SOX17

SOX17
SOX17
사용 가능한 구조
PDBOrtholog 검색: PDBe RCSB
식별자
에일리어스SOX17, VUR3, SRY박스 17, SRY박스 전사율 17
외부 IDOMIM: 610928 MGI: 107543 HomoloGene: 7948 GeneCard: SOX17
맞춤법
종.인간마우스
엔트레즈

64321

20671

앙상블

ENSG00000164736

ENSMUSG000025902

유니프로트

Q9H6I2

Q61473

RefSeq(mRNA)

NM_022454

NM_001289464
NM_001289465
NM_001289466
NM_0012897
NM_011441

RefSeq(단백질)

NP_071899

NP_001276393
NP_001276394
NP_001276395
NP_001276396
NP_035571

장소(UCSC)Chr 8: 54.46 ~54.46 MbChr 1: 4.56 ~4.57 Mb
PubMed 검색[3][4]
위키데이터
인간 보기/편집마우스 표시/편집

SRY박스17은 SOX17 유전자에 의해 인체 내에서 암호화되는 단백질이다.[5]

인간 SOX17 궤적에서의 규정

이 유전자는 염색체 8 q11.23에 위치한 SOX(SRY 관련 HMG 상자) 계열의 전사 인자를 코드한다.유전자 본체가 CTCF 루프 [6][7][8]영역 내에서 분리되었습니다.SOX17의 약 230kb 업스트림에서 SOX17 규제 [9][10]요소로 구성된 조직 특이적 차등(하이포) 메틸화 영역(DMR)이 식별되었습니다.특히 DMR에는 SOX17 [11]궤적에서 가장 원위적인 최종 내배엽 고유의 인핸서가 포함되어 있습니다.SOX17 자체는 최근 소위 토폴로지적으로 절연된 유전자(TIG)로 정의되었습니다.정의당 TIG는 CTCF 루프 도메인 내의 단일 단백질 코딩 유전자(PCG)로, 주로 개발 규제 기관으로 강화되며 3D 루프 도메인 [12]아키텍처를 통해 매우 엄격하게 제어될 것을 제안한다.

개발 중인 기능

SOX17은 척추동물의 배아발달 조절과 내배엽세포 운명 결정에 관여한다.암호화된 단백질은 TGF 베타 시그널링(Activin)과 표준 WNT 시그널링(Wnt3a)[13][14]의 다운스트림으로 작용합니다.특히 각 세포주기(초기 G1상) 내에서 SMAD2/3의 정확한 인산화(인산화)는 기수 내배엽 유전자(예를 들어 SOX17)가 최종 내배엽 [15]계통에 더욱 진입하는 데 중요하다.또한 SOX17의 중심성 CTCF 경계가 초기 확정적 내배엽 분화에 있어 섭동함으로써 현저한 발육부전 및 소위 포획 세포상태와 같은 중배엽이 발생하게 되며, 이는 이소성 SOX17 [16]발현으로 구제할 수 있다.Xenopus gastrulae에서는 SOX17이 Wnt 반응을 수정하는 것으로 나타났으며, 여기서 SOX17과 β-catenin/Tcf 전사 [17]복합체 간의 기능적 상호작용을 통해 Wnt/β-catenin 전사의 게놈 특이성이 결정된다.

레퍼런스

  1. ^ a b c GRCh38: 앙상블 릴리즈 89: ENSG00000164736 - 앙상블, 2017년 5월
  2. ^ a b c GRCm38: 앙상블 릴리즈 89: ENSMUSG000025902 - 앙상블, 2017년 5월
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ "Entrez Gene: SRY-box 17". Retrieved 2017-09-07.
  6. ^ Rao SS, Huang SC, Glenn St Hilaire B, Engreitz JM, Perez EM, Kieffer-Kwon KR, et al. (October 2017). "Cohesin Loss Eliminates All Loop Domains". Cell. 171 (2): 305–320.e24. doi:10.1016/j.cell.2017.09.026. hdl:1721.1/118942. PMID 28985562.
  7. ^ Szabo Q, Bantignies F, Cavalli G (April 2019). "Principles of genome folding into topologically associating domains". Science Advances. 5 (4): eaaw1668. doi:10.1126/sciadv.aaw1668. PMC 6457944. PMID 30989119.
  8. ^ Wu, Hua-Jun; Landshammer, Alexandro; Stamenova, Elena K.; Bolondi, Adriano; Kretzmer, Helene; Meissner, Alexander; Michor, Franziska (2021-08-12). "Topological isolation of developmental regulators in mammalian genomes". Nature Communications. 12 (1): 4897. doi:10.1038/s41467-021-24951-7. ISSN 2041-1723. PMC 8361032. PMID 34385432.
  9. ^ Tsankov AM, Gu H, Akopian V, Ziller MJ, Donaghey J, Amit I, et al. (February 2015). "Transcription factor binding dynamics during human ES cell differentiation". Nature. 518 (7539): 344–9. doi:10.1038/nature14233. PMC 4499331. PMID 25693565.
  10. ^ Wu, Hua-Jun; Landshammer, Alexandro; Stamenova, Elena K.; Bolondi, Adriano; Kretzmer, Helene; Meissner, Alexander; Michor, Franziska (2021-08-12). "Topological isolation of developmental regulators in mammalian genomes". Nature Communications. 12 (1): 4897. doi:10.1038/s41467-021-24951-7. ISSN 2041-1723. PMC 8361032.
  11. ^ Wu, Hua-Jun; Landshammer, Alexandro; Stamenova, Elena K.; Bolondi, Adriano; Kretzmer, Helene; Meissner, Alexander; Michor, Franziska (2021-08-12). "Topological isolation of developmental regulators in mammalian genomes". Nature Communications. 12 (1): 4897. doi:10.1038/s41467-021-24951-7. ISSN 2041-1723. PMC 8361032.
  12. ^ Wu, Hua-Jun; Landshammer, Alexandro; Stamenova, Elena K.; Bolondi, Adriano; Kretzmer, Helene; Meissner, Alexander; Michor, Franziska (2021-08-12). "Topological isolation of developmental regulators in mammalian genomes". Nature Communications. 12 (1): 4897. doi:10.1038/s41467-021-24951-7. ISSN 2041-1723. PMC 8361032.
  13. ^ Engert S, Burtscher I, Liao WP, Dulev S, Schotta G, Lickert H (August 2013). "Wnt/β-catenin signalling regulates Sox17 expression and is essential for organizer and endoderm formation in the mouse". Development. 140 (15): 3128–38. doi:10.1242/dev.088765. PMID 23824574.
  14. ^ Mukherjee S, Chaturvedi P, Rankin SA, Fish MB, Wlizla M, Paraiso KD, et al. (September 2020). LaBonne C, Morrisey EE (eds.). "Sox17 and β-catenin co-occupy Wnt-responsive enhancers to govern the endoderm gene regulatory network". eLife. 9: e58029. doi:10.7554/eLife.58029. PMC 7498262. PMID 32894225.
  15. ^ Pauklin S, Vallier L (September 2013). "The cell-cycle state of stem cells determines cell fate propensity". Cell. 155 (1): 135–47. doi:10.1016/j.cell.2013.08.031. PMC 3898746. PMID 24074866.
  16. ^ Wu, Hua-Jun; Landshammer, Alexandro; Stamenova, Elena K.; Bolondi, Adriano; Kretzmer, Helene; Meissner, Alexander; Michor, Franziska (2021-08-12). "Topological isolation of developmental regulators in mammalian genomes". Nature Communications. 12 (1): 4897. doi:10.1038/s41467-021-24951-7. ISSN 2041-1723. PMC 8361032.
  17. ^ Mukherjee, Shreyasi; Chaturvedi, Praneet; Rankin, Scott A; Fish, Margaret B; Wlizla, Marcin; Paraiso, Kitt D; MacDonald, Melissa; Chen, Xiaoting; Weirauch, Matthew T; Blitz, Ira L; Cho, Ken WY (2020-09-07). LaBonne, Carole; Morrisey, Edward E (eds.). "Sox17 and β-catenin co-occupy Wnt-responsive enhancers to govern the endoderm gene regulatory network". eLife. 9: e58029. doi:10.7554/eLife.58029. ISSN 2050-084X. PMC 7498262.

추가 정보

이 기사에는 미국 국립 의학 도서관(미국 국립 의학 도서관)의 공공 도메인 텍스트가 포함되어 있습니다.


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