. PMID 26323761.