RNA나리카제A

DHX9
사용 가능한 구조
PDB	Ortholog 검색: PDBe RCSB
PDB ID 코드 목록
	3LLM, 3VYX, 3VYY
식별자
에일리어스	DHX9, DDX9, LKP, NDH2, NDHII, RHA, RNA 헬리케이스A, DEAH박스 헬리케이스9, DExH박스 헬리케이스9
외부 ID	OMIM: 603115 MGI: 108177 HomoloGene: 1039 GeneCard: DHX9
유전자 위치(인간)
크르.	1번 염색체(인간)
끝.	182,887,982 bp
유전자 위치(마우스)
크르.	1번 염색체(마우스)
끝.	153,363,406 bp
RNA발현패턴
	상단 표시 위치:
	신경절 융기; ; 정자; ; 아킬레스건; ; 자궁경관; ; 소뇌 반구; ; 우측 자궁관; ; 림프절; ; 갑상선 좌엽; ; 갑상선 우엽; ; 경골 신경;
	추가 참조 표현식 데이터
	; ; ; ;
	추가 참조 표현식 데이터
유전자 존재론
분자 함수	RNA헬리카제활성; 뉴클레오티드 결합; GO:0008026 헬리케이스 액티비티; GO:0001948 단백질 결합; 핵산 결합; 가수분해효소활성; RNA결합; DNA결합; 외가닥 DNA결합; 이중가닥 RNA결합; 외가닥 RNA결합; 뉴클레오시드트리포스파타아제활성; 크로마틴DNA결합; GO:0033681 3'-5' DNA/RNA 헬리케이스 활성; GO:0034459 3'-5' RNA 헬리케이스 활성; 삼중 DNA결합; 뉴클레오시드삼인산디포스파타아제활성; 임포틴알파족단백질결합; 외가닥3'-5'DNA헬리카제활성; siRNA 결합; mRNA 결합; RNA 스템루프결합; 폴리솜 결합; 프로모터 특이 크로마틴 결합; RNA중합효소II복합체결합; 조절영역RNA결합; GO:0001104 트랜스크립션코어레이터 액티비티; GO:0001105 트랜스크립션코액티베이터 액티비티; DNA복제원결합; 이중가닥DNA결합; GO:0004003 DNA 헬리케이스 활성; ATP 결합; ATP효소활성; RNA중합효소결합; GO:0043140 3'-5' DNA 헬리케이스 활성; RISC 복합 바인딩; 배열특이mRNA결합; 금속 이온 결합; GO:0000980 RNA중합효소II 시스조절영역배열특이적 DNA결합;
셀룰러 컴포넌트	CRD 매개 mRNA 안정성 복합체; 세포; 중심체; 막; 세포질 리보핵단백질과립; 핵; 핵소체; 페리크로마틴 섬유; 세포질; 핵응력 과립; 핵체; 다염색체리보솜; 폴리섬; 액틴 세포골격; RISC 로딩 복합체; 핵소체; 미소관 조직 센터; 세포골격; 단백질 함유 복합체; 리보핵단백질복합체;
생물학적 과정	CRD 매개 mRNA 안정화; mRNA 스플라이싱, 스플라이싱 경유; RNA 처리; 율동 과정; 세포질 스트레스 과립에 대한 단백질 국재화; 골아세포분화; I형 간섭자 생성의 양성 조절; RNA 2차 구조 풀림; DNA 수복의 양성 조절; RNA중합효소II에 의한 전사의 양성 조절; 사이토카인 자극에 대한 반응의 양성 조절; 외인성 dsRNA에 대한 세포반응; 대체 mRNA 스플라이싱, 스플라이싱 경유; DNA템플릿바이러스전사; 바이러스 전사의 양성 조절; 바이러스 번역의 양성 조절; 세포질 번역의 양성 조절; RNA중합효소II에 의한 전사조절; DNA쌍꺼풀림; DNA 복제의 양성 조절; 섬유아세포 증식의 양성 조절; mRNA 처리 조절; NF-kappaB 전사인자 활성의 양성 조절; 종양괴사인자에 대한 세포반응; DNA토포이소머라아제(ATP 가수분해효소) 활성의 양성 조절; 세포질 번역 조절; 인터류킨-18 생산의 양성 조절; G-쿼드플렉스 DNA 풀림; 선천성 면역 반응의 양성 조절; 핵으로부터의 RNA 수출의 양성 조절; 숙주에 의한 바이러스에 대한 방어 반응 조절; 염증 반응의 양성 조절; 화농증; RISC에 대한 작은 RNA 로드; 폴리섬 결합의 양성 조절; miRNA에 의한 유전자 소음의 양성 조절; 면역계 과정; DNA복제; 전사, DNA 템플릿; DNA 템플릿 전사, 종료; 전사조절, DNA템플릿화; mRNA 처리; 번역 규제; 운송; 염증 반응; RNA 스플라이싱; 유전자 사일런트화; 선천성 면역 반응; mRNA 트랜스포트;
	출처:아미고 / QuickGO
맞춤법
	1660
	13211
	ENSG00000135829
	ENSMUSG000042699
	Q08211
	O70133
	NM_001357; NM_030588
	NM_007842
	NP_001348
	NP_031868; NP_001392438
	위키데이터
인간 보기/편집	마우스 표시/편집

ATP 의존성 RNA 헬리케이스 A(RHA, DHX9, LKP, NDHI로도 알려져 있음)는 사람에게서 DHX9 ^[5]^[6]^[7]유전자에 의해 암호화되는 효소이다.

기능.

DEAD/DEAH 박스 헬리케이스는 단백질이며 추정 RNA 헬리케이스입니다.이들은 번역 개시, 핵 및 미토콘드리아 스플라이싱, 리보솜 및 스플라이세솜 조립과 같은 RNA 2차 구조의 변화를 수반하는 많은 세포 과정에 관여한다.그들의 분포 패턴에 근거하여, 이 과의 일부 구성원들은 배아 발생, 정자 형성, 그리고 세포 성장과 분열에 관여하는 것으로 여겨진다.이 유전자는 RNA 헬리케이스 활성으로 DEAD 박스 단백질을 암호화합니다.그것은 DNA의 용융에 관여할 수 있다.전사 중에 발생하는 것과 같은 RNA 하이브리드는 X-연결 유전자 발현에 역할을 할 수 있습니다.이중 가닥 RNA 결합 도메인의 복사본 2개, DEXH 코어 도메인 및 RGG 상자를 포함합니다.RNA 결합 도메인과 RGG 박스는 RNA 헬리케이스 ^[7]활성에 영향을 미치고 조절합니다.DHX9 유전자는 1번 염색체의 긴 팔 q에 위치한다.

상호 작용

DHX9는 다음과 상호작용하는 것으로 나타났습니다.

레퍼런스

^ ^a ^b ^c GRCh38: 앙상블 릴리즈 89: ENSG00000135829 - 앙상블, 2017년 5월
^ ^a ^b ^c GRCm38: 앙상블 릴리즈 89: ENSMUSG000042699 - 앙상블, 2017년 5월
^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
^ Lee CG, Hurwitz J (Aug 1993). "Human RNA helicase A is homologous to the maleless protein of Drosophila". The Journal of Biological Chemistry. 268 (22): 16822–30. doi:10.1016/S0021-9258(19)85490-X. PMID 8344961.
^ Zhang S, Grosse F (Apr 1997). "Domain structure of human nuclear DNA helicase II (RNA helicase A)". The Journal of Biological Chemistry. 272 (17): 11487–94. doi:10.1074/jbc.272.17.11487. PMID 9111062.
^ ^a ^b "Entrez Gene: DHX9 DEAH (Asp-Glu-Ala-His) box polypeptide 9".
^ Yang JP, Tang H, Reddy TR, Wong-Staal F (Aug 2001). "Mapping the functional domains of HAP95, a protein that binds RNA helicase A and activates the constitutive transport element of type D retroviruses". The Journal of Biological Chemistry. 276 (33): 30694–700. doi:10.1074/jbc.M102809200. PMID 11402034.
^ Westberg C, Yang JP, Tang H, Reddy TR, Wong-Staal F (Jul 2000). "A novel shuttle protein binds to RNA helicase A and activates the retroviral constitutive transport element". The Journal of Biological Chemistry. 275 (28): 21396–401. doi:10.1074/jbc.M909887199. PMID 10748171.
^ Schlegel BP, Starita LM, Parvin JD (Feb 2003). "Overexpression of a protein fragment of RNA helicase A causes inhibition of endogenous BRCA1 function and defects in ploidy and cytokinesis in mammary epithelial cells". Oncogene. 22 (7): 983–91. doi:10.1038/sj.onc.1206195. PMID 12592385.
^ Anderson SF, Schlegel BP, Nakajima T, Wolpin ES, Parvin JD (Jul 1998). "BRCA1 protein is linked to the RNA polymerase II holoenzyme complex via RNA helicase A". Nature Genetics. 19 (3): 254–6. doi:10.1038/930. PMID 9662397. S2CID 10953768.
^ Wilson BJ, Giguère V (November 2007). "Identification of novel pathway partners of p68 and p72 RNA helicases through Oncomine meta-analysis". BMC Genomics. 8: 419. doi:10.1186/1471-2164-8-419. PMC 3225811. PMID 18005418.
^ Reddy TR, Tang H, Xu W, Wong-Staal F (Jul 2000). "Sam68, RNA helicase A and Tap cooperate in the post-transcriptional regulation of human immunodeficiency virus and type D retroviral mRNA". Oncogene. 19 (32): 3570–5. doi:10.1038/sj.onc.1203676. PMID 10951562.
^ Fujita H, Fujii R, Aratani S, Amano T, Fukamizu A, Nakajima T (Apr 2003). "Antithetic effects of MBD2a on gene regulation". Molecular and Cellular Biology. 23 (8): 2645–57. doi:10.1128/mcb.23.8.2645-2657.2003. PMC 152551. PMID 12665568.
^ Tang H, Wong-Staal F (Oct 2000). "Specific interaction between RNA helicase A and Tap, two cellular proteins that bind to the constitutive transport element of type D retrovirus". The Journal of Biological Chemistry. 275 (42): 32694–700. doi:10.1074/jbc.M003933200. PMID 10924507.
^ Smith WA, Schurter BT, Wong-Staal F, David M (May 2004). "Arginine methylation of RNA helicase a determines its subcellular localization". The Journal of Biological Chemistry. 279 (22): 22795–8. doi:10.1074/jbc.C300512200. PMID 15084609.
^ Tetsuka T, Uranishi H, Sanda T, Asamitsu K, Yang JP, Wong-Staal F, Okamoto T (Sep 2004). "RNA helicase A interacts with nuclear factor kappaB p65 and functions as a transcriptional coactivator". European Journal of Biochemistry. 271 (18): 3741–51. doi:10.1111/j.1432-1033.2004.04314.x. PMID 15355351.
^ Pellizzoni L, Charroux B, Rappsilber J, Mann M, Dreyfuss G (Jan 2001). "A functional interaction between the survival motor neuron complex and RNA polymerase II". The Journal of Cell Biology. 152 (1): 75–85. doi:10.1083/jcb.152.1.75. PMC 2193649. PMID 11149922.

추가 정보

Lee CG, Hurwitz J (Mar 1992). "A new RNA helicase isolated from HeLa cells that catalytically translocates in the 3' to 5' direction". The Journal of Biological Chemistry. 267 (7): 4398–407. doi:10.1016/S0021-9258(18)42849-9. PMID 1537828.
Lee CG, Zamore PD, Green MR, Hurwitz J (Jun 1993). "RNA annealing activity is intrinsically associated with U2AF". The Journal of Biological Chemistry. 268 (18): 13472–8. doi:10.1016/S0021-9258(19)38673-9. PMID 7685763.
Abdelhaleem MM, Hameed S, Klassen D, Greenberg AH (Mar 1996). "Leukophysin: an RNA helicase A-related molecule identified in cytotoxic T cell granules and vesicles". Journal of Immunology. 156 (6): 2026–35. PMID 8690889.
Nakajima T, Uchida C, Anderson SF, Lee CG, Hurwitz J, Parvin JD, Montminy M (Sep 1997). "RNA helicase A mediates association of CBP with RNA polymerase II". Cell. 90 (6): 1107–12. doi:10.1016/S0092-8674(00)80376-1. PMID 9323138. S2CID 16819946.
Loor G, Zhang SJ, Zhang P, Toomey NL, Lee MY (Dec 1997). "Identification of DNA replication and cell cycle proteins that interact with PCNA". Nucleic Acids Research. 25 (24): 5041–6. doi:10.1093/nar/25.24.5041. PMC 147130. PMID 9396813.
Lee CG, Eki T, Okumura K, da Costa Soares V, Hurwitz J (Feb 1998). "Molecular analysis of the cDNA and genomic DNA encoding mouse RNA helicase A". Genomics. 47 (3): 365–71. doi:10.1006/geno.1997.5139. PMID 9480750.
Anderson SF, Schlegel BP, Nakajima T, Wolpin ES, Parvin JD (Jul 1998). "BRCA1 protein is linked to the RNA polymerase II holoenzyme complex via RNA helicase A". Nature Genetics. 19 (3): 254–6. doi:10.1038/930. PMID 9662397. S2CID 10953768.
Lee CG, da Costa Soares V, Newberger C, Manova K, Lacy E, Hurwitz J (Nov 1998). "RNA helicase A is essential for normal gastrulation". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 95 (23): 13709–13. Bibcode:1998PNAS...9513709L. doi:10.1073/pnas.95.23.13709. PMC 24884. PMID 9811865.
Li J, Tang H, Mullen TM, Westberg C, Reddy TR, Rose DW, Wong-Staal F (Jan 1999). "A role for RNA helicase A in post-transcriptional regulation of HIV type 1". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 96 (2): 709–14. Bibcode:1999PNAS...96..709L. doi:10.1073/pnas.96.2.709. PMC 15201. PMID 9892698.
Tang H, McDonald D, Middlesworth T, Hope TJ, Wong-Staal F (May 1999). "The carboxyl terminus of RNA helicase A contains a bidirectional nuclear transport domain". Molecular and Cellular Biology. 19 (5): 3540–50. doi:10.1128/mcb.19.5.3540. PMC 84146. PMID 10207077.
Westberg C, Yang JP, Tang H, Reddy TR, Wong-Staal F (Jul 2000). "A novel shuttle protein binds to RNA helicase A and activates the retroviral constitutive transport element". The Journal of Biological Chemistry. 275 (28): 21396–401. doi:10.1074/jbc.M909887199. PMID 10748171.
Tang H, Wong-Staal F (Oct 2000). "Specific interaction between RNA helicase A and Tap, two cellular proteins that bind to the constitutive transport element of type D retrovirus". The Journal of Biological Chemistry. 275 (42): 32694–700. doi:10.1074/jbc.M003933200. PMID 10924507.
Lee CG, Eki T, Okumura K, Nogami M, Soares Vda C, Murakami Y, Hanaoka F, Hurwitz J (Jan 1999). "The human RNA helicase A (DDX9) gene maps to the prostate cancer susceptibility locus at chromosome band 1q25 and its pseudogene (DDX9P) to 13q22, respectively". Somatic Cell and Molecular Genetics. 25 (1): 33–9. doi:10.1023/B:SCAM.0000007138.44216.3a. PMID 10925702. S2CID 29684315.
Reddy TR, Tang H, Xu W, Wong-Staal F (Jul 2000). "Sam68, RNA helicase A and Tap cooperate in the post-transcriptional regulation of human immunodeficiency virus and type D retroviral mRNA". Oncogene. 19 (32): 3570–5. doi:10.1038/sj.onc.1203676. PMID 10951562.
Pellizzoni L, Charroux B, Rappsilber J, Mann M, Dreyfuss G (Jan 2001). "A functional interaction between the survival motor neuron complex and RNA polymerase II". The Journal of Cell Biology. 152 (1): 75–85. doi:10.1083/jcb.152.1.75. PMC 2193649. PMID 11149922.
Takasaki Y, Kogure T, Takeuchi K, Kaneda K, Yano T, Hirokawa K, Hirose S, Shirai T, Hashimoto H (Apr 2001). "Reactivity of anti-proliferating cell nuclear antigen (PCNA) murine monoclonal antibodies and human autoantibodies to the PCNA multiprotein complexes involved in cell proliferation". Journal of Immunology. 166 (7): 4780–7. doi:10.4049/jimmunol.166.7.4780. PMID 11254741.
Yang JP, Tang H, Reddy TR, Wong-Staal F (Aug 2001). "Mapping the functional domains of HAP95, a protein that binds RNA helicase A and activates the constitutive transport element of type D retroviruses". The Journal of Biological Chemistry. 276 (33): 30694–700. doi:10.1074/jbc.M102809200. PMID 11402034.
Aratani S, Fujii R, Oishi T, Fujita H, Amano T, Ohshima T, Hagiwara M, Fukamizu A, Nakajima T (Jul 2001). "Dual roles of RNA helicase A in CREB-dependent transcription". Molecular and Cellular Biology. 21 (14): 4460–9. doi:10.1128/MCB.21.14.4460-4469.2001. PMC 87106. PMID 11416126.

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: 앙상블 릴리즈 89: ENSG00000135829 - 앙상블, 2017년 5월

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: 앙상블 릴리즈 89: ENSMUSG000042699 - 앙상블, 2017년 5월

[3] "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.

[4] "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.

[pmid8344961-5] Lee CG, Hurwitz J (Aug 1993). "Human RNA helicase A is homologous to the maleless protein of Drosophila". The Journal of Biological Chemistry. 268 (22): 16822–30. doi:10.1016/S0021-9258(19)85490-X. PMID 8344961.

[pmid9111062-6] Zhang S, Grosse F (Apr 1997). "Domain structure of human nuclear DNA helicase II (RNA helicase A)". The Journal of Biological Chemistry. 272 (17): 11487–94. doi:10.1074/jbc.272.17.11487. PMID 9111062.

[entrez-7] "Entrez Gene: DHX9 DEAH (Asp-Glu-Ala-His) box polypeptide 9".

[pmid11402034-8] Yang JP, Tang H, Reddy TR, Wong-Staal F (Aug 2001). "Mapping the functional domains of HAP95, a protein that binds RNA helicase A and activates the constitutive transport element of type D retroviruses". The Journal of Biological Chemistry. 276 (33): 30694–700. doi:10.1074/jbc.M102809200. PMID 11402034.

[pmid10748171-9] Westberg C, Yang JP, Tang H, Reddy TR, Wong-Staal F (Jul 2000). "A novel shuttle protein binds to RNA helicase A and activates the retroviral constitutive transport element". The Journal of Biological Chemistry. 275 (28): 21396–401. doi:10.1074/jbc.M909887199. PMID 10748171.

[pmid12592385-10] Schlegel BP, Starita LM, Parvin JD (Feb 2003). "Overexpression of a protein fragment of RNA helicase A causes inhibition of endogenous BRCA1 function and defects in ploidy and cytokinesis in mammary epithelial cells". Oncogene. 22 (7): 983–91. doi:10.1038/sj.onc.1206195. PMID 12592385.

[pmid9662397-11] Anderson SF, Schlegel BP, Nakajima T, Wolpin ES, Parvin JD (Jul 1998). "BRCA1 protein is linked to the RNA polymerase II holoenzyme complex via RNA helicase A". Nature Genetics. 19 (3): 254–6. doi:10.1038/930. PMID 9662397. S2CID 10953768.

[pmid18005418-12] Wilson BJ, Giguère V (November 2007). "Identification of novel pathway partners of p68 and p72 RNA helicases through Oncomine meta-analysis". BMC Genomics. 8: 419. doi:10.1186/1471-2164-8-419. PMC 3225811. PMID 18005418.

[pmid10951562-13] Reddy TR, Tang H, Xu W, Wong-Staal F (Jul 2000). "Sam68, RNA helicase A and Tap cooperate in the post-transcriptional regulation of human immunodeficiency virus and type D retroviral mRNA". Oncogene. 19 (32): 3570–5. doi:10.1038/sj.onc.1203676. PMID 10951562.

[pmid12665568-14] Fujita H, Fujii R, Aratani S, Amano T, Fukamizu A, Nakajima T (Apr 2003). "Antithetic effects of MBD2a on gene regulation". Molecular and Cellular Biology. 23 (8): 2645–57. doi:10.1128/mcb.23.8.2645-2657.2003. PMC 152551. PMID 12665568.

[pmid10924507-15] Tang H, Wong-Staal F (Oct 2000). "Specific interaction between RNA helicase A and Tap, two cellular proteins that bind to the constitutive transport element of type D retrovirus". The Journal of Biological Chemistry. 275 (42): 32694–700. doi:10.1074/jbc.M003933200. PMID 10924507.

[pmid15084609-16] Smith WA, Schurter BT, Wong-Staal F, David M (May 2004). "Arginine methylation of RNA helicase a determines its subcellular localization". The Journal of Biological Chemistry. 279 (22): 22795–8. doi:10.1074/jbc.C300512200. PMID 15084609.

[pmid15355351-17] Tetsuka T, Uranishi H, Sanda T, Asamitsu K, Yang JP, Wong-Staal F, Okamoto T (Sep 2004). "RNA helicase A interacts with nuclear factor kappaB p65 and functions as a transcriptional coactivator". European Journal of Biochemistry. 271 (18): 3741–51. doi:10.1111/j.1432-1033.2004.04314.x. PMID 15355351.

[pmid11149922-18] Pellizzoni L, Charroux B, Rappsilber J, Mann M, Dreyfuss G (Jan 2001). "A functional interaction between the survival motor neuron complex and RNA polymerase II". The Journal of Cell Biology. 152 (1): 75–85. doi:10.1083/jcb.152.1.75. PMC 2193649. PMID 11149922.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

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[14]

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