태평양 바이오사이언론

Pacific Biosciences

좌표:37°28°43°N 122°09′03§ W/37.4787°N 122.1507°W/ 37.4787;-1507(커넥터)

캘리포니아, 주식회사 태평양 바이오사이언스
유형일반의
산업생명공학
설립.2004년; 18년 전(2004년)
본사
멘로 파크 (캘리포니아 주)
,
미국
주요 인물
  • Christian Henry, CEO 겸 사장
  • John F. Milligan, 이사회 의장
수익.Increase 1,3050만달러 (2021년)
Decrease 2억1000만달러 (2021년)
Decrease 1억8100만달러(2021년)
총자산Increase 20억 1천만 달러 (2021년)
총자본Increase 7억9100만달러(2021년)
종업원수
728 (2021년 12월)
웹 사이트pacb.com
각주/참고 자료
[1]

Pacific Biosciences of California, Inc. (일명 PacBio)는 유전자 배열 분석 및 새로운 실시간 생물학적 [2][3][failed verification]관찰을 위한 시스템을 개발 및 제조하는 2004년 설립된 미국의 생명공학 회사입니다.PacBio는 이 플랫폼을 제로 모드 도파관의 특성에 기반한 단일 분자 실시간 시퀀스 처리(SMRT)라고 설명합니다.

역사

이 회사는 코넬대에서 실시한 반도체 처리와 광자학을 생명공학 [2]연구와 결합한 연구를 바탕으로 설립됐다.와트 교수 연구실에 대학원생 3명이 있어요 Web – Jonas Korlach – Harold Craighead – Steve Turner – Mathieu Focquet – 첫 번째 직원이 되었습니다.

그것은 나노플루이딕스라는 이름으로 시작되었다.동사는, 주로 벤처 캐피털 파이낸스 6 라운드에서 약 4억달러의 자금을 조달해, 2010년에 가장 자본이 풍부한 스타트 업의 하나가 되어,[4] 그 해 10월에 기업 공모를 개시했습니다.주요 투자자로는 Mohr Davidow Ventures, Kleiner, Perkins, Caufield & Byers, Allie Ventures, Wellcome [2]Trust 등이 있습니다.

동사의 최초의 상용 제품인 PacBio RS는, 2010년에 한정된 고객에게 판매되어 2011년 [5][6]초에 시판되었습니다.후속 버전인 PacBio RS II는 2013년 [7]4월에 출시되었습니다.2013년 9월 25일, Pacific Biosciences와 Roche Diagnostics의 파트너십이 발표되어 Roche는 [8][9]이 기술을 이용한 체외 진단 제품 개발에 7500만 달러를 제공했습니다.2015년에는 Sequel System이라는 새로운 시퀀싱 기구를 출시하여 PacBio RS [10]II보다 약 7배 더 큰 용량을 제공하였습니다.그리고 2019년 4월 Sequel II 시스템을 출시하여 처리량을 [11]8배 더 늘렸습니다.2020년 10월 Sequel IIe를 발표했는데, Sequel IIe는 시퀀싱 기기에 온보드 컨센서스 연산을 추가함으로써 생성된 DNA 시퀀스가 [12]이미 정확성을 위해 보정되었습니다.

2021년 2월, 소프트뱅크 그룹의 [13]전환 선순위 채권에 9억달러의 투자를 발표했습니다.2021년 7월 주식 공모로 3억달러를 조달하고 단판 시퀀싱 스타트업 옴니옴을 8억달러에 현금과 [14]주식으로 인수할 뜻을 밝혔다.이어 8월에는 시료제조사업체 서큘러믹스를 [15]인수했다.

리더십

2004년, 클라이너 퍼킨의 거주 기업가인 휴 마틴이 CEO가 되었습니다.2012년 1월 6일, 이사회 멤버 Michael Hunkapiller가 [16]CEO로 취임했습니다.Hunkapiller는 2020년 9월에 퇴직하고, 이사회 의장인 Christian [17]Henry에 의해 대체되었습니다.Henry는 Illumina의 전 이그제큐티브 VP 겸 최고상업책임자(CFO)였으며, 2018년 [18]7월에 PacBio의 이사회에 합류했습니다.

상장

Pacific Biosciences는 2010년 10월 27일 주식공개에서 주당 16달러에 1,250만주를 매각하여 약 2억달러를 조달했습니다.이 주식은 나스닥에서 [19]PACB라는 기호로 거래된다.

일루미나

2018년 11월 1일, Illumina, Inc.는 PacBio를 현금 12억 달러에 인수하기로 합의했습니다.이 계약은 2019년 [20]4분기에 체결될 것으로 예상되었다.2019년 12월 연방거래위원회는 인수를 [21][22]금지해 달라고 소송을 제기했다.이 거래는 2020년 1월 2일 발표와 함께 포기되었다.또한 Illumina는 태평양 바이오사이언스에 9,800만 달러의 해지 수수료를 지불하기로 합의했으며, 이전에 2월에 2,200만 달러,[23] 2020년 3월에 600만 달러의 계약 연장 지급에 합의했습니다.

인식

이 회사는 2009년 [2][24]세계경제포럼으로부터 기술 개척자상을 받았다.

2010년, The Scientist는 이 회사와 그들의 첫 제품을 [25]올해의 최고 생명과학 혁신으로 선정했고, 이 회사는 국립 인간 게놈 [26]연구소로부터 2010 Advanced Sequencing Technology Award를 받았습니다.Technology Review 매거진은 2010년과 [27]2011년 모두 가장 혁신적인 기업 상위 50개사에 이들을 포함시켰습니다.설립자 겸 최고기술책임자(CTO) Dr.Stephen Turner는 회사에서의 [28]업적으로 2010년 유잉 Marion Kauffman Foundation Outstanding Postdoctoral Entrepreneur 상을 받았습니다.

상품들

시퀀싱 기구

PacBio RSII 시퀀서
Pacific Biosciences 속편 시퀀서

이 [29]회사의 첫 번째 과학 기기인 "PacBio RS"는 2010년 말에 11명의 제한된 고객 세트를 대상으로 출시되었습니다.시퀀싱 프로바이더 GATC Biotechniences는 2010년 [30]말 Pacific Biosciences에 의해 유럽 최초의 서비스 프로바이더로 선정되었습니다.이 제품은 2011년 [6]초에 상업적으로 출시되었습니다.2013년 4월 "PacBio RS II"라는 새로운 버전의 시퀀서가 출시되었으며, 기존 RS [7]기기보다 더 긴 시퀀스 읽기를 생성하고 처리량을 제공했습니다.RS 계측기는 [31]2021년 말까지 공식적으로 지원됩니다.

2015년 9월에는 Sequel System이라는 새로운 시퀀싱 도구를 출시했습니다.이 시퀀서는 100만개의 제로 모드 도파관으로 용량이 증가했으며, PacBio RS II의 15만개에 비해 크기는 약 1/3이고 가격은 PacBio RS [32]II의 1/2입니다.

2019년 4월에는 800만 [33]ZMW의 새로운 SMRT Cell을 지원하는 업그레이드된 Sequel II 시스템을 출시하여 SMRT Cell당 처리량을 8배 [11][34]증가시켰습니다.

2020년 10월 Sequel II 시스템에 컴퓨팅 용량을 추가하는 Sequel IIe 시스템을 발표했습니다.이 계산으로 시스템에서 생성된 모든 DNA 판독치는 정확성을 위해 자동으로 보정됩니다.

시약 및 SMRT 셀

상세정보: 단일분자 실시간 시퀀스 처리

두 기기를 모두 사용하려면 고객은 DNA 준비 및 염기서열 분석을 위한 시약 팩과 "SMRT 셀"이라는 작은 소모품도 구입해야 합니다.RS 시퀀서의 셀은 1cm 사각보다 약간 작으며 수만 개의 제로 모드 도파로를 포함합니다.Sequel Sequencer용 셀은 약 2.5cm 정사각형이며 100만 개의 제로 모드 도파로를 포함하고 있는 반면 Sequel II용 셀은 800만 개의 제로 모드 도파로를 포함합니다.RS 시퀀서용 셀은 8개 팩으로 판매됩니다.Sequel 또는 Sequel II 시퀀서용 셀은 4개 단위로 판매됩니다.

2018년 9월 19일, 팩바이오는 속편 6.0 소프트웨어와 3.0 케미스트리를 출시했다.성능은 대형 삽입 라이브러리와 고분자량 DNA와 최대 15,000개 이하의 짧은 삽입 라이브러리 간에 차이가 있다.템플릿이 큰 경우 평균 읽기 길이는 최대 30,000개입니다.짧은 삽입 라이브러리의 경우, 같은 분자를 원으로 읽을 때 평균 판독 길이는 최대 100,000개입니다.후자의 짧은 삽입 라이브러리는 단일 SMRT® [35]셀에서 최대 500억 개의 베이스를 산출합니다.

2019년 10월 1일, 팩바이오는 후속편 II의 8.0 소프트웨어와 2.0 화학 버전을 출시하였다."연속적인 긴 읽기"로 읽히는 더 큰 템플릿의 경우, 인간 라이브러리의 예에서는 N50 읽기 길이가 52,456이고 셀당 수량은 182GB입니다.[36]20,000 base 이하의 라이브러리의 경우, 순환 컨센서스 시퀀스로 읽혀지는 경우, 셀당 수율은 450 GB 또는 약 30 GB의 HiFi 보정 [37]판독치로 견적됩니다.

소프트웨어 및 응용 프로그램

RS를 위한 2차 분석 생물 정보학 제품인 "SMRT Analysis"는 오픈 [38]소스였다.Sequel 시스템의 경우 보조 분석 소프트웨어가 "SMRT Link" 애플리케이션으로 재구성되었습니다.2013년에는 자동 게놈 조립(HGAP)과 99.999% 정확도(Quiver)[39][40][41]로 마감하는 새로운 바이오 인포매틱스 툴을 출시했습니다.

주요 출판물

시퀀서의 첫 번째 상용 공개 전, 과학자들은 2009년 1월에 단일 분자 실시간 시퀀싱에서 생성된 첫 번째 시퀀스 데이터를 [42]사이언스 저널에 발표했다.그 후 2010년 4월, 과학자들은 제로 모드 도파로를 사용하여 리보솜 [43]번역의 실시간 관찰을 수행했다는 논문을 네이처에 발표했다.

Pacific Biosciences 및 기타 기관의 과학자들은 2011년 1월 [44]아이티에서 발생한 2010년 콜레라의 기원을 설명하는 논문을 New England Journal of Medicine에 발표했다.2011년 8월, 태평양 생물 과학자와 다른 기관의 공동 연구자는 수백 건의 용혈 요독 [45]증후군을 일으키는 치명적인 2011년 독일 발병의 원인이 되는 대장균 균주의 분류를 설명하는 논문을 New England Journal of Medicine에 게재했습니다.본 논문은 발병에 책임이 있는 대장균의 변종이 측면 유전자 이식을 통해 시가독신 부호화 파지를 획득했음을 보여주었다.2012년 7월에는 단일 분자 실시간 염기서열 [46][47][48]분석을 사용하여 박테리아의 게놈 마무리를 자동화하는 방법을 보여주는 여러 논문이 동료 리뷰 저널에 발표되었습니다.2013년, 과학자들은 대부분의 박테리아와 고고학 게놈의 완전한 염기서열 분석과 조립이 PacBio의 [49]긴 판독을 통해 마무리될 수 있을 것으로 추정했다.

Pacific Biosciences의 연구자들에 의해 발표된 여러 논문들은 배열 분석 기구가 메틸화, DNA 손상, 그리고 다른 후생유전 정보에 [50][51][52][53][54]대한 데이터를 수집하는데 사용될 수 있다는 것을 보여주었다.제로 모드 도파관에서 염기서열반응을 수행하는 중합효소는 염기변형을 [55]구별하는 데 사용할 수 있는 운동데이터를 생성한다.2012년 10월, 과학자들은 SMRT 염기서열 분석을 사용하여 6개의 박테리아 메틸롬을 생성했으며, 그 결과를 핵산 연구 [54]논문에 발표했다.

읽기 길이와 처리량이 증가함에 따라 이 제품을 사용하는 포유류의 연구가 증가했습니다.2012년 4월, Pacific Biosciences, University of California 및 기타 연구소의 과학자들은 SMRT 시퀀싱을 사용하여 급성 골수성 [56]백혈병의 치료 대상으로 FLT3의 내부 탠덤 복제 돌연변이를 활성화하는 것의 유효성을 입증했다.그들의 연구결과는 네이처 [57]저널에 실렸다.2012년 8월 Broad Institute의 과학자들은 SNP 호출 및 [58]검출을 위한 Pacific Biosciences 시퀀서의 평가 결과를 보고하는 논문을 발표했습니다.과학자들은 2012년 10월 게놈 리서치에 연약한 X [59]증후군을 일으키는 FMR1 유전자의 완전한 반복 확장을 배열하기 위해 PacBio 플랫폼을 사용했다고 보고했다.

2012년 12월에 발표된 논문은 라이브러리 [60]준비 없이 PacBio 시퀀서를 사용하여 시퀀스 데이터를 생성하는 방법을 최초로 시연했습니다.

2013년, 과학자들은 PacBio 시퀀싱을 사용하여 트랜스크립텀을 분석하는 것을 증명하는 논문을 발표했는데, 이는 긴 판독이 완전한 [61][62]Isoform을 완전히 포착할 수 있었다는 것을 보여줍니다.

외부 링크

레퍼런스

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