PATZ1

PATZ1
사용 가능한 구조
PDB	Ortholog 검색: PDBe RCSB
PDB ID 코드 목록
	2EPP, 2EPQ, 2EPR, 2EPS, 2YT9
식별자
에일리어스	아연 핑거 1을 포함한 PATZ1, MAZR, PATZ, RIAZ, ZBTB19, ZNF278, ZSG, dJ400N23, POZ/BTB 및 AT 후크
외부 ID	OMIM: 605165 MGI: 1891832 HomoloGene: 8636 GeneCard: PATZ1
유전자 위치(인간)
크르.	22번 염색체(인간)
끝.	31,346,346 bp
유전자 위치(마우스)
크르.	11번 염색체(쥐)
끝.	3,259,083 bp
RNA발현패턴
	상단 표시 위치:
	신경절 융기; ; 갑상선 우엽; ; 우측 자궁관; ; 갑상선 좌엽; ; 소침샘; ; 난소; ; 췌장체; ; 위체; ; 전립선; ; 안저;
	추가 참조 표현식 데이터
	; ; ; ;
	추가 참조 표현식 데이터
유전자 존재론
분자 함수	GO:0000980 RNA중합효소II 시스조절영역배열특이적 DNA결합; DNA결합; GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA결합전사활성화제, RNA중합효소II 특이적; 크로마틴 결합; GO:0001948 단백질 결합; 금속 이온 결합; 핵산 결합; GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA결합전사인자활성, RNA중합효소II 특이적;
셀룰러 컴포넌트	핵; 핵소체;
생물학적 과정	유전자 발현 조절; 전사의 양성 조절, DNA 템플릿화; T세포분화; 남성 생식선 발달; 전사 음성 조절, DNA 템플릿; 전사조절, DNA템플릿화; RNA중합효소II에 의한 전사; 정자 형성; RNA중합효소II에 의한 전사의 양성 조절; 전사, DNA 템플릿;
	출처:아미고 / QuickGO
맞춤법
	23598
	56218
	ENSG00000100105
	ENSMUSG000020453
	Q9HBE1
	Q5 NBY9
	NM_032052; NM_014323; NM_032050; NM_032051
	NM_001253690; NM_001253691; NM_019574
	NP_055138; NP_114439; NP_114440; NP_114441
	NP_001240619; NP_001240620; NP_062520
	위키데이터
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POZ-, AT-후크, 아연 핑거 함유 단백질 1은 PATZ1 ^[5]^[6]^[7]^[8]유전자에 의해 인체 내에서 암호화되는 단백질이다.

기능.

이 유전자에 의해 암호화된 단백질은 AT-훅 DNA 결합 모티브를 포함하고 있으며, 이것은 보통 염색질 모델링과 전사 조절에 중요한 역할을 하기 위해 다른 DNA 결합 구조에 결합합니다.Poz 도메인은 단백질-단백질 상호작용의 부위로 기능하는 것으로 생각되며 전사 억제에 필요하며, 아연 손가락은 DNA 결합 도메인을 구성한다.부호화 단백질은 전사 인자의 전형적인 특징을 가지기 때문에 유전자 발현 억제제라고 가정한다.작은 원형 세포 육종에서, 이 유전자는 22q의 작은 반전에 의해 EWS에 융합되어 잡종이 전위하는 것으로 생각된다(t(1;22)(p36.1;q12).염색체 22의 전위는 EWS의 인트론 8과 이 유전자의 엑손 1이 이 단백질의 아연 핑거 도메인에 융합된 EWS의 트랜스활성화 도메인을 포함하는 키메라 배열을 생성하는 것을 포함한다.이것은 염색체 22의 염색체 내 재배열의 뚜렷한 예이다.이 ^[8]유전자에 대해 4개의 대체적으로 스플라이스된 전사 변이가 설명된다.

상호 작용

PATZ1은 다음과 상호작용하는 것으로 나타났습니다.

레퍼런스

^ ^a ^b ^c GRCh38: 앙상블 릴리즈 89: ENSG00000100105 - 앙상블, 2017년 5월
^ ^a ^b ^c GRCm38: 앙상블 릴리즈 89: ENSMUSG000020453 - 앙상블, 2017년 5월
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^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
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^ ^a ^b "Entrez Gene: PATZ1 POZ (BTB) and AT hook containing zinc finger 1".
^ ^a ^b Pero R, Lembo F, Palmieri EA, Vitiello C, Fedele M, Fusco A, Bruni CB, Chiariotti L (February 2002). "PATZ attenuates the RNF4-mediated enhancement of androgen receptor-dependent transcription". J. Biol. Chem. 277 (5): 3280–5. doi:10.1074/jbc.M109491200. PMID 11719514.
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^ Fedele M, Benvenuto G, Pero R, Majello B, Battista S, Lembo F, Vollono E, Day PM, Santoro M, Lania L, Bruni CB, Fusco A, Chiariotti L (March 2000). "A novel member of the BTB/POZ family, PATZ, associates with the RNF4 RING finger protein and acts as a transcriptional repressor". J. Biol. Chem. 275 (11): 7894–901. doi:10.1074/jbc.275.11.7894. PMID 10713105.

추가 정보

Sanger Centre, The; Washington University Genome Sequencing Cente, The (1999). "Toward a complete human genome sequence". Genome Res. 8 (11): 1097–108. doi:10.1101/gr.8.11.1097. PMID 9847074.
Kobayashi A, Yamagiwa H, Hoshino H, Muto A, Sato K, Morita M, Hayashi N, Yamamoto M, Igarashi K (2000). "A Combinatorial Code for Gene Expression Generated by Transcription Factor Bach2 and MAZR (MAZ-Related Factor) through the BTB/POZ Domain". Mol. Cell. Biol. 20 (5): 1733–46. doi:10.1128/MCB.20.5.1733-1746.2000. PMC 85356. PMID 10669750.
Fedele M, Benvenuto G, Pero R, Majello B, Battista S, Lembo F, Vollono E, Day PM, Santoro M, Lania L, Bruni CB, Fusco A, Chiariotti L (2000). "A novel member of the BTB/POZ family, PATZ, associates with the RNF4 RING finger protein and acts as a transcriptional repressor". J. Biol. Chem. 275 (11): 7894–901. doi:10.1074/jbc.275.11.7894. PMID 10713105.
Mastrangelo T, Modena P, Tornielli S, Bullrich F, Testi MA, Mezzelani A, Radice P, Azzarelli A, Pilotti S, Croce CM, Pierotti MA, Sozzi G (2000). "A novel zinc finger gene is fused to EWS in small round cell tumor". Oncogene. 19 (33): 3799–804. doi:10.1038/sj.onc.1203762. PMID 10949935.
Pero R, Lembo F, Palmieri EA, Vitiello C, Fedele M, Fusco A, Bruni CB, Chiariotti L (2002). "PATZ attenuates the RNF4-mediated enhancement of androgen receptor-dependent transcription". J. Biol. Chem. 277 (5): 3280–5. doi:10.1074/jbc.M109491200. PMID 11719514.
Mitchelmore C, Kjaerulff KM, Pedersen HC, Nielsen JV, Rasmussen TE, Fisker MF, Finsen B, Pedersen KM, Jensen NA (2002). "Characterization of two novel nuclear BTB/POZ domain zinc finger isoforms. Association with differentiation of hippocampal neurons, cerebellar granule cells, and macroglia". J. Biol. Chem. 277 (9): 7598–609. doi:10.1074/jbc.M110023200. PMID 11744704.
Morii E, Oboki K, Kataoka TR, Igarashi K, Kitamura Y (2002). "Interaction and cooperation of mi transcription factor (MITF) and myc-associated zinc-finger protein-related factor (MAZR) for transcription of mouse mast cell protease 6 gene". J. Biol. Chem. 277 (10): 8566–71. doi:10.1074/jbc.M110392200. PMID 11751862.
Collins JE, Wright CL, Edwards CA, Davis MP, Grinham JA, Cole CG, Goward ME, Aguado B, Mallya M, Mokrab Y, Huckle EJ, Beare DM, Dunham I (2005). "A genome annotation-driven approach to cloning the human ORFeome". Genome Biol. 5 (10): R84. doi:10.1186/gb-2004-5-10-r84. PMC 545604. PMID 15461802.

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[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: 앙상블 릴리즈 89: ENSG00000100105 - 앙상블, 2017년 5월

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: 앙상블 릴리즈 89: ENSMUSG000020453 - 앙상블, 2017년 5월

[3] "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.

[4] "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.

[pmid10591208-5] Dunham I, Shimizu N, Roe BA, Chissoe S, Hunt AR, Collins JE, Bruskiewich R, Beare DM, Clamp M, Smink LJ, Ainscough R, Almeida JP, Babbage A, Bagguley C, Bailey J, Barlow K, Bates KN, Beasley O, Bird CP, Blakey S, Bridgeman AM, Buck D, Burgess J, Burrill WD, O'Brien KP (December 1999). "The DNA sequence of human chromosome 22". Nature. 402 (6761): 489–95. doi:10.1038/990031. PMID 10591208.

[pmid18241078-6] Fedele M, Franco R, Salvatore G, Paronetto MP, Barbagallo F, Pero R, Chiariotti L, Sette C, Tramontano D, Chieffi G, Fusco A, Chieffi P (April 2008). "PATZ1 gene has a critical role in the spermatogenesis and testicular tumours". J Pathol. 215 (1): 39–47. doi:10.1002/path.2323. PMID 18241078.

[pmid18401526-7] Tian X, Sun D, Zhang Y, Zhao S, Xiong H, Fang J (April 2008). "Zinc finger protein 278, a potential oncogene in human colorectal cancer". Acta Biochim Biophys Sin (Shanghai). 40 (4): 289–96. CiteSeerX 10.1.1.624.619. doi:10.1111/j.1745-7270.2008.00405.x. PMID 18401526.

[entrez-8] "Entrez Gene: PATZ1 POZ (BTB) and AT hook containing zinc finger 1".

[pmid11719514-9] Pero R, Lembo F, Palmieri EA, Vitiello C, Fedele M, Fusco A, Bruni CB, Chiariotti L (February 2002). "PATZ attenuates the RNF4-mediated enhancement of androgen receptor-dependent transcription". J. Biol. Chem. 277 (5): 3280–5. doi:10.1074/jbc.M109491200. PMID 11719514.

[pmid11751862-10] Morii E, Oboki K, Kataoka TR, Igarashi K, Kitamura Y (March 2002). "Interaction and cooperation of mi transcription factor (MITF) and myc-associated zinc-finger protein-related factor (MAZR) for transcription of mouse mast cell protease 6 gene". J. Biol. Chem. 277 (10): 8566–71. doi:10.1074/jbc.M110392200. PMID 11751862.

[pmid10713105-11] Fedele M, Benvenuto G, Pero R, Majello B, Battista S, Lembo F, Vollono E, Day PM, Santoro M, Lania L, Bruni CB, Fusco A, Chiariotti L (March 2000). "A novel member of the BTB/POZ family, PATZ, associates with the RNF4 RING finger protein and acts as a transcriptional repressor". J. Biol. Chem. 275 (11): 7894–901. doi:10.1074/jbc.275.11.7894. PMID 10713105.

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