FARP2

FARP2
FARP2
사용 가능한 구조
PDBOrtholog 검색: PDBe RCSB
식별자
에일리어스FARP2, FIR, FRG, PLEKHC3, FERM, ARH/RhoGEF 및 플렉스트린 도메인 단백질 2
외부 IDOMIM: 617586 MGI: 2385126 HomoloGene: 8877 GenCard: FARP2
맞춤법
종.인간마우스
엔트레즈
앙상블
유니프로트
RefSeq(mRNA)

NM_001282983
NM_001282984
NM_014808

NM_145519

RefSeq(단백질)

NP_001269912
NP_001269913
NP_055623

NP_663494

장소(UCSC)Chr 2: 241.36 ~241.49 MbChr 1: 93.44 ~93.55 Mb
PubMed 검색[3][4]
위키데이터
인간 보기/편집마우스 표시/편집

FERM, RoGEF 플렉스트린 도메인 함유 단백질 2는 FARP2 [5][6][7]유전자에 의해 인체 내에서 부호화되는 단백질이다.

모델 유기체

Farp2 녹아웃쥐 표현형

모델 유기체는 FARP2 기능의 연구에 사용되어 왔다.Farp2라고tm1a(KOMP)Wtsi[12][13] 불리는 조건부 녹아웃 마우스 라인이 International Knockout Mouse Consortium 프로그램의 일부로 생성되었습니다.이것은 질병 동물 모델을 생성하여 관심 있는 [14][15][16]과학자들에게 배포하는 높은 처리량 돌연변이 유발 프로젝트입니다.

수컷과 암컷은 표준화된 표현형 검사를 통해 [10][17]결실의 효과를 확인했습니다.돌연변이 생쥐에 대해 24개의 검사가 수행되었고 2개의 유의한 이상이 [10]관찰되었다.호모 접합 돌연변이 동물은 대뇌피질이 두꺼워지고 [10]탈모가 비정상적으로 나타났다.

상호 작용

FARP2는 PDZK1[18]상호 작용하는 으로 나타났습니다.

레퍼런스

  1. ^ a b c GRCh38: 앙상블 릴리즈 89: ENSG00000006607 - 앙상블, 2017년 5월
  2. ^ a b c GRCm38: 앙상블 릴리즈 89: ENSMUSG000034066 - 앙상블, 2017년 5월
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ Nagase T, Ishikawa K, Suyama M, Kikuno R, Miyajima N, Tanaka A, Kotani H, Nomura N, Ohara O (Oct 1998). "Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XI. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro". DNA Research. 5 (5): 277–86. doi:10.1093/dnares/5.5.277. PMID 9872452.
  6. ^ Kubo T, Yamashita T, Yamaguchi A, Sumimoto H, Hosokawa K, Tohyama M (Oct 2002). "A novel FERM domain including guanine nucleotide exchange factor is involved in Rac signaling and regulates neurite remodeling". The Journal of Neuroscience. 22 (19): 8504–13. doi:10.1523/JNEUROSCI.22-19-08504.2002. PMC 6757789. PMID 12351724.
  7. ^ "Entrez Gene: FARP2 FERM, RhoGEF and pleckstrin domain protein 2".
  8. ^ "Salmonella infection data for Farp2". Wellcome Trust Sanger Institute.
  9. ^ "Citrobacter infection data for Farp2". Wellcome Trust Sanger Institute.
  10. ^ a b c d Gerdin AK (2010). "The Sanger Mouse Genetics Programme: High throughput characterisation of knockout mice". Acta Ophthalmologica. 88: 925–7. doi:10.1111/j.1755-3768.2010.4142.x. S2CID 85911512.
  11. ^ Wellcome Trust Sanger Institute의 마우스 리소스 포털.
  12. ^ "International Knockout Mouse Consortium".
  13. ^ "Mouse Genome Informatics".
  14. ^ Skarnes WC, Rosen B, West AP, Koutsourakis M, Bushell W, Iyer V, Mujica AO, Thomas M, Harrow J, Cox T, Jackson D, Severin J, Biggs P, Fu J, Nefedov M, de Jong PJ, Stewart AF, Bradley A (Jun 2011). "A conditional knockout resource for the genome-wide study of mouse gene function". Nature. 474 (7351): 337–42. doi:10.1038/nature10163. PMC 3572410. PMID 21677750.
  15. ^ Dolgin E (Jun 2011). "Mouse library set to be knockout". Nature. 474 (7351): 262–3. doi:10.1038/474262a. PMID 21677718.
  16. ^ Collins FS, Rossant J, Wurst W (Jan 2007). "A mouse for all reasons". Cell. 128 (1): 9–13. doi:10.1016/j.cell.2006.12.018. PMID 17218247. S2CID 18872015.
  17. ^ van der Weyden L, White JK, Adams DJ, Logan DW (2011). "The mouse genetics toolkit: revealing function and mechanism". Genome Biology. 12 (6): 224. doi:10.1186/gb-2011-12-6-224. PMC 3218837. PMID 21722353.
  18. ^ Gisler SM, Pribanic S, Bacic D, Forrer P, Gantenbein A, Sabourin LA, Tsuji A, Zhao ZS, Manser E, Biber J, Murer H (Nov 2003). "PDZK1: I. a major scaffolder in brush borders of proximal tubular cells". Kidney International. 64 (5): 1733–45. doi:10.1046/j.1523-1755.2003.00266.x. PMID 14531806.

추가 정보

외부 링크

  • PDB for UniProt: Q91VS8(FERM, ARHGEF 및 플렉스트린 도메인 함유 단백질 2)에서 PDBe-KB에 제공되는 모든 구조 정보의 개요.