RBM9

RBFOX2
사용 가능한 구조
PDB	Ortholog 검색: PDBe RCSB
PDB ID 코드 목록
	2CQ3
식별자
에일리어스	RBFOX2, FOX2, Fox-2, HNRBP2, RBM9, RTA, dJ106I20.3, fxh, RNA결합단백질, fox-1호몰로그2, RNA결합호몰로그2
외부 ID	OMIM: 612149 MGI: 1933973 HomoloGene: 49375 GeneCard: RBFOX2
유전자 위치(인간)
크르.	22번 염색체(인간)
끝.	36,028,824 bp
유전자 위치(마우스)
크르.	15번 염색체(쥐)
끝.	77,307,004 bp
RNA발현패턴
	상단 표시 위치:
	신경절 융기; ; 소뇌 피질; ; 소뇌 반구; ; 평활근 조직; ; 자궁내막간질세포; ; 상전두회; ; 아킬레스건; ; 위점막; ; 근막; ; 난소;
	추가 참조 표현식 데이터
	; ;
	추가 참조 표현식 데이터
유전자 존재론
분자 함수	GO:0001106 전사 코어프레서 액티비티; 전사 인자 결합; GO:0001948 단백질 결합; RNA결합; 핵산 결합; mRNA 결합;
셀룰러 컴포넌트	핵; 핵소체; 세포질; 세포;
생물학적 과정	신경근 조절 균형; 수상돌기 형태 형성; mRNA 처리; 스플라이소솜을 통한 대체 mRNA 스플라이싱 조절; 신경계의 발달; RNA 스플라이싱 조절; 세포군 증식 조절; RNA 스플라이싱; 퍼킨제 세포의 요골 글리아 유도 이동; 적혈구분화조절; RNA대사과정; 전사 음성 조절, DNA 템플릿; 세포내 에스트로겐수용체신호경로; 섬유아세포증식인자수용체신호경로;
	출처:아미고 / QuickGO
맞춤법
	23543
	93686
	ENSG00000277564; ENSG00000100320
	ENSMUSG000033565
	O43251
	Q8BP71
NM_001031695; NM_001082576; NM_001082577; NM_001082578; NM_001082579;
	NM_014309; NM_001349982; NM_001349983; NM_001349989; NM_001349990; NM_001349991; NM_001349992; NM_001349994; NM_001349995; NM_001349996; NM_001349997; NM_001349998; NM_0013499999; NM_001394108; NM_001394109; NM_001394110; NM_001394111; NM_001394112; NM_001394113; NM_001394114; NM_001394115
NM_001110827; NM_001110828; NM_001110829; NM_001110830; NM_001286417;
	NM_001286418; NM_001286419; NM_053104; NM_175387; NM_001358770; NM_00135871; NM_001358772
NP_001026865; NP_001076045; NP_001076046; NP_001076047; NP_001076048;
	NP_055124; NP_001336911; NP_001336912; NP_001336918; NP_001336919; NP_001336920; NP_001336921; NP_001336923; NP_001336924; NP_001336925; NP_001336926; NP_001336927; NP_001336928
NP_001104297; NP_001104298; NP_001104299; NP_001104300; NP_001273346;
	NP_001273347; NP_001273348; NP_444334; NP_780596; NP_001345699; NP_001345700; NP_001345701
	위키데이터
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Rbfox2라고도 알려진 RNA 결합 모티브 단백질 9(RBM9)는 RBM9 ^[5]유전자에 의해 인체 내에서 암호화되는 단백질이다.

기능.

Rbfox2는 C. elegans 유전자 Fox-1과 유사한 여러 인간 유전자 중 하나이다.이 유전자는 신경계와 다른 세포 유형에서 대체 스플라이싱의 핵심 조절자로 생각되는 RNA 결합 단백질을 암호화합니다.Rbfox2 및 관련 단백질 Rbfox1은 다수의 대체 스플라이싱 엑손에 인접한 인트론에서 보존된 (U)GCAUG RNA 모티브에 결합하고 성숙한 ^[6]^[7]전사물에 대체 엑손의 포함 또는 배제를 촉진한다.단백질은 또한 에스트로겐 수용체 1의 전사 인자와 상호작용하고 에스트로겐 수용체 1의 전사 활성을 조절합니다.이 ^[5]유전자에 대해 서로 다른 아이소폼을 코드하는 여러 개의 전사 변형이 발견되었다.

CLIP-seq에 의해 결정되는 Rbfox2는 교대로 스플라이스된 엑손 근방에 결합하고 엑손의 하류(포함) 또는 상류(포함)에 결합함으로써 대체 스플라이싱 중에 엑손의 포함 또는 제외를 조절한다.Rbfox2의 녹다운은 줄기세포 생존과 ^[8]아포토시스 활성화 마커를 위해 중요하다.

「」를 참조해 주세요.

레퍼런스

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추가 정보

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외부 링크

PDBe-KB에서 UniProt: O43251(RNA 결합 단백질 fox-1 homolog 2)에 대해 PDB에서 사용 가능한 모든 구조 정보의 개요.

인간 염색체 22번 유전자에 대한 이 기사는 뭉툭한 것이다.위키피디아를 확장함으로써 위키피디아를 도울 수 있습니다.

[refGRCh38Ensembl-1] ENSG00000100320 GRCh38: Ensembl 릴리즈 89: ENSG00000277564, ENSG00000100320 - Ensembl, 2017년 5월

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: 앙상블 릴리즈 89: ENSMUSG000033565 - 앙상블, 2017년 5월

[3] "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.

[4] "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.

[entrez-5] "Entrez Gene: RBM9 RNA binding motif protein 9".

[Jin_pp._905–912-6] Jin, Y. (2003-02-17). "A vertebrate RNA-binding protein Fox-1 regulates tissue-specific splicing via the pentanucleotide GCAUG". The EMBO Journal. 22 (4): 905–912. doi:10.1093/emboj/cdg089. ISSN 1460-2075. PMC 145449. PMID 12574126.

[Ponthier_Schluepen_Chen_Lersch_pp._12468–12474-7] Ponthier, Julie L.; Schluepen, Christina; Chen, Weiguo; Lersch, Robert A.; Gee, Sherry L.; Hou, Victor C.; Lo, Annie J.; Short, Sarah A.; Chasis, Joel A.; Winkelmann, John C.; Conboy, John G. (2006-03-14). "Fox-2 Splicing Factor Binds to a Conserved Intron Motif to Promote Inclusion of Protein 4.1R Alternative Exon 16". Journal of Biological Chemistry. 281 (18): 12468–12474. doi:10.1074/jbc.m511556200. ISSN 0021-9258. PMID 16537540.

[pmid19136955-8] Yeo GW, Coufal NG, Liang TY, Peng GE, Fu XD, Gage FH (February 2009). "An RNA code for the FOX2 splicing regulator revealed by mapping RNA-protein interactions in stem cells". Nature Structural & Molecular Biology. 16 (2): 130–137. doi:10.1038/nsmb.1545. PMC 2735254. PMID 19136955.

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