생물분자자원시설협회
Association of Biomolecular Resource Facilities![]() | |
| 포메이션 | 1989 |
|---|---|
| 본부 | 렉싱턴, KY |
| 위치 | |
멤버십 | 1800년 (2021년 12월) |
공용어 | 영어 |
대통령 | 케빈 크누트슨 |
| 웹사이트 | http://www.abrf.org/ |
생물분자자원시설협회(ABRF)는 연구, 커뮤니케이션, 교육을 통해 핵심 및 연구 생명공학 연구소를 발전시키는 데 전념하고 있다.[1]ABRF 회원은 산업, 정부, 학술 및 연구기관을 포함한 41개국의 340개의 핵심 연구소를 대표하는 1800명 이상의 과학자를 포함하고 있다.
역사
1986년에는 제6차 단백질 시퀀스 분석 방법에 관한 국제 회의와 연계하여 연구 자원 시설 위성 회의가 개최되었다.[citation needed]다음해 단백질 염기서열화와 아미노산 샘플이 103개의 핵심 시설을 조사하기 위해 보내졌다.1989년까지 ABRF는 공식적으로 조직되고 통합되었다.매년 단백질 협회의 위성 회의로서 연례 회의가 열렸고, 그 때 개별 회의가 시작되었다.[2]
ABRF 연구 그룹
생물분자자원시설협회의 목적 중 두 가지를 충족시키기 위해 연구단을 설립한다.첫째, 절차적·운용적 정확성, 자원 설비 및 연구소의 정밀성, 효율성의 자체 평가 및 개선을 위한 메커니즘을 제공한다.둘째, 자원시설 및 연구실 직원, 사용자, 관리자, 과학계의 관심 있는 구성원의 교육에 기여한다.[3]ABRF 리서치 그룹 연구 결과는 과학 논문에 실렸다.[4][5][6]ABRF 리서치 그룹 연구의 결과는 다른 연구에서 재사용되었다.[7][8][9]
- ABRF 차세대 시퀀싱 그룹(ABRF-NGS)
- 항체기술연구그룹(ARG)
- 바이오메디컬 '오믹스 리서치 그룹(BORG)'
- DSRG(DNA Sequence Research Group)
- 흐름 Cytometry 연구 그룹(FCRG)
- Genomics Research Group(GVRG)
- 글리코프로틴 연구 그룹(gPRG)
- LMRG(Light Microscopy Research Group)
- 대사물학 연구 그룹(MRG)
- MGRG(Metagenomics Research Group)
- IMT2000 3GPP - 분자상호작용 연구그룹
- 핵산 연구 그룹(NARG)
- 단백질 표현 연구 그룹(PERG)
- 단백질 시퀀싱 연구 그룹(PSRG)
- PRG(Proteomics Research Group)
- 프로테오메 정보 연구 그룹(iPRG)
- 프로테오믹스 표준 연구 그룹(sPRG)
리소스 기술
ABRF 회원은 핵심 시설 환경에서 구현되는 광범위한 생체 분자 기술에 관여한다.
- 자동화: 높은 처리량 스크리닝, LMS, 로봇공학.
- 단백질/펩타이드 화학: 아미노산 분석, N- 및 C-단자 시퀀싱, 펩타이드 합성, 펩타이드/단백질 배열.
- 생물물리학: 칼로리메트리, CD, 형광, 빛 산란, SPR, 초경밀화
- 유동 Cytometry 형광 활성 셀 정렬
- 단백질 표현, 식별 및 프로파일링: 차등 형광, 기존 2-D 젤 전기영양, 질병 바이오마커 발견
- 유전자 표현과 프로파일링: 유전자 배열, 실시간 PCR.
- 질량분석법: 단백질, 탄수화물, 올리고뉴클레오티드, 지질 등의 질적, 정량적, 구조적 분석.
- 현미경 조명 현미경 및 이미지, 콘포칼 현미경
- 핵산 화학: DNA 염기서열, DNA 합성, RNA 합성, 유전자형.
- 분리: 1-D 페이지와 2-D 페이지, 모세관 전기영동, 크로마토그래피.
- 품질 관리: GLP, GMP, 품질 및 컴플라이언스.
- 위에서 언급한 sPRG에 의해 도입된 단백질학에서 기준 표준으로 사용되는 단백질의 혼합물인 UPS(Universal Proteomics Standard)가 그것이다.[10]여기에는 오리지널(UPS1, 48개 단백질이 모두 48pmol인 경우)과 500pmol에서 50pmol에 이르는 동적 농도 범위(UPS2)가 포함된다.[11]
- 기타: 생물정보학, 탄수화물 분석, 차등 표시, 재조합 단백질 생산.
연례 회의
매년 생물 분자 자원 설비 협회는 봄철에 다양한 북미 도시에서 열린다.이번 국제회의는 강의, 라운드테이블, 리서치그룹 발표회, 포스터 세션, 워크숍, 기술전시회 등을 통해 회원들이 새롭고 떠오르는 생명공학에 노출될 수 있도록 활용된다.
- ABRF 2022년 3월 27~30일, 캘리포니아 팜스프링스
- ABRF 2021, 3월 7-11일 COVID-19로 인한 가상 회의
- ABRF 2020, 2월 29일 - 2020년 3월 3일, 캘리포니아 팜 스프링스
- ABRF 2019, 3월 23일–26일, 텍사스 샌안토니오, 30년간 과학기술의 한계에 도전하며 미래를 여는 문
- ABRF 2018, 4월 22일–25일, 사우스 캐롤라이나 머틀 비치.Premier Conference for Core Services
- ABRF 2017, 3월 25일–28일, 캘리포니아주 샌디에이고, 미래의 혁신을 실현하기 위한 오늘날의 핵심 기술 발전을 위한 포럼
- ABRF 2016년 2월 20-23일, Ft. 플로리다 로더데일; 발견을 가속화하는 혁신 기술
- ABRF 2015, 3월 28-31일 미주리 주 세인트루이스; 과학 코어 진보를 위한 통합 기술
- ABRF 2014, 3월 23–25일, 앨버커키, 뉴멕시코, 팀 과학 및 빅 데이터: 프론티어의 코어
- ABRF 2013년 3월 2~5일 캘리포니아 팜 스프링스융합과학 발전을 위한 도구
- 2012년 ABRF, 3월 17-20일 플로리다 올랜도, 생물분자로부터 배우기
- ABRF 2011년 2월 19일–22일, 텍사스 샌안토니오.맞춤형 의약품을 활성화하는 기술
- ABRF 2010, 3월 20-23일 캘리포니아 새크라멘토; 생체분자 기술의 진보와 함께 기초 연구 번역
- ABRF 2009년 2월 7일–10일, 테네시 주 멤피스; 기존 및 신흥 바이오테크놀로지 적용 및 최적화
- ABRF 2008, 2월 9-12일, 유타 솔트레이크시티; 생명과학 분야의 기술 활성화
- ABRF 2007, 3월 31일 플로리다 탬파에서 4월 3일; 생물학적 로드맵 작성
- ABRF 2006년 2월 11-14일, 캘리포니아 롱비치; 과학, 도구 및 기술을 시스템 생물학과 통합
- 2005년 ABRF, 2월 5-8일 조지아 사바나; 바이오몰리브 테크놀로지스:디스커버리 투 가설
- ABRF 2004, 2월 28일 3월 2일, 오리건 주 포틀랜드, 프로테오믹스 및 게노믹스에 대한 기술 통합
- ABRF 2003, 2월 10-13일, 콜로라도 덴버; 프로테오믹스와 기능성 게노믹스를 이용한 생물학 번역
- ABRF 2002, 3월 9-12일, 텍사스 오스틴; 생체 분자 기술:단백질학 및 유전체학의 발견을 위한 도구
- ABRF 2001, 2월 24일–27일, 캘리포니아 샌디에이고; The New Biology:고분자 커뮤니케이션 해결 기술
- ABRF 2000, 2월 19-22일, 워싱턴 벨뷰, 단수에서 글로벌 생물 시스템 분석까지
- ABRF 1999, 3월 19-22일 노스캐롤라이나 더럼, 생물정보학 및 생체분자 기술:게놈, 프로테오놈, 생화학 연결
- ABRF 1998년 3월 21일–24일, 캘리포니아 샌디에이고; 게놈에서 기능까지 - 포스트 게놈 시대의 기술적 도전
- ABRF 1997년 2월 9일–12일 메릴랜드 볼티모어게놈-단백질 인터페이스의 기술
- ABRF 1996년 3월 30일 4월 2일 캘리포니아 샌프란시스코; 생체분자 기법
ABRF상
ABRF상은 Biomolecular Technologies에 대한 탁월한 공헌에 대해 매년 개최되는 ABRF 회의에서 수여된다.과거 수상자:[12]
- 2021 -
- 2020년 조지 교회는 유전체 염기서열 분석의 획기적인 연구와 유전자 치료와 합성 생물학 기술 분야에서 리더십을 발휘했다.
- 질량분광법을 이용한 생물학적 시스템에서 시간적, 공간적 처리의 발견을 위한 2019년 리처드 M. 카프리올리.
- 2018 Amos Bairoch는 UniProtKB/Swiss-Protect 기술기반, PROSITE, E효소, neXtPrott 등 지역사회 자원 개발을 위한 활동을 전개한다.
- 2017년 샨카르 발라수브라마니안 경과 데이비드 클렌너먼 경은 오늘날 흔히 "합성에 의한 순서"라고 알려진 차세대 DNA 염기서열 방법의 발명을 맡았다.
- 2016년 CRISPR/Cas9 게놈 편집 기술 개발을 위한 엠마뉴엘 샤르펜티어와 제니퍼 도드나.
- 2015년 존 G.고해상도 레이저 스캔 콘포칼로컬 현미경 개발을 위한 White 및 William Bradshaw Amos
- 2014 Patrick H. O'Farrell, 2차원 겔 전기영동 개발용.
- 2013년 Leonard Herzenberg와 Leonore Herzenberg가 FACS(Flow Activated Cell Sorting) 개발을 담당했다.
- 2012년 푸리에 변환 이온 사이클로트론 공명(FT-ICR) 질량분석기 개발 앨런 G. 마샬.
- 2011년 알렉 존 제프리스 경:DNA 지문 인식 및 DNA 프로파일링을 위한 개발된 기술
- 2010 Pat Brown: 마이크로레이 개발의 선구적인 작업과 유전자 연구에 이 기술의 다양한 적용.
- 2009년 마티아스 울렌
- 2008년 루디 애버설트
- 2007년 도널드 F. 사냥
- 2006년 로저 첸
- 2005년 스티븐 포더
- 2004년 에드윈 서던
- 2003년 프란츠 힐렌캄프와 마이클 카라스
- 2002년 존 펜
- 2001년 차바 호바스
- 2000 레로이 후드
- 1999년 마빈 H. 카루더스 DNA와 RNA의 화학 합성에 대한 선구적 기여
- 1998년 브루스 메리필드
- 로이드 M. 1997 스미스
- 1996년 데이비드 립먼
- 1995년 클라우스 바이만
- 1994년 프레데릭 생어
생체분자 기법 저널
ABRF는 생물 분자 기술 저널의 발행인이다.그 저널은 동료들의 리뷰를 받으며 분기별로 발행된다.[13]이 잡지의 주요 초점은 생체 분자 자원 시설과 관련된 과학적 리뷰와 기사를 게재하는 것이다.리서치 그룹이 발표한 보고서에는 연간 설문조사가 포함되어 있다.뉴스 및 이벤트뿐만 아니라 전형적인 핵심 시설 환경에서 사용되는 기법에 초점을 맞춘 기사 시계도 포함되어 있다.현재 편집장은 조지아 대학의 론 올랜도다.
ABRF 집행위원회
- Kevin Knudtson, ABRF, Genomics Division, Iowa University of Iowa
- 다트머스 대학교 회계 담당자 크리스티안 라이틀
- 반 안델 연구소 마리 애덤스
- 존스홉킨스 대학교 록산 애슈워스
- 시르다르 치투르, SUNY 알바니
- KU의료원 저스틴 키겐이
- 플로리다 주립 대학교 클라우디우스 먼도마
- 레이든 대학 의료 센터 매그너스 팰럼블라드
- 켄 쇼프만, ABRF 전무이사
참조
- ^ "Mission Statement". Association of Biomolecular Resource Facilities. Archived from the original on 1 April 2019. Retrieved 4 March 2020.
- ^ 크랩, JW: "ABRF; 간략한 역사" ABRF 뉴스, 1995년 6월
- ^ "Research Group Guidelines" (PDF). Association of Biomolecular Resource Facilities. Archived from the original (PDF) on 31 January 2012. Retrieved 15 April 2009.
- ^ Choi, Meena; Eren-Dogu, Zeynep F.; Colangelo, Christopher; Cottrell, John; Hoopmann, Michael R.; Kapp, Eugene A.; Kim, Sangtae; Lam, Henry; Neubert, Thomas A.; Palmblad, Magnus; Phinney, Brett S.; Weintraub, Susan T.; MacLean, Brendan; Vitek, Olga (2017). "ABRF Proteome Informatics Research Group (iPRG) 2015 Study: Detection of Differentially Abundant Proteins in Label-Free Quantitative LC–MS/MS Experiments". Journal of Proteome Research. 16 (2): 945–957. doi:10.1021/acs.jproteome.6b00881. PMID 27990823.
- ^ Chalkley, Robert J.; Bandeira, Nuno; Chambers, Matthew C.; Clauser, Karl R.; Cottrell, John S.; Deutsch, Eric W.; Kapp, Eugene A.; Lam, Henry H. N.; McDonald, W. Hayes; Neubert, Thomas A.; Sun, Rui-Xiang (2014). "Proteome informatics research group (iPRG)_2012: a study on detecting modified peptides in a complex mixture". Molecular & Cellular Proteomics. 13 (1): 360–371. doi:10.1074/mcp.M113.032813. PMC 3879627. PMID 24187338. Retrieved 5 November 2018.
- ^ Bennett, Keiryn L.; Wang, Xia; Bystrom, Cory E.; Chambers, Matthew C.; Andacht, Tracy M.; Dangott, Larry J.; Elortza, Félix; Leszyk, John; Molina, Henrik; Moritz, Robert L.; Phinney, Brett S.; Thompson, J. Will; Bunger, Maureen K.; Tabb, David L. (2015). "The 2012/2013 ABRF Proteomic Research Group Study: Assessing Longitudinal Intralaboratory Variability in Routine Peptide Liquid Chromatography Tandem Mass Spectrometry Analyses". Molecular & Cellular Proteomics. 14 (12): 3299–3309. doi:10.1074/mcp.O115.051888. PMC 4762617. PMID 26435129. Retrieved 5 November 2018.
- ^ Nguyen, Trung Hai; Rustenburg, Ariën S.; Krimmer, Stefan G.; Zhang, Hexi; Clark, John D.; Novick, Paul A.; Branson, Kim; Pande, Vijay S.; Chodera, John D.; Minh, David D. L. (2018). "Bayesian analysis of isothermal titration calorimetry for binding thermodynamics". PLOS ONE. 13 (9): e0203224. Bibcode:2018PLoSO..1303224N. doi:10.1371/journal.pone.0203224. PMC 6136728. PMID 30212471.
- ^ The, Matthew; Edfors, Fredrik; Perez-Riverol, Yasset; Payne, Samuel H.; Hoopmann, Michael R.; Palmblad, Magnus; Forsström, Björn; Käll, Lukas (2018). "A Protein Standard That Emulates Homology for the Characterization of Protein Inference Algorithms". Journal of Proteome Research. 17 (5): 1879–1886. doi:10.1021/acs.jproteome.7b00899. PMC 6474350. PMID 29631402.
- ^ Wu, Guanying; Wan, Xiang; Xu, Baohua (2018). "A new estimation of protein-level false discovery rate". BMC Genomics. 19 (Suppl 6): 567. doi:10.1186/s12864-018-4923-3. PMC 6101079. PMID 30367581.
- ^ "Universal Proteomics Standards – Validating the Future of Proteomics". Retrieved 22 August 2016.
- ^ "UPS1 and UP2 Proteomic Standards". Retrieved 22 August 2016.
- ^ "ABRF Award". Association of Biomolecular Resource Facilities. Archived from the original on 30 January 2012. Retrieved 22 August 2016.
- ^ "JBT: Journal of Biomolecular Techniques". Association of Biomolecular Resource Facilities. Archived from the original on 3 August 2019. Retrieved 4 March 2020.
