DUX4
DUX4DUX4 | |||||||||||||||||||||||||
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식별자 | |||||||||||||||||||||||||
에일리어스 | DUX4, DUX4L, 더블홈박스4 | ||||||||||||||||||||||||
외부 ID | OMIM : 606009 GeneCard : DUX4 | ||||||||||||||||||||||||
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맞춤법 | |||||||||||||||||||||||||
종. | 인간 | 마우스 | |||||||||||||||||||||||
엔트레즈 |
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앙상블 |
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유니프로트 |
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RefSeq(mRNA) |
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RefSeq(단백질) |
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장소(UCSC) | Chr 4: 190.17 ~190.19 Mb | 없음 | |||||||||||||||||||||||
PubMed 검색 | [2] | 없음 | |||||||||||||||||||||||
위키데이터 | |||||||||||||||||||||||||
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Double homeobox, 4는 DUX4 [3]유전자에 의해 인간에게 암호화되는 단백질이다.그것의 양성 억제는 안면근위축증의 원인이다.
진
이 유전자는 염색체 4q35의 서브텔로미어 영역에 있는 D4Z4 매크로위성 반복 배열 내에 위치한다.D4Z4 반복 배열은 일반 모집단에서 11-150 D4Z4 반복을 포함하고 있으며, 10번 염색체에서 매우 상동성이 높은 D4Z4 반복 배열이 확인되었다.그 유전자는 세 개의 엑손으로 구성되어 있다.D4Z4의 반복마다 Exon 1과 2가 존재합니다.D4Z4 리피트 [4]어레이에 텔로미릭한 exon 3의 복사본은 1개뿐입니다.Open Reading Frame(ORF; 개방형 판독 프레임)은 exon 1에 완전히 포함되어 있으며 2개의 [4]홈오박스를 포함합니다.Exons 2 및 3은 3개의 주요 미번역 영역(3µ-UTR)[4]에 대해 부호화한다.특정 하플로타입에서 엑손3은 폴리아데닐화 [4]신호를 포함한다.표준 cDNA 라이브러리에서 전사에 대한 증거는 없었지만, RTPCR 및 시험관 발현 실험에서는 ORF가 [5]전사된 것으로 나타났다.
반복 배열과 ORF는 다른 포유류에서 보존됩니다.
구조.
DUX4 단백질은 424개의 아미노산 [4]길이입니다.두 개의 호메오도메인이 N 터미널에 있습니다.C 말단에 전사활성도메인(TAD)과 p300 결합도메인이 위치한다.TAD는 잠재적인 9개의 아미노산 TAD를 포함한다.[4]
두 개의 호메오도메인과 TAD는 잘 정의된 3차 [4]구조를 가지고 있다.두 번째 호메오도메인과 TAD 사이의 영역은 무질서가 [4]될 것으로 예상됩니다.
DUX4 트랜스크립트를 스플라이스하여 DUX4-S(짧음) 또는 DUX4-FL(풀렝스) mRNA를 생성할 수 있습니다.DUX4-FL mRNA는 DUX4 단백질 전체를 암호화한다.DUX4-S mRNA는 전사활성화 [4]도메인이 없는 부분 DUX4 단백질을 암호화한다.
기능.
DUX4 단백질은 많은 유전자의 전사 활성제이며, 한 가지 예는 쌍상 호메오도메인 전사 인자 1(PITX1)[5]이다.접합체 게놈 [citation needed]활성화를 자극할 수 있어
두 개의 호메오도메인은 DUX4 단백질이 [4]DNA와 결합하도록 한다.C 말단 도메인은 표적 유전자 [4]활성화에 관여한다.
DUX는 보통 고환, 흉선, 그리고 분열 단계의 [6]배아에서 발현된다.
임상적 의의
근육 세포에서 DUX4의 부적절한 발현은 안면근위축증(FSHD)[7][8]의 원인이다.
전위에 의한 DUX4의 과잉발현은 B세포 [6]백혈병을 일으킬 수 있다.DUX4와 CIC를 합병하는 전위는 공격적인 유형의 [9]육종을 일으킬 수 있습니다.
「 」를 참조해 주세요.
레퍼런스
- ^ a b c ENSG00000283949 GRCh38: 앙상블 릴리즈 89: ENSG00000260596, ENSG00000283949: Ensembl, 2017년 5월
- ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
- ^ Gabriëls J, Beckers MC, Ding H, De Vriese A, Plaisance S, van der Maarel SM, et al. (August 1999). "Nucleotide sequence of the partially deleted D4Z4 locus in a patient with FSHD identifies a putative gene within each 3.3 kb element". Gene. 236 (1): 25–32. doi:10.1016/S0378-1119(99)00267-X. PMID 10433963.
- ^ a b c d e f g h i j k Schätzl, T; Kaiser, L; Deigner, HP (12 March 2021). "Facioscapulohumeral muscular dystrophy: genetics, gene activation and downstream signalling with regard to recent therapeutic approaches: an update". Orphanet Journal of Rare Diseases. 16 (1): 129. doi:10.1186/s13023-021-01760-1. PMC 7953708. PMID 33712050.
- ^ a b "Entrez Gene: DUX4 Double homeobox, 4".
- ^ a b Lee JK, Bosnakovski D, Toso EA, Dinh T, Banerjee S, Bohl TE, et al. (December 2018). "Crystal Structure of the Double Homeodomain of DUX4 in Complex with DNA". Cell Reports. 25 (11): 2955–2962.e3. doi:10.1016/j.celrep.2018.11.060. PMC 6463520. PMID 30540931.
- ^ Lemmers RJ, van der Vliet PJ, Klooster R, Sacconi S, Camaño P, Dauwerse JG, et al. (September 2010). "A unifying genetic model for facioscapulohumeral muscular dystrophy". Science. 329 (5999): 1650–3. Bibcode:2010Sci...329.1650L. doi:10.1126/science.1189044. PMC 4677822. PMID 20724583.
- ^ Jones TI, Chen JC, Rahimov F, Homma S, Arashiro P, Beermann ML, et al. (October 2012). "Facioscapulohumeral muscular dystrophy family studies of DUX4 expression: evidence for disease modifiers and a quantitative model of pathogenesis". Human Molecular Genetics. 21 (20): 4419–30. doi:10.1093/hmg/dds284. PMC 3459465. PMID 22798623.
- ^ Wong D, Yip S (April 2020). "Making heads or tails - the emergence of capicua (CIC) as an important multifunctional tumour suppressor". The Journal of Pathology. 250 (5): 532–540. doi:10.1002/path.5400. PMID 32073140.