OpenEye Scientific Software

OpenEye Scientific Software
OpenEye Scientific Software
유형개인 소유, 직원 소유, C Corporation
산업컴퓨터 소프트웨어
연구개발
생명공학
체민포매틱스
설립됨1997
본부
산타페, 뉴멕시코 주
,
미국
직원수
100-200
웹사이트www.eyesopen.com

OpenEye Scientific Software는 대규모 분자 모델링 애플리케이션과 툴킷을 개발하는 미국의 소프트웨어 회사다.

범위

주로 약물 발견과 설계에 맞춰져 있으며, 응용 분야에는 순응 생성, 도킹, 형상 비교, 전하/전기학, 척수학 및 시각화가 포함된다.이 소프트웨어는 속도, 확장성 및 플랫폼 독립성뿐만 아니라 과학적인 엄격함을 위해 설계되었다.

OpenEye는 기술 대부분을 맞춤형 개발에 적합한 툴킷으로 제공한다.툴킷은 다국어로 제공된다.C++, Python, Java, C#.[citation needed]

응용 소프트웨어

  • AFITT - 결정학적 정교화 및 분석.
  • BROOD - 형상, 화학 및 정전기 유사성을 이용한 생체 인식.
  • EON - 전기적 오버레이의 비교를 통한 화학적 유사성 분석
  • FastROCS - GPU 기술을 사용하여 실시간 3D 분자 모양 검색
  • 필터 - 물리적 특성 또는 기능 그룹에 기반한 분자 선별 및 선택
  • OEDOcking - FRED(빠른 도킹), HIRID(리간드 유도 도킹) 및 POSIT(리간드 유도 포즈 예측)를 포함한 분자 도킹 도구.
  • 오메가 - 선형 및 매크로 순환 분자를 위한 빠르고 정확한 컨포머 생성.
  • pKa 통합관리 - 고품질 pKa 측정 데이터베이스.
  • QUACPAC - Tautomers, 양성자 상태 및 작은 분자와 단백질에 대한 전하.
  • ROCS - 신속한 3D 분자 형태 검색을 통한 화학 유사성 분석
  • SZMAP - 리간드 효력 향상을 위한 단백질 결합 부위의 수분 부위 식별
  • SZYBKI - 가스 위상, 용액 또는 단백질 활성 부위 내에서 리간드의 빠른 힘장 최적화.
  • VIDA - 분자 구조 및 정보의 기업 컬렉션을 시각화, 분석 및 관리하는 그래픽 사용자 인터페이스.

툴킷

주어진 기능 집합에 대한 객체 지향 접근성을 가진 다른 응용프로그램을 제공하는 프로그래밍 라이브러리.

  • OEChem TK - 체민성 및 3D 분자 데이터 처리.
  • OEDepict TK - 화합물의 우아한 2D 구조 렌더링.
  • OEDOkking TK - 도킹 및 득점.
  • 그래핀 TK - 복합물의 고급 구조 렌더링
  • 그래프심 TK - 2D 분자 지문 및 유사성 계산
  • Lexichem TK - 다국어에 대한 지원과 함께 최첨단 복합 이름 및 구조 상호 변환.
  • MolProp TK - 2D 분자 특성 계산 및 필터링.
  • QuacPac TK - Tautomer 세대.
  • 오메가 TK - 컨포머 세대.
  • 형상 TK - 3D 오버레이를 기반으로 한 분자형 비교
  • 스피콜리 TK - 신속한 분자 표면 생성 및 조작
  • Szmap TK - 결합 현장의 물 상호작용
  • Szykbi TK - 일반 함수 최적화, 예를 들어 분자 구조 최적화.
  • Zap TK - 효율적인 Poisson-Boltzmann 전기 기술 해결사.

참고 항목

참조

  • "Downloads and Upgrades: AFITT 2.3, GenBank 197.0, and the Protein Databank". BioInform. Genomeweb LLC. August 16, 2013. Retrieved August 28, 2013.
  • "Company Overview of OpenEye Scientific Software, Inc". Bloomberg Businessweek. Bloomberg L.P. Retrieved August 28, 2013.
  • Yang, Jeremy J. (Fall 2011). "Cheminformatics Software Development: Case Studies" (PDF). Indiana University School of Informatics and Computing. Retrieved August 28, 2013.

외부 링크