제한 효소 절단 부위 목록:T~Z
List of restriction enzyme cutting sites:| 핵염기 범례 | |
|---|---|
| 코드 | 표시된 뉴클레오티드 |
| A | 아데닌(A) |
| C | 시토신(C) |
| G | 구아닌(G) |
| T | 티민(T) |
| N | A, C, G 또는 T |
| M | A 또는 C |
| R | A 또는 G |
| W | A 또는 T |
| Y | C 또는 T |
| S | C 또는 G |
| K | G 또는 T |
| H | A, C 또는 T |
| B | C, G 또는 T |
| V | A, C 또는 G |
| D | A, G 또는 T |
이 기사에는 이름이 T에서 Z로 시작하는 가장 많이 연구된 제한 효소의 목록이 포함되어 있습니다.그것은 약 70개의 효소를 함유하고 있다.
다음과 같은 정보가 제공됩니다.
- 효소: 국제적으로 통용되고[1][2] 있는 명명법 및 참고문헌에 따라 승인된 분자명(자세한 내용은 '제한효소'의 '명칭법' 참조)
- PDB 코드:단백질 구조의 PDB 데이터베이스에서 단백질 구조를 식별하는 데 사용되는 코드입니다.단백질의 3D 원자 구조는 그 작용[3][4] 메커니즘의 친밀한 세부사항을 이해하기 위해 매우 가치 있는 정보를 제공합니다.
- 출처 : 효소를 자연적으로 생성하는 유기체.
- 인식 시퀀스:효소에 의해 인식되고 그것이 특이적으로 결합하는 DNA의 배열.
- 절단: 절단 부위 및 절단 DNA 제품.일반적으로 인식 시퀀스와 절단 부위가 일치하지만 절단 부위가 인식[5][6] 부위에서 수십 개의 뉴클레오티드가 떨어져 있을 수 있습니다.
- 이성질체 및 네오 이성질체:이성질체는 다른 것과 같은 염기서열을 인식하는 효소이다.네오시조머는 다른 것과 같은 서열을 인식하지만 다른 방식으로 절단하는 특별한 형태의 이성질체이다.모든 효소에는 최대 8-10개의 가장 일반적인 이성질체가 표시되지만 더 많을 수 있습니다.네오시조머는 굵은 녹색 글꼴로 표시됩니다(예:BamHI)"None on date"가 표시되면 해당 날짜에 절단 부위가 명확하게 정의된 데이터베이스에 등록된 이성질체가 없음을 의미합니다.흰색 글꼴과 회색 배경으로 표시된 이성질체는 현재 목록에 나열되지 않은 효소에 해당합니다.
열거되지 않은 효소: 에코R70I
제한효소
T
| 효소 | PDB 코드 | 원천 | 인식 시퀀스 | 인하. | 이성질체 |
| TaI | 테르머스 아쿠아티쿠스 Vn 4-311 | 5' ACNGT 3' TGNCA | 5' ---ACN GT--- 3' 3' ---TG NCA--- 5' | ||
| 타이아이 | 테르머스 아쿠아티쿠스 cs1-331 | 5' ACGT 3' TGCA | 5' ---ACGT --- 3' 3' --- TGCA--- 5' | ||
| TaqI | 테르머스 아쿠아쿠아티쿠스 | 5' TCGA 3' AGCT | 5' ---T CGA--- 3' 3' ---AGC T--- 5' | ||
| TaqII | 테르머스 아쿠아티쿠스 YTI | 5' GACCGA 3' CTGGCT | 5' ---GACCGAN8NNN --- 3' 3' ---CTGGCTN8N NN--- 5' | ||
| Taq52I | 테르머스 아쿠아티쿠스 YS52 | 5' GCWGC 3' CGWCG | 5' ---G CWGC--- 3' 3' ---CGWC G--- 5' | ACEI, ApeKI, Sui, TseI | |
| TaqXI | 테르머스 아쿠아쿠아티쿠스 | 5' CCWGG 3' GGWCC | 5' ---CC WGG--- 3' 3' ---GGW CC--- 5' | ApaORI, BseBI, BsiLI, BstNI, BstOI, Bst2UI, MvaI, SleI, SspAI | |
| 태시 | 테르머스 아쿠아티쿠스 Vn 4-211 | 5' AATT 3' TTAA | 5' --- AATT--- 3' 3' ---TTAA --- 5' | ||
| 타티 | 테르머스 아쿠아티쿠스 CBA1-331 | 5' WGTACW 3' WCATGW | 5' ---W GTACW--- 3' 3' ---WCATG W--- 5' | ||
| 타우아이 | 테르머스 아쿠아쿠아티쿠스 | 5' GCSGC 3' CGSCG | 5' ---GCSG C--- 3' 3' ---C GSCG--- 5' | ||
| TelI | 톨리포트릭스는 상세하게 기술한다. | 5' GACNNNGTC 3' CTGNNNCAG | 5' ---GACN NNGTC--- 3' 3' ---CTGNN NCAG--- 5' | AspI, AtsI, PflFI, PsyI, Tth111I | |
| TFII | 테르무스필라포미스 | 5' GAWTC 3' CTWAG | 5' ---G AWTC--- 3' 3' ---CTWA G--- 5' | ||
| 타이 | 열가소성아시드필럼 | 5' CGCG 3' GCGC | 5' ---CG CG--- 3' 3' ---GC GC--- 5' | Bpu95I, Bsh1236I, Bsp50I, BstFNI, BstUI, Csp68KVI, FalII, FnuDII | |
| TLII | 열전성 리토랄리스 | 5' CTCGAG 3' GAGCTC | 5' ---C TCGAG--- 3' 3' ---GAGCT C--- 5' | AbrI, BluI, BssHI, MavI, Sau3239I, Sfr274I, StrI, XhoI | |
| 트루1I | 서머스 러버 RFL1 | 5' TTAA 3' AATT | 5' ---T TAA--- 3' 3' ---AAT T--- 5' | ||
| Tru9I | 테르무스 러버 9 | 5' TTAA 3' AATT | 5' ---T TAA--- 3' 3' ---AAT T--- 5' | ||
| Tru201I | 테르머스 러버 201 | 5' RGATCY 3' YCTAGR | 5' ---R GATCY--- 3' 3' ---YCTAG R--- 5' | ||
| TscI | 써머스 sp. 491A | 5' ACGT 3' TGCA | 5' ---ACGT --- 3' 3' --- TGCA--- 5' | ||
| 체이 | 써머스 93170 | 5' GCWGC 3' CGWCG | 5' ---G CWGC--- 3' 3' ---CGWC G--- 5' | ACEI, ApeKI, Sui, Taq52I | |
| Tsp1I | 써머스 1호 | 5' ACTGG 3' TGACC | 5' ---ACTGGN --- 3' 3' ---TGAC CN--- 5' | ||
| Tsp32I | 써머스 제32장 | 5' TCGA 3' AGCT | 5' ---T CGA--- 3' 3' ---AGC T--- 5' | ||
| Tsp32II | 써머스 제32장 | 5' TCGA 3' AGCT | 5' ---T CGA--- 3' 3' ---AGC T--- 5' | ||
| Tsp45I | 써머스 스패프YS45 | 5' GTSAC 3' CASTG | 5' --- GTSAC--- 3' 3' ---CASTG --- 5' | ||
| Tsp49I | 써머스 스패프 | 5' ACGT 3' TGCA | 5' ---ACGT --- 3' 3' --- TGCA--- 5' | ||
| Tsp509I | 써머스 스패프 | 5' AATT 3' TTAA | 5' --- AATT--- 3' 3' ---TTAA --- 5' | ||
| TspBI | 호열성 SP. | 5' CCRYGG 3' GGYRCC | 5' ---C CRYGG--- 3' 3' ---GGYRC C--- 5' | ||
| Tsp4CI | 써머스 4C | 5' ACNGT 3' TGNCA | 5' ---ACN GT--- 3' 3' ---TG NCA--- 5' | ||
| TspDTI | 써머스 스패프DT | 5' ATGAA 3' TACTT | 5' ---ATGAAN8NNN --- 3' 3' ---TACTTN8N NN--- 5' | - 2010년 5월에는 없음 - | |
| TspEI | 써머스 1E | 5' AATT 3' TTAA | 5' --- AATT--- 3' 3' ---TTAA --- 5' | ||
| Tsp8EI | 써머스 8E | 5' GCCN5GGC 3' CGGN5CCG | 5' ---GCCNNNN NGGC--- 3' 3' ---CGGN NNNNCCG--- 5' | ||
| TspGWI | 써머스 스패프GW | 5' ACGGA 3' TGCCT | 5' ---ACGGAN8NNN --- 3' 3' ---TGCCTN8N NN--- 5' | ||
| TspMI = UthSI | 정체불명의 열애호성 물질 | 5' CCCGGG 3' GGGCCC | 5' ---C CCGGG--- 3' 3' ---GGGCC C--- 5' | AhyI, Cfr9I, EaeAI, EclRI, PaeBI, PspAI, SmaI, XcyI, XmaI, XmaI, XmaI | |
| TSPRI | 써머스 스패프r | 5' CASTGNN 3' GTSAC | 5' ---CASTGNN --- 3' 3' --- GTSACNN--- 5' | ||
| Tth111I | 서모필러스 111 | 5' GACNNNGTC 3' CTGNNNCAG | 5' ---GACN NNGTC--- 3' 3' ---CTGNN NCAG--- 5' | AspI, AtsI, PflFI, PsyI, TelI | |
| Tth111II | 서모필러스 111 | 5' CAARCA 3' GTTYGT | 5' ---CAARCAN8NNN --- 3' 3' ---GTTYGTN8N NN--- 5' | ||
| THB8I | 서모필러스 HB8 | 5' TCGA 3' AGCT | 5' ---T CGA--- 3' 3' ---AGC T--- 5' |
U
| 효소 | PDB 코드 | 원천 | 인식 시퀀스 | 인하. | 이성질체 |
| Uba4009I | 미확인균 A | 5' GGATCC 3' CCTAGG | 5' ---G GATCC--- 3' 3' ---CCTAG G--- 5' | AccEBI, AliI, ApaCI, AsiI, BamHI, BnaI, BspAAIII, RspLKII, SolI | |
| 우바153AI | 미확인균 153A | 5' CAGCTG 3' GTCGAC | 5' ---CAG CTG--- 3' 3' ---GTC GAC--- 5' | ||
| UbaM39I | 미확인균 M39 | 5' CAGCTG 3' GTCGAC | 5' ---CAG CTG--- 3' 3' ---GTC GAC--- 5' | ||
| 언비 | 미확인세균 #8 | 5' GGNCC 3' CCNGG | 5' --- GGNCC--- 3' 3' ---CCNGG --- 5' | AvcI, BavAII, Bce22I, Bsp1894I, Bsu54I, FmuI, NspIV, UnbI | |
| Uur960I | 우레아플라스마 우레알리티쿰 960 | 5' GCNGC 3' CGNCG | 5' ---GC NGC--- 3' 3' ---CGN CG--- 5' |
V
| 효소 | PDB 코드 | 원천 | 인식 시퀀스 | 인하. | 이성질체 |
| Van91I | 비브리오 앵글라룸 RFL91 | 5' CCAN5TGG 3' GGTN5ACC | 5' ---CCANNNN NTGG--- 3' 3' ---GGTN NNNNACC--- 5' | AccB7I, AcpII, ASP10HII, BasI, Esp1396I, PflBI, PflMI | |
| Vha464I | 비브리오 하베이 464 | 5' CTTAAG 3' GAATTC | 5' ---C TTAAG--- 3' 3' ---GAATT C--- 5' | ||
| VneI | 비브리오 네리스 18 | 5' GTGCAC 3' CACGTG | 5' ---G TGCAC--- 3' 3' ---CACGT G--- 5' | Alw44I, ApaLI, SnoI | |
| VpaK32I | 비브리오 부용혈증 4387-61 | 5' GCTCTTC 3' CGAGAAG | 5' ---GCTCTTCN NNN--- 3' 3' ---CGAGAAGNNNN --- 5' | ||
| VpaK11AI | 비브리오 부용혈증 1743 | 5' GGWCC 3' CCWGG | 5' --- GGWCC--- 3' 3' ---CCWGG --- 5' | Bme216I, CauI, EagMI, FdiI, HgiBI, HgiHII, SinI, VpaK11BI | |
| VpaK11BI | 비브리오 부용혈증 1743-1 | 5' GGWCC 3' CCWGG | 5' ---G GWCC--- 3' 3' ---CCWG G--- 5' | BsrAI, CauI, EagMI, FdiI, HgiBI, HgiJI, SinI, VpaK11AI | |
| VspI | 비브리오 343장 | 5' ATTAAT 3' TAATTA | 5' ---AT TAAT--- 3' 3' ---TAAT TA--- 5' | AseI, AsnI, BpoAI, PshBI, Sru4DI |
X
| 효소 | PDB 코드 | 원천 | 인식 시퀀스 | 인하. | 이성질체 | |||
| XagI | 크산토박터 아질리스 Vs 18-132 | 5' CCTN5AGG 3' GGAN5TCC | 5' ---CCTNN NNNAGG--- 3' 3' ---GGANNN NNTCC--- 5' | |||||
| XapI | 크산토모나스 암펠리나 슬로 51-021 | 5' RAATTY 3' YTTAAR | 5' ---R AATTY--- 3' 3' ---YTTAA R--- 5' |
| ||||
| XbaI[7] | 크산토모나스바드리 | 5' TCTAGA 3' AGATCT | 5' ---T CTAGA--- 3' 3' ---AGATC T--- 5' | |||||
| XCAI | 크산토모나스 캄페스트리스 | 5' GTATAC 3' CATATG | 5' ---GTA TAC--- 3' 3' ---CAT ATG--- 5' | |||||
| XceI | 크산토모나스 캄페스트리스 Ast 40-024 | 5' RCATGY 3' YGTACR | 5' ---RCATG Y--- 3' 3' ---Y GTACR--- 5' | |||||
| XCII | 크산토모나스시트리 | 5' GTCGAC 3' CAGCTG | 5' ---G TCGAC--- 3' 3' ---CAGCT G--- 5' | |||||
| XcmI | 크산토모나스 캄페스트리스 | 5' CCAN9TGG 3' GGTN9ACC | 5' ---CCANNNNN NNNNTGG--- 3' 3' ---GGTNNNN NNNNNACC--- 5' | |||||
| XcyI | 크산토모나스시아놉시디스13D5 | 5' CCCGGG 3' GGGCCC | 5' ---C CCGGG--- 3' 3' ---GGGCC C--- 5' | CfrJ4I, EaeAI, EclRI, Pac25I, PspAI, TspMI, XmaI, XmaCI | ||||
| XoI | 크산토모나스 홀시콜라 | 5' CTCGAG 3' GAGCTC | 5' ---C TCGAG--- 3' 3' ---GAGCT C--- 5' | AbrI, BluI, BssHI, PanI, Sau3239I, Sfr274I, TliI, XpaI | ||||
| XoII | 크산토모나스 홀시콜라 | 5' RGATCY 3' YCTAGR | 5' ---R GATCY--- 3' 3' ---YCTAG R--- 5' | |||||
| XMAI | 크산토모나스말바세아룸 | 5' CCCGGG 3' GGGCCC | 5' ---C CCGGG--- 3' 3' ---GGGCC C--- 5' | AhyI, Cfr9I, EaeAI, EclRI, PaeBI, PspAI, TspMI, XcyI, XmaCI | ||||
| XmaII | 크산토모나스말바세아룸 | 5' CGGCCG 3' GCCGGC | 5' ---C GGCCG--- 3' 3' ---GCCGG C--- 5' | AAAI, BseX3I, BstZI, EagI, EclXI, Eco52I, SenPT16I | ||||
| XmaCI | 크산토모나스말바세아룸C | 5' CCCGGG 3' GGGCCC | 5' ---C CCGGG--- 3' 3' ---GGGCC C--- 5' | AhyI, Cfr9I, EaeAI, EclRI, PaeBI, Pac25I, PspAI, TspMI, XcyI, XmaI | ||||
| XmaJI | 크산토모나스말토필리아조85-025 | 5' CCTAGG 3' GGATCC | 5' ---C CTAGG--- 3' 3' ---GGATC C--- 5' | AspA2I, AvrII, AvrBII, BlnI, BspA2i | ||||
| XMII | 크산토모나스말토필리아조21-021 | 5' GTMKAC 3' CAKMTG | 5' ---GT MKAC--- 3' 3' ---CAKM TG--- 5' | AccI, FblI | ||||
| XmnI | 크산토모나스 마니호티스 7AS1 | 5' GAAN4TTC 3' CTTN4AAG | 5' ---GAANN NNTTC--- 3' 3' ---CTTNN NNAAG--- 5' | ASP700I, BbvAI, MroXI, PDMI | ||||
| XorII | 크산토모나스오리새 | 5' CGATCG 3' GCTAGC | 5' ---CGAT CG--- 3' 3' ---GC TAGC--- 5' | Afa16RI, BspCI, EagBI, ErhB9I, MvrI, Ple19I, PvuI, RshI | ||||
| XpaI | 크산토모나스 파파베리콜라 | 5' CTCGAG 3' GAGCTC | 5' ---C TCGAG--- 3' 3' ---GAGCT C--- 5' | BssHI, MavI, PanI, SauLPII, Sbi68I, Sol10179I, StrI, XhoI | ||||
| XspI | 크산토모나스 스펜서YK1 | 5' CTAG 3' GATC | 5' ---C TAG--- 3' 3' ---GAT C--- 5' |
Y
| 효소 | PDB 코드 | 원천 | 인식 시퀀스 | 인하. | 이성질체 |
| 예니 | 예르시니아 장염 08 A2635 | 5' CTGCAG 3' GACGTC | 5' ---CTGCA G--- 3' 3' ---G ACGTC--- 5' | Asp713I, BsuBI, CfrA4I, Ecl37kI, Psp23I, PstI, SalPI, SfLI, Sst12I |
Z
| 효소 | PDB 코드 | 원천 | 인식 시퀀스 | 인하. | 이성질체 | ||||
| Zani | 시모모모나스 혐기증 | 5' CCWGG 3' GGWCC | 5' ---CC WGG--- 3' 3' ---GGW CC--- 5' | ApaORI, BseBI, BspNI, BstNI, Bst2UI, CthII, EcoRII, MvaI, SspAI | |||||
| ZhoI | 시모모모나스 홀시콜라 | 5' ATCGAT 3' TAGCTA | 5' ---AT CGAT--- 3' 3' ---TAGC TA--- 5' | BanII, BbvAII, BscI, BspJI, ClaI, LcaI, PgaI, SpmI, Ssp27144i | |||||
| ZraI | 히가시카미 11 | 5' GACGTC 3' CTGCAG | 5' ---GAC GTC--- 3' 3' ---CTG CAG--- 5' | AatII, Ssp5230I | |||||
| ZrmI | 주글로에아 라미게라 SCA | 5' AGTACT 3' TCATGA | 5' ---AGT ACT--- 3' 3' ---TCA TGA--- 5' |
| |||||
| Zsp2I | Zo Gloea sp.2 | 5' ATGCAT 3' TACGTA | 5' ---ATGCA T--- 3' 3' ---T ACGTA--- 5' | BfrBI, Csp68KIII, EcoT22I, NsiI, PinBI, Ppu10I, SepI, SspD5II | |||||
메모들
- ^ Smith HO, Nathans D (December 1973). "Letter: A suggested nomenclature for bacterial host modification and restriction systems and their enzymes". J. Mol. Biol. 81 (3): 419–23. doi:10.1016/0022-2836(73)90152-6. PMID 4588280.
- ^ Roberts RJ, Belfort M, Bestor T, Bhagwat AS, Bickle TA, Bitinaite J, Blumenthal RM, Degtyarev SK, Dryden DT, Dybvig K, Firman K, Gromova ES, Gumport RI, Halford SE, Hattman S, Heitman J, Hornby DP, Janulaitis A, Jeltsch A, Josephsen J, Kiss A, Klaenhammer TR, Kobayashi I, Kong H, Krüger DH, Lacks S, Marinus MG, Miyahara M, Morgan RD, Murray NE, Nagaraja V, Piekarowicz A, Pingoud A, Raleigh E, Rao DN, Reich N, Repin VE, Selker EU, Shaw PC, Stein DC, Stoddard BL, Szybalski W, Trautner TA, Van Etten JL, Vitor JM, Wilson GG, Xu SY (April 2003). "A nomenclature for restriction enzymes, DNA methyltransferases, homing endonucleases and their genes". Nucleic Acids Res. 31 (7): 1805–12. doi:10.1093/nar/gkg274. PMC 152790. PMID 12654995.
- ^ Jeremy MB, John LT, Lubert S (2002). "3. Protein Structure and Function". Biochemistry. San Francisco: W. H. Freeman. ISBN 0-7167-4684-0.
- ^ Anfinsen C.B. (1973). "Principles that Govern the Folding of Protein Chains". Science. 181 (4096): 223–30. doi:10.1126/science.181.4096.223. PMID 4124164.
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