나노아카움 등각류
Nanoarchaeum equitans| 나노아카움 등각류 | |
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| 2개의 나노카케움 세포(및 그것의 더 큰 호스트 Ignicoccus) | |
| 과학적 분류 | |
| 도메인: | |
| 망울: | |
| 주문: | |
| 패밀리: | |
| 속: | |
| 종: | N. 동일본 |
| 이항식 이름 | |
| 나노아카움 등각류 휴버 외 2002년 | |
나노카르카에움 에퀴탄은 2002년 칼 스테터가 콜베인시 능선 아이슬란드 해안의 열수 분출구에서 발견한 해양 고고학의 한 종이다. 그것은 새로운 망울의 첫 번째 종으로 제안되었다. 이 미생물의 변종은 또한 북극 중간 해양 능선과 옐로우스톤 국립공원의 오브시디안 풀에서도 발견되었다. 끓어오르는 데 가까운 온도에서 자라기 때문에 섭씨 80도 정도에서는 열성애자로 간주된다. pH가 6이고 염분 농도가 2%인 환경에서 가장 잘 자란다. 나노카르카움은 고고학 이그니코쿠스에 대한 의무적인 공생으로 보인다; 그것은 생존하기 위해 숙주 유기체와 접촉해야 한다. 나노카세움은 지질을 합성할 수 없지만 숙주로부터 지질을 얻는다. 이것의 세포는 지름이 400 nm에 불과해 알려진 가장 작은 세포 유기체 중 하나이며, 가장 작은 것으로 알려진 고고학자로 알려져 있다.
엔 에퀴탄의 게놈은 단일 원형 염색체로 구성되며, 평균 GC 함량은 31.6%이다. 아미노산, 뉴클레오티드, 공작용제, 지질의 합성에 필요한 거의 모든 유전자가 부족하지만, 보수와 복제에 필요한 모든 것을 암호화하고 있다. 엔 에퀴탄은 재조합에 사용되는 단백질을 암호화하는 여러 유전자를 포함하고 있어, 엔 에퀴탄스가 동질 재조합을 겪을 수 있음을 시사한다.[1] 그것의 DNA의 총 95%는 단백질이나 안정적인 RNA 분자를 위해 암호화된다.
N. 에퀴탄은 원형 구조에서 나오는 작은 부속물을 가지고 있다. 세포 표면은 얇은 격자 모양의 S층으로 덮여 있어 세포 전체에 구조와 보호를 제공한다.
게놈
마이코플라즈마 생식기(크기 580Kbp, 단백질 부호화 유전자 515개)는 나노카르카에움이 서열화된 2003년(491Kbp, 단백질 부호화 유전자 536개)까지 게놈 크기가 가장 작은 세포 단위로 간주됐다.
유전적으로 나노카케움은 16S RNA 염기서열이 가장 흔한 방법으로 검출되지 않는다는 점에서 특이하다. 단일 가닥 리보솜 RNA의 초기 검사에서 이 유기체가 가장 고고학 영역에 속할 가능성이 높은 것으로 나타났다. 그러나 기존의 필라인 에우리아카게오타, 크레나카게오타와의 차이는 필라의 차이만큼이나 컸다. 그래서 나나르카게오타라고 불리는 고유의 망울이 주어졌다. 그러나 다른 그룹(참고문헌 참조)은 열려 있는 모든 독서 프레임을 다른 고고학자와 비교했다. 그들은 초기 샘플인 리보솜 RNA만이 편향되었고 나노카케움은 실제로 에우리카케오타 망울에 속한다고 주장한다.[2]
나노카슘 게놈의 염기서열 분석은 그 유기체의 생물학에 대한 풍부한 정보를 밝혀냈다. 몇몇 중요한 신진대사 경로에 대한 유전자가 빠진 것 같다. 나노카케움은 대부분의 뉴클레오티드, 아미노산, 지질, 공효소를 합성할 수 없다. 이 세포는 이그니코쿠스에서 이 생체 분자를 얻을 가능성이 높다. 특히 N. 에퀴탄은 다른 유기체에서 퓨린 뉴클레오티드 생합성을 암호화하는 모든 유전자가 부족하다.[3] 그러나 많은 기생 미생물들과는 달리 나노카케움은 DNA 복제, 전사, 번역을 수행하는 데 필요한 모든 것뿐만 아니라 많은 DNA 수리 효소를 가지고 있다. 이것은 왜 게놈은 다른 기생충의 비코딩 DNA 특성의 큰 확장성이 결여되어 있는지 설명할 수 있다.
ATP를 자체 생산하는 유기체의 능력도 의문이다.
나노카케움은 많은 열성애자들이 그렇듯이 수소와 황을 에너지를 위해 대사하는 능력이 부족하다. 그것은 산화 제약을 위한 경로뿐만 아니라 ATP 싱타아제의 5개의 하위 단위를 가지고 있다. 이그니코쿠스에서 수입한 생물학적 분자로부터 에너지를 얻는지, 아니면 ATP를 직접 받는지 등은 현재 알려져 있지 않다. N. 에퀴탄의 게놈과 단백질의 구성은 이중 적응의 서명으로 표시된다. 하나는 고온이고 다른 하나는 기생(또는 공생)을 의무화해야 한다.
참고 항목
참조
- ^ Waters E, Hohn MJ, Ahel I, Graham DE, Adams MD, Barnstead M, Beeson KY, Bibbs L, Bolanos R, Keller M, Kretz K, Lin X, Mathur E, Ni J, Podar M, Richardson T, Sutton GG, Simon M, Soll D, Stetter KO, Short JM, Noordewier M. 나노카세움의 게놈은 초기 고고학적 진화와 파생된 기생충에 대한 통찰력이다. Proc Natl Acad Sci U. S. A. 2003년 10월 28일 (22):12984-8. doi: 10.1073/pnas.1735403100. Epub 2003년 10월 17일. PMID: 14566062; PMCID: PMC240731
- ^ Brochier, Celine; Gribaldo, S; Zivanovic, Y; Confalonieri, F; et al. (2005). "Nanoarchaea: representatives of a novel archaeal phylum or a fast-evolving euryarchaeal lineage related to Thermococcales?". Genome Biology. 6 (5): R42. doi:10.1186/gb-2005-6-5-r42. PMC 1175954. PMID 15892870.
- ^ 브라운 AM, 후프스 SL, 화이트 RH, 사리스키 CA. 고고학에서의 푸린 생합성: 주제에 대한 변화. 비올 다이렉트. 2011년 12월 14일;6:63. 도이: 10.1186/1745-6150-6-63. PMID: 22168471; PMCID: PMC3261824
- Huber, Harald; et al. (2002). "A new phylum of Archaea represented by a nanosized hyperthermophilic symbiont". Nature. 417 (6884): 63–67. Bibcode:2002Natur.417...63H. doi:10.1038/417063a. PMID 11986665. S2CID 4395094. (이 논문은 나노카테움 최초의 발견을 나타낸다.)
- Waters, Elizabeth; et al. (2003). "The genome of Nanoarchaeum equitans: insights into early archaeal evolution and derived parasitism". PNAS. 100 (22): 12984–12988. Bibcode:2003PNAS..10012984W. doi:10.1073/pnas.1735403100. PMC 240731. PMID 14566062. (이 논문은 나노카테움의 게놈 서열을 설명한다.)
- Brochier, 셀린, Gribaldo, 오늘반 Zivanovic, Y, 콘파로 니에리가, F;(알.(2005년)."Nanoarchaea:소설archaeal 문 또는으로 euryarchaeal 혈통 Thermococcales에 관련된 대표들?".게놈 생물학. 6(5):R42.doi:10.1186/gb-2005-6-5-r42.PMC 1175954.PMID 15892870.(최근 연구 archaea의 Nanoarchaeum은 새로운 문,지만 euryarchaeon의 형식으로 보인다.).
- Das, Sabyasachi; et al. (2006). "Analysis of Nanoarchaeum equitans genome and proteome composition: indications for hyperthermophilic and parasitic adaptation". BMC Genomics. 7: 186. doi:10.1186/1471-2164-7-186. PMC 1574309. PMID 16869956. (이 논문은 나노카게움의 게놈과 단백질 분석을 설명한다.)
추가 읽기
Di Giulio, Massimo (January 1, 2013). "Is Nanoarchaeum equitans a paleokaryote?". Journal of Biological Research.
