TMEM69

TMEM69
TMEM69
식별자
에일리어스TMEM69, C1orf154, 막투과단백질69
외부 IDMGI: 3045357 HomoloGene: 9531 GenCard: TMEM69
맞춤법
종.인간마우스
엔트레즈

51249

230657

앙상블

ENSG00000159596

ENSMUSG000055900

유니프로트

Q5 SWH9

Q3KQJ0

RefSeq(mRNA)

NM_016486

NM_177670

RefSeq(단백질)

NP_057570

NP_808338

장소(UCSC)Chr 1: 45.69 ~45.69 MbChr 4: 116.41 ~116.41 Mb
PubMed 검색[3][4]
위키데이터
인간 보기/편집마우스 표시/편집

TMEM69는 TMEM69 [5]유전자에 의해 인간에게 암호화되는 단백질이다.TMEM69에 의해 코드된 단백질의 주목할 만한 특징은 5개의 막 통과 [6]세그먼트의 존재이다.

배경 정보

등록 번호 위치 식별자 M.W. pI
mRNA: NM_016486.3

단백질: NP_057570.2

 1p34.1 HSPC229, C1orf154, FLJ21029, LOC51249 27.6 kDa 10.3

진

염색체 1p34.1에 위치한 TMEM69 유전자는 7.[7]24kb에 이른다.46152886부터 46160121까지의 게놈 배열에서 플러스 가닥에 있으며, 3개의 엑손이 포함되고 길이가 6262bp인 1차 mRNA 전사체를 인코딩한다.TMEM69 [8]유전자를 코드하는 세 가지 대체 트랜스크립트가 예측된다.

진 근린

유전자명 위치 오리엔테이션 기능.
GPBP1L1(GC가 풍부한 프로모터 결합단백질 1-like 1) 1p34.1 마이너스 전사[9] 조절 기능
CCDC17(17을 포함하는 코일 코일 도메인) 1p34.1 마이너스 기능 정보를 찾을 수 없습니다.
MAST2(마이크로튜브 관련 세린/트레오닌인산화효소2) 1p34.1 플러스 멀티프로틴으로 기능

정자 성숙에 복합체입니다.대식세포에서[10] 리포다당 유도 IL-12 합성을 조절한다.

IPP(내부 A 입자 촉진 폴리펩타이드) 1p34-p32 마이너스 액틴과[11] 상호작용하다

기능.

TMEM69의 정확한 기능은 과학계에서 아직 밝혀지지 않았다.그러나 Xenopus tropicalis의 G 결합 단백질 수용체 복합체에서 발판 단백질 역할을 하는 것으로 생각된다.그것은 bcard_41에서 xtGPR54-2 유전자 IPP와 GPBP1과 함께 클러스터를 형성하는 것으로 나타났다.[12]이 복합체는 뇌세포의 [12]혈장막에서 결합 배위자 키스펩틴의 수용체 역할을 하는 G 결합 단백질 수용체의 일부이다.

단백질

TMEM69는 247개의 아미노산이다.아미노산 91-232에 [13]걸쳐 있는 미지의 기능 영역인 DUF3429와 함께 5개의 막 통과 세그먼트가 존재한다.

Features of TMEM69.jpg

예측되는 특징

생물정보학 도구를 사용하여 예측한 TMEM69의 특성:

  • 분자량: 27.[7]6KDa
  • 등전점: 10[14].3
  • 번역 후 수정:NetPhos는 위치 12, 27, 33, 85, 93, 183, 234의 아미노산 세린에 대해 7을 예측하고 위치 26의 트레오닌에 대해 1을 예측하며, 위치 57과 159의 [15]티로신에 대해 2를 예측했다.NetGlyc on ExPASy는 포지션 7, 60, 73, 156, 239에서 5개의 당화 사이트를 예측했다.
  • 막 통과 세그먼트: TMEM69는 위치 97-117, 122-142, 159-179, 185-205 및 216-236에서 [16]발생하는 5개의 막 통과 영역을 포함한다.

표현

EST Profile 데이터는 TMEM69가 간, 편도체, 해마,[17] 시상하부와 같은 신경 내분비 조직에서 특히 높게 발현된다는 것을 보여주지만 TMEM69는 인체 전체에 걸쳐 낮은 수준에서 널리 발현된다.TMEM69는 아테롬성 [18]동맥경화증을 앓고 있는 환자에서 정상치보다 낮은 수치로 발현되는 것으로 확인되었다.

호몰로지

맞춤법

TMEM69 유전자는 여러 생명체에서 깊이 보존되어 있다.비록 그것은 어류, 조류, 양서류와 같은 다른 척색동물과 함께 포유동물 철자류 중에서 가장 높은 보존을 보여주지만, 식물, 곤충, 곰팡이, [13]그리고 박테리아에는 어느 정도 보존이 되어 있다.

속/종 유기체 통칭 등록 번호 시퀀스 아이덴티티 길이(AA)
마카카속 게먹이원숭이 EHH61428.1 89% 246
칼리스트릭스자쿠스 몽키 XP_002750811.1 83% 249
근골근 하우스 마우스 AAI06179.1 69% 245
크세노푸스 트로피컬리스 개구리 NP_001016103.1 49% 253
노베기쿠스 쥐. EDL90276.1 70% 247
오릭톨라구스쿠니쿨루스 토끼 XP_002715715 74% 250
아놀리스카롤리넨시스 도마뱀 XP_003220264.1 50% 257
다니오 레리오 제브라피시 XP_685684.1 49% 249
살모살라 연어 NP_001134056.1 50% 259
다피아풀렉스 물벼룩 EFX84634.1 35% 208
오스트레오코커스타우리 녹조 XP_003081614.1 34% 166
Pseudomonas putida W619 토양균 YP_001748891.1 32% 152
시코필룸 코뮤니티 곰팡이 XP_003035659.1 27% 363

패럴로그

TMEM69에 대한 패럴로그는 발견되지 않았다.

보존.

TMEM69는 다양한 유기체에 잘 보존되어 있다.대부분의 정형외과가 태반 포유동물에서 발견되지만, 일부 정형외과들은 박테리아와 곰팡이에서 발견됩니다.TMEM69와 배열 유사성이 있는 것으로 밝혀진 가장 먼 직교체는 토양 [19]박테리아의 일종인 Pseudomonas putida W619이다.특히 Pseudomonas putida W619를 포함한 가장 먼 직교에서도 잘 보존된 것은 TMEM69의 두 번째 막 통과 세그먼트의 대부분이다.엄밀한 맞춤법에서는 5개의 막 통과 도메인이 모두 [20]보존됩니다.TMEM69에서 발견되는 보존 도메인은 박테리아와 [13]진핵생물에서 발견되는 특성화되지 않은 단백질 패밀리인 DUF3429의 일부이다.

레퍼런스

  1. ^ a b c GRCh38: 앙상블 릴리즈 89: ENSG00000159596 - 앙상블, 2017년 5월
  2. ^ a b c GRCm38: 앙상블 릴리즈 89: ENSMUSG000055900 - 앙상블, 2017년 5월
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ a b "Entrez Gene: TMEM69 Transmembrane Protein 69". Retrieved 22 April 2012.
  6. ^ "Expasy: SOSUI". Archived from the original on 15 May 2012. Retrieved 15 April 2012.
  7. ^ a b "TMEM69". Retrieved 2 February 2012.
  8. ^ "Transcript VariantsTMEM69". Retrieved 13 February 2012.
  9. ^ "NCBI:Gene". Retrieved 13 April 2012.
  10. ^ "NCBI:Gene". Retrieved 13 April 2012.
  11. ^ "NCBI:Gene". Retrieved 13 April 2012.
  12. ^ a b "Molecular Evolution of Multiple Forms of Kisspeptins and GPR54 Receptors in Vertebrates". Retrieved 22 April 2012.
  13. ^ a b c "BLAST". Retrieved 16 February 2012.
  14. ^ "Computer pI/Mw". Retrieved 11 April 2012.
  15. ^ "NetPhos". Retrieved 13 April 2012.
  16. ^ "UniProtKB". Retrieved 22 February 2012.
  17. ^ "GeneCards". Retrieved 18 April 2012.
  18. ^ "GEOProfiles". Retrieved 22 February 2012.
  19. ^ "Ensembl Genome Browser: TMEM69". Retrieved 22 April 2012.
  20. ^ "Biology Workbench: CLUSTALW". Retrieved 22 April 2012.[영구 데드링크]

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