TFEW

TFEB
TFEW
식별자
별칭TFEF, ALFABHLHE35, TCDEC, 전사 계수 EB
외부 IDOMIM: 600744 MGI: 103270 HomoloGene: 5182 GeneCard: TFU
직교체
종인간마우스
엔트레스
앙상블
유니프로트
RefSeq(mRNA)

NM_001167827
NM_001271943
NM_001271944
NM_001271945
NM_007162

NM_001161722
NM_001161723
NM_011549

RefSeq(단백질)

NP_001161299
NP_001258872
NP_001258873
NP_001258874
NP_009093

NP_001155194
NP_001155195
NP_035679

위치(UCSC)Chr 6: 41.68 – 41.74MbCr 17: 48.05 – 48.1Mb
PubMed 검색[3][4]
위키다타
인간 보기/편집마우스 보기/편집

전사 인자 EB는 인간에게 TFU 유전자에 의해 암호화된 단백질이다.[5][6]

함수

TFEF는 라이소솜 생물생식의 마스터 유전자다.[7]그것은 리소솜 하이드롤라아제, 막 단백질, 자가포기에 관여하는 유전자의 발현을 조정하는 전사 인자를 암호화한다.[7][8]Lysosomal 저장 질병과 같은 영양소 고갈과 이상 라이소섬유의 저장 조건 하에서 TFU는 세포질에서 핵으로 반투명하여 표적 유전자가 활성화된다.[7][8]배양된 세포에서 TFEF는 리소솜 생물 발생, 외세포 분열, 자가포진을 유발한다.[7][8][9]

박테리아 감염에서 니코틴산 아데닌 디뉴클레오티드 인산염(NADP)의 리소솜 Ca2+ 유출유도와 TFU 활성화가 염증성 사이토카인의 발현을 강화시킨다.[10]라이소솜 저장 장애의 세포 및 마우스 모델과 헌팅턴, 파킨슨, 알츠하이머병과 같은 일반적인 신경퇴행성 질환에서 바이러스 매개 TFUR가 과다압박을 일으켜 세포 내 분자 축적과 질병 표현형 구조로 이어졌다.[7][9][11][12][13]TDEF는 PGC1-알파(PGC1-alpha)에 의해 활성화되며 헌팅턴병 마우스 모델에서 htt집합과 신경독성 감소를 촉진한다.[14]TFEF 과다압박은 신장세포암과 췌장암 환자에게서 발견되었으며 다양한 종양유발 신호 유도를 통해 종양생식을 촉진하는 것으로 나타났다.[15][16][17]

FLCN 돌연변이로 인한 TDUF 구성 활성화는 Birt-Hogg-Dubé 증후군의 신장 낭종과 종양성 종양을 촉진한다.[18]

TDEC의 핵 국산화 및 활성은 mTORC1에 의한 세린 인산화 및 세포외 신호 조절 키나제2(ERK2)에 의해 억제된다. TDEC의 mTORC1 인산화술은 Lysosomal 표면에서 발생하며, 이 두 가지 모두 Rag GTPases와의 상호작용에 의해 국부화된다.그런 다음 인산염 TFU는 14-3-3 단백질과의 상호작용에 의해 세포솔에 보존된다.[20][22][21]이러한 키나아제는 세포외 영양소의 수준에 맞춰 조정되어 자가포착과 라이소솜 생물생성 조절과 두 개의 서로 다른 세포기관과의 파트너십을 제안한다.[8]영양소 고갈은 인산염 캘시네우린을 통한 TFEC 탈인산화 및 후속 핵 변환을 유도한다.[23] TFU 핵 수출은 CRM1에 의해 매개되며 인산화에 의존한다.[24][25]TFU는 또한 단백질 키나아제 AKT/PKB의 표적이다.[26] AKT/PKB 인산염 TFU는 세린 467에서 TDUF의 핵 변환을 억제한다.[26]AKT/PKB의 약리학적 억제는 TFEW를 활성화하고 리소좀 생물 발생과 자가포진을 촉진하며, 소년 바텐병 및 산필리포 증후군 B형의 마우스 모델에서 신경병리학을 개선한다.[26][27]TDEF는 mTORC1 활동 억제를 통해 Trex1-deficient 세포에서 활성화되어 라이소솜 구획이 확장된다.[28]

참조

  1. ^ a b c GRCh38: 앙상블 릴리스 89: ENSG00000112561 - 앙상블, 2017년 5월
  2. ^ a b c GRCm38: 앙상블 릴리스 89: ENSMUSG000023990 - 앙상블, 2017년 5월
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ Carr CS, Sharp PA (Aug 1990). "A helix-loop-helix protein related to the immunoglobulin E box-binding proteins". Molecular and Cellular Biology. 10 (8): 4384–8. doi:10.1128/mcb.10.8.4384. PMC 360994. PMID 2115126.
  6. ^ "Entrez Gene: TFEB transcription factor EB".
  7. ^ a b c d e Sardiello M, Palmieri M, di Ronza A, Medina DL, Valenza M, Gennarino VA, Di Malta C, Donaudy F, Embrione V, Polishchuk RS, Banfi S, Parenti G, Cattaneo E, Ballabio A (Jul 2009). "A gene network regulating lysosomal biogenesis and function". Science. 325 (5939): 473–7. Bibcode:2009Sci...325..473S. doi:10.1126/science.1174447. PMID 19556463. S2CID 20353685.
  8. ^ a b c d e Settembre C, Di Malta C, Polito VA, Garcia Arencibia M, Vetrini F, Erdin S, Erdin SU, Huynh T, Medina D, Colella P, Sardiello M, Rubinsztein DC, Ballabio A (Jun 2011). "TFEB links autophagy to lysosomal biogenesis". Science. 332 (6036): 1429–33. Bibcode:2011Sci...332.1429S. doi:10.1126/science.1204592. PMC 3638014. PMID 21617040.
  9. ^ a b Medina DL, Fraldi A, Bouche V, Annunziata F, Mansueto G, Spampanato C, Puri C, Pignata A, Martina JA, Sardiello M, Palmieri M, Polishchuk R, Puertollano R, Ballabio A (Sep 2011). "Transcriptional activation of lysosomal exocytosis promotes cellular clearance". Developmental Cell. 21 (3): 421–30. doi:10.1016/j.devcel.2011.07.016. PMC 3173716. PMID 21889421.
  10. ^ Xie N, Zhang L, Gao W, Huang C, Zou B (2020). "NAD + metabolism: pathophysiologic mechanisms and therapeutic potential". Signal Transduction and Targeted Therapy. 5 (1): 227. doi:10.1038/s41392-020-00311-7. PMC 7539288. PMID 33028824.
  11. ^ Settembre C, De Cegli R, Mansueto G, Saha PK, Vetrini F, Visvikis O, Huynh T, Carissimo A, Palmer D, Klisch TJ, Wollenberg AC, Di Bernardo D, Chan L, Irazoqui JE, Ballabio A (Jun 2013). "TFEB controls cellular lipid metabolism through a starvation-induced autoregulatory loop". Nature Cell Biology. 15 (6): 647–58. doi:10.1038/ncb2718. PMC 3699877. PMID 23604321.
  12. ^ Polito VA, Li H, Martini-Stoica H, Wang B, Yang L, Xu Y, Swartzlander DB, Palmieri M, di Ronza A, Lee VM, Sardiello M, Ballabio A, Zheng H (Sep 2014). "Selective clearance of aberrant tau proteins and rescue of neurotoxicity by transcription factor EB". EMBO Molecular Medicine. 6 (9): 1142–60. doi:10.15252/emmm.201303671. PMC 4197862. PMID 25069841.
  13. ^ Decressac M, Mattsson B, Weikop P, Lundblad M, Jakobsson J, Björklund A (May 2013). "TFEB-mediated autophagy rescues midbrain dopamine neurons from α-synuclein toxicity". Proc Natl Acad Sci USA. 110 (19): 1817–26. Bibcode:2013PNAS..110E1817D. doi:10.1073/pnas.1305623110. PMC 3651458. PMID 23610405.
  14. ^ Tsunemi T, Ashe TD, Morrison BE, Soriano KR, Au J, Roque RA, Lazarowski ER, Damian VA, Masliah E, La Spada AR (Jul 2012). "PGC-1α rescues Huntington's disease proteotoxicity by preventing oxidative stress and promoting TFEB function". Science Translational Medicine. 4 (142): 142ra97. doi:10.1126/scitranslmed.3003799. PMC 4096245. PMID 22786682.
  15. ^ Di Malta C, Siciliano D, Calcagni A, Monfregola J, Punzi S, Pastore N, Eastes AN, Davis O, De Cegli R, Zampelli A, Di Giovannantonio LG, Nusco E, Platt N, Guida A, Ogmundsdottir MH, Lanfrancone L, Perera RM, Zoncu R, Pelicci PG, Settembre C, Ballabio A (Jun 2017). "Transcriptional activation of RagD GTPase controls mTORC1 and promotes cancer growth". Science. 356 (6343): 1188–1192. doi:10.1126/science.aag2553. PMC 5730647. PMID 28619945.
  16. ^ Calcagnì A, Kors L, Verschuren E, De Cegli R, Zampelli N, Nusco E, Confalonieri S, Bertalot G, Pece S, Settembre C, Malouf GG, Leemans JC, de Heer E, Salvatore M, Peters DJ, Di Fiore PP, Ballabio A (Sep 2016). "Modelling TFE renal cell carcinoma in mice reveals a critical role of WNT signaling". eLife. 5. doi:10.7554/eLife.17047. PMC 5036965. PMID 27668431.
  17. ^ Perera RM, Stoykova S, Nicolay BN, Ross KN, Fitamant J, Boukhali M, Lengrand J, Deshpande V, Selig MK, Ferrone CR, Settleman J, Stephanopoulos G, Dyson NJ, Zoncu R, Ramaswamy S, Haas W, Bardeesy N (Aug 2015). "Transcriptional control of autophagy-lysosome function drives pancreatic cancer metabolism". Nature. 524 (7565): 361–5. Bibcode:2015Natur.524..361P. doi:10.1038/nature14587. PMC 5086585. PMID 26168401.
  18. ^ Napolitano G, Di Malta C, Esposito A, de Araujo MEG, Pece S, Bertalot G, Matarese M, Benedetti V, Zampelli A, Stasyk T, Siciliano D, Venuta A, Cesana M, Vilardo C, Nusco E, Monfregola J, Calcagnì A, Di Fiore PP, Huber LA, Ballabio A (Sep 2020). "A substrate-specific mTORC1 pathway underlies Birt–Hogg–Dubé syndrome". Nature. 585 (7826): 597–602. doi:10.1038/s41586-020-2444-0. PMC 7610377. PMID 32612235.{{cite journal}}: CS1 maint: 작성자 매개변수 사용(링크)
  19. ^ Settembre C, Zoncu R, Medina DL, Vetrini F, Erdin S, Erdin S, Huynh T, Ferron M, Karsenty G, Vellard MC, Facchinetti V, Sabatini DM, Ballabio A (Mar 2012). "A lysosome-to-nucleus signalling mechanism senses and regulates the lysosome via mTOR and TFEB". EMBO Journal. 31 (5): 1095–108. doi:10.1038/emboj.2012.32. PMC 3298007. PMID 22343943.
  20. ^ a b Martina JA, Chen Y, Gucek M, Puertollano R (Jun 2012). "MTORC1 functions as a transcriptional regulator of autophagy by preventing nuclear transport of TFEB". Autophagy. 8 (6): 903–14. doi:10.4161/auto.19653. PMC 3427256. PMID 22576015.
  21. ^ a b Roczniak-Ferguson A, Petit CS, Froehlich F, Qian S, Ky J, Angarola B, Walther TC, Ferguson SM (Jun 2012). "The transcription factor TFEB links mTORC1 signaling to transcriptional control of lysosome homeostasis". Science Signaling. 5 (228): ra42. doi:10.1126/scisignal.2002790. PMC 3437338. PMID 22692423.
  22. ^ Martina JA, Puertollano R (Jun 2013). "RRAG GTPases link nutrient availability to gene expression, autophagy and lysosomal biogenesis". Autophagy. 9 (6): 928–30. doi:10.4161/auto.24371. PMC 3672304. PMID 23524842.
  23. ^ Medina DL, Di Paola S, Peluso I, Armani A, De Stefani D, Venditti R, Montefusco S, Scotto-Rosato A, Prezioso C, Forrester A, Settembre C, Wang W, Gao Q, Xu H, Sandri M, Rizzuto R, De Matteis MA, Ballabio A (Mar 2015). "Lysosomal calcium signalling regulates autophagy through calcineurin and TFEB". Nature Cell Biology. 17 (3): 288–99. doi:10.1038/ncb3114. PMC 4801004. PMID 25720963.
  24. ^ Napolitano G, Esposito A, Choi H, Matarese M, Benedetti V, Di Malta C, Monfregola J, Medina DL, Lippincott-Schwartz J, Ballabio A (Aug 2018). "mTOR-dependent phosphorylation controls TFEB nuclear export". Nature Communications. 9 (1): 3312. Bibcode:2018NatCo...9.3312N. doi:10.1038/s41467-018-05862-6. PMC 6098152. PMID 30120233.
  25. ^ Li L, Friedrichsen HJ, Andrews S, Picaud S, Volpon L, Ngeow K, Berridge G, Fischer R, Borden KLB, Filippakopoulos P, Goding CR (Jul 2018). "A TFEB nuclear export signal integrates amino acid supply and glucose availability". Nature Communications. 9 (1): 2685. Bibcode:2018NatCo...9.2685L. doi:10.1038/s41467-018-04849-7. PMC 6041281. PMID 29992949.
  26. ^ a b c Palmieri M, Pal R, Nelvagal HR, Lotfi P, Stinnett GR, Seymour ML, Chaudhury A, Bajaj L, Bondar VV, Bremner L, Saleem U, Tse DY, Sanagasetti D, Wu SM, Neilson JR, Pereira FA, Pautler RG, Rodney GG, Cooper JD, Sardiello M (Feb 2017). "mTORC1-independent TFEB activation via Akt inhibition promotes cellular clearance in neurodegenerative storage diseases". Nature Communications. 8: 14338. Bibcode:2017NatCo...814338P. doi:10.1038/ncomms14338. PMC 5303831. PMID 28165011.
  27. ^ Lotfi P, Tse DY, Di Ronza A, Seymour ML, Martano G, Cooper JD, Pereira FA, Passafaro M, Wu SM, Sardiello M (Jul 2018). "Trehalose reduces retinal degeneration, neuroinflammation and storage burden caused by a lysosomal hydrolase deficiency". Autophagy. 14 (8): 1419–1434. doi:10.1080/15548627.2018.1474313. PMC 6103706. PMID 29916295.
  28. ^ Hasan M, Koch J, Rakheja D, Pattnaik AK, Brugarolas J, Dozmorov I, Levine B, Wakeland EK, Lee-Kirsch MA, Yan N (Jan 2013). "Trex1 regulates lysosomal biogenesis and interferon-independent activation of antiviral genes". Nature Immunology. 14 (1): 61–71. doi:10.1038/ni.2475. PMC 3522772. PMID 23160154.

추가 읽기