PIP5K1C

PIP5K1C
PIP5K1C
Protein PIP5K1C PDB 3H1Z.png
사용 가능한 구조
PDBOrtholog 검색: PDBe RCSB
식별자
에일리어스PIP5K1C, LCCS3, PIP5K-GAMA, PIP5K1-감마, PIP5Kgamma, 포스파티딜이노시톨-4-인산5-키나아제1형 감마
외부 IDOMIM : 606102 MGI : 1298224 HomoloGene : 69032 GenC : PIP5K1C
맞춤법
종.인간마우스
엔트레즈
앙상블
유니프로트
RefSeq(mRNA)

NM_001195733
NM_001300849
NM_012398

NM_001146687
NM_001293646
NM_001293647
NM_008844

RefSeq(단백질)

NP_001182662
NP_00128778
NP_036530

NP_001140159
NP_001280575
NP_001280576
NP_032870

장소(UCSC)Chr 19: 3.63 ~3.7 MbChr 10: 81.29 ~81.32 Mb
PubMed 검색[3][4]
위키데이터
인간 보기/편집마우스 표시/편집

포스파티딜이노시톨-4-인산5-키나아제 타입-1 감마(gamma)는 [5][6]PIP5K1C 유전자에 의해 인체 내에서 코드되는 효소이다.

이 유전자는 I형 포스파티딜이노시톨-4-인산5-키나아제 계열의 효소를 코드한다.생쥐의 유사한 단백질은 시냅스 및 국소 접착 플라크에서 발견되며 탈린의 FERM 도메인[6]C 말단을 통해 결합한다.

모델 유기체

Pip5k1c 녹아웃 마우스 표현형

모델 유기체는 PIP5K1C 기능의 연구에 사용되어 왔다.International Knockout Mouse Consortium 프로그램의 일부로서 Pip5k1c라고tm1a(KOMP)Wtsi[11][12] 불리는 조건부 녹아웃 마우스 라인이 생성되었습니다.이것은 질병 동물 모델을 생성하여 관심 있는 [13][14][15]과학자들에게 배포하는 높은 처리량 돌연변이 유발 프로젝트입니다.

수컷과 암컷은 표준화된 표현형 검사를 통해 [9][16]결실의 효과를 확인했습니다.돌연변이 생쥐에 대해 23개의 검사가 수행되었고 2개의 유의한 이상이 [9]관찰되었다.임신 기간 동안 예상보다 적은 수의 동종 접합 돌연변이 배아가 확인되었고, 을 뗄 때까지 생존한 배아는 없었다.나머지 테스트는 헤테로 접합 돌연변이 성인 생쥐를 대상으로 수행되었으며 더 이상의 표현형은 [9]관찰되지 않았다.

레퍼런스

  1. ^ a b c GRCh38: 앙상블 릴리즈 89: ENSG00000186111 - 앙상블, 2017년 5월
  2. ^ a b c GRCm38: 앙상블 릴리즈 89: ENSMUSG000034902 - 앙상블, 2017년 5월
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ Ishihara H, Shibasaki Y, Kizuki N, Wada T, Yazaki Y, Asano T, Oka Y (May 1998). "Type I phosphatidylinositol-4-phosphate 5-kinases. Cloning of the third isoform and deletion/substitution analysis of members of this novel lipid kinase family". J Biol Chem. 273 (15): 8741–8. doi:10.1074/jbc.273.15.8741. PMID 9535851.
  6. ^ a b "Entrez Gene: PIP5K1C phosphatidylinositol-4-phosphate 5-kinase, type I, gamma".
  7. ^ "Salmonella infection data for Pip5k1c". Wellcome Trust Sanger Institute.
  8. ^ "Citrobacter infection data for Pip5k1c". Wellcome Trust Sanger Institute.
  9. ^ a b c d Gerdin AK (2010). "The Sanger Mouse Genetics Programme: High throughput characterisation of knockout mice". Acta Ophthalmologica. 88: 925–7. doi:10.1111/j.1755-3768.2010.4142.x. S2CID 85911512.
  10. ^ Wellcome Trust Sanger Institute의 마우스 리소스 포털.
  11. ^ "International Knockout Mouse Consortium".
  12. ^ "Mouse Genome Informatics".
  13. ^ Skarnes, W. C.; Rosen, B.; West, A. P.; Koutsourakis, M.; Bushell, W.; Iyer, V.; Mujica, A. O.; Thomas, M.; Harrow, J.; Cox, T.; Jackson, D.; Severin, J.; Biggs, P.; Fu, J.; Nefedov, M.; De Jong, P. J.; Stewart, A. F.; Bradley, A. (2011). "A conditional knockout resource for the genome-wide study of mouse gene function". Nature. 474 (7351): 337–342. doi:10.1038/nature10163. PMC 3572410. PMID 21677750.
  14. ^ Dolgin E (2011). "Mouse library set to be knockout". Nature. 474 (7351): 262–3. doi:10.1038/474262a. PMID 21677718.
  15. ^ Collins FS, Rossant J, Wurst W (2007). "A Mouse for All Reasons". Cell. 128 (1): 9–13. doi:10.1016/j.cell.2006.12.018. PMID 17218247. S2CID 18872015.
  16. ^ van der Weyden L, White JK, Adams DJ, Logan DW (2011). "The mouse genetics toolkit: revealing function and mechanism". Genome Biol. 12 (6): 224. doi:10.1186/gb-2011-12-6-224. PMC 3218837. PMID 21722353.

추가 정보