분자 분산 분석

Analysis of molecular variance

분자 분산 분석(AMOVA)은 단일 종에서 분자 알고리즘에 대한 통계적 모델이며, 일반적으로 생물학적 모델이다.[1] 이름과 모델은 분산 분석에서 영감을 얻었다. 이 방법은 1992년 로랑 엑스코피어, 피터 스마우스, 조셉 콰트로가 럿거스 대학교에서 개발했다.

아모바를 개발한 이후 엑스코피어는 이러한 분석을 실행할 수 있는 프로그램을 작성했다. 윈도우에서 실행되는 이 프로그램은 알레킨이라고 불리며 엑스코피어의 웹사이트에서 자유롭게 이용할 수 있다. 또한 cran(Comprehensive R Archive Network)에서 이용할 수 있는 ede4와 pegas 패키지의 R 언어 구현도 있다. 또 다른 구현은 Info-Gen에 있는데, Windows에서도 실행된다. 학생 버전은 자유롭고 완전히 기능적이다. 응용 프로그램의 모국어는 스페인어지만 영어 버전도 이용할 수 있다.

추가적인 무료 통계 패키지인 GenAlEx는 연구뿐만 아니라 교수에 적합하며, 일반적으로 사용되는 Microsoft Excel 인터페이스 내에서 복잡한 유전자 분석을 채택하고 비교할 수 있다.[2] 이 소프트웨어는 AMOVA와 같은 분석은 물론 F-통계, 섀넌 지수 등 밀접하게 연관된 다른 유형의 통계와의 비교를 가능하게 한다.

참조

  1. ^ Excoffier, L; Smouse, Pe; Quattro, Jm (Jun 1992). "Analysis of molecular variance inferred from metric distances among DNA haplotypes: application to human mitochondrial DNA restriction data" (Free full text). Genetics. 131 (2): 479–91. ISSN 0016-6731. PMC 1205020. PMID 1644282.
  2. ^ Peakall, R. 및 Smouse P.E. (2012) GenAlEx 6.5: Excel의 유전자 분석. 교육 및 연구를 위한 인구 유전자 소프트웨어 업데이트. 생물정보학 28, 2537–2539.

외부 링크



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