GlmZ RNA

GlmZ RNA
glmS mRNA의 GlmZ RNA활성화제
RF00083.jpg
GlmZ_SraJ의 예측된 2차 구조 및 배열 보존
식별자
기호.GLMZ_SraJ
Alt. 기호SraJ
RfamRF00083
기타 데이터
RNA형진; sRNA
도메인박테리아
그렇게SO:0000655
PDB 구조PDBe

GlmZ(공식적으로 SraJ)는 작은 비코드 RNA(ncRNA)입니다.그것은 단백질로 변환되지 않는 유전자의 기능적 산물이다.

이 ncRNA는 알려진 작은 RNA 부호화 [1]유전자의 전사 신호와 게놈 특징에 대한 대규모 계산 화면 동안 대장균에서 발견되었다.이 화면 동안 SraB, SraC, SraD 및 SraG를 [1]포함하여 14개의 새로운 ncRNA 유전자가 확인되었다.

SraJ의 발현은 노던 [1]블로팅을 통해 실험적으로 확인되었다.이 ncRNA는 초기 로그 단계로 표현되지만, 그 수준은 정지 단계로 감소합니다.노던 블롯 분석은 또한 이 RNA가 특정 분할 처리를 거치는 것으로 나타났다.

GlmZ sRNA는 GlmS [2][3]mRNA의 합성을 적극적으로 제어하는 것으로 나타났다. GlmZ는 GlmY라고 [4][5][6]불리는 관련 sRNA에 의해 조절된다.GlmY는 항어댑터로서 기능하며, RapZ(sRNA GlmZ용 RNase 어댑터 단백질)에 결합하며, 이 결합은 RapZ가 GlmZ에 결합하는 것을 방지하고 RNase [7]E에 의한 분할을 목표로 합니다.

레퍼런스

  1. ^ a b c Argaman L, Hershberg R, Vogel J, et al. (2001). "Novel small RNA-encoding genes in the intergenic regions of Escherichia coli". Curr. Biol. 11 (12): 941–950. doi:10.1016/S0960-9822(01)00270-6. PMID 11448770.
  2. ^ Kalamorz F, Reichenbach B, März W, Rak B, Görke B (2007). "Feedback control of glucosamine-6-phosphate synthase GlmS expression depends on the small RNA GlmZ and involves the novel protein YhbJ in Escherichia coli". Mol Microbiol. 65 (6): 1518–1533. doi:10.1111/j.1365-2958.2007.05888.x. PMID 17824929.
  3. ^ Urban JH, Papenfort K, Thomsen J, Schmitz RA, Vogel J (2007). "A conserved small RNA promotes discoordinate expression of the glmUS operon mRNA to activate GlmS synthesis". J Mol Biol. 373 (3): 521–528. doi:10.1016/j.jmb.2007.07.035. PMID 17854828.
  4. ^ Reichenbach B, Maes A, Kalamorz F, Hajnsdorf E, Görke B (2008). "The small RNA GlmY acts upstream of the sRNA GlmZ in the activation of glmS expression and is subject to regulation by polyadenylation in Escherichia coli". Nucleic Acids Res. 36 (8): 2570–2580. doi:10.1093/nar/gkn091. PMC 2377431. PMID 18334534.
  5. ^ Urban JH, Vogel J (2008). "Two seemingly homologous noncoding RNAs act hierarchically to activate glmS mRNA translation". PLOS Biol. 6 (3): e64. doi:10.1371/journal.pbio.0060064. PMC 2267818. PMID 18351803.
  6. ^ Görke B, Vogel J (2008). "Noncoding RNA control of the making and breaking of sugars". Genes Dev. 22 (21): 2914–2925. doi:10.1101/gad.1717808. PMID 18981470.
  7. ^ Göpel, Y; Papenfort, K; Reichenbach, B; Vogel, J; Görke, B (Mar 1, 2013). "Targeted decay of a regulatory small RNA by an adaptor protein for RNase E and counteraction by an anti-adaptor RNA". Genes & Development. 27 (5): 552–564. doi:10.1101/gad.210112.112. PMC 3605468. PMID 23475961.

외부 링크

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