락토비
LACTB| 락토비 | |||||||||||||||||||||||||
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| 식별자 | |||||||||||||||||||||||||
| 에일리어스 | LOCTB, G24, MRPL56, 락타마아제 베타 | ||||||||||||||||||||||||
| 외부 ID | OMIM : 608440 MGI : 1933395 HomoloGene : 12755 GenCard : LOCTB | ||||||||||||||||||||||||
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| 맞춤법 | |||||||||||||||||||||||||
| 종. | 인간 | 마우스 | |||||||||||||||||||||||
| 엔트레즈 | |||||||||||||||||||||||||
| 앙상블 | |||||||||||||||||||||||||
| 유니프로트 | |||||||||||||||||||||||||
| RefSeq(mRNA) | |||||||||||||||||||||||||
| RefSeq(단백질) | |||||||||||||||||||||||||
| 장소(UCSC) | Chr 15: 63.12 ~63.14 Mb | Chr 9: 66.86 ~66.88 Mb | |||||||||||||||||||||||
| PubMed 검색 | [3] | [4] | |||||||||||||||||||||||
| 위키데이터 | |||||||||||||||||||||||||
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세린β-락타마아제 유사 단백질인 LOCTB, 미토콘드리아는 인간에서 LOCTB [5][6]유전자에 의해 암호화되는 효소이다.이 유전자는 페니실린 결합 단백질의 세린 단백질 분해효소 및 박테리아에서 발생하는 베타락타마아제 슈퍼패밀리와 유의미한 배열 유사성을 공유하는 54kDa 단백질을 암호화한다.[7] 이것은 대사 회로의 조절에 관여합니다.LOCB와 [8]비만 사이의 인과관계가 발견되었다.유방암에서 LOCTB는 지질대사를 [9]조절하여 종양억제기능을 가지고 있다.
구조.
진
LACTB 유전자는 8개의 엑손으로 구성된 15q22.1 염색체에 위치합니다.대체 스플라이싱은 다른 단백질 아이소폼을 코드하는 여러 개의 전사 변형을 일으킨다.
단백질
LOCTB는 박테리아 세포벽 대사에 관여하는 세린 단백질 효소의 베타-락타마아제/페니실린 결합 단백질군과 배열 유사성을 공유합니다.LOCTB의 N 말단 97 아미노산 세그먼트는 보존된 페니실린 결합 단백질 도메인의 일부를 형성하지 않으므로 오르가넬 [7][10]표적을 담당할 수 있습니다.
기능.
LOCTB는 다양한 포유동물 조직에서 널리 발현되며, 인간의 골격근에서 주로 발현된다.그것은 미토콘드리아 막사이의 [10]공간에 위치한다.LOCTB는 미토콘드리아 막간 공간을 차지하는 안정적인 필라멘트로 중합할 수 있다.이러한 필라멘트는 연골하조직에서 역할을 하는 것으로 추측되며, 따라서 미토콘드리아 [10]대사체조직에 영향을 미칠 수 있다.
임상적 의의
LOCTB는 여러 출처로부터 통합된 데이터를 바탕으로 유전자 공발현 분석을 통해 비만을 유발할 수 있는 것으로 밝혀졌다.이는 트랜스제닉 마우스에서 LOCTB 과발현을 통해 생체 내에서 검증되었으며, 이는 비만 표현형을 [8]초래했다.또한 LOCTB는 미토콘드리아 인지질 대사 및 세포 분화 [11]상태 조절에 대한 영향을 통해 종양 억제제로 확인되었다.
상호 작용
레퍼런스
- ^ a b c GRCh38: 앙상블 릴리즈 89: ENSG00000103642 - 앙상블, 2017년 5월
- ^ a b c GRCm38: 앙상블 릴리즈 89: ENSMUSG000032370 - 앙상블, 2017년 5월
- ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
- ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
- ^ Smith TS, Southan C, Ellington K, Campbell D, Tew DG, Debouck C (November 2001). "Identification, genomic organization, and mRNA expression of LACTB, encoding a serine beta-lactamase-like protein with an amino-terminal transmembrane domain". Genomics. 78 (1–2): 12–4. doi:10.1006/geno.2001.6643. PMID 11707067.
- ^ "Entrez Gene: LACTB lactamase, beta".
- ^ a b Peitsaro N, Polianskyte Z, Tuimala J, Pörn-Ares I, Liobikas J, Speer O, Lindholm D, Thompson J, Eriksson O (2008). "Evolution of a family of metazoan active-site-serine enzymes from penicillin-binding proteins: a novel facet of the bacterial legacy". BMC Evolutionary Biology. 8: 26. doi:10.1186/1471-2148-8-26. PMC 2266909. PMID 18226203.
- ^ a b Chen Y, Zhu J, Lum PY, Yang X, Pinto S, MacNeil DJ, Zhang C, Lamb J, Edwards S, Sieberts SK, Leonardson A, Castellini LW, Wang S, Champy MF, Zhang B, Emilsson V, Doss S, Ghazalpour A, Horvath S, Drake TA, Lusis AJ, Schadt EE (March 2008). "Variations in DNA elucidate molecular networks that cause disease". Nature. 452 (7186): 429–35. doi:10.1038/nature06757. PMC 2841398. PMID 18344982.
- ^ Eriksson, Ove; Lalowski, Maciej; Lindholm, Dan (2017). "Commentary: LACTB is a tumour suppressor that modulates lipid metabolism and cell state". Frontiers in Physiology. 8: 396. doi:10.3389/fphys.2017.00396. ISSN 1664-042X. PMC 5462942. PMID 28642719.
- ^ a b c Polianskyte Z, Peitsaro N, Dapkunas A, Liobikas J, Soliymani R, Lalowski M, Speer O, Seitsonen J, Butcher S, Cereghetti GM, Linder MD, Merckel M, Thompson J, Eriksson O (November 2009). "LACTB is a filament-forming protein localized in mitochondria". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 106 (45): 18960–5. doi:10.1073/pnas.0906734106. PMC 2767363. PMID 19858488.
- ^ 케케소바 외 2017년LOCTB는 지질 대사 및 세포 상태를 조절하는 종양 억제제입니다.네이처 543:681-686
- ^ Lu JB, Yao XX, Xiu JC, Hu YW (January 2016). "MicroRNA-125b-5p attenuates lipopolysaccharide-induced monocyte chemoattractant protein-1 production by targeting inhibiting LACTB in THP-1 macrophages". Archives of Biochemistry and Biophysics. 590: 64–71. doi:10.1016/j.abb.2015.11.007. PMID 26603571.
추가 정보
- Hallis TM, Kopp AL, Gibson J, Lebakken CS, Hancock M, Van Den Heuvel-Kramer K, Turek-Etienne T (August 2007). "An improved beta-lactamase reporter assay: multiplexing with a cytotoxicity readout for enhanced accuracy of hit identification". Journal of Biomolecular Screening. 12 (5): 635–44. doi:10.1177/1087057107301499. PMID 17517902.
- Olsen JV, Blagoev B, Gnad F, Macek B, Kumar C, Mortensen P, Mann M (November 2006). "Global, in vivo, and site-specific phosphorylation dynamics in signaling networks". Cell. 127 (3): 635–48. doi:10.1016/j.cell.2006.09.026. PMID 17081983.
- Clark HF, Gurney AL, Abaya E, Baker K, Baldwin D, Brush J, Chen J, Chow B, Chui C, Crowley C, Currell B, Deuel B, Dowd P, Eaton D, Foster J, Grimaldi C, Gu Q, Hass PE, Heldens S, Huang A, Kim HS, Klimowski L, Jin Y, Johnson S, Lee J, Lewis L, Liao D, Mark M, Robbie E, Sanchez C, Schoenfeld J, Seshagiri S, Simmons L, Singh J, Smith V, Stinson J, Vagts A, Vandlen R, Watanabe C, Wieand D, Woods K, Xie MH, Yansura D, Yi S, Yu G, Yuan J, Zhang M, Zhang Z, Goddard A, Wood WI, Godowski P, Gray A (October 2003). "The secreted protein discovery initiative (SPDI), a large-scale effort to identify novel human secreted and transmembrane proteins: a bioinformatics assessment". Genome Research. 13 (10): 2265–70. doi:10.1101/gr.1293003. PMC 403697. PMID 12975309.
- Hell-Pourmojib M, Neuner P, Fischer H, Rezaie S, Kindås-Mügge I, Knobler R, Trautinger F (July 2002). "Differential expression of a novel gene in response to hsp27 and cell differentiation in human keratinocytes". The Journal of Investigative Dermatology. 119 (1): 154–9. doi:10.1046/j.1523-1747.2002.01793.x. PMID 12164938.
- Koc EC, Burkhart W, Blackburn K, Moyer MB, Schlatzer DM, Moseley A, Spremulli LL (November 2001). "The large subunit of the mammalian mitochondrial ribosome. Analysis of the complement of ribosomal proteins present". The Journal of Biological Chemistry. 276 (47): 43958–69. doi:10.1074/jbc.M106510200. PMID 11551941.