아파탁신

Aprataxin
APTX
APTX .png
사용 가능한 구조
PDBOrtholog 검색: PDBe RCSB
식별자
에일리어스APTX, AOA, AOA1, AAXA1, EAOH, EOHA, FHA-HIT, 아파탁신
외부 IDOMIM: 606350 MGI: 1913658 HomoloGene: 41634 GeneCard: APTX
맞춤법
종.인간마우스
엔트레즈
앙상블
유니프로트
RefSeq(mRNA)

NM_001025444
NM_001025445
NM_025545

RefSeq(단백질)

NP_001020615
NP_001020616
NP_079821

장소(UCSC)Chr 9: 32.97 ~33.03 MbChr 4: 40.68 ~40.7 Mb
PubMed 검색[3][4]
위키데이터
인간 보기/편집마우스 표시/편집

아파탁신은 인간의 APTX [5][6][7]유전자에 의해 암호화되는 단백질이다.

이 유전자는 뉴클레오티드 결합 및 디아데노신 폴리인산 가수분해효소 활성을 가진 히스티딘 3중합체(HIT) 슈퍼패밀리의 멤버를 코드한다.암호화된 단백질은 단일 가닥 DNA 수복에 역할을 할 수 있다.이 유전자의 돌연변이는 운동실조-안구실조증과 관련이 있다.이 유전자에 대해 별개의 아이소폼을 코드하는 복수의 전사 변이가 확인되었지만, 일부 변종의 전체 길이 특성은 [7]결정되지 않았다.

기능.

아파탁신은 비호몰로지 말단 결합 중 DNA 리가아제 IV에 의한 결찰 시도 실패 후 DNA 말단으로부터 AMP를 제거하여 [8][9]결찰 시도를 후속적으로 가능하게 한다.

DNA 가닥이 끊어지다

운동실조증(Ataxia oculomotor apraxia-1)은 APTX 유전자의 돌연변이에 의해 발생하는 신경학적 질환으로 아파탁신을 [10]코드한다.신경학적 장애는 파괴적인 DNA 결찰 [10]사건으로 인해 수리되지 않은 DNA 가닥이 점차적으로 축적되면서 발생하는 것으로 보인다.

조기 노화

aptx−/− 돌연변이 생쥐가 생성되었지만 뚜렷한 [10]표현형이 없습니다.Aptx−/− [11]마우스로 슈퍼옥사이드 디스뮤타아제 I(SOD1)의 돌연변이를 발현하는 또 다른 마우스 모델이 생성되었다.SOD1 돌연변이는 산화적 스트레스에 따른 전사 회복 감소를 일으킨다.이 쥐들은 세포 노화를 가속화했다.이 연구는 또한 생체 내 Aptx의 보호 역할을 보여주었고 Aptx 기능의 상실은 신경계에서 DNA 파괴의 점진적 축적을 초래하여 전신 조기 노화의 특징을 유발한다고 제안했다(노화 DNA 손상 이론 참조).

상호 작용

Aprataxin은 다음과 상호작용하는 으로 나타났습니다.

레퍼런스

  1. ^ a b c GRCh38: 앙상블 릴리즈 89: ENSG00000137074 - 앙상블, 2017년 5월
  2. ^ a b c GRCm38: 앙상블 릴리즈 89: ENSMUSG000028411 - 앙상블, 2017년 5월
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ Date H, Onodera O, Tanaka H, Iwabuchi K, Uekawa K, Igarashi S, Koike R, Hiroi T, Yuasa T, Awaya Y, Sakai T, Takahashi T, Nagatomo H, Sekijima Y, Kawachi I, Takiyama Y, Nishizawa M, Fukuhara N, Saito K, Sugano S, Tsuji S (Oct 2001). "Early-onset ataxia with ocular motor apraxia and hypoalbuminemia is caused by mutations in a new HIT superfamily gene". Nat Genet. 29 (2): 184–8. doi:10.1038/ng1001-184. PMID 11586299. S2CID 25665707.
  6. ^ Moreira MC, Barbot C, Tachi N, Kozuka N, Uchida E, Gibson T, Mendonca P, Costa M, Barros J, Yanagisawa T, Watanabe M, Ikeda Y, Aoki M, Nagata T, Coutinho P, Sequeiros J, Koenig M (Oct 2001). "The gene mutated in ataxia-ocular apraxia 1 encodes the new HIT/Zn-finger protein aprataxin". Nat Genet. 29 (2): 189–93. doi:10.1038/ng1001-189. PMID 11586300. S2CID 23001321.
  7. ^ a b "Entrez Gene: APTX aprataxin".
  8. ^ Rass U, Ahel I, West SC (December 2008). "Molecular mechanism of DNA deadenylation by the neurological disease protein aprataxin". J. Biol. Chem. 283 (49): 33994–4001. doi:10.1074/jbc.M807124200. PMC 2662222. PMID 18836178.
  9. ^ Reynolds JJ, El-Khamisy SF, Katyal S, Clements P, McKinnon PJ, Caldecott KW (March 2009). "Defective DNA ligation during short-patch single-strand break repair in ataxia oculomotor apraxia 1". Mol. Cell. Biol. 29 (5): 1354–62. doi:10.1128/MCB.01471-08. PMC 2643831. PMID 19103743.
  10. ^ a b c Ahel I, Rass U, El-Khamisy SF, Katyal S, Clements PM, McKinnon PJ, Caldecott KW, West SC (2006). "The neurodegenerative disease protein aprataxin resolves abortive DNA ligation intermediates". Nature. 443 (7112): 713–6. Bibcode:2006Natur.443..713A. doi:10.1038/nature05164. PMID 16964241. S2CID 4431045.
  11. ^ a b Carroll J, Page TK, Chiang SC, Kalmar B, Bode D, Greensmith L, Mckinnon PJ, Thorpe JR, Hafezparast M, El-Khamisy SF (2015). "Expression of a pathogenic mutation of SOD1 sensitizes aprataxin-deficient cells and mice to oxidative stress and triggers hallmarks of premature ageing". Hum. Mol. Genet. 24 (3): 828–40. doi:10.1093/hmg/ddu500. PMC 4291253. PMID 25274775.
  12. ^ a b Date H, Igarashi S, Sano Y, Takahashi T, Takahashi T, Takano H, Tsuji S, Nishizawa M, Onodera O (December 2004). "The FHA domain of aprataxin interacts with the C-terminal region of XRCC1". Biochem. Biophys. Res. Commun. 325 (4): 1279–85. doi:10.1016/j.bbrc.2004.10.162. PMID 15555565.
  13. ^ a b c Gueven N, Becherel OJ, Kijas AW, Chen P, Howe O, Rudolph JH, Gatti R, Date H, Onodera O, Taucher-Scholz G, Lavin MF (May 2004). "Aprataxin, a novel protein that protects against genotoxic stress". Hum. Mol. Genet. 13 (10): 1081–93. doi:10.1093/hmg/ddh122. PMID 15044383.
  14. ^ Clements PM, Breslin C, Deeks ED, Byrd PJ, Ju L, Bieganowski P, Brenner C, Moreira MC, Taylor AM, Caldecott KW (November 2004). "The ataxia-oculomotor apraxia 1 gene product has a role distinct from ATM and interacts with the DNA strand break repair proteins XRCC1 and XRCC4". DNA Repair (Amst.). 3 (11): 1493–502. doi:10.1016/j.dnarep.2004.06.017. PMID 15380105.

추가 정보

외부 링크