WDR90

WDR90

WD 반복 함유 단백질 90은 WDR90 유전자(16p13.3)[1]에 의해 인간에게 암호화되는 단백질이다.이 인간 단백질은 아미노산 1750개로 분자량은 187.7kDa다.[2]여기에는 여러 WD40 반복 도메인과 알 수 없는 [3]기능의 도메인이 포함되어 있습니다.이 단백질은 [4]무척추동물에게까지 보존된다.WD 트랜스신 반복 도메인을 포함하는 단백질은 신호 전달 및 전사 조절에서 세포 주기 제어, 자가 형성 [5]및 아포토시스까지 다양한 기능에서 역할을 하는 것으로 밝혀졌다.

진

인간 게놈에서 WDR90은 염기쌍 649363에서 667833에 걸쳐 있으며 길이가 5,250 뉴클레오티드인 mRNA 서열을 가지고 있다.이 유전자는 41개의 엑손과 인간의 1,750개의 아미노산 단백질의 암호로 구성되어 있다.

궤적

이 인간 유전자는 16번 염색체의 양성 DNA 가닥에 16p13.[1]3 위치에 있습니다.정연선상의 플랭크 배열에는 FAM195A 및 RHOT2가 [3]포함된다.

에일리어스

WDR90 의 에일리어스에는, C16orf15, C16orf16, C16orf17, C16orf18, C16orf19, 및 KIAA1924 [1]가 있습니다.

호몰로지

패럴로그

WDR90에 대한 인체 패럴로그가 1개 발견되었습니다.이 패럴로그는 WDR16으로 알려져 있습니다.UniProtKB/Swiss-Prot에 따르면 WDR16은 간세포암의 성장 또는 생존에 필수적인 역할을 할 수 있습니다.인간의 이 단백질은 620개의 아미노산 [6][7]길이입니다.

맞춤법

단백질 WDR90을 위한 정형어는 단일 [8]무척추동물까지 보존되어 있는 것으로 밝혀졌다.포유류에 걸쳐 보존된 도메인은 DUF667(위치 3-124)과 WD40 반복 2개(위치 697-991 및 1155-1549)[3]였다.

인간과 그 맞춤법에서의 WDR90의 배열 비교.

단백질

프라이머리 시퀀스

인간 단백질 WDR90은 287.7kDa이며 등전점은 6.584이다.DUF667이라는 미지의 함수의 도메인이 있으며,[9] 30개의 예측된 Isoforms에 걸쳐 보존되어 있습니다.

인간 WDR90 유전자의 영역과 위치.

번역 후 수정

WDR90은 고도로 인산화 [10]된 단백질로 예측된다.

도메인과 모티브

인간의 [11]염기서열 전체에 걸쳐 반복되는 세 개의 도메인이 있습니다.

Protein WDR90 primary amino acid sequence and its internal features/structures.
단백질 WDR90 1차 아미노산 배열 및 그 내부 특징/구조.

이차 구조

인간의 WDR90의 데노보 단백질 구조는 베타 시트, 베타 턴, 랜덤 [12]코일을 가질 것으로 예측된다.

3차 및 4차 구조

인간 단백질 WDR90은 WD40 반복 패밀리를 나타내는 7블레이드 베타 프로펠러를 채택하고 있습니다.이 구조는 구조예측 프로그램인 Phyre2에 의해 100% 확신을 가지고 예측되었다.

상호작용단백질

인간 WDR90과 상호작용하는 가장 주목할 만한 단백질은 UTY, KDM6B, SETD1B 및 ASH2L로 [13]예측된다.이 단백질들은 주로 히스톤 수식제로서 발견된다.

전사 계수

인간에서 WDR90의 프로모터는 전사인자(ARNT, AP-1, MYB 및 Cis2His2)[14]에 대한 도메인을 가질 것으로 예측되어 왔다.

표현

인간 WDR90의 발현 수준은 비교적 낮은 수준에서 구성되며 [15][16]림프절과 흉선에서 가장 높은 수준으로 나타난다.발달 중인 WDR90의 발현은 배반포와 태아 단계에서 가장 높다.발현이 신생아와 유아 단계에서 두드러지게 결여되어 있다가 청소년기에 다시 나타나 [16]성인기까지 지속된다.

기능.

사람에게 WDR90의 기능은 잘 알려져 있지 않다.많은 조직에서 그것의 광범위한 발현, 단백질 슈퍼패밀리 WD40 도메인을 포함하는 단백질과의 결합 및 알려진 단백질 상호작용을 고려할 때, 그것은 히스톤 수정, 소포 수송 또는 전사 [13][15][16]조절에 역할을 할 수 있다.

레퍼런스

  1. ^ a b c Database, GeneCards. "WDR90 Gene - GeneCards WDR90 Protein WDR90 Antibody". www.genecards.org. Retrieved 2015-05-06.
  2. ^ Stanford University, Stanford CA 94305, 미국 수학부 Volker Brendel, 수정. 오류는 수정으로 인해 발생합니다.http://workbench.sdsc.edu/
  3. ^ a b c "WDR90 WD repeat domain 90 [Homo sapiens (Human)] - Gene - NCBI".
  4. ^ "NCBI - WWW Error Blocked Diagnostic". www.ncbi.nlm.nih.gov. Retrieved 2015-04-30.
  5. ^ Stirnimann, Christian U.; Petsalaki, Evangelia; Russell, Robert B.; Müller, Christoph W. (Oct 2010). "WD40 proteins propel cellular networks". Trends in Biochemical Sciences. 35 (10): 565–574. doi:10.1016/j.tibs.2010.04.003. ISSN 0968-0004. PMID 20451393.
  6. ^ Database, GeneCards. "WDR16 Gene - GeneCards WDR16 Protein WDR16 Antibody". www.genecards.org. Retrieved 2015-05-06.
  7. ^ "ExPASy: SIB Bioinformatics Resource Portal - Categories". www.expasy.org. Retrieved 2015-05-06.
  8. ^ "CLUSTALWPROF". Biology Workbench. SDSC.[영구 데드링크]
  9. ^ "Biology WorkBench". Volker Brendel, Department of Mathematics, Stanford University, Stanford CA 94305, U.S.A., modified; any errors are due to the modification. Statistical Analysis of PS. {{cite web}}:날짜 값 확인: date=(도움말)[영구 데드링크]
  10. ^ "NetPhos 2.0 Server". www.cbs.dtu.dk. Retrieved 2015-05-07.
  11. ^ "Ensembl genome browser 79: Homo sapiens - Domains & features - Transcript: WDR90-002 (ENST00000293879)". useast.ensembl.org. Retrieved 2015-05-06.
  12. ^ UCBL, Institut. "NPS@ : SOPMA secondary structure prediction". npsa-prabi.ibcp.fr. Retrieved 2015-05-07.
  13. ^ a b "STRING: functional protein association networks". string-db.org. Retrieved 2015-05-07.
  14. ^ "Genomatix: Retrieve and analyze promoters: Query Input". www.genomatix.de. Retrieved 2015-05-07.
  15. ^ a b "NCBI - WWW Error Blocked Diagnostic". www.ncbi.nlm.nih.gov. Retrieved 2015-05-07.
  16. ^ a b c "NCBI - WWW Error Blocked Diagnostic". www.ncbi.nlm.nih.gov. Retrieved 2015-05-07.

권장독서

  • 베인, 로즈마리 AL 등"인간 고환의 분자 프로파일링, 고나도트로핀 억제 및 프로게스토겐 치료 후 엄격한 경로(RNA 발현 특이적 조절)를 드러냄." andology 저널 29.4(2008) : 389-403.
  • 콕스, D.M., M. G. 버틀러."두 염색체 이상에 대한 임상적 특징을 가진 36세 남성에서 원위부 삼분지 15q26과 부분 단분지 16p13.3."세포유전학 및 게놈 연구(2015).
  • 황, 치청 등"한성 유방암에 대한 동시 유전자 시그니처." PLoS ONE 8.10 (2013) : e76421.
  • 야콥슨, 리스 등"보완적 단백질학 방법으로 식별된 인간 중심체의 비대칭 국소화 성분"EMBO 저널 30.8 (2011): 1520-1535.
  • 로위리스, 버나드 등'류머티즘 질환의 판정 및 분류 방법' 미국 특허출원 12/528,615.
  • 링크, 로리 등"위장관 간질 종양에서 이마티닙 메실레이트에 대한 유전자 발현과 반응"분자암 치료제 8.8 (2009) : 2172-2182.
  • 야나기사와, 하루아키 등스테이션, 텍사스 77843, 미국. 약어: DMT, 더블렛 마이크로튜브, IJ, 내부 분기점.