부서
DEPTOR부서 | |||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
식별자 | |||||||||||||||||||||||||
에일리어스 | DEPTOR, DEP.6, DEPDC6, MTOR 상호작용 단백질을 포함한 DEP 도메인, MTOR 상호작용 단백질을 포함한 DEP 도메인 | ||||||||||||||||||||||||
외부 ID | OMIM: 612974 MGI: 2146322 HomoloGene: 32551 GeneCard: DEPTOR | ||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
맞춤법 | |||||||||||||||||||||||||
종. | 인간 | 마우스 | |||||||||||||||||||||||
엔트레즈 | |||||||||||||||||||||||||
앙상블 | |||||||||||||||||||||||||
유니프로트 | |||||||||||||||||||||||||
RefSeq(mRNA) | |||||||||||||||||||||||||
RefSeq(단백질) | |||||||||||||||||||||||||
장소(UCSC) | Chr 8: 119.87 – 120.05 Mb | Chr 15: 54.98 ~55.12 Mb | |||||||||||||||||||||||
PubMed 검색 | [3] | [4] | |||||||||||||||||||||||
위키데이터 | |||||||||||||||||||||||||
|
DEP 도메인 함유 mTOR-상호작용 단백질(DEPTOR)은 DEP 도메인 함유 단백질 6(DEPDC6)이라고도 하며, DEPTOR [5]유전자에 의해 인체 내에서 암호화되는 단백질이다.
구조.
DEPTOR라는 유전자는 척추동물에서만 발견될 수 있다.사람의 DEPTOR 유전자는 단백질 크기 409 a.a.[6]의 8, 8q24.12 염색체에 위치한다.Human DEPTOR에는 2개의 N단말 DEP 도메인과 1개의 C단말 PDZ 도메인이 있습니다.[7]
기능.
DEPTOR는 내인성 조절기로서 mTOR 시그널링 경로에 관여한다.DEPTOR와 mTOR의 직접적인 상호작용이 나타났다.[7] DEPTOR의 과잉발현은 mTORC1과 mTORC2의 in vitro 활성을 저하시킨다.mTORC1과 mTORC2는 모두 인산화로 [7]DEPTOR를 억제할 수 있다.
대사
DEPTOR 세포는 지방 [8]형성을 자율적으로 조절한다.근육에서 Baf60c는 DEPTOR 매개 Akt/[9]PKB 활성화를 통해 산화형에서 당화근섬유형으로의 전환을 촉진한다.뇌 내에서 DEPTOR는 해마, 시상하부 중앙부 및 심실주위 [10]장기에 고도로 발현된다.시상하부 내 DEPTOR의 과잉발현은 Akt/PKB [11]시그널링을 변조함으로써 고지방 식이요법 유도 비만으로부터 생쥐를 보호한다.
임상암
대부분의 암에서 mTOR 경로는 구성적으로 활성화되고 DEPTOR의 발현은 낮지만, 한 연구는 DEPTOR가 여러 골수종 세포에서 과다하게 발현되어 [7]생존에 필요하다는 것을 발견했다.
레퍼런스
- ^ a b c GRCh38: 앙상블 릴리즈 89: ENSG00000155792 - 앙상블, 2017년 5월
- ^ a b c GRCm38: 앙상블 릴리즈 89: ENSMUSG000022419 - 앙상블, 2017년 5월
- ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
- ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
- ^ "Entrez Gene: DEPDC6 DEP domain containing 6".
- ^ "Homo sapiens - Ensembl protein families - Gene: DEPTOR (ENSG00000155792)". Ensembl genome browser 78.
- ^ a b c d Peterson TR, Laplante M, Thoreen CC, Sancak Y, Kang SA, Kuehl WM, Gray NS, Sabatini DM (May 2009). "DEPTOR is an mTOR inhibitor frequently overexpressed in multiple myeloma cells and required for their survival". Cell. 137 (5): 873–86. doi:10.1016/j.cell.2009.03.046. PMC 2758791. PMID 19446321.
- ^ Laplante M, Horvat S, Festuccia WT, Birsoy K, Prevorsek Z, Efeyan A, Sabatini DM (Aug 2012). "DEPTOR cell-autonomously promotes adipogenesis, and its expression is associated with obesity". Cell Metabolism. 16 (2): 202–12. doi:10.1016/j.cmet.2012.07.008. PMC 3463374. PMID 22883231.
- ^ Meng ZX, Li S, Wang L, Ko HJ, Lee Y, Jung DY, Okutsu M, Yan Z, Kim JK, Lin JD (May 2013). "Baf60c drives glycolytic metabolism in the muscle and improves systemic glucose homeostasis through Deptor-mediated Akt activation". Nature Medicine. 19 (5): 640–5. doi:10.1038/nm.3144. PMC 3650110. PMID 23563706.
- ^ Caron A, Baraboi ED, Laplante M, Richard D (Jan 2015). "DEP domain-containing mTOR-interacting protein in the rat brain: distribution of expression and potential implication". The Journal of Comparative Neurology. 523 (1): 93–107. doi:10.1002/cne.23668. PMID 25159114. S2CID 205683672.
- ^ Caron, Alexandre; Labbé, Sébastien M.; Lanfray, Damien; Blanchard, Pierre-Gilles; Villot, Romain; Roy, Christian; Sabatini, David M.; Richard, Denis; Laplante, Mathieu (2016). "Mediobasal Hypothalamic Overexpression of Deptor Protects Against High-Fat Diet-Induced Obesity". Molecular Metabolism. 5 (2): 102–112. doi:10.1016/j.molmet.2015.11.005. PMC 4735664. PMID 26909318.
추가 정보
- Maruyama K, Sugano S (Jan 1994). "Oligo-capping: a simple method to replace the cap structure of eukaryotic mRNAs with oligoribonucleotides". Gene. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
- Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (Oct 1997). "Construction and characterization of a full length-enriched and a 5'-end-enriched cDNA library". Gene. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016/S0378-1119(97)00411-3. PMID 9373149.
- Hartley JL, Temple GF, Brasch MA (Nov 2000). "DNA cloning using in vitro site-specific recombination". Genome Research. 10 (11): 1788–95. doi:10.1101/gr.143000. PMC 310948. PMID 11076863.
- Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, Gassenhuber J, Glassl S, Ansorge W, Böcher M, Blöcker H, Bauersachs S, Blum H, Lauber J, Düsterhöft A, Beyer A, Köhrer K, Strack N, Mewes HW, Ottenwälder B, Obermaier B, Tampe J, Heubner D, Wambutt R, Korn B, Klein M, Poustka A (Mar 2001). "Toward a catalog of human genes and proteins: sequencing and analysis of 500 novel complete protein coding human cDNAs". Genome Research. 11 (3): 422–35. doi:10.1101/gr.GR1547R. PMC 311072. PMID 11230166.
- Simpson JC, Wellenreuther R, Poustka A, Pepperkok R, Wiemann S (Sep 2000). "Systematic subcellular localization of novel proteins identified by large-scale cDNA sequencing". EMBO Reports. 1 (3): 287–92. doi:10.1093/embo-reports/kvd058. PMC 1083732. PMID 11256614.
- Wiemann S, Arlt D, Huber W, Wellenreuther R, Schleeger S, Mehrle A, Bechtel S, Sauermann M, Korf U, Pepperkok R, Sültmann H, Poustka A (Oct 2004). "From ORFeome to biology: a functional genomics pipeline". Genome Research. 14 (10B): 2136–44. doi:10.1101/gr.2576704. PMC 528930. PMID 15489336.
- Mehrle A, Rosenfelder H, Schupp I, del Val C, Arlt D, Hahne F, Bechtel S, Simpson J, Hofmann O, Hide W, Glatting KH, Huber W, Pepperkok R, Poustka A, Wiemann S (Jan 2006). "The LIFEdb database in 2006". Nucleic Acids Research. 34 (Database issue): D415–8. doi:10.1093/nar/gkj139. PMC 1347501. PMID 16381901.