자칼린양 렉틴 도메인
Jacalin-like lectin domain| 자칼린양 렉틴 도메인 | |||||||||
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 인간과 복합된 헬리안투스 투베로스 렉틴의 결정 구조(1-2) | |||||||||
| 식별자 | |||||||||
| 기호. | 자칼린 | ||||||||
| 팜 | PF01419 | ||||||||
| 인터프로 | IPR001229 | ||||||||
| SCOP2 | 1jac/SCOPe/SUPFAM | ||||||||
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분자생물학에서 자칼린 유사 렉틴 도메인은 내부 의사 3배 대칭을 가진 3개의 4가닥 베타 시트로 구성된 베타 프리즘 폴드를 가진 만노스 결합 렉틴 도메인이다.이 그룹의 일부 렉틴은 T-항원에 결합하고 응집제로 작용하는 자칼린과 같은 독특한 T- 및 B-세포 기능을 자극한다.이 도메인은 1~6개의 복사본으로 렉틴에 있습니다.이 도메인은 또한 쌀의 소금-스트레스 유도 단백질과 동물 전립선 스펠민 결합 단백질에서도 발견된다.
렉틴이나 구조 함수 관계와 같은 자칼린의 데이터베이스.[1]이 도메인을 포함하는 단백질은 다음과 같습니다.
- 갈락토스에 특유한 [2]Artocarpus 헤테로필루스(재킷)의 4중합체 식물 종자 렉틴 및 응집체인 자칼린.
- 헤테로필러스에서 유래한 [3]4중합체 식물 종자 렉틴인 Artocarpin.
- 맥루라 포미페라(Osage Orange)[4]의 4중합체 식물 종자 렉틴 및 응집제인 렉틴 MPA.
- 헬투바 렉틴, 헬란투스 투베로수스(예루살렘 아티초크)[5]의 식물 종자 렉틴과 응집제.
- 칼리스테기아 세피움(헤지빈드위드)[6]의 응집소.
- 그리피신, 홍조(그리피시아종)[7]의 항바이러스 렉틴.
레퍼런스
- ^ 라발 외 연구진, "자칼린 유사 렉틴 데이터베이스 분석: 배열-성분-기능 관계" 당생물학 제14권 제1247-1263, 2004년 http://glycob.oxfordjournals.org/content/14/12/1247.full.pdf
- ^ Jeyaprakash AA, Geetha Rani P, Banuprakash Reddy G, Banumathi S, Betzel C, Sekar K, Surolia A, Vijayan M (August 2002). "Crystal structure of the jacalin-T-antigen complex and a comparative study of lectin-T-antigen complexes". J. Mol. Biol. 321 (4): 637–45. CiteSeerX 10.1.1.532.2424. doi:10.1016/S0022-2836(02)00674-5. PMID 12206779.
- ^ Jeyaprakash AA, Srivastav A, Surolia A, Vijayan M (May 2004). "Structural basis for the carbohydrate specificities of artocarpin: variation in the length of a loop as a strategy for generating ligand specificity". J. Mol. Biol. 338 (4): 757–70. CiteSeerX 10.1.1.530.4331. doi:10.1016/j.jmb.2004.03.040. PMID 15099743.
- ^ Lee X, Thompson A, Zhang Z, Ton-that H, Biesterfeldt J, Ogata C, Xu L, Johnston RA, Young NM (March 1998). "Structure of the complex of Maclura pomifera agglutinin and the T-antigen disaccharide, Galbeta1,3GalNAc". J. Biol. Chem. 273 (11): 6312–8. doi:10.1074/jbc.273.11.6312. PMID 9497359.
- ^ Bourne Y, Zamboni V, Barre A, Peumans WJ, Van Damme EJ, Rouge P (December 1999). "Helianthus tuberosus lectin reveals a widespread scaffold for mannose-binding lectins". Structure. 7 (12): 1473–82. doi:10.1016/s0969-2126(00)88338-0. PMID 10647178.
- ^ Bourne Y, Roig-Zamboni V, Barre A, Peumans WJ, Astoul CH, Van Damme EJ, Rouge P (January 2004). "The crystal structure of the Calystegia sepium agglutinin reveals a novel quaternary arrangement of lectin subunits with a beta-prism fold". J. Biol. Chem. 279 (1): 527–33. doi:10.1074/jbc.M308218200. PMID 14561768.
- ^ Ziolkowska NE, O'Keefe BR, Mori T, Zhu C, Giomarelli B, Vojdani F, Palmer KE, McMahon JB, Wlodawer A (July 2006). "Domain-swapped structure of the potent antiviral protein griffithsin and its mode of carbohydrate binding". Structure. 14 (7): 1127–35. doi:10.1016/j.str.2006.05.017. PMC 7126681. PMID 16843894.
