스포프

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사용 가능한 구조물
PDB	직교 검색: PDBe RCSB
PDB ID 코드 목록
	2CR2, 3HQH, 3HQH, 3HQL, 3HQM, 3HTM, 3HU6, 3IVB, 3IVQ, 3IVV, 4EOZ, 4HS2, 4J8Z, 4O1V
식별자
별칭	SPOP, BTBD32, TEF2, 얼룩 유형 BTB/POZ 단백질, NEDMIDF, NSDVS1, NSDVS2, NEDMACE
외부 ID	OMIM: 602650 MGI: 1343085 호몰로진: 68354 GeneCard: SPOP
유전자 위치(인간)
쳇.	17번 염색체(인간)
끝	49,678,190 bp
유전자 위치(마우스)
쳇.	11번 염색체(쥐)
끝	95,384,232 bp
RNA 표현 패턴
	표현된 상단
	질질 끌다; ; 자궁경부; ; 흉부 대동맥; ; 매끄러운 근육 조직; ; 펀두스; ; 대뇌동맥; ; 전립선의;
	추가 참조 표현식 데이터
	; ;
	추가 참조 표현식 데이터
유전자 온톨로지
분자함수	GO:0001948 단백질 결합; 유비퀴틴 단백질 리가제 결합;
셀룰러 컴포넌트	CULL3-RIN 유비퀴틴 리가제 복합체; 핵 반점; 핵의; 핵종의; 세포질; SCF 유비퀴틴 리가세 콤플렉스;
생물학적 과정	단백질의 편재; 프로테롤리시스; RNA 중합효소 II에 의한 전사의 음성 조절; 포도당 동점선; 프로테아솜 매개 유비퀴틴 단백질 카타볼릭 공정; DNA 결합 전사인자 활동에 대한 부정적 규제; 내소성 망막 응력에 의한 내인성 세포 신호 경로의 양성 조절; B형 췌장 세포 사멸 과정에 대한 양성 규제; 유비퀴틴 함유 단백질 카타볼릭 공정;
	출처:아미고 / 퀵고
직교체
	8405
	20747
	ENSG00000121067
	ENSMUSG000057522
	O43791
	Q6ZWS8
NM_001007226; NM_001007227; NM_001007228; NM_001007229; NM_001007230;
	NM_003563; NM_001370730; NM_001370731; NM_001370732
	NM_025287; NM_001359107
NP_001007227; NP_001007228; NP_001007229; NP_001007230; NP_001007231;
	NP_003554; NP_001357659; NP_001357660; NP_001357661
	NP_079563; NP_001346036
	위키다타
인간 보기/편집	마우스 보기/편집

설명:애니메이션 시리즈는 She-Ra: Princess of Power를 참조하십시오.

싱가포르 노래 경연대회는 SPOP Sing!과 SPOP Wave를 참고하십시오!

Specle형 POZ단백질은 인간에서 SPOP유전자에 의해 암호화된 단백질이다.^[5]^[6]^[7]

이 유전자는 히스톤 디아세틸라제, 코어 히스톤, 기타 히스톤 관련 단백질과 상호작용하는 사망 관련 단백질 6(DAXX)의 전사적 억제 활동을 변조할 수 있는 단백질을 암호화하고 있다.마우스에서 인코딩된 단백질은 비활성화된 X 염색체에 농축된 변형 H2A 히스톤인 매크로H2A1.2의 putative lucine 지퍼영역에 결합된다.이 단백질의 BTB/POZ 영역은 전사 억제를 중재하고 히스톤 디아세틸라제 공동억제제 복합체의 성분과 상호작용하기 위해 다른 단백질에서 보여졌다.이 유전자의 대체적인 스플라이싱은 동일한 단백질을 인코딩하는 다중 대본 변형을 초래한다.^[7]

임상 관련성

SPOP의 돌연변이는 모든 전립선암의 약 15%에 관련되어 있는 것으로 생각되는 전립선 종양의 한 종류로 이어진다.^[8]^[9]

참조

^ ^a ^b ^c GRCh38: 앙상블 릴리스 89: ENSG00000121067 - 앙상블, 2017년 5월
^ ^a ^b ^c GRCm38: 앙상블 릴리스 89: ENSMUSG000057522 - 앙상블, 2017년 5월
^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
^ Nagai Y, Kojima T, Muro Y, Hachiya T, Nishizawa Y, Wakabayashi T, Hagiwara M (Nov 1997). "Identification of a novel nuclear speckle-type protein, SPOP". FEBS Letters. 418 (1–2): 23–6. doi:10.1016/S0014-5793(97)01340-9. PMID 9414087. S2CID 32204506.
^ Zapata JM, Pawlowski K, Haas E, Ware CF, Godzik A, Reed JC (Jun 2001). "A diverse family of proteins containing tumor necrosis factor receptor-associated factor domains". The Journal of Biological Chemistry. 276 (26): 24242–52. doi:10.1074/jbc.M100354200. PMID 11279055.
^ ^a ^b "Entrez Gene: SPOP speckle-type POZ protein".
^ Heidi Evans (20 May 2012). "Scientists find new type of prostate cancer - discovery may lead to tailored treatments". New York Daily News. Retrieved 20 May 2012.
^ Barbieri CE, Baca SC, Lawrence MS, Demichelis F, Blattner M, Theurillat JP, White TA, Stojanov P, Van Allen E, Stransky N, Nickerson E, Chae SS, Boysen G, Auclair D, Onofrio RC, Park K, Kitabayashi N, MacDonald TY, Sheikh K, Vuong T, Guiducci C, Cibulskis K, Sivachenko A, Carter SL, Saksena G, Voet D, Hussain WM, Ramos AH, Winckler W, Redman MC, Ardlie K, Tewari AK, Mosquera JM, Rupp N, Wild PJ, Moch H, Morrissey C, Nelson PS, Kantoff PW, Gabriel SB, Golub TR, Meyerson M, Lander ES, Getz G, Rubin MA, Garraway LA (Jun 2012). "Exome sequencing identifies recurrent SPOP, FOXA1 and MED12 mutations in prostate cancer". Nature Genetics. 44 (6): 685–9. doi:10.1038/ng.2279. PMC 3673022. PMID 22610119.

추가 읽기

Maruyama K, Sugano S (Jan 1994). "Oligo-capping: a simple method to replace the cap structure of eukaryotic mRNAs with oligoribonucleotides". Gene. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Bonaldo MF, Lennon G, Soares MB (Sep 1996). "Normalization and subtraction: two approaches to facilitate gene discovery". Genome Research. 6 (9): 791–806. doi:10.1101/gr.6.9.791. PMID 8889548.
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (Oct 1997). "Construction and characterization of a full length-enriched and a 5'-end-enriched cDNA library". Gene. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016/S0378-1119(97)00411-3. PMID 9373149.
Wu J, Song Y, Bakker AB, Bauer S, Spies T, Lanier LL, Phillips JH (Jul 1999). "An activating immunoreceptor complex formed by NKG2D and DAP10". Science. 285 (5428): 730–2. doi:10.1126/science.285.5428.730. PMID 10426994.
Hartley JL, Temple GF, Brasch MA (Nov 2000). "DNA cloning using in vitro site-specific recombination". Genome Research. 10 (11): 1788–95. doi:10.1101/gr.143000. PMC 310948. PMID 11076863.
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Takahashi I, Kameoka Y, Hashimoto K (Aug 2002). "MacroH2A1.2 binds the nuclear protein Spop". Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Molecular Cell Research. 1591 (1–3): 63–8. doi:10.1016/S0167-4889(02)00249-5. PMID 12183056.
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Diefenbach A, Tomasello E, Lucas M, Jamieson AM, Hsia JK, Vivier E, Raulet DH (Dec 2002). "Selective associations with signaling proteins determine stimulatory versus costimulatory activity of NKG2D". Nature Immunology. 3 (12): 1142–9. doi:10.1038/ni858. PMID 12426565. S2CID 14901451.
Billadeau DD, Upshaw JL, Schoon RA, Dick CJ, Leibson PJ (Jun 2003). "NKG2D-DAP10 triggers human NK cell-mediated killing via a Syk-independent regulatory pathway". Nature Immunology. 4 (6): 557–64. doi:10.1038/ni929. PMID 12740575. S2CID 7699074.
Liu A, Desai BM, Stoffers DA (May 2004). "Identification of PCIF1, a POZ domain protein that inhibits PDX-1 (MODY4) transcriptional activity". Molecular and Cellular Biology. 24 (10): 4372–83. doi:10.1128/MCB.24.10.4372-4383.2004. PMC 400448. PMID 15121856.
La M, Kim K, Park J, Won J, Lee JH, Fu YM, Meadows GG, Joe CO (Jul 2004). "Daxx-mediated transcriptional repression of MMP1 gene is reversed by SPOP". Biochemical and Biophysical Research Communications. 320 (3): 760–5. doi:10.1016/j.bbrc.2004.06.022. PMID 15240113.
Wiemann S, Arlt D, Huber W, Wellenreuther R, Schleeger S, Mehrle A, Bechtel S, Sauermann M, Korf U, Pepperkok R, Sültmann H, Poustka A (Oct 2004). "From ORFeome to biology: a functional genomics pipeline". Genome Research. 14 (10B): 2136–44. doi:10.1101/gr.2576704. PMC 528930. PMID 15489336.
Hernández-Muñoz I, Lund AH, van der Stoop P, Boutsma E, Muijrers I, Verhoeven E, Nusinow DA, Panning B, Marahrens Y, van Lohuizen M (May 2005). "Stable X chromosome inactivation involves the PRC1 Polycomb complex and requires histone MACROH2A1 and the CULLIN3/SPOP ubiquitin E3 ligase". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 102 (21): 7635–40. doi:10.1073/pnas.0408918102. PMC 1140410. PMID 15897469.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (Oct 2005). "Towards a proteome-scale map of the human protein-protein interaction network". Nature. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005Natur.437.1173R. doi:10.1038/nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
Mehrle A, Rosenfelder H, Schupp I, del Val C, Arlt D, Hahne F, Bechtel S, Simpson J, Hofmann O, Hide W, Glatting KH, Huber W, Pepperkok R, Poustka A, Wiemann S (Jan 2006). "The LIFEdb database in 2006". Nucleic Acids Research. 34 (Database issue): D415-8. doi:10.1093/nar/gkj139. PMC 1347501. PMID 16381901.

17번 염색체의 유전자에 관한 이 기사는 단조롭다.위키피디아를 확장하여 도울 수 있다.

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: 앙상블 릴리스 89: ENSG00000121067 - 앙상블, 2017년 5월

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: 앙상블 릴리스 89: ENSMUSG000057522 - 앙상블, 2017년 5월

[3] "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.

[4] "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.

[pmid9414087-5] Nagai Y, Kojima T, Muro Y, Hachiya T, Nishizawa Y, Wakabayashi T, Hagiwara M (Nov 1997). "Identification of a novel nuclear speckle-type protein, SPOP". FEBS Letters. 418 (1–2): 23–6. doi:10.1016/S0014-5793(97)01340-9. PMID 9414087. S2CID 32204506.

[pmid11279055-6] Zapata JM, Pawlowski K, Haas E, Ware CF, Godzik A, Reed JC (Jun 2001). "A diverse family of proteins containing tumor necrosis factor receptor-associated factor domains". The Journal of Biological Chemistry. 276 (26): 24242–52. doi:10.1074/jbc.M100354200. PMID 11279055.

[entrez-7] "Entrez Gene: SPOP speckle-type POZ protein".

[NYDNHeidiEvans-8] Heidi Evans (20 May 2012). "Scientists find new type of prostate cancer - discovery may lead to tailored treatments". New York Daily News. Retrieved 20 May 2012.

[doi.10.1038/ng.2279-9] Barbieri CE, Baca SC, Lawrence MS, Demichelis F, Blattner M, Theurillat JP, White TA, Stojanov P, Van Allen E, Stransky N, Nickerson E, Chae SS, Boysen G, Auclair D, Onofrio RC, Park K, Kitabayashi N, MacDonald TY, Sheikh K, Vuong T, Guiducci C, Cibulskis K, Sivachenko A, Carter SL, Saksena G, Voet D, Hussain WM, Ramos AH, Winckler W, Redman MC, Ardlie K, Tewari AK, Mosquera JM, Rupp N, Wild PJ, Moch H, Morrissey C, Nelson PS, Kantoff PW, Gabriel SB, Golub TR, Meyerson M, Lander ES, Getz G, Rubin MA, Garraway LA (Jun 2012). "Exome sequencing identifies recurrent SPOP, FOXA1 and MED12 mutations in prostate cancer". Nature Genetics. 44 (6): 685–9. doi:10.1038/ng.2279. PMC 3673022. PMID 22610119.

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