Peroxi Base

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PeroxiBase 데이터베이스는 2003년 말 제네바 대학(스위스)에서 식물 과산화효소 연구를 전문으로 하는 식물생물학자 2명에 의해 작성되었다.먼저 III급 페르옥시다아제(식물 페르옥시다아제)로 제한한 후 가능한 모든 헴 및 비헴 페르옥시다아제 단백질 염기서열을 포함하도록 확장되었다.제네바 대학의 많은 연구원들과 생물 정보학자들은 데이터베이스를 개발하고 페르옥시다아제 배열의 수를 빠르게 증가시키기 위한 노력에 동참했다.2005년 이후 데이터베이스는 PeroxiBase 큐레이터에 의해 검증되는 외부 기고를 받아들인다.이제 대부분의 헴 및 비헴 페르옥시다아제 시퀀스는 PeroxiBase에서 ^[1]찾을 수 있습니다.

이 데이터베이스는 스위스 생물정보학 연구소가 주최한다.

Peroxidase 시퀀스는 다른 일반 공개 데이터베이스(NCBI, TIGR, UniProt KnowledgeBase: 사용된 모든 데이터베이스는 PeroxiBase에 이미 주석이 달린 시퀀스 또는 원시 데이터(전체 게놈 시퀀스 프로젝트)에서 가져옵니다.

Peroxi Base의 목표

• 공개적으로(비영리) 과학계에 페르옥시다아제 배열에 대한 중앙 집중식 플랫폼 재결집 정보를 제공한다.가능한 응용 프로그램: 빠른 시퀀스 검색, 계통 분석, 발현 프로파일 결정
• 기존 시퀀스를 수동으로 다시 주석 붙이려면(자동 주석으로 인해 잘못된 예측이 발생할 수 있음)
• 다른 데이터베이스에서는 아직 이용할 수 없는 새로운 염기서열 획득: 비주석 게놈, 염기서열 그룹으로부터의 외부 기여

레퍼런스

외부 링크

• 데이터베이스 홈페이지