TAF11

TAF11
TAF11
Protein TAF11 PDB 1bh8.png
사용 가능한 구조
PDBOrtholog 검색: PDBe RCSB
식별자
에일리어스TAF11, MGC:15243, TAF2I, TAFII28, PRO2134, TATA박스결합단백질관련인자 11
외부 IDOMIM: 600772 MGI: 1916026 HomoloGene: 55918 Genecards: TAF11
맞춤법
종.인간마우스
엔트레즈
앙상블
유니프로트
RefSeq(mRNA)

NM_001270488
NM_005643

NM_026836
NM_001379368

RefSeq(단백질)

NP_001257417
NP_005634

NP_081112
NP_0013667

장소(UCSC)Chr 6: 34.88 ~34.89 MbChr 17: 28.12 ~28.13 Mb
PubMed 검색[3][4]
위키데이터
인간 보기/편집마우스 표시/편집

TAFII28로도 알려진 전사 개시 인자 TFIID 서브유닛 11은 TAF11 [5][6][7]유전자에 의해 인체 내에서 부호화되는 단백질이다.

기능.

RNA 중합효소 II에 의한 전사의 시작은 70개 이상의 폴리펩타이드 활성을 필요로 한다.이러한 활동을 조정하는 단백질은 전사 인자 IID(TFIID)로, 중합효소를 적절히 배치하기 위해 코어 프로모터에 결합하고 전사 복합체의 나머지 조립을 위한 발판 역할을 하며 조절 신호의 통로 역할을 합니다.TFIID는 TATA 결합단백질(TBP)과 TBP 관련인자(TAFs)로 알려진 진화적으로 보존된 단백질 그룹으로 구성된다.TAF는 기초 전사에 참여하거나, 공동활성제 역할을 하거나, 프로모터 인식에 기능하거나, 복잡한 조립 및 전사 개시를 용이하게 하기 위해 일반 전사인자(GTF)를 수정할 수 있다.이 유전자는 모든 TFIID 복합체에 존재하는 TFIID의 작은 서브유닛을 암호화하고 TBP와 상호작용합니다.또한 이 서브유닛은 또 다른 작은 서브유닛인 TAF13과 상호작용하여 히스톤 코어 [7]구조와 유사한 구조를 가진 헤테로디머를 형성한다.

TAFII28
PDB 1bh9 EBI.jpg
결합 pcmbs를 가진 htafii18/htafii28 헤테로다이머 결정 구조
식별자
기호.TAFII28
팜PF04719
빠맘 클랜CL0012
인터프로IPR006809
SCOP21 bh9 / SCOPe / SUPFAM

분자생물학에서 TAFII28은 TATA 박스 결합 단백질 관련 인자를 말한다.TATA 결합 단백질 및 다른 TAF와 함께 일반적인 전사 인자 TFIID를 형성합니다.이들은 함께 전사 사전 시작 복합체의 조립에 참여합니다.보존된 영역은 대부분의 구성원 단백질의 C 말단에서 발견된다.

구조.

hTAFII28과 hTAFII18의 결정구조는 이 영역이 이들 2개의 서브유닛의 결합에 관여하고 있음을 보여준다.보존 영역에는 히스톤 H3와 [5][8]같이 배치된 4개의 알파 나선과 3개의 루프가 있습니다.

상호 작용

TAF11은 다음과 상호작용하는 것으로 나타났습니다.

레퍼런스

  1. ^ a b c GRCh38: 앙상블 릴리즈 89: ENSG000064995 - 앙상블, 2017년 5월
  2. ^ a b c GRCm38: 앙상블 릴리즈 89: ENSMUSG000024218 - 앙상블, 2017년 5월
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ a b c d Mengus G, May M, Jacq X, Staub A, Tora L, Chambon P, Davidson I (May 1995). "Cloning and characterization of hTAFII18, hTAFII20 and hTAFII28: three subunits of the human transcription factor TFIID". EMBO J. 14 (7): 1520–31. doi:10.1002/j.1460-2075.1995.tb07138.x. PMC 398239. PMID 7729427.
  6. ^ Kuzuhara T, Horikoshi M (November 1996). "Isolation and characterization of a cDNA encoding a human TFIID subunit containing a variety of putative structural motifs including direct repeats". Biol. Pharm. Bull. 19 (1): 122–6. doi:10.1248/bpb.19.122. PMID 8820923.
  7. ^ a b "Entrez Gene: TAF11 TAF11 RNA polymerase II, TATA box binding protein (TBP)-associated factor, 28kDa".
  8. ^ a b Birck C, Poch O, Romier C, Ruff M, Mengus G, Lavigne AC, Davidson I, Moras D (July 1998). "Human TAF(II)28 and TAF(II)18 interact through a histone fold encoded by atypical evolutionary conserved motifs also found in the SPT3 family". Cell. 94 (2): 239–49. doi:10.1016/S0092-8674(00)81423-3. PMID 9695952. S2CID 6274415.
  9. ^ a b c Scully R, Anderson SF, Chao DM, Wei W, Ye L, Young RA, Livingston DM, Parvin JD (May 1997). "BRCA1 is a component of the RNA polymerase II holoenzyme". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 94 (11): 5605–10. Bibcode:1997PNAS...94.5605S. doi:10.1073/pnas.94.11.5605. PMC 20825. PMID 9159119.
  10. ^ Bertolotti A, Melot T, Acker J, Vigneron M, Delattre O, Tora L (March 1998). "EWS, but not EWS-FLI-1, is associated with both TFIID and RNA polymerase II: interactions between two members of the TET family, EWS and hTAFII68, and subunits of TFIID and RNA polymerase II complexes". Mol. Cell. Biol. 18 (3): 1489–97. doi:10.1128/mcb.18.3.1489. PMC 108863. PMID 9488465.
  11. ^ Bellorini M, Lee DK, Dantonel JC, Zemzoumi K, Roeder RG, Tora L, Mantovani R (June 1997). "CCAAT binding NF-Y-TBP interactions: NF-YB and NF-YC require short domains adjacent to their histone fold motifs for association with TBP basic residues". Nucleic Acids Res. 25 (11): 2174–81. doi:10.1093/nar/25.11.2174. PMC 146709. PMID 9153318.
  12. ^ May M, Mengus G, Lavigne AC, Chambon P, Davidson I (June 1996). "Human TAF(II28) promotes transcriptional stimulation by activation function 2 of the retinoid X receptors". EMBO J. 15 (12): 3093–104. doi:10.1002/j.1460-2075.1996.tb00672.x. PMC 450252. PMID 8670810.

추가 정보