벡터 베이스

VectorBase

VectorBase는[1][2] 미국 보건복지부 산하 NIH(National Institutes of Health and Human Services)의 구성 요소인 NIAID(National Institutes of Alergy and Infectious Diseases)가 자금을 지원하는 5개의 BRC(Bio Informatics Resource Center) 중 하나입니다.VectorBase는 벡터 게놈(주로 게놈 주석)을 큐레이션하기 위해 배열 센터 및 연구 커뮤니티와 함께 작업하는 인간 병원체의 무척추 동물 벡터에 초점을 맞추고 있습니다.

VectorBase 데이터베이스에 포함된 게놈

VectorBase 사이트에서 이용할 수 있는 도구

  • 게놈 브라우저
  • 커뮤니티 주석 시스템
  • 마이크로어레이 및 유전자 발현 저장소
  • 해부학,[5] 살충제 내성 및 벡터 매개성 질환(말라리아 및 뎅기열)에 대한 통제된 용어
  • BLAST는 모든 게놈을 검색한다.

「 」를 참조해 주세요.

레퍼런스

  1. ^ Lawson, D; Arensburger, P; Atkinson, P; Besansky, NJ; Bruggner, RV; Butler, R; Campbell, KS; Christophides, GK; et al. (2007). "VectorBase: a home for invertebrate vectors of human pathogens". Nucleic Acids Research. 35 (Database issue): D503–5. doi:10.1093/nar/gkl960. PMC 1751530. PMID 17145709.
  2. ^ Lawson, D; Arensburger, P; Atkinson, P; Besansky, NJ; Bruggner, RV; Butler, R; Campbell, KS; Christophides, GK; et al. (2009). "VectorBase: a data resource for invertebrate vector genomics". Nucleic Acids Research. 37 (Database issue): D583–7. doi:10.1093/nar/gkn857. PMC 2686483. PMID 19028744.
  3. ^ Nene, V; Wortman, JR; Lawson, D; Haas, B; Kodira, C; Tu, ZJ; Loftus, B; Xi, Z; et al. (2007). "Genome sequence of Aedes aegypti, a major arbovirus vector". Science. 316 (5832): 1718–23. Bibcode:2007Sci...316.1718N. doi:10.1126/science.1138878. PMC 2868357. PMID 17510324.
  4. ^ Holt, RA; Subramanian, GM; Halpern, A; Sutton, GG; Charlab, R; Nusskern, DR; Wincker, P; Clark, AG; et al. (2002). "The genome sequence of the malaria mosquito Anopheles gambiae". Science. 298 (5591): 129–49. Bibcode:2002Sci...298..129H. CiteSeerX 10.1.1.149.9058. doi:10.1126/science.1076181. PMID 12364791. S2CID 4512225.
  5. ^ Topalis, P; Tzavlaki, C; Vestaki, K; Dialynas, E; Sonenshine, DE; Butler, R; Bruggner, RV; Stinson, EO; et al. (2008). "Anatomical ontologies of mosquitoes and ticks, and their web browsers in VectorBase". Insect Molecular Biology. 17 (1): 87–9. doi:10.1111/j.1365-2583.2008.00781.x. PMID 18237287. S2CID 8618269.

외부 링크

VectorBase 게놈 브라우저