효소 커미션 번호

Enzyme Commission number
유럽 공동체 번호와 혼동하지 마십시오.

효소 위원회 번호(EC 번호)는 효소가 [1]촉매하는 화학 반응에 기초한 효소에 대한 수치 분류 체계입니다.효소 명명법 체계로서 모든 EC 번호는 대응하는 효소 촉매 반응에 대한 권장 이름과 관련된다.

EC 수치는 효소를 명시하지 않고 효소 촉매 반응을 명시한다.서로 다른 효소(예를 들어 서로 다른 유기체의 효소)가 동일한 반응을 촉매하면 동일한 EC [2]번호를 받게 됩니다.또한 수렴 진화를 통해 완전히 다른 단백질 접힘은 동일한 반응을 촉매할 수 있으며(이들은 때때로 비상동성 이소관능성 [3]효소라고 불린다) 따라서 동일한 EC 번호가 할당됩니다.반면 UniProt 식별자는 아미노산 배열에 [4]따라 단백질을 고유하게 규정한다.

번호의 형식

모든 효소 코드는 "EC" 문자 뒤에 마침표로 구분된 네 개의 숫자로 구성됩니다.이 수치들은 효소의 더 미세한 분류를 나타낸다.예비 EC 번호가 존재하며 네 번째(직렬) 자리(예: EC 3.5.1.n3)[2]의 일부로 'n'이 있습니다.

예를 들어, 트리펩타이드 아미노펩티드가수분해효소는 "EC 3.4.11.4"라는 코드를 가지고 있으며, 그 성분은 다음과 같은 효소 그룹을 나타낸다.

  • EC3 효소는 가수분해효소(다른 분자를 분해하기 위해 물을 사용하는 효소)입니다.
  • EC 3.4는 펩타이드 결합에 작용하는 가수분해효소이다.
  • EC 3.4.11은 폴리펩타이드로부터 아미노 말단 아미노산을 분리하는 가수분해효소이다.
  • EC 3.4.11.4는 3중펩타이드로부터 아미노 말단을 분리하는 것이다.

최상위 코드

최상위[5] EC 번호
학급 반응 촉매 전형적인 반응 일반 이름의 효소 예제
EC 1
산화환원효소

산화/환원 반응; H 및 O 원자 또는 전자가 한 물질에서 다른 물질로 전달됨

 AH + B → A + BH (표준)
A + O → AO (표준)		 탈수소효소, 산화효소
EC 2
트랜스페라아제 		한 물질에서 다른 물질로 기능군의 이동.그룹은 메틸기, 아실기, 아미노기 또는 인산기일 수 있다. AB + C → A + BC 트랜스아미나아제, 키나아제
EC 3
가수분해효소 		가수분해로 기질에서 두 가지 생성물 생성 AB + HO2 → AOH + BH 리파아제, 아밀라아제, 펩티드가수분해효소, 포스파타아제
EC 4
리아제 		기질에서 그룹의 비 가수분해 첨가 또는 제거.C-C, C-N, C-O 또는 C-S 결합을 절단할 수 있다. RCOOOH → RCOH + CO2 또는 [X-A+B-Y] → [A=B + X-Y] 탈탄산화효소
EC 5
이성질화효소 		분자 내 재배열, 즉 단일 분자 내 이성화 변화 ABC → BCA 이성질화효소, 뮤타아제
EC 6
연결효소 		ATP의 동시 분해와 함께 새로운 C-O, C-S, C-N 또는 C-C 결합을 합성하여 두 분자를 결합합니다. X + Y + ATP → XY + ADP + Pi 합성효소
EC 7
트랜스로케이스 		이온 또는 분자의 막간 이동 또는 막내 분리를 촉매한다. 트랜스포터

반응 유사성

효소 반응 간의 유사성은 결합 변화, 반응 중심 또는 하위 구조 메트릭(이전의 EC-BLAST, 현재의 EMBL-EBI 효소 포털)[6]을 사용하여 계산할 수 있습니다.

역사

EC 번호 체계가 개발되기 전에는 효소가 임의로 명명되었고, 어떤 반응이 촉매되었는지에 대한 단서를 거의 주지 않는 오래된 노란색 효소나 말릭 효소 같은 이름이 일반적으로 사용되었다.특수성에 기초한 합리적인 분류가 매우 어려웠기 때문에, 특히 펩신이나 파파인과 같은 매우 낮은 특이성을 가진 단백질 분해 효소가 여전히 사용되고 있지만, 이러한 이름들의 대부분은 사용되지 않고 있다.

1950년대에 이르러 혼란은 참을 수 없게 되었고, 호프만[7] 오스텐호프, 딕슨과[8] 웹이 효소 촉매 반응을 분류하기 위해 다소 유사한 계획을 제안한 후, 브뤼셀에서 열린 국제 생화학 회의는 1955년 말콤 딕슨의 의장으로 효소 위원회를 설립하였다.첫 번째 버전은 1961년에 출판되었고, 효소 위원회는 그 당시에 해산되었지만, 그 이름은 EC 번호라는 용어로 남아 있다.1992년 국제생화학분자생물학연합(International Union of Phiology and Molecular Biology)이 인쇄물로 발간한 최신 6판은 3196종의 효소를 포함하고 있다.부록 1-4는 1993-1999년에 출판되었다.후속 보충제는 국제 생화학 및 분자생물학 [5]연합 명명 위원회 웹사이트에서 전자적으로 발표되었습니다.2018년 8월, IUBMB는 트랜스로케이스를 [9]포함한 최상위 EC 7 카테고리를 추가하여 시스템을 수정하였습니다.

「 」를 참조해 주세요.

레퍼런스

  1. ^ Webb, E. C. (1992). Enzyme nomenclature 1992: recommendations of the Nomenclature Committee of the International Union of Biochemistry and Molecular Biology on the nomenclature and classification of enzymes. Academic Press. ISBN 978-0-12-227164-9.
  2. ^ a b "ENZYME (Enzyme nomenclature database)". ExPASy. Archived from the original on 21 March 2019. Retrieved 24 April 2019.
  3. ^ Omelchenko MV, Galperin MY, Wolf YI, Koonin EV (2010). "Non-homologous isofunctional enzymes: a systematic analysis of alternative solutions in enzyme evolution". Biology Direct. 5 (1): 31. doi:10.1186/1745-6150-5-31. PMC 2876114. PMID 20433725.
  4. ^ Apweiler R, Bairoch A, Wu CH, Barker WC, Boeckmann B, Ferro S, Gasteiger E, Huang H, Lopez R, Magrane M, Martin MJ, Natale DA, O'Donovan C, Redaschi N, Yeh LS (Jan 2004). "UniProt: the Universal Protein knowledgebase". Nucleic Acids Research. 32 (Database issue): D115–9. doi:10.1093/nar/gkh131. PMC 308865. PMID 14681372.
  5. ^ a b Moss GP. "Recommendations of the Nomenclature Committee". International Union of Biochemistry and Molecular Biology on the Nomenclature and Classification of Enzymes by the Reactions they Catalyse. Archived from the original on 2018-09-10. Retrieved 2006-03-14.
  6. ^ Rahman SA, Cuesta SM, Furnham N, Holliday GL, Thornton JM (Feb 2014). "EC-BLAST: a tool to automatically search and compare enzyme reactions". Nature Methods. 11 (2): 171–174. doi:10.1038/nmeth.2803. PMC 4122987. PMID 24412978.
  7. ^ Hoffman-Ostenhof, O (1953). "Suggestions for a more rational classification and nomenclature of enzymes". Advances in Enzymology and Related Areas of Molecular Biology. Advances in Enzymology and Related Subjects of Biochemistry. Vol. 14. pp. 219–260. doi:10.1002/9780470122594.ch7. ISBN 9780470122594. PMID 13057718.
  8. ^ Dixon, M; Webb, E.C. (1958). Enzymes. London: Longmans Green. pp. 183–227.
  9. ^ Tipton, Keith (August 2018). "Enzyme Nomenclature News: Translocases (EC 7): A new EC Class". ExplorEnz: the primary source of the IUBMB enzyme list. Archived from the original on 10 September 2018. Retrieved 3 November 2018.

외부 링크

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