액면 안정성 결정 요인
par stability determinant| FstAT | |
|---|---|
 Fst의 2차 구조AT | |
| 식별자 | |
| 기호 | fstAT |
| Rfam | RF01797 |
| 기타자료 | |
| RNA형 | 유전자; 항독소 |
| 도메인 | 페칼리스자리 엔토코쿠스 |
| PDB 구조 | PDBe |
| Fst 타입 1 독소-항독소 시스템 | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 식별자 | |||||||||
| 기호 | Fst_toxin | ||||||||
| Pfam | PF13955 | ||||||||
| TCDB | 1.C.64 | ||||||||
| OPM 슈퍼 패밀리 | 225 | ||||||||
| OPM단백질 | 2kv5 | ||||||||
| |||||||||
파 안정성 결정 인자는 pAD1 플라스미드의 400 bp locus이며, 엔테로코커스 faecalis의 I형 독소 항티톡신 시스템을 인코딩한다.[1][2]그것은 그램 양성 박테리아에서 발견된 최초의 플라스미드 중독 모듈이었다.[3]
파로쿠스에는 두 개의 유전자가 있다: 33-아미노산 독성 단백질을 암호화하는 fst와 fst 번역을 억제하는 작은 RNA 안티톡신인 RNAII를 위한 유전자가 있다.[4]이 두 유전자는 반대편 DNA 가닥에서 발견되며, 항이센스 상호작용이 있는 것으로 생각되는 5' 영역을 공유한다.[4]이들의 RNA 이차 구조는 계산적으로 예측되었고, 상호작용을 위해 노출된 루프에 보완 영역이 제시된 것으로 보인다.[4]
par는 pad1을 PSK(Post-gregative killing, PSK)를 통해 유지한다.딸세포가 파로쿠스를 물려받지 못하면 불안정한 RNAII는 빠르게 분해되어 장수 fst독소를 딸세포에 손상시키거나 죽인다.[5]
참고 항목
참조
- ^ Weaver KE, Walz KD, Heine MS (November 1998). "Isolation of a derivative of Escherichia coli-Enterococcus faecalis shuttle vector pAM401 temperature sensitive for maintenance in E. faecalis and its use in evaluating the mechanism of pAD1 par-dependent plasmid stabilization". Plasmid. 40 (3): 225–232. doi:10.1006/plas.1998.1368. PMID 9806859.
- ^ Weaver KE, Jensen KD, Colwell A, Sriram SI (April 1996). "Functional analysis of the Enterococcus faecalis plasmid pAD1-encoded stability determinant par". Mol. Microbiol. 20 (1): 53–63. doi:10.1111/j.1365-2958.1996.tb02488.x. PMID 8861204. S2CID 30452609.
- ^ Shokeen S, Greenfield TJ, Ehli EA, Rasmussen J, Perrault BE, Weaver KE (March 2009). "An intramolecular upstream helix ensures the stability of a toxin-encoding RNA in Enterococcus faecalis". J. Bacteriol. 191 (5): 1528–1536. doi:10.1128/JB.01316-08. PMC 2648210. PMID 19103923.
- ^ a b c Greenfield TJ, Ehli E, Kirshenmann T, Franch T, Gerdes K, Weaver KE (August 2000). "The antisense RNA of the par locus of pAD1 regulates the expression of a 33-amino-acid toxic peptide by an unusual mechanism". Mol. Microbiol. 37 (3): 652–660. doi:10.1046/j.1365-2958.2000.02035.x. PMID 10931358.
- ^ Gerdes K, Gultyaev AP, Franch T, Pedersen K, Mikkelsen ND (1997). "Antisense RNA-regulated programmed cell death". Annu. Rev. Genet. 31: 1–31. doi:10.1146/annurev.genet.31.1.1. PMID 9442888.
추가 읽기
- Gerdes K, Gultyaev AP, Franch T, Pedersen K, Mikkelsen ND (1997). "Antisense RNA-regulated programmed cell death". Annu. Rev. Genet. 31: 1–31. doi:10.1146/annurev.genet.31.1.1. PMID 9442888.
- Poulsen LK, Larsen NW, Molin S, Andersson P (November 1989). "A family of genes encoding a cell-killing function may be conserved in all gram-negative bacteria". Mol. Microbiol. 3 (11): 1463–1472. doi:10.1111/j.1365-2958.1989.tb00131.x. PMID 2693900. S2CID 41192501.
- Hayes F (September 2003). "Toxins-antitoxins: plasmid maintenance, programmed cell death, and cell cycle arrest". Science. 301 (5639): 1496–1499. Bibcode:2003Sci...301.1496H. doi:10.1126/science.1088157. PMID 12970556. S2CID 10028255.
- Gerdes K, Rasmussen PB, Molin S (May 1986). "Unique type of plasmid maintenance function: postsegregational killing of plasmid-free cells". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 83 (10): 3116–3120. Bibcode:1986PNAS...83.3116G. doi:10.1073/pnas.83.10.3116. PMC 323463. PMID 3517851.
외부 링크
- Rfam의 fst 항독소 sRNA(RNAII) 페이지
