바이오JS

BioJS
바이오JS
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초기 릴리즈2012
리포지토리
기록 위치자바스크립트
유형생물정보학
면허증아파치 2
웹사이트biojs.net

바이오JS는 웹상의 생물정보학 데이터를 위한 오픈소스 프로젝트다.[1]생물학적 데이터를 시각화하기 위한 자바스크립트 구성요소의 오픈소스 라이브러리를 개발하는 것이 목표다.[2]바이오JS는 타인이 재사용할 수 있는 소형 빌딩블록(구성요소)을 개발·유지한다.사용 가능한 구성요소의 발견을 위해, BioJS는 웨이백 머신에 보관된 레지스트리 2018-03-13을 유지한다.null

역사

바이오JS의 첫 버전은 2012년 존 고메즈가 출시했다.웹 애플리케이션에서 생물학적 데이터를 나타내기 위해 웹 구성요소의 자바스크립트 라이브러리로 개발되었다.버전 2.0은 도서관 전면 재설계가 포함됐으며 2014년 마누엘 코퍼스가 주도하고 데이비드 다오와 세바스티안 윌즈바흐가 개발한 구글 서머 오브 코드 프로젝트로 출시됐다.그 이후로 100명이 넘는 사람들이 그 프로젝트에 기여했다.현재 바이오JS 등록부에는 150개 이상의 부품이 있다.null

게시된 구성 요소의 선택된 목록

  • DAG 뷰어[3]
  • DNA 콘텐츠 뷰어[4]
  • FeatureViewer[5]
  • 히트맵뷰어[6]
  • 지뢰간 분석[7]
  • 엔드포인트[8] 연결
  • 케그비워[9]
  • PPI-상호작용[10]
  • PsicquicGraph[11]
  • 순서[12]
  • 위그스펙터[13]
  • 트리위젯[14]

BioJ를 사용하는 기관s

참고 항목

참조

  1. ^ Corpas; Jimenez, Rafael; Carbon, Seth J; García, Alex; Garcia, Leyla; Goldberg, Tatyana; Gomez, John; Kalderimis, Alexis; Lewis, Suzanna E; Mulvany, Ian; Pawlik, Aleksandra; Rowland, Francis; Salazar, Gustavo; Schreiber, Fabian; Sillitoe, Ian; Spooner, William H; Thanki, Anil; Villaveces, José M; Yachdav, Guy; Hermjakob, Henning (2014). "BioJS: an open source standard for biological visualisation – its status in 2014". F1000Research. doi:10.12688/f1000research.3-55.v1. ISSN 2046-1402. PMC 4103492. PMID 25075290.
  2. ^ "BioJS Vision and Mission". BioJS. Archived from the original on 10 August 2014. Retrieved 29 August 2014.
  3. ^ Kalderimis, Alexis; Stepan, Radek; Sullivan, Julie; Lyne, Rachel; Lyne, Michael; Micklem, Gos (2014). "BioJS DAGViewer: A reusable JavaScript component for displaying directed graphs". F1000Research. doi:10.12688/f1000research.3-51.v1. ISSN 2046-1402. PMC 3945768. PMID 24627804.
  4. ^ Thanki, Anil S.; Caim, Shabhonam; Corpas, Manuel; Davey, Robert P. (2014). "DNAContentViewer a BioJS component to visualise GC/AT Content". F1000Research. doi:10.12688/f1000research.3-54.v1. ISSN 2046-1402.
  5. ^ Garcia, Leyla; Yachdav, Guy; Martin, Maria-Jesus (2014). "FeatureViewer, a BioJS component for visualization of position-based annotations in protein sequences". F1000Research. doi:10.12688/f1000research.3-47.v2. ISSN 2046-1402. PMID 24741440.
  6. ^ Yachdav, Guy; Hecht, Maximilian; Pasmanik-Chor, Metsada; Yeheskel, Adva; Rost, Burkhard (2014). "HeatMapViewer: interactive display of 2D data in biology". F1000Research. doi:10.12688/f1000research.3-48.v1. ISSN 2046-1402. PMID 24860644.
  7. ^ Kalderimis, Alexis; Stepan, Radek; Sullivan, Julie; Lyne, Rachel; Lyne, Michael; Micklem, Gos (2014). "BioJS InterMine List Analysis: A BioJS component for displaying graphical or statistical analysis of collections of items from InterMine endpoints". F1000Research. doi:10.12688/f1000research.3-45.v1. ISSN 2046-1402.
  8. ^ Kalderimis, Alexis; Stepan, Radek; Sullivan, Julie; Lyne, Rachel; Lyne, Michael; Micklem, Gos (2014). "BioJS InterMineTable Component: A BioJS component for displaying data from InterMine compatible webservice endpoints". F1000Research. doi:10.12688/f1000research.3-46.v1. ISSN 2046-1402.
  9. ^ Villaveces, Jose M.; Jimenez, Rafael C.; Habermann, Bianca H. (2014). "KEGGViewer, a BioJS component to visualize KEGG Pathways". F1000Research. doi:10.12688/f1000research.3-43.v1. ISSN 2046-1402. PMID 24715980.
  10. ^ Salazar, Gustavo A.; Meintjes, Ayton; Mulder, Nicola (2014). "PPI layouts: BioJS components for the display of Protein-Protein Interactions". F1000Research. doi:10.12688/f1000research.3-50.v1. ISSN 2046-1402. PMID 25075288.
  11. ^ Villaveces, Jose M.; Jimenez, Rafael C.; Habermann, Bianca H. (2014). "PsicquicGraph, a BioJS component to visualize molecular interactions from PSICQUIC servers". F1000Research. doi:10.12688/f1000research.3-44.v1. ISSN 2046-1402. PMID 25075287.
  12. ^ Gomez, John; Jimenez, Rafael (2014). "Sequence, a BioJS component for visualising sequences". F1000Research. doi:10.12688/f1000research.3-52.v1. ISSN 2046-1402. PMID 25075289.
  13. ^ Thanki, Anil S.; Jimenez, Rafael C.; Kaithakottil, Gemy G.; Corpas, Manuel; Davey, Robert P. (2014). "wigExplorer, a BioJS component to visualise wig data". F1000Research. doi:10.12688/f1000research.3-53.v2. ISSN 2046-1402.
  14. ^ Schreiber, Fabian (2014). "treeWidget: a BioJS component to visualise phylogenetic trees". F1000Research. doi:10.12688/f1000research.3-49.v1. ISSN 2046-1402.

외부 링크