징멘바이러스

Jingmenvirus
징멘바이러스
바이러스 분류 e
(랭킹되지 않음): 바이러스
영역: 리보비리아
킹덤: 오르토나비라과
망울: 키트리노비리코타
클래스: 플라수비리케테스속
순서: 아마릴로비루스목
패밀리: 플라비비루스과(?)
(랭킹되지 않음): 징멘바이러스
회원바이러스

징멘바이러스는 분할된 게놈을 가진 양성 감각 단일 가닥 RNA 바이러스의 그룹이다.그것들은 주로 절지동물과 연관되어 있고 동물 숙주를 감염시키는 오직 두 개의 알려진 분할된 RNA 바이러스들 중 하나이다.[1][2][3]이 그룹의 첫 번째 멤버인 징먼 진드기 바이러스(JMTV)는 2014년에 설명되었다.[4]또 다른 멤버인 Guaico Culex virus(GCXV)는 게놈 세그먼트가 서로 다른 바이러스 캡시드로 별도로 둘러싸인 매우 특이한 다원체 구조를 가지고 있다.[5]

예

징먼 진드기 바이러스

이 그룹의 첫 번째 멤버는 2014년에 설명되었고, 중국 징먼에서 샘플링된 진드기와 격리되었기 때문에 징먼 진드기 바이러스(JMTV)라고 명명되었다.[4]그것은 가장 가까운 바이러스 친척들보다 약간 더 큰 감춰진 구형 바이러스다.JMTV 게놈은 4개의 세그먼트를 가지고 있으며, 그 중 2개에는 메틸전달효소와 RNA 의존 RNA중합효소 등 미각에서 발견되는 비구조적 단백질에 대한 시퀀스 호몰로지 유전자가 들어 있다.JMTV 게놈의 putterative 구조 단백질은 알려진 호몰로로그를 가지고 있지 않다.[4]JMTV는 진드기 식별 외에도 에이데스알보픽투스 등 모기 발생률이 낮은 곳에서도 확인되고 있다.[6]

과이코쿠렉스바이러스

과이코 쿠렉스 바이러스(GCXV)는 트리니다드 주 과이코 인근에서 발견된 쿠렉스 모기로부터 격리돼 2016년 보고됐다.[5]다섯 번째가 바이러스 확산에 필수적인 것은 아니지만, 바이러스의 다른 격리된 형태는 네 개 또는 다섯 개의 게놈 분열을 가지고 있다.GCXV는 각 게놈 세그먼트가 자신의 작은 밀폐형 바이러스 캡시드 안에 밀폐되어 있는 다중물질(Multipartite) 바이러스다.비구조적 단백질과 캡시드 성분의 유전자를 포함하는 최소 3개의 게놈 부위가 세포에 들어가야 바이러스를 성공적으로 감염시키고 재생산할 수 있다.[5]GMXV가 발견되기 전, 다원체 아키텍처는 이전에는 식물과 곰팡이를 감염시키는 바이러스에서만 보고되었고, 밀폐된 바이러스에서는 관찰된 적이 없었다.[1][5]

기타바이러스

다른 징맨바이러스에 속할 가능성이 있는 유전물질은 생물정보학을 통해 확인할 수 있다.어떤 경우에는 그러한 시퀀스가 바이러스성으로 인식되지 않았거나 게놈의 분할된 성질을 JMTV가 설명되기 전에 인식하지 못한 경우도 있었다.예를 들어, 보고된 개 기생충인 톡소카라 카니스의 게놈은 JMTV에 대한 호몰로리가 포함된 것으로 밝혀졌는데, 이는 서열화된 기생충의 바이러스 감염을 나타내는 것일 가능성이 있다.[4][7]2011년에 처음 보고된 모기아나 진드기 바이러스는 유사한 사례로, 분절된 게놈은 첫 번째 출판물에서 인식되지 않았지만 2017년에 다시 분석되어 징멘바이러스로 확인되었다.[8]

JMTV에 대한 호몰로리가 있는 염기서열은 또한 붉은 콜로부스 원숭이로부터 격리되어 영장류를 감염시킬 수 있는 분할된 다세포성 바이러스의 가능성을 시사했다.[5]절지동물의 메타게노믹스 연구는 가능한 징멘바이러스 시퀀스의 5가지 추가 사례를 확인했다.[9]

진화

징멘바이러스는 단일 캡시드로 전송되는 비분절 게놈을 가진 미각과 관련이 있다.RNA 의존적 RNA 중합효소를 포함한 징먼바이러스와 향미비루스의 비구조적 단백질을 암호화하는 유전자 사이에서 균질학은 일관되게 관찰되어 왔다.그러나, 동질 유전자의 게놈 구조는 상당히 다양하다; 규범적 플라비바이러스 게놈은 단백질 제품이 단백질에 의해 처리되는 단일 개방형 판독 프레임(ORF)으로 구성되는 반면, 비구조적 징그멘바이러스 단백질은 각각 하나의 ORF를 포함하는 두 개의 게놈 세그먼트에 인코딩된다.알려진 징메바이러스 시퀀스는 거의 없지만 게놈 세그먼트의 유전자 구성은 잘 보존된 것으로 보인다.[4][5][9]이와는 대조적으로, 캡시드를 구성할 가능성이 있는 putputive jingmenvirus 구조 단백질은 알려진 단백질에 대한 동질감이 없다.[4][5]

분단된 징검다리의 가장 가까운 친척들이 분단되지 않은 것은 놀라운 일이다.[1][2]게놈 분할과 특히 다중 요소 아키텍처의 기초가 되는 진화적 메커니즘은 잘 이해되지 않는다.분절된 게놈들이 바이롬에서 여러 번 진화했던 것으로 보이지만, 이 구조의 기초가 되는 진화 메커니즘은 불분명하다.[10][11]마찬가지로 다중 요소 아키텍처가 뚜렷한 진화 전략인지 또는 결함이 있는 간섭 입자의 형성을 통해 분할 메커니즘의 인공물인지 불분명하다.[1][10]

참조

  1. ^ a b c d Holmes, Edward C. (September 2016). "The Expanding Virosphere". Cell Host & Microbe. 20 (3): 279–280. doi:10.1016/j.chom.2016.08.007. PMID 27631697.
  2. ^ a b Attar, Naomi (6 September 2016). "Animal viruses in pieces". Nature Reviews Microbiology. 14 (10): 606–7. doi:10.1038/nrmicro.2016.133. PMID 27595788.
  3. ^ Michalakis, Yannis (September 2020). "The Curious Strategy of Multipartite Viruses". Annual Review of Virology. 7: 203–218. doi:10.1146/annurev-virology-010220-063346.
  4. ^ a b c d e f Qin, X.-C.; Shi, M.; Tian, J.-H.; Lin, X.-D.; Gao, D.-Y.; He, J.-R.; Wang, J.-B.; Li, C.-X.; Kang, Y.-J.; Yu, B.; Zhou, D.-J.; Xu, J.; Plyusnin, A.; Holmes, E. C.; Zhang, Y.-Z. (21 April 2014). "A tick-borne segmented RNA virus contains genome segments derived from unsegmented viral ancestors". Proceedings of the National Academy of Sciences. 111 (18): 6744–6749. Bibcode:2014PNAS..111.6744Q. doi:10.1073/pnas.1324194111. PMC 4020047. PMID 24753611.
  5. ^ a b c d e f g Ladner, Jason T.; Wiley, Michael R.; Beitzel, Brett; Auguste, Albert J.; Dupuis, Alan P.; Lindquist, Michael E.; Sibley, Samuel D.; Kota, Krishna P.; Fetterer, David; Eastwood, Gillian; Kimmel, David; Prieto, Karla; Guzman, Hilda; Aliota, Matthew T.; Reyes, Daniel; Brueggemann, Ernst E.; St. John, Lena; Hyeroba, David; Lauck, Michael; Friedrich, Thomas C.; O’Connor, David H.; Gestole, Marie C.; Cazares, Lisa H.; Popov, Vsevolod L.; Castro-Llanos, Fanny; Kochel, Tadeusz J.; Kenny, Tara; White, Bailey; Ward, Michael D.; Loaiza, Jose R.; Goldberg, Tony L.; Weaver, Scott C.; Kramer, Laura D.; Tesh, Robert B.; Palacios, Gustavo (September 2016). "A Multicomponent Animal Virus Isolated from Mosquitoes". Cell Host & Microbe. 20 (3): 357–367. doi:10.1016/j.chom.2016.07.011. PMC 5025392. PMID 27569558.
  6. ^ Parry R, James ME, Asgari S (2021). "Uncovering the Worldwide Diversity and Evolution of the Virome of the Mosquitoes Aedes aegypti and Aedes albopictus". Microorganisms. 9 (8): 1653. doi:10.3390/microorganisms9081653. PMC 8398489. PMID 34442732.{{cite journal}}: CS1 maint : 복수이름 : 작성자 목록(링크)
  7. ^ Tetteh, KK; Loukas, A; Tripp, C; Maizels, RM (September 1999). "Identification of abundantly expressed novel and conserved genes from the infective larval stage of Toxocara canis by an expressed sequence tag strategy". Infection and Immunity. 67 (9): 4771–9. doi:10.1128/IAI.67.9.4771-4779.1999. PMC 96808. PMID 10456930.
  8. ^ Villa, Erika C.; Maruyama, Sandra R.; de Miranda-Santos, Isabel K. F.; Palacios, Gustavo; Ladner, Jason T. (4 May 2017). "Complete Coding Genome Sequence for Mogiana Tick Virus, a Jingmenvirus Isolated from Ticks in Brazil". Genome Announcements. 5 (18): e00232–17. doi:10.1128/genomeA.00232-17. PMC 5477184. PMID 28473376.
  9. ^ a b Shi, Mang; Lin, Xian-Dan; Vasilakis, Nikos; Tian, Jun-Hua; Li, Ci-Xiu; Chen, Liang-Jun; Eastwood, Gillian; Diao, Xiu-Nian; Chen, Ming-Hui; Chen, Xiao; Qin, Xin-Cheng; Widen, Steven G.; Wood, Thomas G.; Tesh, Robert B.; Xu, Jianguo; Holmes, Edward C.; Zhang, Yong-Zhen; Ou, J.-H. J. (15 January 2016). "Divergent Viruses Discovered in Arthropods and Vertebrates Revise the Evolutionary History of the Flaviviridae and Related Viruses". Journal of Virology. 90 (2): 659–669. doi:10.1128/JVI.02036-15. PMC 4702705. PMID 26491167.
  10. ^ a b Lucía-Sanz, Adriana; Manrubia, Susanna (9 November 2017). "Multipartite viruses: adaptive trick or evolutionary treat?". NPJ Systems Biology and Applications. 3 (1): 34. doi:10.1038/s41540-017-0035-y. PMC 5680193. PMID 29263796.
  11. ^ Sicard, Anne; Michalakis, Yannis; Gutiérrez, Serafín; Blanc, Stéphane; Hobman, Tom C. (3 November 2016). "The Strange Lifestyle of Multipartite Viruses". PLOS Pathogens. 12 (11): e1005819. doi:10.1371/journal.ppat.1005819. PMC 5094692. PMID 27812219.