CDK5RAP2

CDK5RAP2
CDK5RAP2
식별자
별칭CDK5RAP2, C48, Cep215, MCPH3, CDK5 규제 하위단위 관련 단백질 2
외부 IDOMIM: 608201 MGI: 2384875 호몰로진: 49533 GeneCard: CDK5RAP2
직교체
종인간마우스
엔트레스

55755

214444

앙상블

ENSG00000136861

ENSMUSG00000039298

유니프로트

Q96SN8

P68254
Q8K389

RefSeq(mRNA)

NM_001011649
NM_001272039
NM_018249

NM_145990
NM_00133762

RefSeq(단백질)

NP_001011649
NP_001258968
NP_060719

NP_035869
NP_001300691
NP_666102

위치(UCSC)Chr 9: 120.39 – 120.58MbChr 4: 70.14 – 70.33Mb
PubMed 검색[3][4]
위키다타
인간 보기/편집마우스 보기/편집

CDK5 규제 소단위 관련 단백질 2는 인간에서 CDK5RAP2 유전자에 의해 인코딩되는 단백질이다.센트로솜에서[5] 나오는 미세관 형성 및 안정성에 필요한 역할을 하고 있으며, 남성의 뇌 크기 변동과 관련이 있는 것으로 밝혀졌다.[6]이 유전자에 대해서는 복수의 대본변형이 존재하지만, 단 두 가지에 불과한 전신적 성질이 결정되었다.[7][8]

CDK5RAP2는 드로소필라 단백질 센트로소민(cnn)[9]과 동질적이고 묘메갈린(myomegalin)과 파라로그로 되어 있는데, 포유류에는 인간의 뇌 크기 진화와 관련된 영역인 올두바이(Olduvai) 도메인이 포함되어 있다.[10][11]

함수

CDK5RAP2는 마이크로튜브의 적절한 형성, 앵커링, 방향성을 위해 센트로솜에서 필요하다.γ-tubulin 링 콤플렉스(rcTuRC)와 결합하며, 이는 tuTuRC가 센트로솜에 부착되기 위해 필요하다.[5]또한 CDK5RAP2는 CDK5의 활성화 서브유닛 역할을 하는 CDK5R1의 한 형태인 p25에 바인딩되는데, 이는 뉴런 분화 규제에 관여하고 있다.따라서 CDK5RAP2는 신경 분화에 대한 역할을 한다.[8]CDK5RAP2는 또한 딕티오스텔륨의 중심 코로나에 있는 비계단백질로서 필요하다.[12]

임상적 유의성

인간의 뇌 크기 변화

MRI 연구는 CDK5RAP2 유전자와 뇌 구조에서 일반적인 인간의 변화 사이의 연관성을 입증했다.구체적으로는 여러 개의 단일 뉴클레오티드 다형성(SNP)과 뇌 피질 표면적 및 총 뇌량 사이에서 연관성이 발견되었다.이러한 연관성은 남성 피험자만을 대상으로 발견되었으며, 모든 SNP는 유전자의 마지막 7개 인트론이나 다운스트림에 위치하였다.이들 로키의 기능적 중요성은 아직 알려지지 않았다.그러나 이들의 위치가 규제 요소에 가까운 것으로 보아 유전자 규제에 관여하고 있을 가능성이 있으며, 이는 뇌 구조의 공통적인 분산이 단백질 구조보다는 유전자 규제의 차이와 연관되어 다른 복잡한 인간 형질의 발견과 일치할 수 있음을 시사한다.[6]CDK5RAP2는 묘메갈린(myomegalin)의 파라로그로 포유류에서 인간의 뇌 크기 진화에 관여해 온 인간 특유의 중복이 있는 영역인 올두바이(Olduvai) 도메인을 포함하고 있다.[10][11]

자동 열성 일차 소두증

CDK5RAP2의 돌연변이는 자가 열성 1차 소두증 타입 3을 유발한다.[13][5]

상호작용

CDK5RAP2는 CDK5R1[14] 및 페리센트린(PCTN)[8]과 상호작용하는 것으로 나타났다.

역사

이 유전자는 2000년에[15] 발견되었고 2007년에 처음으로 특징지어졌다.[5]

참조

  1. ^ a b c GRCh38: 앙상블 릴리스 89: ENSG00000136861 - 앙상블, 2017년 5월
  2. ^ a b c GRCm38: 앙상블 릴리스 89: ENSMUSG000039298 - 앙상블, 2017년 5월
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ a b c d Fong KW, Choi YK, Rattner JB, Qi RZ (January 2008). "CDK5RAP2 is a pericentriolar protein that functions in centrosomal attachment of the gamma-tubulin ring complex". Molecular Biology of the Cell. 19 (1): 115–25. doi:10.1091/mbc.E07-04-0371. PMC 2174194. PMID 17959831.
  6. ^ a b Rimol LM, Agartz I, Djurovic S, Brown AA, Roddey JC, Kähler AK, et al. (January 2010). "Sex-dependent association of common variants of microcephaly genes with brain structure". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 107 (1): 384–8. Bibcode:2010PNAS..107..384R. doi:10.1073/pnas.0908454107. PMC 2806758. PMID 20080800.
  7. ^ Ching YP, Qi Z, Wang JH (January 2000). "Cloning of three novel neuronal Cdk5 activator binding proteins". Gene. 242 (1–2): 285–94. doi:10.1016/S0378-1119(99)00499-0. PMID 10721722.
  8. ^ a b c "Entrez Gene: CDK5RAP2 CDK5 regulatory subunit associated protein 2".
  9. ^ Barr AR, Kilmartin JV, Gergely F (April 2010). "CDK5RAP2 functions in centrosome to spindle pole attachment and DNA damage response". The Journal of Cell Biology. 189 (1): 23–39. doi:10.1083/jcb.200912163. PMC 2854379. PMID 20368616.
  10. ^ a b Dumas L, Kim YH, Karimpour-Fard A, Cox M, Hopkins J, Pollack JR, Sikela JM (September 2007). "Gene copy number variation spanning 60 million years of human and primate evolution". Genome Research. 17 (9): 1266–77. doi:10.1101/gr.6557307. PMC 1950895. PMID 17666543.
  11. ^ a b O'Bleness MS, Dickens CM, Dumas LJ, Kehrer-Sawatzki H, Wyckoff GJ, Sikela JM (September 2012). "Evolutionary history and genome organization of DUF1220 protein domains". G3. 2 (9): 977–86. doi:10.1534/g3.112.003061. PMC 3429928. PMID 22973535.
  12. ^ Pitzen V, Askarzada S, Gräf R, Meyer I (April 2018). "CDK5RAP2 Is an Essential Scaffolding Protein of the Corona of the Dictyostelium Centrosome". Cells. 7 (4): 32. doi:10.3390/cells7040032. PMC 5946109. PMID 29690637.
  13. ^ "OMIM Entry - # 604804 - MICROCEPHALY 3, PRIMARY, AUTOSOMAL RECESSIVE; MCPH3". www.omim.org. Retrieved 2020-01-06.
  14. ^ Wang X, Ching YP, Lam WH, Qi Z, Zhang M, Wang JH (October 2000). "Identification of a common protein association region in the neuronal Cdk5 activator". The Journal of Biological Chemistry. 275 (41): 31763–9. doi:10.1074/jbc.M004358200. PMID 10915792.
  15. ^ Ching YP, Qi Z, Wang JH (January 2000). "Cloning of three novel neuronal Cdk5 activator binding proteins". Gene. 242 (1–2): 285–94. doi:10.1016/S0378-1119(99)00499-0. PMID 10721722.

추가 읽기

외부 링크