막투과단백질222

Transmembrane protein 222
TMEM222
식별자
에일리어스TMEM222, C1orf160, 막투과단백질222, NEDMOSBA
외부 IDMGI: 1098568 HomoloGene: 11999 GenCard: TMEM222
맞춤법
종.인간마우스
엔트레즈
앙상블
유니프로트
RefSeq(mRNA)

NM_032125

NM_025667

RefSeq(단백질)

NP_115501

NP_079943

장소(UCSC)Chr 1: 27.32 ~27.34 MbChr 4: 132.99 ~133.01 Mb
PubMed 검색[3][4]
위키데이터
인간 보기/편집마우스 표시/편집

TMEM222 [5][6]유전자에 의해 인체 내에서 암호화되는 단백질이다.이 유전자에 의해 암호화된 단백질의 주목할 만한 특징 중 하나는 세 개의 예측된 막 통과 도메인[7]존재이다.TMEM222 단백질은 분비성 소포에 [8]국소화될 가능성이 가장 높은 것으로 예측된다.

유전자 특징

TMEM222에는 미지의 함수 도메인(DUF778)[9]이 있습니다.이 유전자의 별칭은 DKFZP564D0478, RP11-4K3__A.4, C1orf160 및 MGC11002를 [10]포함한다.가장 긴 코드 배열(1629 bp)인 등록 NM_032125.2는 컨센서스 코드 배열(23230 Daltons)[11]로 간주되는 208개의 아미노산 잔류물(23230 Daltons)의 단백질을 코드한다.이 유전자에 의해 암호화된 단백질에는 두 가지 동질 형태가 있다.두 번째(Q9H0R3-2)에는 첫 번째(Q9H0R3-1)[12]에 존재하는 첫 번째 96개의 아미노산 잔기가 없다는 점을 제외하고는 유사하다.

유전자 발현

ACEVIEW는 TMEM222를 데이터베이스 [13]내 평균 유전자보다 3.8배 더 많은 발현으로 고도로 표기했다.뇌, 폐, 대장, 신장, [13]태반을 포함한 166개의 조직에서 발현 증거가 있습니다.

호몰로지

인간 TMEM222의 정형어와 원거리 상동어는 특히 식물과 [14]동물에서 진핵생물 전반에 걸쳐 확인되었다.인간 [15]게놈에서 이 유전자의 병변은 발견되지 않았다.

속/종 공통명 등록 번호 길이 유사성 신원
노베기쿠스 쥐. NP_001107252.1 208aaa 99% 96%
친숙한 개 XP_852505.1 208aaa 98% 96%
근골근 마우스 NP_079943.2 208aaa 96% 95%
서스스크로파 돼지. XP_00312773.1 208aaa 97% 94%
에쿠스 카발루스 말. XP_001917747.1 207aaa 94% 93%
담쟁이덩굴 치킨. XP_417729.1 182aa 90% 85%
다니오 레리오 제브라피시 NP_001013334.1 174aaa 83% 71%
아노펠레스감비아 모기 XP_320483.3 197aa 66% 53%
드로소필라멜라노가스터 초파리 NP_723362.1 196aa 74% 61%
케노하브디시스엘레건스 네마토데 NP_494762.2 168aaa 72% 55%
피토프토라 인페스탄스 레이트블랙 XP_002902629.1 186aa 59% 48%
제아메이스 옥수수 NP_001144071.1 233aa 61% 44%
오리자 사티바 NP_001051577.1 204aa 61% 43%
아라비도시스탈리아나 탈크레스 NP_190673.1 231aa 55% 36%
호모 사피엔스 인간 NP_115501.2 208 - -

원거리 호몰로그

TMEM222의 [14]원거리 호몰로그인 RTH([16]Rversion-to-Ethylene Perception 1)는 ETR1(에틸렌 수용체 1)의 배향 변화를 유도하는 것으로 알려져 에틸렌 [17]지각의 상실에 대응하여 의 조절을 일으키는 것으로 알려져 있다.

단백질 상호작용

효모 2-하이브리드 스크리닝의 증거는 이 유전자와의 두 가지 단백질 상호작용에 대해 존재한다.하나는 세린단백질가수분해효소(PRSS23)[18]로, 마우스 배란에 관여하는 것으로 확인되어 세포외 [19]매트릭스로 배설된다.다른 단백질은 막에 필수적인 ab-hydroase(HLA-B 관련 전사체 5)[20]이며, 대응하는 유전자는 TNF(Tumor Necrosis Factor)-alpha 및 TNF-β [21]근처의 게놈에 위치한다.

레퍼런스

  1. ^ a b c GRCh38: 앙상블 릴리즈 89: ENSG00000186501 - 앙상블, 2017년 5월
  2. ^ a b c GRCm38: 앙상블 릴리즈 89: ENSMUSG000028857 - 앙상블, 2017년 5월
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, Gassenhuber J, Glassl S, Ansorge W, Bocher M, Blocker H, Bauersachs S, Blum H, Lauber J, Dusterhoft A, Beyer A, Kohrer K, Strack N, Mewes HW, Ottenwalder B, Obermaier B, Tampe J, Heubner D, Wambutt R, Korn B, Klein M, Poustka A (Mar 2001). "Toward a catalog of human genes and proteins: sequencing and analysis of 500 novel complete protein coding human cDNAs". Genome Res. 11 (3): 422–35. doi:10.1101/gr.GR1547R. PMC 311072. PMID 11230166.
  6. ^ "Entrez Gene: C1orf160 chromosome 1 open reading frame 160".
  7. ^ 티엠엠
  8. ^ k-NN
  9. ^ 국립생명공학정보센터(NCBI)
  10. ^ 진 카드
  11. ^ 유니프로트
  12. ^ 유니프로트
  13. ^ a b ACE뷰
  14. ^ a b 호몰로겐
  15. ^ 폭발.
  16. ^ "RTH RTE1-homolog [Arabidopsis thaliana (thale cress)] - Gene - NCBI".
  17. ^ Resnick JS, Wen CK, Shockey JA, Chang C (May 2006). "REVERSION-TO-ETHYLENE SENSITIVITY1, a conserved gene that regulates ethylene receptor function in Arabidopsis". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 103 (20): 7917–22. doi:10.1073/pnas.0602239103. PMC 1458508. PMID 16682642.
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  19. ^ Miyakoshi K, Murphy MJ, Yeoman RR, Mitra S, Dubay CJ, Hennebold JD (December 2006). "The identification of novel ovarian proteases through the use of genomic and bioinformatic methodologies". Biol. Reprod. 75 (6): 823–35. doi:10.1095/biolreprod.106.052290. PMID 16870946.
  20. ^ Lehner B, Semple JI, Brown SE, Counsell D, Campbell RD, Sanderson CM (January 2004). "Analysis of a high-throughput yeast two-hybrid system and its use to predict the function of intracellular proteins encoded within the human MHC class III region". Genomics. 83 (1): 153–67. doi:10.1016/S0888-7543(03)00235-0. PMID 14667819.
  21. ^ Spies T, Bresnahan M, Strominger JL (November 1989). "Human major histocompatibility complex contains a minimum of 19 genes between the complement cluster and HLA-B". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 86 (22): 8955–8. Bibcode:1989PNAS...86.8955S. doi:10.1073/pnas.86.22.8955. PMC 298409. PMID 2813433.

추가 정보