CUB 도메인

CUB domain
CUB 도메인
식별자
기호.큐브
팜PF00431
인터프로IPR000859
프로 사이트PDOC00758
SCOP21sfp/SCOPe/SUPFAM
CDDcd00041

CUB 도메인은 진화적으로 보존된 단백질 도메인이다.

CUB 도메인(보체 C1r/C1s, Uegf, Bmp1)은 거의 전적으로 세포외 및 혈장막 관련 단백질에서 발견되는 약 110개의 잔류물의 구조적 모티브이며, 그 중 다수는 발달적으로 [1][2]조절된다.이러한 단백질은 보체 활성화, 발달 패턴 형성, 조직 복구, 축삭 유도 및 혈관 형성, 세포 신호 전달, 수정, 지혈, 염증, 신경 전달, 수용체 매개 내구성 및 종양 억제 [3]등 다양한 기능에 관여한다.많은 CUB 함유 단백질은 MEROPS 펩티드가수분해효소군 M12A(아스타신) 및 S1A(키모트립신)에 속하는 펩티다아제이다.

예

CUB 도메인을 포함하는 단백질은 다음과 같습니다.

  • 포유류는 보체계의 고전적 경로의 첫 번째 성분인 칼슘의존성 복합체 C1을 형성하는 하위 성분 C1s/C1r.
  • 칼슘이 존재할 때 I형 및 IV형 콜라겐과 피브로넥틴을 분해하는 Cricetidae sp.(햄스터) 세린 단백질 분해효소 Casp.
  • 보체의 C4 성분을 분해하는 단백질 분해효소인 Ra-reactive factor(RARF)의 포유동물 보체활성화 성분.
  • 장 브러시 테두리의 II형 막 단백질인 척추동물 엔테로펩티드가수분해효소(EC 3.4.21.9)로 트립시노겐을 활성화한다.
  • 연골형성과 골형성을 유도하고 메탈엔도펩티드가수분해효소 활성을 발현하는 단백질인 척추동물골형태형성단백질1(BMP-1).
  • 성게배란단백질 BP10 및 SpAN.
  • C. elegans 가설 단백질 F42A10.8 및 R151.5.
  • 특정 신경 회로의 형성 중에 기능하는 칼슘 비의존 세포 접착 분자 Neuroilin(A5 항원).
  • 자색 성게의 섬유소 I 및 III.
  • 포유류의 히알루론산염 결합단백질 TSG-6(또는 PS4)로 혈청 및 성장인자 유도단백질.
  • 포유류의 스펠마데신.
  • 제노푸스 라에비스 배아단백질 UVS.2. 이는 돌소내 개발 중에 발현된다.

상기 단백질 중 일부는 칼슘 결합 EGF 도메인이 삽입된 여러 CUB 도메인과 함께 촉매 도메인으로 구성된다.

스펠마데신은 CUB 도메인 패밀리의 하위 분류로 포유류의 정액의 주요 구성 요소를 형성합니다.스펠마데신은 110-133개의 아미노산 폴리펩타이드이다.[4]예를 들어 헤파린과 탄수화물 결합과 같은 정자의 결합 활성은 난모세포 [5]표면에 있는 당단백질에서 탄수화물 그룹에 대한 정자의 부착을 촉진하는 중심 역할을 가능하게 한다.돼지, 황소 및 종마에서 추출된 정자 헤신은 아미노산 배열에서 40-98%의 유사성을 보이며, 모두 인접한 시스테인 잔류물 사이에 디설피드 결합을 가지고 있다.돼지 정자 폴리펩타이드는 밀접하게 연결된 다섯 개의 유전자에 의해 코드화 된다.소의 스펠마데신은 소의 정액에서 이 단백질의 발현과 관련이 있는 단 2개의 유전자에 의해 상당히 적은 수의 유전자에 의존합니다.침팬지, 개, 그리고 [6]인간에게서 정조세포에 대한 중복 유전암호가 관찰되었다.쥐와 쥐의 DNA에서 스펠마데신 유전자와 상관되는 영역은 스펠마데신 코드가 없다.이러한 조세포의 발현과 유전자 부호화의 변화는 유전자 물질의 돌연변이와 결실의 결과로 유전자의 진화적 조정에서 비롯되는 것으로 보인다.

일부 CUB 도메인은 기질 및 결합 파트너의 올리고머화 및/또는 인식에 관여하는 것으로 보인다.예를 들어 보체단백질가수분해효소에서는 CUB 도메인이 표적단백질의 콜라겐 유사영역에 대한 이량화 및 결합을 매개한다(예: C1r/C1s).CUB 도메인의 구조는 젤리 롤 폴드가 있는 베타 샌드위치입니다.거의 모든 CUB 도메인에는 2개의 디설피드브리지(C1-C2, C3-C4)를 형성하는4개의 보존 시스테인이 포함되어 있습니다.C1 및 Map19의 CUB1 도메인은 칼슘 결합 사이트를 [7]가지고 있습니다.

이 도메인을 포함하는 단백질을 코드하는 인간 유전자는 다음과 같다.

레퍼런스

  1. ^ Bork P, Beckmann G (May 1993). "The CUB domain. A widespread module in developmentally regulated proteins". Journal of Molecular Biology. 231 (2): 539–45. doi:10.1006/jmbi.1993.1305. PMID 8510165.
  2. ^ Bork P (Apr 1991). "Complement components C1r/C1s, bone morphogenic protein 1 and Xenopus laevis developmentally regulated protein UVS.2 share common repeats". FEBS Letters. 282 (1): 9–12. doi:10.1016/0014-5793(91)80433-4. PMID 2026272. S2CID 33375087.
  3. ^ Perry SE, Robinson P, Melcher A, Quirke P, Bühring HJ, Cook GP, Blair GE (Mar 2007). "Expression of the CUB domain containing protein 1 (CDCP1) gene in colorectal tumour cells". FEBS Letters. 581 (6): 1137–42. doi:10.1016/j.febslet.2007.02.025. PMID 17335815. S2CID 30701692.
  4. ^ Romero A, Varela PF, Sanz L, Töpfer-Petersen E, Calvete JJ (Mar 1996). "Crystallization and preliminary X-ray diffraction analysis of boar seminal plasma spermadhesin PSP-I/PSP-II, a heterodimer of two CUB domains". FEBS Letters. 382 (1–2): 15–7. doi:10.1016/0014-5793(96)00133-0. PMID 8612739. S2CID 37515421.
  5. ^ Töpfer-Petersen E, Romero A, Varela PF, Ekhlasi-Hundrieser M, Dostàlovà Z, Sanz L, Calvete JJ (1998). "Spermadhesins: a new protein family. Facts, hypotheses and perspectives". Andrologia. 30 (4–5): 217–24. doi:10.1111/j.1439-0272.1998.tb01163.x. PMID 9739418. S2CID 24941844.
  6. ^ Haase B, Schlötterer C, Hundriser ME, Kuiper H, Distl O, Töfer-Petersen E, Leb T, 정자마데신 유전자군의 진화, Gene.(2005) 352, P-20-29
  7. ^ Blanc G, Font B, Eichenberger D, Moreau C, Ricard-Blum S, Hulmes DJ, Moali C (Jun 2007). "Insights into how CUB domains can exert specific functions while sharing a common fold: conserved and specific features of the CUB1 domain contribute to the molecular basis of procollagen C-proteinase enhancer-1 activity". The Journal of Biological Chemistry. 282 (23): 16924–33. doi:10.1074/jbc.M701610200. PMID 17446170.
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