튜더 도메인

Tudor domain
튜더 도메인
PDB 2diq EBI.jpg
TUDOR 도메인의 구조입니다.
식별자
기호.튜더
팜PF00567
빠맘 클랜CL0049
인터프로IPR008191
스마트튜더
프로 사이트PDOC50304
SCOP23fdr/SCOPe/SUPFAM
CDDcd04508

분자생물학에서 튜더 도메인은 원래 드로소필라로 [1]인코딩된 튜더 단백질에서 확인된 보존된 단백질 구조 도메인이다.튜더 유전자는 태아의 발달이나 [2]출산을 조절하는 모성 요인들에 대한 드로소필라 검사에서 발견되었다.이곳의 돌연변이는 튜더 왕 헨리 8세와 그의 [1]아내들이 겪은 몇 번의 유산에 대한 언급으로 튜더라는 이름을 얻으면서 후손들에게 치명적입니다.

구조.

튜더 도메인은 길이가 약 60개의 아미노산 단백질 영역이며, 5가닥 역평행 베타 배럴 [1]형태로 SH3와 같은 구조로 접힌다.튜더 도메인은 단일 튜더 도메인, 탠덤 튜더 도메인 또는 공유된 두 번째 및 세 번째 베타 스트랜드로 만든 [1]반병렬 베타 시트로 연결된 두 튜더 도메인으로 구성된 하이브리드 튜더 도메인으로 구성된 기능 단위로 구성할 수 있습니다.튜더 도메인 구조의 필수 구성 요소는 여러 개의 방향족 아미노산 [1]잔류물에 의해 형성된 방향족 결합 케이지이다.

메틸화 잔류물과의 상호작용

튜더 도메인은 메틸화 리신과 아르기닌 잔기를 인식하고 결합함으로써 기능을 발휘하여 후생유전학적 [1]맥락에서 히스톤 리더로서 기능할 수 있다.이는 메틸화된 Arg/Lys 잔기와 튜더 도메인의 방향족 결합 [1]케이지의 방향족 잔류물 사이의 양이온-pi 상호작용을 통해 발생한다.튜더 도메인에 따라 이 상호작용은 메틸화 상태 고유(모노화, 디화 또는 트리메틸화)[1]일 수 있습니다.

기능.

DNA전사와 수정

튜더 도메인 단백질은 후생성 조절에 관여하며 번역 후 히스톤 변형을 인식하여 어댑터 [2]단백질로서 전사를 바꿀 수 있다.메틸화 아르기닌 및 리신 히스톤 잔기의 인식은 하류 효과인자를 모집하여 튜더 도메인 단백질 및 [1]맥락에 따라 크로마틴 사일런싱 또는 활성화를 초래한다.예를 들어 인간 TDRD3 단백질은 메틸화 아르기닌 잔기를 결합하여 에스트로겐 응답성 [3]요소의 전사를 촉진한다.반대로 폴리콤유사단백질(PCL)은 [4]전사를 억제하는 히스톤 H3K27 메틸전달효소인 폴리콤억제복합체2(PRC2)의 성분을 모집하는 어댑터로 작용한다.또한 튜더 도메인 단백질은 DNA 메틸화 및 헤테로크로마틴 [1]조립을 촉진하기 위해 DNA-메틸전달효소를 모집함으로써 전사를 억제할 수 있다.튜더 도메인 단백질은 후생유전학적 [1]변형을 유지하고 전파하는 기능도 가지고 있다.

게놈 안정성

튜더 왕국은 [5]역트랜스포존과 같은 이기적인 유전 요소의 침묵에 관여하고 있다.이 기능은 Tdrd7과 같은 튜더 함유 단백질과 piRNA [6]합성을 통해 직접 수행된다.튜더 도메인은 Yb 단백질의 Yb 체내 국재화, Drosophila 극질 조립, PiRNA를 장전하기 위한 단백질 모집 등 piRNA [5]생성과 관련된 단백질 기계의 국재화에 필수적이다.

DNA손상반응

인간 p53 결합 단백질 1(TRP53BP1)은 외부 [5]자극으로부터 게놈을 보호하는 기능을 하는 DNA 손상 반응(DDR) 경로에 관여하는 튜더 도메인 단백질이다.어댑터 단백질을 통해 손상을 감지하고 세포 주기 정지, DNA 복구, 전사 수정, 아포토시스 [5]등의 반응을 유발하는 일련의 사건이다.TRP53BP1s Tudor 도메인은 손상 부위에 축적되는 센서에 대한 결합을 중개하고 손상 [5]부위에 대한 이펙터 모집을 촉진하는 어댑터 역할도 합니다.TRP53BP1은 DDR에 필수적입니다. DDR은 관련된 [5]여러 단백질의 조절과 획득에 매우 복잡한 역할을 하기 때문입니다.

RNA대사

RNA 대사에 관여하는 튜더 도메인 단백질은 약 180개의 아미노산의 [5]확장된 튜더 도메인을 가지고 있다.이러한 단백질은 RNA를 대상으로 하는 RNA 결합 모티브를 포함하거나 RNA에 [5]결합된 단백질의 디메틸화 아르기닌에 결합합니다.이러한 단백질은 처리, 안정성, 번역 및 작은 RNA [5]경로를 포함한 RNA 대사의 여러 측면을 조절합니다.구체적으로는 생존운동뉴런(SMN)[5] 단백질은 snRNA를 결합하고 SNRN의 단백질 성분을 형성하는 SM 단백질의 비대칭 디메틸화 아르기닌을 모집함으로써 snRN(소핵 리보핵단백질)의 조립을 매개하는 튜더 도메인 단백질이다.SMN은 스플라이소좀 조립 및 인트론 [5]제거에 필수적인 snRN의 숙성을 촉진합니다.

예

JMJD2A의[7] 하이브리드 튜더 도메인

TP53BP1(Tumor suppressor p53-binding protein 1) 단백질과 그 핵분열 효모 호몰로그 Crb2[8] 및 JMJD2A(2A를 포함한 Jumonji 도메인)는 탠덤 또는 이중 튜더 도메인을 포함하고 메틸화 히스톤을 [9][10]인식한다.

인간 SMN(운동 뉴런의 생존)에서 구조적으로 특징지어지는 튜더 도메인은 통 모양의 접힌 5개의 β-strand로 구성된 강하게 구부러진 반평행 β-시트이며 대칭적으로 디메틸화 아르기닌을 [11]인식한다.

단백질을 포함한 다른 튜더 도메인으로는 AKAP1(A-키나아제 앵커 단백질 [12]1) 및 ARID4A(AT 리치 인터랙티브 도메인 4A)가 있다.단백질을 함유하는 잘 알려진 튜더 도메인은 1(SND1)/Tudor-SN/p100 공동활성제이다.[13]SND1은 RISC 복합체에 관여하며 AEG-1 [14]종양유전자와 상호작용한다.SND1은 또한 종양 유전자로 작용하며 HCC와 대장암에 [15]매우 중요한 역할을 한다.SND1 튜더 도메인은 PIWIL1 [16]단백질에서 메틸화된 아르기닌과 결합합니다.SND1을 포함한 튜더는 NF-kappaB 및 miR-221을 [17]포함하는 새로운 경로를 통해 인간 간세포암에서 종양 혈관신생을 촉진한다.튜더 SND1은 드로소필라 멜라노가스터에도 [6]존재한다.

레퍼런스

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