해조류 게놈 목록
List of sequenced algae genomes이 서열화된 조류 게놈 목록에는 조립, 주석 달기, 출판된 완전한 게놈 서열을 공개적으로 이용할 수 있는 것으로 알려진 조류 종들이 포함되어 있다.조립되지 않은 게놈은 포함되지 않으며, 오르가넬 전용 시퀀스도 포함되지 않는다.식물 게놈의 경우 배열된 식물 게놈의 목록을 참조한다.플라스티드 시퀀스는 시퀀싱된 플라스티옴 목록을 참조하십시오.모든 왕국에 대해 시퀀싱된 게놈 목록을 참조하십시오.
디노플라겔라테스 (알베올라타)
시퀀싱된 양성자 게놈 목록도 참조하십시오.
유기체 무리를 하다 | 유형 | 관련성 | 게놈 크기 | 숫자 유전자의 예견된 | 조직 | 년도 완성 | 조립 지위 | 링크 |
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Breviolum minutum (Symbiodinium minutum; clade B1) | 디노플라겔라테 | 산호 공생 | 1.5Gb | 47,014 | 오키나와 과학 기술 연구소 | 2013[1] | 초안 | OIST 마린 게노믹스[2] |
Cladocopium goreaui (Symbiodinium goreaui; clade C, type C1) | 디노플라겔라테 | 산호 공생 | 1.19Gb | 35,913 | 암초미래유전체학(ReFuGe) 2020 / 퀸즐랜드 대학교 | 2018[3] | 초안 | 르푸게 2020[4] |
Cladocopium C92 변형률 Y103(Symbiodinium sp. clade C; putative type C92) | 디노플라겔라테 | 포아미니퍼 공생 | 알 수 없음(어셈블리 크기 0.70Gb) | 65,832 | 오키나와 과학 기술 연구소 | 2018[5] | 초안 | OIST 마린 게노믹스[2] |
푸가키움 카와구티이 CS156=CCMP2468(심비오디늄 카와구티이; 쇄도 F1) | 디노플라겔라테 | 산호 공생? | 1.07Gb | 26,609 | 암초미래유전체학(ReFuGe) 2020 / 퀸즐랜드 대학교 | 2018[3] | 초안 | 르푸게 2020[4] |
푸가키움 카와구티이 CCMP2468(심비오디늄 카와구티이; 클래드 F1) | 디노플라겔라테 | 산호 공생? | 1.18Gb | 36,850 | 코네티컷 대학교 / 샤먼 대학교 | 2015[6] | 초안 | S. 카와구티 게놈 프로젝트[7] |
폴라렐라 빙하 | 디노플라겔라테 | 사이크로필레, 남극 | 3.02Gb(다이플로이드), 1.48Gbp(할로이드) | 58,232 | 퀸즐랜드 대학교 | 2020[8] | 초안 | UQ eSpace[9] |
폴라렐라 빙하 | 디노플라겔라테 | 사이크로필리, 북극 | 2.65Gb(다이플로이드), 1.30Gbp(할로이드) | 51,713 | 퀸즐랜드 대학교 | 2020[8] | 초안 | UQ eSpace[9] |
심보디니움 마이크로로드리아툼(클레이드 A) | 디노플라겔라테 | 산호 공생 | 1.1Gb | 49,109 | 킹 압둘라 과학기술 대학 | 2016[10] | 초안 | 암초 게노믹스[11] |
심비오디늄 A3 균주 Y106(심비오디늄 sp. clade A3) | 디노플라겔라테 | 공생시키다 | 알 수 없음(어셈블리 크기 0.77Gb) | 69,018 | 오키나와 과학 기술 연구소 | 2018[5] | 초안 | OIST 마린 게노믹스[2] |
크립토모나드
유기체 무리를 하다 | 유형 | 관련성 | 게놈 크기 | 숫자 유전자의 예견된 | 조직 | 년도 완성 | 조립 지위 | 링크 |
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크립토피세아 sp.CCMP2293 | 나노플라겔레이트 | 뉴클레오모르프, 정신분열증 | 534.5Mb | 33,051 | 공동 게놈 연구소 | 2016[12] | JGI 게놈 포털[13] | |
기야르디아테타 | 에우카리오테 내시경 | 87.2Mb | 24, 840 | 달호지 대학 | 2012[14] | 온실[15] |
글라우코피테
유기체 무리를 하다 | 유형 | 관련성 | 게놈 사이즈를 맞추다 | 숫자 유전자의 예견된 | 조직 | 년도 완성 | 조립 지위 | 링크 |
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시아노포라속 | 모델 유기체 | 70.2Mb | 3,900 | 러트거스 대학교 | 2012[16] | 초안 v1 | 온실[15] 시아노포라 게놈 프로젝트[17] | |
시아노포라속 | 모델 유기체 | 99.94Mb | 25,831 | 러트거스 대학교 | 2019[18] | 초안 v2 | 시아노포라 게놈 프로젝트[19] |
녹조
유기체 무리를 하다 | 유형 | 관련성 | 게놈 사이즈를 맞추다 | 숫자 유전자의 예견된 | 조직 | 년도 완성 | 조립 지위 | 링크 |
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아스테로클로리스 sp.Cgr/DA1pho | 포토비온트 | 55.8Mb | 10,025 | 듀크 대학교 | 2011[20] | JGI 게놈 포털[13] | ||
아우세노클로렐라 원피테코이드 | 바이오 연료 | 22.9Mb | 7,039 | 칭화 대학 | 2014[21] | 온실[15] | ||
바티코쿠스 프라시노스 | 비교분석 | 15.1Mb | 7,900 | 공동 게놈 연구소 | 2012[22] | JGI 게놈 포털[13] | ||
클라미도모나스 라인하르티 CC-503 cw92 mt+ | 모델 유기체 | 111.1Mb | 17,741 | 공동 게놈 연구소 | 2017[23] | 피토좀[24] 온실[15] | ||
클로렐라소로키니아나길1228번길 | 바이오 연료 | 61.4Mb | 로스 알라모스 국립 연구소 | 2018[25] | 온실[15] | |||
클로렐라 소로키니아나 우텍스 1230 | 바이오 연료 | 58.5Mb | 로스 알라모스 국립 연구소 | 2018[26] | 온실[15] | |||
클로렐라 소로키니아나 DOE1412 | 바이오 연료 | 57.8Mb | 로스 알라모스 국립 연구소 | 2018[27] | 온실[15] | |||
클로렐라 변이 NC64a | 바이오 연료 | 46.2Mb | 9,791 | 2010[28] | 온실[15] | |||
클로렐라속 | 바이오 연료 | 37.3Mb | 내셔널 리뉴얼 | 2015[29] | 온실[15] | |||
콕코미x아방상과 sp. C-169 | 바이오 연료 | 48.8Mb | 9839 | 공동 게놈 연구소 | 2012[30] | 피토좀[24] 온실[15] | ||
두날레아살리나 CCAP19/18 | 할로파일 바이오 연료 | 343.7Mb | 16,697 | 공동 게놈 연구소 | 2017[31] | 피토좀[24] | ||
에우도리나 sp. | 다세포 알가, 모델 유기체 | ~180Mb | 도쿄 대학교 | 2018[32] | ||||
고늄 펙터레일 | 148.81Mb | 캔자스 주립 대학교 | 2016[33] | |||||
마이크로모나스 콤모다 NUM17 (RCC288) | 해양 식물성 플랑크톤 | 21.0Mb | 10,262 | 몬터레이 베이 수족관 연구소 | 2013[34][35] | JGI 게놈 포털[13] | ||
미크로모나스속 푸실라 CCMP-1545 | 마린 | 21.9Mb | 10,575 | 미크로모나스속 게놈 컨소시엄 | 2009[36] | 피토좀[24] 온실[15] | ||
미크로모나스속 RCC299/NOUM17 | 마린 | 20.9Mb | 10,056 | 조인트 게놈 | 2009[36] | 피토좀[24] 그 온실[15] | ||
모노라피듐 | 바이오 연료 | 69.7Mb | 16,755 | 빌레펠트 | 2013[37] | 그 온실[15] | ||
오스트레오코쿠스 CCE9901 | 소형 게놈 | 13.2Mb | 7,603 | 공동 게놈 연구소 | 2007[38] | 피토좀[24] | ||
오스트레오코쿠스 타우리 OTH95 | 소형 게놈 | 12.9Mb | 7,699 | 씨엔스 | 2014[39] | 온실[15] | ||
오스트레오코쿠스 sp. RCC809 | 소형 게놈 | 13.3Mb | 7,492 | 조인트 게놈 | 2009[40] | JGI[41] | ||
피코클로룸 DOE101 | 바이오 연료 | 15.2Mb | 7,844 | 로스 알라모스 | 2017[42] | 온실[15] | ||
피코클로룸 세네W3 | 바이오 연료 | 13.5Mb | 7,367 | 러트거스 대학교 | 2014[43] | 온실[15] | ||
크레네데스무스 obliquus DOE0152Z | 바이오 연료 | 210.3Mb | 브루클린 대학교 | 2017[44] | 온실[15] | |||
심비오클로로시스 레티쿨라타(메타게놈) | 포토비온트 | 58.6Mb | 12,720 | 공동 게놈 연구소 | 2018[45] | JGI 게놈 포털[13] | ||
테트라셀미스 삽. | 바이오 연료 | 228Mb | 로스 알라모스 | 2018[15] | 온실[15] | |||
볼복스카리 | 다세포 알가, 모델 유기체 | 131.2Mb | 14,247 | 조인트 게놈 | 2010[46] | 피토좀[24] 그 온실[15] | ||
야마가시엘라유니코카 | 다세포 알가, 모델 유기체 | ~140Mb | 도쿄 대학교 | 2018[32] |
헵토피테
유기체 무리를 하다 | 유형 | 관련성 | 게놈 사이즈를 맞추다 | 숫자 유전자의 예견된 | 조직 | 년도 완성 | 조립 지위 | 링크 |
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크리소크로물리나 | 바이오 연료 | 65.8Mb | 로스 알라모스 국립 연구소 | 2018[47] | 온실[15] | |||
크리소크로물리나토비니 CCMP291 | 모델 유기체, 바이오 연료 | 59.1Mb | 16,765 | 워싱턴 대학교 | 2015[48] | 온실[15] | ||
에밀리아 헉슬리 | 코콜리토포레 | 알케논 생산, 알갈꽃 | 167.7Mb | 38,554 | 공동 게놈 연구소 | 2013[49] | 온실[15] | |
파블로발레스 sp.CCMP2436 | 사이크로필러 | 165.4Mb | 26,034 | 공동 게놈 연구소 | 2016[50] | JGI 게놈 포털[13] |
헤테로콘츠/스트라메노필레스
유기체 무리를 하다 | 유형 | 관련성 | 게놈 사이즈를 맞추다 | 숫자 유전자의 예견된 | 조직 | 년도 완성 | 조립 지위 | 링크 |
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아우레오코쿠스 | 유해한 알갈 블룸 | 50.1Mb | 11,522 | 공동 게놈 연구소 | 2011[51] | 온실[15] | ||
옥토카르푸스실룰로수스 | 갈색조류 | 모델 유기체 | 198.5Mb | 16,269 | 게노스코프 | 2012[52] | 온실[15] | |
프래글리오피스 원통형 원통형물 CCMP1102 | 사이크로필러 | 61.1Mb | 21,066 | 이스트 앵글리아 대학교 공동 게놈 연구소 | 2017[53] | JGI 게놈 포털[13] | ||
난노클로로피스 | 바이오 연료 | 28.5Mb | 10,486 | 파두아 대학교 | 2014[54] | 온실[15] | ||
난노클로로피스 | 바이오 연료 | 31.5Mb | 중국과학원, 칭다오 바이오에너지기술연구소 | 2016[55] | 온실[15] | |||
난노클로로프시스 살리나 CCMP1766 | 바이오 연료 | 24.4Mb | 중국과학원, 칭다오 바이오에너지기술연구소 | 2016[56] | 온실[15] | |||
오크로모나디아과 sp.CCMP2298 | 사이크로필러 | 61.1Mb | 20,195 | 공동 게놈 연구소 | 2016[57] | JGI 게놈 포털[13] | ||
펠라기초과 sp.CCMP2097 | 사이크로필러 | 85.2Mb | 19,402 | 공동 게놈 연구소 | 2016[58] | JGI 게놈 포털[13] | ||
대왕오징어 | 모델 유기체 | 27.5Mb | 10,408 | 디아톰 컨소시엄 | 2008[59] | 온실[15] | ||
의사-니츠키아 멀티시리즈 CLN-47 | 218.7Mb | 19,703 | 공동 게놈 연구소 | 2011[60] | JGI 게놈 포털[13] | |||
사카리나자포니카 | 갈색조류 | 상업작물 | 543.4Mb | 중국과학원, 베이징생명과학원 | 2015[61] | 온실[15] | ||
탈라시오시라 오세아니카 CCMP 1005 | 모델 유기체 | 92.2Mb | 34,642 | 퓨처 오션 | 2012[62] | 온실[15] | ||
탈라시오시라프고나나 | 모델 유기체 | 32.4Mb | 11,673 | 디아톰 컨소시엄 | 2009[63] | 온실[15] |
홍조류 (호조류)
유기체 무리를 하다 | 유형 | 관련성 | 게놈 사이즈를 맞추다 | 숫자 유전자의 예견된 | 조직 | 년도 완성 | 조립 지위 | 링크 |
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콘드루스크레푸스 | 카라게난 생산, 모델 유기체 | 105Mb | 9,606 | 게노스코프 | 2013 | 온실[15] | ||
시아니디오시존 메롤레 10D | 모델 유기체 | 16.5Mb | 4,775 | 국립 연구소 | 2007[64] | 온실[15] | ||
황화 갈디에리아 | 극소수 | 12.1Mb | 요크 대학교 | 2016[65] | 온실[15] | |||
화음속 | 메소필 | 92.1Mb | 10,806 | 성균관대학교 | 2018[66] | |||
포피리듐자반증 | 메소필 | 19.7Mb | 8,355 | 러트거스 대학교 | 2013[67] | |||
포피라 탯실리스 | 마녀사과 | 87.6Mb | 13,360 | 메인 주의 대학교 | 2017[68] | 피토좀[24] | ||
파이로피아 예조엔시스 | 마녀사과 | 43.5Mb | 10,327 | 국립수산과학원 | 2013[69] |
리자리아
유기체 무리를 하다 | 유형 | 관련성 | 게놈 사이즈를 맞추다 | 숫자 유전자의 예견된 | 조직 | 년도 완성 | 조립 지위 | 링크 |
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비겔로위엘라 나탄스 | 모델 유기체 | 94.Mb | 21,708 | 달호지 대학 | 2012[14] | 온실[15] |
참조
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