스시 도메인

Sushi domain
스시 도메인(SCR/CP)
식별자
기호스시
PfamPF00084
인터프로IPR000436
Cath1g4g
SCOP21hfi / SCOPe / SUPFAM
CDDcd00033

스시 도메인은 진화적으로 보존된 단백질 영역이다.그것은 또한 보완 제어 단백질(CP) 모듈 또는 짧은 컨센서스 반복 (SCR)로도 알려져 있다.이황화채에 의해 만들어진 루프를 보여주는 1차 구조물이 그려질 때 니기리 초밥과 도메인의 시각적 유사성에서 유래한 이름이다.[1]

초밥 영역은 매우 다양한 보완 단백질과 접착 단백질로 존재한다.이 구조는 이 영역으로 알려져 있다. 베타-샌드위치 배치에 기초한다. 한 면은 그 중심에 삼중 가닥 영역을 형성하기 위해 β-균드 수소 결합 3개로 구성되고, 다른 면은 두 개의 분리된 β-균드로부터 형성된다.[2]

CD21(C3d 수용체, CR2, Epstein Barr 바이러스 수용체 또는 EBV-R이라고도 함)은 EBV와 C3d, C3dg, iC3b의 수용체다.보완 요소는 CD21을 통해 B 셀을 활성화할 수 있다. CD21은 CD19, CD81 및 Leu13을 포함하는 큰 신호 전달 복합체의 일부다.

이 그룹의 단백질들 중 일부는 적혈구 세포막 바깥의 표면 표식인 혈액군 항원의 분자적 기초를 담당한다.이러한 표지의 대부분은 단백질이지만 일부는 지방이나 단백질에 부착된 탄수화물이다.[3]붕괴 가속 인자(Antigen CD55)는 크로머 혈액군 시스템에 속하며 Cr(a), Dr(a), Es(a), Tc(a/b/c), Wd(a), WES(a/b), IFC(A/b), UMC 항원과 관련된다.보완수용체 타입 1(C3b/C4b수용체) (antigen CD35)은 Knops 혈액군계에 속하며 Kn(a/b), McC(a), Sl(a), Yk(a) 항원과 관련된다.

하위 가족

예

이 영역을 포함하는 단백질을 인코딩하는 인간의 유전자는 다음과 같다.

참조

  1. ^ Ichinose, Akitada; Bottenus, Ralph E.; Davie, Earl W. "Structure of Transglutaminases". The Journal of Biological Chemistry. 265: 13411–13414. PMID 1974250.
  2. ^ Campbell ID, Baron M, Day AJ, Sim RB, Norman DG, Barlow PN (1991). "Three-dimensional structure of a complement control protein module in solution". J. Mol. Biol. 219 (4): 717–725. doi:10.1016/0022-2836(91)90666-T. PMID 1829116.
  3. ^ Lomas-Francis, Christine; Reid, Marion E. (2004). The blood group antigen: factsbook. Boston: Academic Press. ISBN 0-12-586585-6.
이 글에는 공용 도메인 Pfam과 InterPro의 텍스트가 포함되어 있다: IPR000436