Manuel Corpas (과학자)

Manuel Corpas (scientist)
마누엘 코르파스
MannyCorpas.jpg
마누엘 코르파스의 초상화
태어난
마누엘 코르파스 로페스

말라가
모교나바라 대학교
로 알려져 있다
어워드소프트웨어 지속가능성 연구소 2016
과학 경력
필드생물정보학
유전체학
기관
논문단백질 배열의 접힘 패턴 (2007)
박사 어드바이저테리 애트우드
웹 사이트

Manuel Corpas는 주로 생물정보학 및 유전체학 분야에 기여한 것으로 알려진 영국계 스페인인 생물학자이자 기업가입니다.현재 Corpas는 케임브리지 스타트업 Cambridge Precision [1]Medicine의 수석 과학자이며, Cambridge University for Continuing Education의 튜터 및 Universityidad International de La Rioja의 강사입니다.Manuel은 그의 경력 초기부터 인간 게놈에 대해 연구했고, 그의 게놈과 그가 Corpasome으로 [2]출판한 가까운 친척들의 게놈을 최초로 배열하는 소비자 중 한 명이었다.그는 얼햄 연구소와 웰컴 생어 연구소에서 프로젝트 리더로 재직하며 희귀 유전체 질환 환자의 진단을 돕는 데이터베이스인 DECIPLE 데이터베이스를 개발했습니다.

교육

Corpas는 2000년에 Navara 대학에서 생물학 학사 학위를 취득했습니다.그는 단백질 [3]주름의 진화적 보존을 연구하는 테리 앳우드 교수와 스티브 페티퍼 박사의 지도 아래 2007년 맨체스터 대학에서 생물정보학 박사학위를 받았습니다.

학술 서비스

박사학위 기간 동안 컴퓨터 생물학 학생들의 국제 조직인 국제 컴퓨터 생물학 학생회(ISCBSC)[4]를 설립했습니다.국제컴퓨터생물학회는 2004년에 Corpas를 초대 의장으로 하여 학생회를 공식적으로 승인했습니다.현재까지 학생회는 [5][6]전 세계에 수많은 지역 학생 단체가 이 분야의 수천 명의 학생들과 접촉하고 있습니다.Corpas는 또한 2005년 마드리드에서 열린 유럽 컴퓨터 생물학 회의에서 컴퓨터 생물학에 관한 제1회 학생회의 심포지엄을 개최하였습니다.또한, 그는 아프리카 생물정보학 및 계산생물학 협회에 의해 아프리카에서 열린 최초의 생물정보학 컨퍼런스의 의장을 역임했습니다.

연구 및 경력

알폰소 발렌시아가 이끄는 스페인 국립생물정보학원과 이완 버니가 이끄는 유럽생물정보학원에서 몇 개월을 보낸 후, Corpas는 Dr. Helen V의 감독 아래 UNITE 데이터베이스의 개발자로서 Wellcome Sanger Institute에 정착했다.그 [7]이후로 그는 인간 게놈 연구와 개인 게놈학 분야에서 일하고 있다.Wellcome Sanger Institute에 재직하는 동안 그는 처음에는 복사 번호 [8][9]변동 데이터 세트를 해석하기 위한 통합 및 시각화 도구 개발에 주력했습니다.잠시 후, 그는 '콜파솜'[10][11][12]에서 일을 시작했다.그는 23andMe의 개인 유전자형을 인터넷에 공개한 최초의 사람들 중 한 명으로, 이 과정을 "genome blogging"[13]이라고 불렀습니다.그의 가족이 먼저 23andMe 데이터를 사용하여 유전자형을 분석한 후 인간 엑소메 기술과 더 최근에는 전체 [14]게놈을 분석했습니다.이로 인해 개인 [15]유전체학 분야에서 많은 중요한 출판물이 발표되어 게놈 [16]패밀리에 대한 최초의 크라우드 소스 분석을 수행하게 되었다.Sanger Institute 재직 말기에는 2012년부터 2017년까지 BioJavaScript(BioJS) 커뮤니티를 조직하여 코디네이터가 되었습니다.BioJS 커뮤니티는 생물학적 시각화를 위한 오픈 소스 웹 컴포넌트를 제공하는 데 있어 지금까지 가장 큰 노력을 기울이고 있다.Corpas의 연구 그룹은 이 오픈 소프트웨어 [17][18][19]커뮤니티의 가장 중요한 개발에 관여하고 있습니다.BioJS는 유럽생물정보학연구소, 버클리랩, 케임브리지대학 등 세계 유수의 자원으로부터의 노력을 수반한다.Corpas는 구글 Summer of Code의 인턴십을 5개 획득하는 데 성공하여 BioJs를 국제적인 노력으로 급부상시켰다.

Corpas는, ELIXIR 유럽 네트워크의 영국 지사인 [20]ELIXIR-UK의 바이오 정보학 및 데이터 자원의 테크니컬 코디네이터이기도 합니다.ELIXIR 테크니컬 코디네이터로 재직하는 동안 유럽 전역의 데이터 자원의 영향을 측정하기 위한 베스트 프랙티스와 표준화된 지표 개발에 관여해 왔습니다.이 기간 동안 그는 또한 세계 생물 정보학 학습, 교육 [21][22]및 훈련을 위한 조직에 참여했으며, 기술 위원회의 의장과 생물 정보학 커뮤니티에 개방적인 접근 훈련 자원을 제공하는 훈련 포털의 개발을 담당했습니다.

케임브리지 정밀 의학에서의 일뿐만 아니라, Manuel은 케임브리지 대학 지속 교육 [23]연구소의 튜터이며 영어와 스페인어로 정밀 의학 온라인 강좌를 가르칩니다.Manuel은 50개 이상의 동료가 자신의 [24]이름으로 과학 출판물을 검토했으며 유전자 배열 분석의 과학을 넘어 더 광범위한 문제를 탐구하는 완벽한 [25]DNA라는 책을 가지고 있습니다.

상과 명예

Corpas는 Software Sustainability [26]Institute의 펠로우로 Genomics London, BioData West, Life World Forum 등의 게놈학 분야에서 세계적으로 유명한 행사에 자주 참석합니다.그는 말라가(스페인)에서 세계에서 영향력을 [27]행사하는 주요 인물 중 한 명으로 분류되고 있다.

레퍼런스

  1. ^ "CPM - Homepage". www.cpm.onl. Retrieved 2019-09-04.
  2. ^ Corpas, Manuel (2013). "Corpasome". figshare. doi:10.6084/m9.figshare.693052.v3. Retrieved 2019-09-04. {{cite journal}}:Cite 저널 요구 사항 journal=(도움말)
  3. ^ Corpas, Manuel (2007). Folding patterns in protein sequences (PhD thesis). University of Manchester. doi:10.6084/m9.figshare.964811.v1.
  4. ^ Corpas, Manuel (August 2005). "Scientists & societies". Nature. 436 (7054): 1204. doi:10.1038/nj7054-1204b. ISSN 0028-0836. PMID 16144051. S2CID 186242202.
  5. ^ "ISCB-SC RSGs". Retrieved 1 February 2017.
  6. ^ Macintyre, Geoff (2013). "The Regional Student Group Program of the ISCB Student Council: Stories from the Road". PLOS Computational Biology. 9 (9): e1003241. doi:10.1371/journal.pcbi.1003241. PMC 3784494. PMID 24098107.
  7. ^ www-core (webteam). "Helen V Firth". www.sanger.ac.uk. Retrieved 2019-09-04.
  8. ^ Firth HV, Richards SM, Bevan AP, Clayton S, Corpas M, et al. (April 2009). "DECIPHER: Database of Chromosomal Imbalance and Phenotype in Humans Using Ensembl Resources". Am. J. Hum. Genet. 84 (4): 524–33. doi:10.1016/j.ajhg.2009.03.010. PMC 2667985. PMID 19344873.
  9. ^ Swaminathan GJ; Bragin E; Chatzimichali EA; Corpas M; et al. (2012). "DECIPHER: web-based community resource for clinical interpretation of rare variants in developmental disorders". Hum. Mol. Genet. 21 (R1): R37–R44. doi:10.1093/hmg/dds362. PMC 3459644. PMID 22962312.
  10. ^ Corpas M, Cariaso M, Coletta A, Weiss D, Harrison AP, Moran F, Yang H (12 November 2013). "A Complete Public Domain Family Genomics Dataset". bioRxiv 10.1101/000216.
  11. ^ Corpas, Manuel (2013). "Crowdsourcing the Corpasome". Source Code for Biology and Medicine. 8 (1): 13. doi:10.1186/1751-0473-8-13. PMC 3706263. PMID 23799911.
  12. ^ Corpas M, Valdivia-Granda W, Torres N, Greshake B, Coletta A, Knaus A, Harrison AP, Cariaso M, Moran F, Nielsen F, Swan D, Weiss Solis DY, Krawitz P, Schacherer F, Schols P, Yang H, Borry P, Glusman G, Robinson PN (Nov 2015). "Crowdsourced direct-to-consumer genomic analysis of a family quartet". BMC Genomics. 16 (910): 910. doi:10.1186/s12864-015-1973-7. PMC 4636840. PMID 26547235.
  13. ^ Corpas, Manuel (2012). "A genome blogger manifesto". GigaScience. 1 (1): 15. doi:10.1186/2047-217X-1-15. PMC 3626510. PMID 23587446.
  14. ^ "Corpasome at BMC". blogs.biomedcentral.com. 28 June 2013. Retrieved 2020-09-29.
  15. ^ Corpas M (June 2012). "A Family Experience of Personal Genomics". Journal of Genetic Counseling. 21 (3): 386–391. doi:10.1007/s10897-011-9473-7. PMC 134180. PMID 22223063.
  16. ^ "Keeping It in the family". www.sciencemag.org. Retrieved 13 August 2012.
  17. ^ Corpas; Jimenez, Rafael; Carbon, Seth J; García, Alex; Garcia, Leyla; Goldberg, Tatyana; Gomez, John; Kalderimis, Alexis; Lewis, Suzanna E; Mulvany, Ian; Pawlik, Aleksandra; Rowland, Francis; Salazar, Gustavo; Schreiber, Fabian; Sillitoe, Ian; Spooner, William H; Thanki, Anil; Villaveces, José M; Yachdav, Guy; Hermjakob, Henning (2014). "BioJS: an open source standard for biological visualisation – its status in 2014". F1000Research. 3: 55. doi:10.12688/f1000research.3-55.v1. ISSN 2046-1402. PMC 4103492. PMID 25075290.
  18. ^ Thanki, Anil S.; Caim, Shabhonam; Corpas, Manuel; Davey, Robert P. (2014). "DNAContentViewer a BioJS component to visualise GC/AT Content". F1000Research. 3: 54. doi:10.12688/f1000research.3-54.v1. ISSN 2046-1402.
  19. ^ Thanki, Anil S.; Jimenez, Rafael C.; Kaithakottil, Gemy G.; Corpas, Manuel; Davey, Robert P. (2014). "wigExplorer, a BioJS component to visualise wig data". F1000Research. 3: 53. doi:10.12688/f1000research.3-53.v2. ISSN 2046-1402. PMC 5054804. PMID 27781080.
  20. ^ "ELIXIR-UK – UK life science infrastructure for biological information". Retrieved 2019-09-04.
  21. ^ "Committees GOBLET". www.mygoblet.org. 16 November 2014. Retrieved 24 August 2016.
  22. ^ Corpas, M.; Jimenez, R. C.; Bongcam-Rudloff, E.; Budd, A.; Brazas, M. D.; Fernandes, P. L.; van Gelder, C.; Korpelainen, E.; Lewitter, F.; McGrath, A.; MacLean, D.; Palagi, P.; Rother, K.; Taylor, J.; Via, A.; Watson, M.; Schneider, M. V.; Attwood, T. K. (2015). "The GOBLET training portal: a global repository of bioinformatics training materials, courses and trainers". Bioinformatics. 31 (1): 140–142. doi:10.1093/bioinformatics/btu601. PMC 4271145. PMID 25189782.
  23. ^ "Manuel Corpas - Institute of Continuing Education (ICE)". ice.cam.ac.uk. 12 July 2018. Retrieved 2020-09-29.
  24. ^ "Manuel Corpas - Google Scholar Citations". scholar.google.com. Retrieved 2019-09-04.
  25. ^ Manuel Corpas (2016). Perfect DNA. Cambridge: DNAdigest. ISBN 978-1539783725.
  26. ^ "Fellow Software Sustainability Institute". software.ac.uk. 2016. Retrieved 2020-09-29.
  27. ^ Hoy, Málaga (2016-04-10). "Los números 1 malagueños". Málaga Hoy (in Spanish). Retrieved 2019-09-04.