PVC 초문

PVC superphylum
PVC 초문
ChlamydiaTrachomatisEinschlusskörperchen.jpg
클라미디아 트라코마티스
과학적 분류 e
(표준)
도메인: 박테리아
(순위 미지정): 그라실리쿠테스
슈퍼문: PVC 초문
필라

클라미디오타
키리티마티에라에오타
렌티스파에로타
플랑크토균류
버러코믹 바이오오타
아비수박테리아속
"Ca. Aurabacteria
옴니트로피카

동의어

Planctobacteria Cavalier-Smith, 1987년[1]

PVC 슈퍼문은 세 개의 중요한 구성원인 Planctomycetota, Verrucomic miroota,[2][3] Chlamydiota의 이름을 딴 박테리아 슈퍼문이다.Cavalier-Smith는 PVC 박테리아가 펩티도글리칸 세포벽을 두 [4]번 잃거나 감소시켰다고 가정했다.PVC 분지군이 최초의 원시핵세포를 [5][6]발생시킨 내생생물학적 사건에서 숙주세포였을 수 있다는 가설이 있다.

Cavalier-Smith는 같은 그룹을 Planctobacteria라고 부르며 문으로 간주한다.하지만, 이것은 더 큰 과학계가 [7]따르지 않는다.Cavalier-Smith 세균 메가클래스화에서 Gracilicutes 인프라 내이며, Phyla Chlamyda, Lentisphaerota, Planctomycetota,[4][8] Verrucomic biobota를 포함한다.

PVC 초문[9][10][2][11]
PVC

아우라박테리아

플랑크토균류

옴니트로피카

클라미디오타

키리티마틸레오타

렌티스파에로타

버러코믹 바이오오타

분자 시그니처

종래의 분자 계통학 관점에서의 평형균류, 초생균류, 클라미디오타는 필라로 간주되어 후보균류(이전[12] OP3) 및 포리박테리아와 [13]함께 PVC 슈퍼문에서도 클러스터된다.보존된 시그니처 단백질 형태의 중요한 분자 마커는 PVC 구성원에 의해 일관되게 공유되는 것으로 밝혀졌지만, Poribacteria는 예외입니다.보존된 시그니처 단백질은 시너포메이션 품질을 나타내는 마커 및 이 세균군을 구별하는 수단일 수 있다.최근의 연구는 이 단백질의 특성을 나타내며 DNA/RNA [14]결합에서 중요한 하우스키핑 기능을 하는 것으로 알려져 있다.이 관찰은 PVC 초문을 구분하는 수단을 제공할 뿐만 아니라 다른 [15][16]박테리아와 구별되는 이 분지군이 공유하는 진화적 관계를 강력하게 뒷받침한다.

보존된 시그니처 인델(CSI)은 또한 각각의 문과 서로 및 다른 [15][17]박테리아를 구별하는 Planctomycetota, Verrucomic miobota 및 Chlamydiota에 대해 특이적으로 발견되었습니다.RNA 중합효소 단백질 RpoB에 3-아미노산 삽입물이 발견되었으며, 이는 배열된 모든 Verrucomicrobia, Clamydae 및 Rentisphaerae 종에 의해 공유된다.CSI는 인접한 Planctomycetes와 Poribacteria에 존재하지 않으며, CSI가 [15]특정된 그룹 간의 공통 조상을 나타낸다.

이 분류군의 존재에 대한 추가 증거가 발견되었다.[18][19]여기에는 막 피막 유사 단백질, 튜불린, 스테롤 합성 및 응축 DNA의 존재가 포함된다.

메모들

레퍼런스

  1. ^ Cavalier-Smith, T (1987). "The origin of eukaryote and archaebacterial cells". Annals of the New York Academy of Sciences. 503 (1): 17–54. Bibcode:1987NYASA.503...17C. doi:10.1111/j.1749-6632.1987.tb40596.x. PMID 3113314. S2CID 38405158.
  2. ^ a b Wagner, M.; Horn, M. (2006). "The Planctomycetes, Verrucomicrobia, Chlamydiae and sister phyla comprise a superphylum with biotechnological and medical relevance". Current Opinion in Biotechnology. 17 (3): 241–249. doi:10.1016/j.copbio.2006.05.005. PMID 16704931.
  3. ^ Rivas-Marín, Elena; Devos, Damien P. (1 June 2018). "The Paradigms They Are a-Changin': past, present and future of PVC bacteria research". Antonie van Leeuwenhoek. 111 (6): 785–799. doi:10.1007/s10482-017-0962-z. PMC 5945725. PMID 29058138.
  4. ^ a b Cavalier-Smith, T (2002). "The neomuran origin of archaebacteria, the negibacterial root of the universal tree and bacterial megaclassification". International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 52 (Pt 1): 7–76. doi:10.1099/00207713-52-1-7. PMID 11837318.
  5. ^ Forterre, Patrick (January 2011). "A new fusion hypothesis for the origin of Eukarya: better than previous ones, but probably also wrong". Research in Microbiology. 162 (1): 77–91. doi:10.1016/j.resmic.2010.10.005. PMID 21034817.
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  12. ^ "Taxonomy - Candidatus Omnitrophica (PHYLUM)". UniProt.
  13. ^ Wagner, M.; Horn, M. (2006). "The Planctomycetes, Verrucomicrobia, Chlamydiae and sister phyla comprise a superphylum with biotechnological and medical relevance". Current Opinion in Biotechnology. 17 (3): 241–249. doi:10.1016/j.copbio.2006.05.005. PMID 16704931.
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  17. ^ Gupta RS, Naushad S, Chokshi C, Griffiths E, Adeolu M (2015). "A phylogenomic and molecular markers based analysis of the phylum Chlamydiae: proposal to divide the class Chlamydiia into two orders, Chlamydiales and Parachlamydiales ord. nov., and emended description of the class Chlamydiia". Antonie van Leeuwenhoek. 108 (3): 765–781. doi:10.1007/s10482-015-0532-1. PMID 26179278. S2CID 17099157.
  18. ^ Wagner M, Horn M (2006). "The Planctomycetes, Verrucomicrobia, Chlamydiae and sister phyla comprise a superphylum with biotechnological and medical relevance". Curr. Opin. Biotechnol. 17 (3): 241–9. doi:10.1016/j.copbio.2006.05.005. PMID 16704931.
  19. ^ Kamneva OK, Liberles DA, Ward NL (2010). "Genome-wide influence of indel Substitutions on evolution of bacteria of the PVC superphylum, revealed using a novel computational method". Genome Biol Evol. 2: 870–86. doi:10.1093/gbe/evq071. PMC 3000692. PMID 21048002.