러그두닌

Lugdunin
러그두닌
Lugdunin.svg
이름
IUPAC 이름
(1R, 4R, 7S, 10R, 13S, 16R, 19S)-7-(1H-인돌-3-일메틸)-10-이소부틸-4, 13, 16, 19-테트라이소프로필-21-티아-3, 6, 9, 12, 15, 1823-18-헥타지스카브.
식별자
3D 모델(JSmol)
체비
켐스파이더
  • InChI=1S/C40H62N8O6S/c1-19(2)15-27-35(50)45-31(21)38(53)47-32(22)39(54)48-33(23)4044-29(1855-203651)(4651)
    키: QZNGYAMKAHFFKCJ-ZBQZSICZSA-N
  • InChI=1/C40H62N8O6S/c1-19(2)15-27-35(50)45-31(21)38(53)47-32(22)39(54)48-33(23)1040-4429(18-55)203-3651)
    키: QZNGYAMKAHFFKCJ-ZBQZSICZBY
  • CC(C)C[C@@H]1C(=O)N[C@H](C=O)N[C@H](C(=O)N[C@H](C2N[C@H])(C2N[C@H](C=O)N[C]
특성.
C40H62N8O6S
몰 질량 783.05g/120−1
달리 명시되지 않은 한 표준 상태(25°C[77°F], 100kPa)의 재료에 대한 데이터가 제공됩니다.

루그두닌은 티아졸리딘 함유 고리형 펩타이드로 분류되는 조사용 항생제이다.2016년 인간 [1][2][3]마이크로바이옴에서 질병을 일으키는 세균의 성장을 억제한 사람 코에서 나온 박테리아로 포도상구균 러그두넨시스가 확인되면서 분리됐다.

루그두닌은 황색포도상구균주의 성장을 억제하는 비리보솜 합성 고리형 펩타이드이다.루그두닌 유전자는 30kbp의 오퍼론 위에 있다.lugA, lugB, lugC 및 lugD 유전자는 추정 조절 유전자 [4]lugR에 선행되는 네 가지 비-리보솜 펩타이드 합성 효소를 코드한다.

진 메뚜기 단백질 크기/aa Genbank 단백질 엔트리 RefSeq 단백질 엔트리
러그 슬래그_RS03935 196 CCB53263.1 WP_002460032.1
러그 슬래그_RS03940 2374 CCB53264.1 WP_002478842.1
슬래그_RS03945 124 CCB53265.1 WP_002460029.1
러그B 슬래그_RS03950 1230 CCB53266.1 WP_014533237.1
러그C 슬래그_RS03955 2937 CCB53267.1 WP_002478844.1
러그 슬래그_RS03960 228 CCB53268.1 WP_002460022.1
러그D 슬래그_RS03965 579 CCB53269.1 WP_002478846.1
ChemDraw image depicting the synthesis of lugdunin. The synthesis proceeds in typical NRPS fashion with four distinct domains.
환화 및 티아졸리딘 생성 전 루그두닌의 NRPS 합성.

생합성

루그두닌은 S. 루그두넨시스 중 비리보솜펩타아제(Non-Ribosome 펩타이드 합성효소)에 의해 합성된다.이 분자는 티아졸리딘 헤테로사이클과 3개의 D 아미노산으로 구성된 고리형 펩타이드이다.러그두닌 합성을 담당하는 오퍼론은 약 30kb이며 4개의 비리보솜펩타이드 합성효소 유전자를 포함한다.오퍼론은 포스포판테닐전달효소, 모노옥시게나아제,[5] 알려지지 않은 길들이기 효소, 조절 유전자 및 타입 II 티오에스테라아제를 포함한다.포스포판테닐전달효소는 운반단백질 역할을 하는 T 도메인을 활성화한다.모노옥시게나아제는 단일 수산기를 러그두닌 중간체에 통합한다.타입 II 티오에스테라아제는 생합성 과정에서 멈춘 중간물질을 제거하기 위해 사용된다.

러그두닌에 대한 놀라운 점은 오퍼론이 5개의 아데닐화 도메인만 부호화한다는 것인데, 이는 이러한 큰 분자에 대한 흥미로운 양이다.이러한 차이는 LugC가 D와 L을 번갈아 구성할 때 3개의 연속 발린 잔기를 첨가함으로써 설명된다.티아졸리딘 고리는 환원을 통한 대사물의 방출에 따라 형성된다.N 말단 L-시스테인 잔기는 C 말단 L-발린 잔기에 있는 카르보닐을[6] 친핵적으로 공격하여 이민 매크로사이클을 형성한다.이 반응에서 형성된 쉬프 염기는 앞에서 설명한 티아졸리딘 헤테로사이클을 생성하는 시스테인 티올에 의해 친핵적으로 공격된다.

레퍼런스

  1. ^ Gallagher, James (2016-07-27). "Antibiotic resistance: 'Snot wars' study heralds new class of drugs". BBC News. Retrieved 2016-07-27.
  2. ^ Zipperer, Alexander; Konnerth, Martin C.; Laux, Claudia; Berscheid, Anne; Janek, Daniela; Weidenmaier, Christopher; Burian, Marc; Schilling, Nadine A.; Slavetinsky, Christoph (2016). "Human commensals producing a novel antibiotic impair pathogen colonization". Nature. 535 (7613): 511–516. Bibcode:2016Natur.535..511Z. doi:10.1038/nature18634. PMID 27466123. S2CID 205249755.
  3. ^ "Scientists find microbiotic treasure hidden in the nose". Los Angeles Times. 2016-07-27. Retrieved 2016-07-27.
  4. ^ Krismer, Bernhard; Peschel, Andreas; Grond, Stephanie; Brötz-Oesterhelt, Heike; Schittek, Birgit; Kalbacher, Hubert; Willmann, Matthias; Marschal, Matthias; Slavetinsky, Christoph; Schilling, Nadine A.; Burian, Marc; Weidenmaier, Christopher; Janek, Daniela; Berscheid, Anne; Laux, Claudia; Konnerth, Martin C.; Zipperer, Alexander (July 2016). "Extended Data Figure 1: Gene cluster of lugdunin and generation of S. lugdunensis IVK28-Xyl". Nature. 535 (7613): 511–516. Bibcode:2016Natur.535..511Z. doi:10.1038/nature18634. PMID 27466123. S2CID 205249755.
  5. ^ Krauss, Sophia; Zipperer, Alexander; Wirtz, Sebastian; Saur, Julian; Konnerth, Martin C.; Heilbronner, Simon; Torres Salazar, Benjamin O.; Grond, Stephanie; Krismer, Bernhard; Peschel, Andreas (2020-12-16). "Secretion of and Self-Resistance to the Novel Fibupeptide Antimicrobial Lugdunin by Distinct ABC Transporters in Staphylococcus lugdunensis". Antimicrobial Agents and Chemotherapy. 65 (1): e01734–20. doi:10.1128/AAC.01734-20. ISSN 0066-4804. PMC 7927808. PMID 33106269.
  6. ^ "Lugdunin - an overview ScienceDirect Topics". www.sciencedirect.com. Retrieved 2022-06-04.

외부 링크


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