GCM 전사인자
GCM transcription factors| GCM | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 DNA에 결합된 gcm 도메인의 구조 | |||||||||
| 식별자 | |||||||||
| 기호. | GCM | ||||||||
| 팜 | PF03615 | ||||||||
| 빠맘 클랜 | CL0274 | ||||||||
| 인터프로 | IPR003902 | ||||||||
| 프로 사이트 | PS50807 | ||||||||
| SCOP2 | 1odh/SCOPe/SUPFAM | ||||||||
| |||||||||
분자생물학에서 GCM 전사 인자는 GCM 모티브를 포함하는 단백질 패밀리이다.GCM 모티브는 Drosophila melanogaster GCM과 그 포유동물 호몰로지(인간 GCM1 및 [1][2][3][4]GCM2)를 포함하는 기본적인 발달 과정에 관여하는 전사 조절제 패밀리에 속하는 단백질에서 식별된 도메인이다.GCM 전사인자에서 N-말단 부분은 150개의 아미노산 DNA 결합 도메인을 포함한다.시퀀스 보존은 이 GCM 도메인에서 가장 높습니다.반면 C-단자 부분에는 하나 또는 두 개의 트랜스활성화 영역이 포함되어 있으며 보존 상태가 좋지 않습니다.
GCM 모티브는 비회문성 옥타머 5'-ATGGGT-3'[1][2][3]을 우선적으로 인식하는 DNA 결합 도메인으로 나타났다.GCM 모티브는 보존된 많은 염기성 아미노산 잔기, 7개의 시스테인 잔기, 4개의 히스티딘 [1]잔기를 포함합니다.보존된 시스테인은 도메인의 전체적인 형태 형성, DNA 결합 과정 및 DNA [3]결합의 산화환원 조절에 관여합니다.다른 DNA 결합 [5]도메인과 유사성이 없는 새로운 등급의 Zn 함유 DNA 결합 도메인으로서의 GCM 도메인.GCM 도메인은 구조 내에 존재하는 2개의 Zn 이온 중 하나에 의해 서로 연결된 크고 작은 도메인으로 구성됩니다.큰 도메인과 작은 도메인은 각각 5가닥 베타 시트와 3가닥 베타 시트로 구성되며, 두 베타 시트의 동일한 측면에 대해 세 개의 작은 나선 세그먼트가 채워진다.GCM 도메인은 5가닥 베타-완성 시트가 DNA의 주요 홈에 삽입되는 배열 특이적 DNA 인식의 새로운 모드를 실행한다.베타-완성 시트의 가장자리 가닥과 다음 루프 및 가닥에서 돌출된 잔류물이 양쪽 DNA 가닥의 베이스와 골격에 접촉하여 DNA 표적 부위의 특이성을 제공한다.
레퍼런스
- ^ a b c Akiyama Y, Hosoya T, Poole AM, Hotta Y (December 1996). "The gcm-motif: a novel DNA-binding motif conserved in Drosophila and mammals". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 93 (25): 14912–6. Bibcode:1996PNAS...9314912A. doi:10.1073/pnas.93.25.14912. PMC 26236. PMID 8962155.
- ^ a b Schreiber J, Sock E, Wegner M (April 1997). "The regulator of early gliogenesis glial cells missing is a transcription factor with a novel type of DNA-binding domain". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 94 (9): 4739–44. Bibcode:1997PNAS...94.4739S. doi:10.1073/pnas.94.9.4739. PMC 20794. PMID 9114061.
- ^ a b c Schreiber J, Enderich J, Wegner M (May 1998). "Structural requirements for DNA binding of GCM proteins". Nucleic Acids Res. 26 (10): 2337–43. doi:10.1093/nar/26.10.2337. PMC 147556. PMID 9580683.
- ^ Tuerk EE, Schreiber J, Wegner M (February 2000). "Protein stability and domain topology determine the transcriptional activity of the mammalian glial cells missing homolog, GCMb". J. Biol. Chem. 275 (7): 4774–82. doi:10.1074/jbc.275.7.4774. PMID 10671510.
- ^ Cohen SX, Moulin M, Hashemolhosseini S, Kilian K, Wegner M, Muller CW (April 2003). "Structure of the GCM domain-DNA complex: a DNA-binding domain with a novel fold and mode of target site recognition". EMBO J. 22 (8): 1835–45. doi:10.1093/emboj/cdg182. PMC 154474. PMID 12682016.
