알레르 주파수

Allele frequency

알레르 빈도 또는 유전자 빈도는 모집단의 특정 위치에서 알레르(유전자의 변수)의 상대적 빈도로, 분수 또는 백분율로 표현된다.[1] 특히, 그것은 그 알레르기를 운반하는 모집단의 모든 염색체들 중 일부분이다. 마이크로진화란 한 모집단 내에서 시간에 따라 발생하는 알레르기의 빈도 변화를 말한다.

다음과 같은 경우:

  1. 염색체의 특정 위치 및 그 위치의 특정 알레르
  2. 플로디 n을 가진 N 개인의 인구, 즉 개인은 체세포에 각 염색체의 복사본 n개를 가지고 있다(예: 디플로이드 종의 세포에 있는 두 개의 염색체).
  3. 알레르기는 모집단의 i 염색체에 존재한다.

그 다음, 알레 빈도는 알레르기의 모든 발생 i와 모집단 전체 염색체 복사본의 총 수 i/(nN)의 일부분이다.

알레 주파수는 관련이 있지만 유전자형 주파수와 구별되며, 알레 주파수는 유전자형 주파수로 계산할 수 있다.[1]

모집단 유전학에서 알레르 주파수는 특정 위치 또는 다중 위치에서의 변화량을 설명하는 데 사용된다. 많은 뚜렷한 로키에 대한 알레 주파수의 합주를 고려할 때, 이들의 분포를 알레 주파수 스펙트럼이라고 한다.

유전자형 주파수에서 알레르 주파수의 계산

실제 주파수 계산은 자가 유전자에 대한 종의 형태에 따라 달라진다.

단극류

alle A의 빈도(p)는 A alle의 복사본 수(i)와 모집단 또는 표본 크기(N)의 일부분이기 때문에

디플로이드

If , , and are the frequencies of the three genotypes at a locus with two alleles, then the frequency p of the A-allele and the frequency q of the B-allele in the population are obtained by cou음탕한 [2]언쟁점

p와 q는 그 중심점에 존재하는 유일한 두 개의 대립의 주파수이기 때문에, 그것들은 1로 합해야 한다. 확인 방법:

= - 및 = -

두 개 이상의 서로 다른 알레르기가 있는 경우, 각 알레르기의 빈도는 단순히 동형질의 빈도에 그것이 나타나는 모든 이형체들의 빈도수의 반을 더한 것이다.

(3개 알레르기의 경우 알레르 § 알레르기와 유전자형 주파수 참조)

알레르 주파수는 항상 유전자형 주파수로 계산할 수 있지만, 반대로 하디-웨인버그 조건의 무작위 교미를 요구한다.

예

A와 B라는 두 개의 알레르기가 있는 위치를 생각해 보아라. 디플로이드 모집단에는 3개의 유전자형, 2개의 동질 유전자형(AA와 BB), 1개의 이질 유전자형(AB)이 있을 수 있다. 만약 우리가 10명의 사람들을 표본으로 추출하고 유전자형 주파수를 관찰한다면

  1. freq(AA) = 6
  2. freq(AB) = 3
  3. freq(BB) = 1

그 다음 20개의 총 염색체 복사본 6× + = 62+의 관찰 복사본과 1 2+ = 이(가) 있다. A 알레일의 주파수 p는 p = 15/20 = 0.75이고, B 알레일의 주파수 q는 q = 5/20 = 0.25이다.

역학

인구유전학은 알레르기를 포함한 모집단의 유전적 구성과 알레르기의 빈도가 시간이 지남에 따라 어떻게 변화할 것으로 예상되는지를 설명한다. Hardy-Weinberg 법은 무작위 짝짓기 후 디플로이드 모집단에서 예상되는 평형 유전자형 주파수를 설명한다. 무작위 짝짓기만으로는 알레 주파수를 바꾸지 않으며, 하디-웨인버그 평형은 무한 모집단 크기와 선택적으로 중립적인 위치를 가정한다.[1]

자연 모집단에서는 유전자 흐름과 돌연변이가 결합하여 여러 세대에 걸쳐 알레르기의 주파수를 변화시킨다. 유전적 표류는 유한 모집단 크기의 자손 수 분산으로 인한 무작위 표본 추출에서 알레르 빈도의 변화를 유발하며, 소 모집단은 큰 모집단보다 세대당 빈도수 변동이 더 크다. 또한 두 번째 적응 메커니즘이 존재한다는 이론이 있다 – 틈새 건설 자연[3] 선택, 환경 유도, 비유전적 상속, 학습 및 문화적 전달에 의해 진화적 종합 적응이 확장된다.[4] 특정 장소에 있는 알레르기는 또한 자연 선택이 작용하는 알레르기를 운반하는 개인에게 약간의 건강 효과를 줄 수 있다. 유익한 알레르기는 빈도가 증가하는 반면 해로운 알레르기는 빈도가 감소하는 경향이 있다. 알레르기가 선택적으로 중립적일 때에도, 근처의 유전자에 작용하는 선택 또한 히치하이킹이나 배경 선택을 통해 알레르기의 빈도를 바꿀 수 있다.

알레르기가 모집단에서 고정되거나 상실됨에 따라 주어진 위치에서의 이질성은 시간이 지남에 따라 감소하지만, 모집단 간의 이동으로 인한 새로운 돌연변이와 유전자 흐름을 통해 모집단에서 변화가 유지된다. 자세한 내용은 모집단 유전학을 참조하십시오.

참고 항목

참조

  1. ^ a b c Gillespie, John H. (2004). Population genetics : a concise guide (2. ed.). Baltimore, Md.: The Johns Hopkins University Press. ISBN 978-0801880087.
  2. ^ "Population and Evolutionary Genetics". ndsu.edu.
  3. ^ Scott-Phillips, T. C.; Laland, K. N.; Shuker, D. M.; Dickins, T. E.; West, S. A. (2014). "The Niche Construction Perspective: A Critical Appraisal". Evolution. 68 (5): 1231–1243. doi:10.1111/evo.12332. PMC 4261998. PMID 24325256.
  4. ^ Laland, K. N.; Uller, T.; Feldman, M. W.; Sterelny, K.; Müller, G. B.; Moczek, A.; Jablonka, E.; Odling-Smee, J. (Aug 2015). "The extended evolutionary synthesis: its structure, assumptions and predictions". Proc Biol Sci. 282 (1813): 20151019. doi:10.1098/rspb.2015.1019. PMC 4632619. PMID 26246559.

외부 링크

Cheung, KH; Osier MV; Kidd JR; Pakstis AJ; Miller PL; Kidd KK (2000). "ALFRED: an allele frequency database for diverse populations and DNA polymorphisms". Nucleic Acids Research. 28 (1): 361–3. doi:10.1093/nar/28.1.361. PMC 102486. PMID 10592274.

Middleton, D; Menchaca L; Rood H; Komerofsky R (2002). "New allele frequency database: www.allelefrequencies.net". Tissue Antigens. 61 (5): 403–7. doi:10.1034/j.1399-0039.2003.00062.x. PMID 12753660.